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[目的]探讨适合舞毒蛾标本的保存和DNA提取方法,分析舞毒蛾标本的保存时间和保存方式对基因序列扩增的影响。[方法]利用SDS法、磁珠法以及E.Z.N.A.TM昆虫DNA提取试剂盒3种方法对舞毒蛾新鲜样本、干燥成虫标本和福尔马幼虫林标本进行DNA提取,并对3种方法提取DNA的浓度和纯度进行分析比较。利用1956年至1996年收集的舞毒蛾干燥成虫标本和福尔马林幼虫标本分析并比较保存时间和保存方式对15对COI基因(cytochrome oxidase subunit I)引物(目的片段长度为216 bp^977 bp)扩增成功率的影响。[结果]表明与SDS法和磁珠法相比,E.Z.N.A.TM昆虫DNA提取试剂盒对舞毒蛾3种标本的DNA提取效果最好,提取过程中未对标本DNA产生额外损伤。标本保存时间越久扩增长序列目的片段的成功率越低,福尔马林幼虫标本总体扩增成功率比干燥成虫标本的略高。[结论]E.Z.N.A.TM昆虫DNA提取试剂盒更适合舞毒蛾新鲜样本、干燥成虫标本和福尔马林幼虫标本的DNA提取。舞毒蛾标本的保存时间和保存方式均会对基因序列扩增产生影响。 相似文献
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采用PCR技术对来自山东荣成、长岛、俄罗斯和日本的刺参(Apostichopus japonicus),来自澳大利亚的黄乳海参(Holothuria fuscogilva),来自冰岛的北大西洋瓜参(Cucumaria frondosa)和来自福建的二色桌片参(Mensamaria interce-dens)的16SrRNA和COI基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为500bp和540bp的片段。通过统计变异位点、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数进行基因序列变异分析。结果表明,根据16SrRNA、COI基因片段进行刺参种内差异比较时,长岛和荣成刺参序列差异最小,和日本刺参序列差异最大;刺参和其他科3种海参种间的序列差异远远高于刺参种内差异。从GenBank中选取7条海参序列与本研究所测序列一同构建了NJ和ME系统树。根据2种基因片段的系统学分析均表明,刺参属和拟刺参属亲缘关系很近,可能有共同的起源。而海参科未与同属于楯手目(Aspidochirolida)的刺参科聚类,而与枝手目瓜参科和沙子鸡科聚为一支,与形态学的分类不一致。 相似文献
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以腹足纲，田螺科，螺蛳属（Ｍａｒｇａｒｙａ）的５种动物和中国圆田螺（对照）为研究对象，提取肝脏组织ＤＮＡ，ＰＣＲ扩增线粒体细胞色素Ｃ氧化酶Ｉ（ＣＯＩ）基因，纯化后测序，并用ＤＮＡＳｔａｒ软件包对序列进行编辑，ＭＥＧＡ软件绘制基因Ｎ－Ｊ树和ＵＰＧＭＡ系统树。结果表明：ＣＯＩ基因大小为６３６ｂｐ，系统树显示，螺蛳、滇池螺蛳、牟氏螺蛳、
乳顶螺蛳共同组成一个大支，阳宗海螺蛳与上述动物的亲缘关系较远，成为螺蛳属中单独进化的类群；中国圆田螺与螺蛳属动物的遗传距离达０．４０４％ ～０．５１８％，亲缘关系很远。 相似文献
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Javier Diéguez‐Uribeondo Félix Royo Catherine Souty‐Grosset Anne Ropiquet Frédéric Grandjean 《水产资源保护:海洋与淡水生态系统》2008,18(1):19-31
- 1. A study on the genetic variability of the white‐clawed crayfish was carried out based on mitochondrial cytochrome oxidase subunit I gene sequences. The sequences applied were more informative regarding white‐clawed crayfish genetic variability than others previously used.
- 2. Two haplotypes were found to exist in the Iberian Peninsula. The haplotypes exhibit a strong geographic subdivision (ΦST=0.83). One of the Iberian haplotype s was similar to north Italian haplotypes and the second differed in only one mutation. This pattern of genetic variability contrasts with those found in glacial refugial areas of France, Italy and the Balkan Peninsula.
- 3. Two hypotheses on the origin of the white‐clawed crayfish in the Iberian Peninsula are discussed: (i) one based on an anthropogenic origin, and (ii) a second based on a successive number of postglacial ancient and recent bottlenecks, i.e. the disjunction between Iberian and Italian populations of white‐clawed crayfish species is due to competition between A. italicus and A. pallipes, in addition to the impact of crayfish plague and human translocations.
- 4. New references for the white‐clawed crayfish in the Iberian Peninsula were found in medieval and Arabic texts. The results show that this species has been thriving in this peninsula since ancient periods and that its indigenous status should not be questioned.
- 5. Conservation action and plans should consider the low genetic diversity as a limitation for farm‐raising specimens more adapted and resistant to changing environments and diseases.
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试验测定了雉科4属7种的81条COI序列,获得片段长度为690 bp,并从Genbank、BOLD中获取21属46种的相应序列,进行了序列和系统发生分析。通过计算属间遗传距离,并以中华秋沙鸭(Mergus squamatus)、马来闭壳龟(Cuora amboinensis)为外群,用NJ法、ME法和ML法对雉科46种鸟类构建系统发育树,来探讨雉科内存在争议属的分类问题。结果表明:血雉与鹑类关系更近;雪鸡属与石鸡属关系很近;山鹑属始终与鹌鹑属聚在一起;勺鸡属与雉鹑属相邻而自成一个支;原鸡属与竹鸡属和鹧鸪属始终聚在一起;山鹧鸪属最先分化出来,在整个雉科类群的基部。 相似文献
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斑潜蝇隶属双翅目(Diptera)潜蝇科(Agromyzidae)斑潜蝇属(Liriomyza),是一类重要的农业害虫。近年来,随着海峡两岸果蔬贸易的快速发展,斑潜蝇类害虫传入大陆地区的风险明显增加,植物检疫部门急需该类害虫的快速鉴定技术和方法。本研究针对我国进境检疫性害虫三叶草斑潜蝇(L.trifolii),在检测和检索其线粒体DNA细胞色素氧化酶I(mtDNA COI)基因序列并与其近缘种美洲斑潜蝇(L.sati-vae)和南美斑潜蝇(L.huidobrensis)相同基因序列比对的基础上,设计并筛选了其种类识别特异引物,初步实现了三叶草斑潜蝇的快速鉴定。 相似文献
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Given the morphological characters of purple crabs identical with that of the tea-green ones except the body color, it is expected that the purple crabs and the tea-green ones were from the same species. In order to identify the phylogenetic relationships between them at the molecular level, we amplified and compared two conserved mitochondrial gene fragments of purple and tea-green crabs through PCR-SSCP and DNA sequencing analyses. The results showed that there was no distinct variation of DNA bands of both the CO1 and 16srRNA genes detected in polyacrylamide gels through SSCP analysis between purple and tea-green crab samples, and the following sequence analysis of color-different crab individuals presented 99.81% and 99.91% nucleotide sequence identity of the CO1 and 16srRNA genes respectively. These indicated that there was no species or subspecies differentiation between purple and tea-green crabs, meaning that they belonged to the same species, Portunus trituberculatus. 相似文献
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利用分子生物学技术对驯鹿狂蝇蛆及其成蝇（Ccphenemyia trompe）的线粒体COI基因种属特异性序列进行了研究。DNA核苷酸测序结果证实：中国内蒙古株驯鹿狂蝇蛆（C.trompe CIML）及其成蝇（C．trompe CIMA）线粒体COI种属特异性基因片段长度约为672bp～676bp。种系发生进化树分析显示：第三期幼虫与成蝇两者在核苷酸碱基序列上存在一定差异；它们与同种不同挪威株（C．trompel同源性较为接近：与同属不同种（C．stimulator和C．ulrichii）同源性稍差；与不同属种的羊狂蝇（Oestrusovis）同源性较远，狂蝇科不同属间序列差异明显，差异性在18．6％～23％之间；鹿蝇属不同种间差异性在1．9％～9．9％之间：驯鹿狂蝇不同株间差异性为0．9％。说明生物线粒体COI基因核苷酸序列在一定程度上．可反映出种属及株间在进化上的差异性。 相似文献
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测定了天津地区养殖的彭泽鲫、黄金鲫、乌克兰鳞鲤、鲤鱼4种共13尾鱼长度为814 bp的COI部分基因序列,以白鲢、罗非鱼作为外群.利用Mega4.1软件进行序列组成统计分析、种内及种间遗传距离分析,并用邻接法构建系统发育树（NJ树）,在NJ树上共发现由不同物种组成的5个分支,这与传统的分类学结果一致.该研究结果显示,COI基因部分序列不但可以作为物种辨识的良好DNA条码,而且在鲤科鱼类的种间系统发生关系分析方面也具有一定的适用性. 相似文献
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两种鲷属鱼类线粒体COI基因片段序列的比较 总被引：5，自引：0，他引：5
利用通用引物成功扩增了黄鳍鲷和黑鲷的线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基（COI）基因序列。通过序列测定，得到581bp的基因片段，碱基A、T、G、C平均含量分别为25．8％、32．6％、18．0％和23．6％，序列中的A＋T含量明显高于G＋C含量，与其他鱼类的C01基因片段研究结果相一致。通过序列分析发现黄鳍鲷和黑鲷两序列共存在14处碱基变异，其中在第19～139bp之间检测到13个变异位点，是变异频率较高的区段，可以考虑作为鲷属或者种群鉴别的分子标记。与黄鲷、真鲷、三长棘真鲷等鱼类比较，无插入和缺失位点，转换明显高于颠换。序列差异比较结果显示，真鲷与黄鳍鲷的序列差异在这5种鱼类中最大，达到了18．2％，黄鳍鲷和黑鲷的筹异最小（2．4％）。两个序列已提交到GenBank数据库中．序列臀录号为DQ185608和DQ185609. 相似文献