基于转录组数据的害虫抗药性综合检测方法   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈龙飞  聂僖曼  梁沛  李飞  韩召军 《植物保护学报》2020,47(1):18-25

为建立基于转录组数据的害虫抗药性检测方法,以3种重要害虫家蝇Musca domestica、白纹伊蚊Aedes albopictus和小菜蛾Plutella xylostella的8个抗性/敏感种群的转录组数据为对象,使用已开发的乙酰胆碱酯酶抗性突变检测程序ACE检测不同种群中的乙酰胆碱酯酶抗药性突变,并使用Bowtie 2软件和R程序包DESeq2检测其解毒酶基因的表达量变化,分析这3种害虫对有机磷类和氨基甲酸酯类杀虫剂的抗性分子基础。结果显示,在家蝇2个抗性种群KS8S3和ALHF中检测到ace2基因上发生了G227A抗药性突变,突变频率分别为0.318和1.000;在白纹伊蚊抗性种群Tem-GR中检测到CCEae3a基因的表达量较敏感种群Par-GR上调了7.175倍;在小菜蛾抗性种群ZZ中检测到ace1基因上发生A201S和G227A抗药性突变,突变频率分别为0.656和0.692。根据上述突变频率和解毒酶基因表达量变化评估的3种害虫种群抗药性情况与其之前的报道基本相符,表明基于转录组数据同时对靶标抗性机制和代谢抗性机制进行检测的害虫抗药性综合检测方法可以很好地反映害虫种群的抗药性状况。  相似文献   

植物病原丝状真菌寄生性与RGS蛋白的关系研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

祝友朋  韩长志 《华中农业大学学报》2020,39(6):23-29

以49个全基因组序列已经公布的真菌为研究对象,通过OrthoVenn2同源基因簇比对、BLASTp比对和关键词搜索3种方法对G蛋白信号调控因子（regulators of G-protein signaling,RGS）同源基因进行比对分析,并结合SMART进行保守结构域分析,结果发现,49个真菌中共有229个RGS蛋白,每种真菌中所含有RGS蛋白的数量范围为3~9个,且死体营养型病原菌和半活体营养型病原菌的RGS蛋白数量高于活体营养型病原菌;根据RGS蛋白中保守结构域进行分类,可以划分为DEP-RGS、RGS-TM、PXA-RGS-PX、RGS、RGS-PAS-PAC、TM-RGS等6种,其中,具有RGS-PAS-PAC和TM-RGS这2种特殊保守结构域的RGS蛋白主要集中在半活体营养型病原菌和死体营养型病原菌;进一步对229个RGS蛋白进行遗传关系分析,发现具有同种保守结构域的RGS蛋白亲缘关系较近。上述研究结果表明植物病原丝状真菌的寄生性与RGS蛋白数量和种类之间存在着一定的关联性。  相似文献   

协同多目标攻击空战决策的启发式粒子群优化算法     

罗德林  杨忠  段海滨  吴在桂  沈春林 《勤云标准版测试》2006,(1):20-26

利用协同多目标攻击战术的特定知识，并结合粒子群算法，提出了一种用于空战决策的启发式粒子群算法。该算法利用粒子群算法对解空间探索能力强，容易跳出局部最优陷井及启发式算法局部搜索能力强的优点，快速、高效地对全局最优值进行搜索。该算法通过求解友机导弹对目标的最优分配来确定空战决策方案。仿真实验结果表明。本文算法对最优空战决策方案的搜索性能明显优于普通粒子群算法及其他两种遗传算法。  相似文献   

有机化合物构性相关分析的解析程序          下载免费PDF全文

傅建熙  马养民 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》2000,28(3):32-35

根据有机化合物的构性相关规则 ,用演绎推理的方法建立了有机化合物构性相关分析的解析程序。这一解析程序把有机化合物的构性相关分析归纳成 5个步骤 ,即写出靶结构式 ,找出官能团 ,分析官能团和烃基中所含的每 1根化学键 ,考察分子中各结构单元之间产生的相互影响 ,最后分类总结出有机化合物的全部性能。  相似文献   

黄瓜褐斑病病原菌鉴定及生物学特性研究   总被引：29，自引：0，他引：29  

邹庆道  傅俊范  朱勇  房德纯 《沈阳农业大学学报》2002,33(4):258-261

对辽宁省保护地发生的黄瓜褐斑病进行病原菌的分离、鉴定 ,明确该病的病原菌为多主棒孢霉[Corynesporacassiicola(B.&C.)Wei]。生物学特性研究表明 ,该菌孢子萌发的最适温度范围为15～35℃ ,最适pH值为5～8,水滴是孢子萌发的必要条件。病菌营养生长的最适温度为15～35℃ ,最适 pH值为6～8 ,在PSA、PDA等常规培养基上生长良好 ,光照对菌丝生长速度影响不显著。病菌产孢的最适温度为25～30℃,最适pH值为5～8,光照有助于孢子形成,在PSA、PDA等常规培养基上能大量产孢。病菌分生孢子在室外难以安全越冬,在保护地内能够安全越夏。该菌寄主范围广,能寄生黄瓜和番茄等20余种作物  相似文献   

寄主植物对云南烟蚜解毒酶和靶标酶活力的影响   总被引：13，自引：0，他引：13  

宋春满  高家合  邓建华  吴兴富 《西南大学学报(自然科学版)》2002,24(3):241-243

比较了9个烤烟品种上烟蚜解毒酶和靶标酶的活力，发现烤烟品种对烟蚜解毒酶和靶标酶活力影响显著，不同品种烤烟上烟蚜的αNA羧酸酯酶，β－NA羧酸酯酶、谷胱甘肽转移酶、乙酰胆碱酯酶、酸性磷酸酶均有差异。  相似文献   

静原鸡胸肌和腿肌肌苷酸特异性沉积相关circRNA的联合分析     

王卫振  邓占钊  辛国省  虎红红  禹宝军  蔡正云  顾亚玲  张娟 《中国农业大学学报》2021,26(4):79-92

旨为分析静原鸡胸肌和腿肌中circRNA的表达模式与肌苷酸(Inosine monphosphate,IMP)在肌肉组织特异性沉积的关系。利用RNA-seq技术对选取的具有相同遗传背景180日龄静原鸡胸肌和腿肌进行全转录组测序,对获得的测序数据进行拼接、比对、注释和差异分析等,并对差异表达的circRNA和mRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,使用qRT-PCR对转录组结果进行表达量验证。结果表明:共筛选到circRNA 3 283个,组织特异性表达circRNA 242个。以|log2Fold change|≥1,P0.05为筛选条件,共得到差异circRNA 446个,DEGs 1 100个,差异miRNA 36个;对差异表达的circRNA和mRNA进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,两者都显著富集于糖酵解/糖异生通路和心肌细胞的肾上腺素信号传导,并且差异circRNA显著富集于嘌呤代谢通路,DEGs显著富集于氨基酸的生物合成、磷酸戊糖途径、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢等与IMP合成高度相关的通路。对差异circRNA进行靶基因预测,构建circRNA-miRNA-mRNA可视化共表达网络,筛选到以novel＿circ＿0013580、novel＿circ＿0012931、novel＿circ＿0011886、novel＿circ＿0013588、novel＿circ＿0007737和novel＿circ＿0008274为核心的转录后调控因子和以PKM2、GART为核心的靶基因,靶向基因分析发现IMP合成关键调控因子可能来源于同一亲本基因的novel＿circ＿0013580和novel＿circ＿0013588,两者能够同时结合novel＿409作用于靶基因GART。对6个circRNA和6个miRNA qRT-PCR检测结果与全转录组测序结果趋势一致。综上,circRNA在静原鸡胸肌和腿肌中的差异性表达与IMP的特异性沉积具有相关性,为研究地方鸡种IMP在肌肉组织中特异性沉积的分子机制提供参考信息。  相似文献   

基于PRIM的皖西大别山区旅游市场细分研究     

程豪 《安徽农业大学学报》2017,26(6):46-51

旅游客源市场细分和目标市场定位是当今旅游研究的热点问题和重要内容.以皖西大别山为例,寻找高重游意愿群体,选择最合适的群体作为目标市场并通过交叉分类研究分析其基本特征,结果显示:国内旅游客源市场以年轻型为主,成年型次之,国内旅游发展空间巨大;关注特定人口特征下的目标游客群体可以将重游率提高200.9%;目标游客群体的态度、行为特征与整体市场基本保持一致,但在人口学特征上有较大差别;目标市场中硕士及以上学历游客和具有本科学历且已婚有成年子女的游客均是被忽略的重要细分群体.  相似文献   

马立克氏病病毒编码的miR-M12-5p对鸡HVCN1基因表达的靶向调控   总被引：1，自引：0，他引：1  

李会珍  滕蔓  党露  冯丽丽  马圣明  赵朴  罗俊  张改平 《河南农业科学》2016,(6)

为研究miR-M12-5p在马立克氏病病毒(Marek’s disease virus,MDV)感染过程中的调控作用,利用生物信息学方法对其候选靶基因进行预测分析,发现4个miR-M12-5p的结合靶点。体外双荧光素酶报告试验结果表明,miR-M12-5p可结合宿主鸡的氢离子电压门控通道1(HVCN1)基因mRNA的3'-UTR相应位点并发生特异性相互作用。实时荧光定量PCR分析进一步证实,miR-M12-5p能够在体内下调HVCN1基因的表达水平。上述结果表明,miR-M12-5p可以靶向调控宿主基因HVCN1的表达。  相似文献   

植物染色体原位杂交技术的发展     

范燕  陈庆富 《贵州农业科学》2007,35(4):130-134

染色体原位杂交技术是现代生物技术的重要组成部分。它具有直接、准确、便捷等特点,在生物科学研究中发挥着重要的作用。随着分子生物学的进步,染色体原位杂交技术不断改进和完善,新的染色体原位杂交技术不断涌现。本文对染色体原位杂交探针、染色体原位杂交靶DNA类型、染色体原位杂交新技术及应用等方面进行了综述。  相似文献