内源性绵羊肺腺瘤病毒全基因组序列测定与序列分析     

周艳喜  苏佳  李靖  刘霄卉  马学恩 《兽医大学学报》2012,(7):962-966

参照内源性绵羊肺腺瘤病毒株enJSRV-20全基因组序列设计合成3对引物,应用PCR技术扩增内源性绵羊肺腺瘤病毒基因片段分别连接pMD-18T载体并测序,完成了内源性绵羊反转录病毒基因组序列测定。分析结果显示,测定序列全长7519bp,与内源性绵羊肺腺瘤病毒代表株enJSRV-20核苷酸同源性为99．4％,与外源性绵羊肺腺瘤病毒代表株AF357971．1的核苷酸同源性为90．4％。基于全基因组序列核苷酸的系统进化发生树分析结果显示,扩增序列与enJSRV-20的亲缘关系最近。  相似文献   

滩羊线粒体ATPase 6基因的序列测定及分析     

马丽娜  李颖康  马青  马小明  杨炜迪 《黑龙江畜牧兽医》2012,(19):56-57

滩羊是在宁夏特定的自然环境条件下,经过数百年的自然选择和人工培育而形成的具有地方特色的优良品种。近几年,随着人们消费需求的变化,绿色消费已成为时尚,宁夏滩羊肉产品需求量不断增加,羊肉市场供应十分紧俏,因此以次充好、假冒产品销售的现象时常发生,影响了该品种羊肉的声誉。线粒体DNA是真核生物核外遗传物质,被广泛应用于系  相似文献   

牛消化道I型肽载体克隆测序及编码蛋白结构分析     

林雪彦  李燕  姜运良  苏鹏程  王云  王中华 《畜牧兽医学报》2009,40(4)

从牛瓣胃上皮提取RNA,根据已知的人、鼠、兔、羊PepT1序列设计引物,PCR扩增目的片段cDNA,扩增产物经纯化、克隆后测序。克隆测序片段为1 566 bp（DQ309694）,与其它动物已知PepT1序列比对,发现该片段位于第3~10跨膜结构域之间。牛测定序列与人、鼠、兔、羊、狗、鸡和猪PepT1相应片段核苷酸序列同源性分别为82.89%、80.14%、78.93%、96.04%、83.08%、63.90%和85.66%,相应片段氨基酸序列同源性分别为81.45%、79.62%、76.25%、94.06%、81.49%、61.41%和83.56%。对8种动物（牛、人、鼠、兔、羊、狗、鸡、猪）测序片段内氨基酸序列同源性分析表明,PepT1是高度保守的蛋白,其中跨膜结构域的氨基酸序列保守性高于膜外环。8种动物PepT1测序片段内各跨膜结构域的氨基酸序列同源性均在90%以上,第3、4、5、6、7、8、9和10跨膜结构域的氨基酸序列同源性分别为90.97%、91.07%、97.62%、93.45%、94.05%、91.67%、91.45%和95.83%。8种动物测序片段内膜外环的氨基酸序列同源性在70%~99%之间,以第4-5跨膜结构域之间膜外环的同源性最高,9-10跨膜结构域之间膜外环的同源性最低,3-4、4-5、5-6、6-7、7-8、8-9、9-10跨膜结构域之间膜外环的氨基酸序列同源性分别为77.63%、98.86%、86.72%、90.13%、91.25%、88.33%和71.74%。9-10结构域之间是1个位于细胞外的大膜外环,可能对底物的识别有重要作用,牛在此区域与鸡相同区域的氨基酸序列同源性仅为29.3%,与大鼠、狗、人、兔、猪和羊相应序列的同源性依次为65.17%、71.64%、67.16%、60.20%、73.13%和88.56%。对测序BPepT1片段编码蛋白的糖基化和磷酸化位点分析表明,测序片段编码蛋白共有6个N-糖基化位点和3个蛋白激酶C依赖性（PKC）磷酸化位点。  相似文献   

猪II型圆环病毒四川分离株鉴定及其ORF2基因序列分析     

王新  郭万柱  朱玲  徐志文  颜其贵  王印  王小玉  罗燕  周婷 《畜牧市场》2009,(11):21-22

猪圆环病毒（Porcinecircovirus,PCV）,属于圆环病毒科（Circoviridae）,圆环病毒属（Circovirus）,血清型为PCV—1和PCV－2。PCV—1首先由Tis2cher于1974年从PK-15猪肾传代细胞系中分离获得,PCV－2首先由Clark报道了是断奶仔猪多系统衰竭综合征（PMWS）的主要病原,  相似文献   

甲型流感H1N1也会感染犬   总被引：1，自引：0，他引：1  

李冰 《中国工作犬业》2009,(12):45-46

人类和甲流的战争还在持续中,现在已经殃及在人类最亲密的朋友——犬身上,我国发现首例狗感染甲流12009年11月25日,农业部接到中国农业大学报告,该校动物医学院临床医院按农业部要求,在门诊病例的52份发病犬鼻咽拭子样品中,检出2份样品呈甲型H1N1流感病原学阳性。基因序列分析表明,该病毒也与当前人群中流行病毒同源性为99‰属于同一种病毒。  相似文献   

4个品系西藏拟溞12S rRNA基因序列及其分子进化研究     

赵文  李睿 《大连水产学院学报》2012,27(4):300-305

应用线粒体12SrRNA基因序列对4个地理品系的西藏拟溞(纳木卡错品系、色林错品系、班戈湖品系、赛里木湖品系)进行分子系统发育研究,并结合GenBank中7种相近溞类的12S rRNA基因序列探讨了西藏拟溞的分子系统进化关系.结果表明,在4个品系西藏拟溞的4条12S rRNA基因序列中,A、T、G、C的平均含量分别为31.9％、32.45％、17.33％和17.95％,A+T的含量64.35％,G+C的含量为35.28％,A+T的含量明显高于G+C的含量,符合节肢动物A、T含量高的特点.聚类分析结果表明,西藏拟溞和其他溞属枝角类动物有着明显的遗传差异,说明西藏拟溞在枝角类生物学研究中有其独特的地位.遗传多样性计算结果表明:在4个品系的西藏拟溞中,纳木卡错品系与色林错品系以及纳木卡错品系与班戈湖品系的遗传相似性均较高,达98％左右;班戈湖品系与纳木卡错品系间的遗传距离最小,仅为0.0126,班戈湖与赛里木湖间的遗传距离最大,为0.0199;与其他溞属枝角类相比较,4个品系西藏拟溞种内差异相对不明显,而与其他溞种间的差异显著,西藏拟溞有着较高的遗传多样性水平.研究表明,12S rRNA基因序列包含有可靠的进化信息,可作为西藏拟溞种类鉴定良好的分子标记,同时利用这种分子标记法从分子系统进化方面证明了Daphnia tibetana和Daphniopsis tibetana Sars应分属于不同的种.  相似文献   

遗传距离     

《西北农业学报》2012,(9):188

1910年,Morgen TH提出假设:假定沿染色体长度上交换的发生具有同等的几率,那么两个基因位点间的距离可以决定减数分裂过程中发生重组染色体的发生率,即重组分数。重组分数的数值将随着两位点间距离的增大而增大。它是构建物理遗传图谱的基础,也是利用连锁分析将基因序列从染色  相似文献   

遗传距离     

《西北农业学报》2012,(4):153

1910年,Morgen TH提出假设:假定沿染色体长度上交换的发生具有同等的几率,那么两个基因位点间的距离可以决定减数分裂过程中发生重组染色体的发生率,即重组分数。重组分数的数值将随着两位点间距离的增大而增大。它是构建物理遗传图谱的基础,也是利用连锁分析将基因序列从染色  相似文献   

植物染色体遗传密码被破译     

毛磊 《河南林业》2000,(1):56-56

继人体首对染色体遗传密码被完整破译出之后，科学家们又在植物基因组测序研究领域获得新的突破。由欧美科学家组成的两个研究小组日前说，他们已完成对拟南芥植物第四号和第二号染色体完整基因序列的测定。这是科学家们首次完整地破译出植物染色体的遗传密码，它被认为是人类朝揭开植物王国深层奥秘迈出的重要一步。  相似文献   

我科学家精确测定毛竹一万余条基因序列——为禾本科植物研究提供了极其重要信息     

《园林科技》2009,(2):47-48

林业基因组学研究获得重点突破。我国林业科学家日前完成包括毛竹叶片、笋和萌发种子等在内的毛竹全长互补DNA文库构建，并精确测定1万余条基因序列。这是公共数据库继模式植物水稻和拟南芥以外的第三大植物全长互补DNA数据信息资源，不仅填补了禾本植物比较基因组学研究空白，还为开展基因组测序计划提供了有效的基因注释依据。  相似文献