蓝细菌与福建苏铁(Cycad revoluta)的侵染性重组的研究     

陈彬  郑斯平  郑伟文 《福建农业学报》2007,22(4):350-353

将苏铁珊瑚状根及根周围的土壤中分离的蓝细菌分离物与福建苏铁(Cycas revoluta)在实验室条件下进行重组。通过比较重组前后蓝细菌分离物的STRR指纹图谱和16S rRNA的序列得蓝细菌分离物RZHA4能重新侵染苏铁的珊瑚状根。通过NCBI比对,蓝细菌分离物RZHA4的16S rRNA序列与蓝细菌NostocaceaeIL13-1的相似性为99%。  相似文献   

Comparative sequence analysis of 16S rRNA gene of Pasteurella multocida serogroup B isolates from different animal species     

Dey S  Singh VP  Kumar AA  Sharma B  Srivastava SK  Singh N 《Research in veterinary science》2007,83(1):1-4

The phylogenetic relationships of five isolates of Pasteurella multocida serotype B:2 belonging to buffalo, cattle, pig, sheep and goat were investigated by comparative sequence analysis of 16S rRNA gene. The 1468bp fragment of 16S rRNA gene sequence comparison showed that the isolates of cattle (PM75), pig (PM49) and sheep (PM82) shared 99.9% homology with the buffalo isolate (vaccine strain P52) whereas, the goat isolate (PM86) shared 99.8% homology with the vaccine strain. The 16S rRNA gene sequences of these isolates were also found monophyletic with type B reference strain NCTC 10323 of P. multocida subsp. multocida. The present study indicated the close relationships of haemorrhagic septicaemia causing P. multocida serotype B:2 isolates of buffalo and cattle with other uncommon hosts (pig, sheep and goat).  相似文献   

Soil organic carbon and phosphorus availability regulate abundance of culturable phosphate-solubilizing bacteria in paddy fields     

Arvind KUMAR  Lal Chand RAI 《土壤圈》2020,30(3):405-413

Low availability of phosphorus(P) is a major constraint for optimal crop production, as P is mostly present in its insoluble form in soil. Therefore,phosphate-solubilizing bacteria(PSB) from paddy field soils of the Indo-Gangetic Plain, India were isolated, and their abundance was attempted to be correlated with the physicochemical characteristics of the soils. Ninety-four PSB were isolated on Pikovskaya's agar medium, and quantitative phosphate solubilization was evaluated using NBRIP medium. The isolates solubilized P up to a concentration of 1 006 μg mL~(-1) from tricalcium phosphate with the secretion of organic acids. These isolates were identified by 16 S rRNA gene sequence comparison, and they belonged to Gammaproteobacteria(56 isolates),Firmicutes(28 isolates), Actinobacteria(8 isolates), and Alphaproteobacteria(2 isolates). Phylogenetic analysis confirmed the identification by clustering the isolates in the clade of the respective reference organisms. The correlation analysis between PSB abundance and physicochemical characteristics revealed that the PSB population increased with increasing levels of soil organic carbon, insoluble P, K~+, and Mg~(2+). The promising PSB explored in this study can be further evaluated for their biofertilizer potential in the field and for their use as potent bio-inoculants.  相似文献   

病犬大肠杆菌16S rRNA甲基化酶基因检测研究     

陈玉霞李德喜  杜向党潘玉善  刘建华苑丽 张素梅 《中国农学通报》2011,27(17):34-37

摘要：为了解郑州市发病犬大肠杆菌对氨基糖苷类药物高度耐药的16S rRNA甲基化酶流行情况,本研究测定了分离自河南郑州市宠物医院发病犬的123株大肠杆菌对氨基糖苷类代表药物阿米卡星的敏感性;分别设计6种16S rRNA甲基化酶基因特异性引物,对耐药分离株进行16S rRNA甲基化酶基因PCR扩增检测。检测结果显示,在发病犬大肠杆菌中仅检测到armA和rmtB,其检出率分别为3.25%（4/123）和38.2%（47/123）。其中,有3.25%（4/123）的大肠杆菌可同时检测到armA和rmtB。这些结果提示,此地区发病犬大肠杆菌16S rRNA甲基化酶基因以rmtB为主。病犬细菌一旦携带这些耐药基因,可导致对氨基糖苷类药物高度耐药,应引起重视。  相似文献   

我国主要养殖罗非鱼的16S rRNA序列特征分析     

郭奕惠  黄桂菊  喻达辉  李莉好  符云  叶卫 《上海海洋大学学报》2007,(5):490-494

对我国主要养殖的尼罗、奥利亚、莫桑比克、杂交种尼奥（尼罗♀×奥利亚♂）和红罗非鱼（莫桑比克×尼罗）的线粒体16S rRNA部分序列进行了PCR扩增和测序分析,探讨罗非鱼种间亲缘关系和种类鉴别标记。PCR产物经直接测序,5种罗非鱼中大部分个体均获得长546 bp的基因序列。其碱基组成GC含量为47.4%。序列比对分析显示变异位点18个,没有插入/缺失位点,转换/颠换比率为2.7。序列分析表明,红和奥利亚各有2个单倍型,尼奥、莫桑比克与尼罗各有1个单倍型。其中,尼奥与尼罗的单倍型序列相同,莫桑比克与红罗非鱼的1个单倍型序列相同。表明部分红罗非鱼的母本为莫桑比克。UPGMA聚类分析表明,尼奥与尼罗聚成一支、红罗非鱼与莫桑比克成一支、奥利亚独成一支。  相似文献   

花生根瘤菌遗传多样性的RFLP分析     

康凯  徐艳  李友国  周俊初 《湖北农业科学》2007,46(5):677-680

利用16S rRNA PCR-RFLP和16S-23S rRNA IGS PCR-RFLP技术对分离自我国不同地区的55株花生慢生根瘤菌和6株参比菌株进行了遗传多样性研究.16S rRNA PCR-RFLP分析结果表明,在63%的相似性水平上,91%的供试花生幔生根瘤菌与B.japonicum和B.elkanii聚在一起;16S-23S rRNA IGS PCR-RFLP分析结果表明,供试花生慢生根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,在65.8%的相似性水平上可分为3大类群.  相似文献   

高效溶栓菌株的筛选鉴定及活性测定     

霍金柱  陈斌  李莹  何正波  敬俊锋 《西南大学学报(自然科学版)》2011,33(6)

以日本纳豆、重庆江津豆豉、忠县豆腐乳为原料,采用酪蛋白平板初筛、摇瓶复筛,得到18株产溶栓酶的菌株.通过纤维蛋白平板实验,从忠县豆腐乳中筛选出1株具有较高溶栓活性的菌株FR-033(登录号:HQ009804),菌株经液体发酵后获得含酶发酵液,采用硫酸铵分段盐析及sephadexG-50凝胶层析进行纯化,获得较高纯度的溶栓酶,酶活力为2 163 IU/mL.进一步对FR-033菌株的形态和生理生化特征进行研究.利用细菌16S rDNA通用引物对16S rRNA进行PCR扩增并测序,得到1444 bp长度的DNA序列,通过BLAST软件在NCBI网站收索其同源性性序列,利用PAUP4.0和MAGE4软件绘制系统发育树,结果表明:菌株FR-033与枯草芽孢杆菌(Bacil-lus subtilis)的16S rRNA序列同源性达99%以上,在系统发育树中,菌株FR-033与枯草芽孢杆菌在同一支上,且遗传距离最短;FR-033的形态及大部分生理生化特征与枯草芽孢杆菌极为相似,表明该菌株是枯草芽孢杆菌(Ba-cillus subtilis)的一个高效的产溶栓酶菌株.  相似文献   

猪源肺炎克雷伯菌的分离与鉴定     

贾艳  雷连成  何礼洋  杨洋  韩俊友  韩文瑜 《吉林农业大学学报》2007,29(2):196-199,202

从9只病死猪肺、肝脏中分离到4株革兰氏阴性杆菌,并对分离菌株进行形态学、培养特性、生化特性和分子生物学的鉴定,确定分离的菌株为肺炎克雷伯菌肺炎亚种。根据GeneBank上肺炎克雷伯菌16S rRNA可变区序列设计1对引物,4株细菌基因组DNA均可扩增到1段大小为127 bp特异性片段,经测序与已知肺炎克雷伯菌相应序列的同源性为100%,鉴定4株细菌均为猪源肺炎克雷伯菌。动物毒性试验证明其对小鼠有较强的致病性。  相似文献   

外来种互花米草盐沼土壤微生物16S rRNA特征分析——以江苏省潮间带为例^*   总被引：3，自引：0，他引：3  

周虹霞  刘金娥  钦佩 《云南农业大学学报(自然科学版)》2006,21(6):799-805

 通过对互花米草盐沼和对应光滩的土壤微生物16S rRNA的特征检测,分析了外来种互花米草的侵入对潮间带生态系统土壤微生物多样性的影响。试验中采集了江苏滨海不同季节光滩与互花米草(Spartina alterniflora)盐沼的土壤,直接提取法分离得到其中的土壤微生物DNA,并采用Sepharose 4B吸附柱对DNA进行纯化,有效地去除了腐殖酸,得到纯度较高的DNA样品模板。通过选取特异引物扩增16S rRNA基因序列,得到了较清晰的结果:有差异的16S rRNA扩增片断通过DGGE被分开,形成可见条带;不同的样品由于其中的微生物多样性的差异,扩增出的条带数量及其在凝胶上的相对位置都有一定的差异。结果显示:互花米草盐沼与光滩的土壤微生物群落多样性皆较低,二者在互花米草生长初期其土壤微生物群落结构具有一定的相似性。但总体来说,外来种互花米草的种植较明显地改变了滩涂的土壤微生物群落结构;此外,滩涂土壤微生物群落随着季节的变化而发生了较大的改变。  相似文献   

羊源杀鲑气单胞菌16S rRNA基因的克隆测序及分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

林如涛  周作勇  王小林  聂奎 《西南大学学报(自然科学版)》2011,33(8)

从重庆市丰都县无菌采集山羊血液,提取全血基因组,用16SrRNA基因的引物进行PCR扩增,得到2条长约1 500bp的扩增片段,将其克隆到pMD19-T载体后进行测序,并与3条豚鼠气单胞菌,3条嗜水气单胞菌,3条中间气单胞菌,4条杀鲑气单胞菌,2条温和气单胞菌,3条维氏气单胞菌和5条舒氏气单胞菌16SrRNA基因序列进行系统发育分析.结果表明:所克隆的基因片段长度均为1 507bp,GenBank登录号为JF823571和JF823572.系统发育分析发现2条序列均被聚类到杀鲑气单胞菌群,并与温和气单胞菌聚类到一个大的分支.同源性比对结果显示所获得的序列与杀鲑气单胞菌法国株(ATCC33658T)X74681和阿根廷株AF134065的同源性最高,均为99.6%,表明重庆地区存在受杀鲑气单胞菌感染的山羊.  相似文献