Identification of ALS inhibitor‐resistant Amaranthus biotypes using polymerase chain reaction amplification of specific alleles     

J Wagner  H U Haas  K Hurle 《Weed Research》2002,42(4):280-286

Summary Polymerase chain reaction (PCR) amplification of specific alleles (PASA) was adapted as a molecular marker‐based method for the rapid detection of point mutations in Amaranthus retroflexus and Amaranthus rudis leading to ALS inhibitor resistance. Two pairs of primers were designed for the specific amplification of alleles of the ALS gene of susceptible and resistant biotypes. The allele‐specific primer matched the desired allele, but mismatched the different allele at its 3′ end. Differentiation was carried out by comparison of the amplified DNA fragments in gel electrophoresis after PASA‐PCR. In A. rudis, differentiation was possible with one PCR and genomic DNA as probe. A ‘nested’ PCR was necessary for the differentiation of sensitive and resistant A. retroflexus. PASA is useful for the identification of resistant weed biotypes and also as a monitoring tool to map resistance occurrence and distribution. Advantages include the fast and clear separation of those plants with and without mutations at an early stage of development, its easy and consistent performance and quick results compared with existing resistance detection tests. These advantages, when combined with management strategies, enable further activities to reduce herbicide resistance.  相似文献   

昆虫病原线虫rDNA多态性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

丘雪红韩日畴  许再福 《昆虫天敌》2003,25(3):130-144

本文对国内外昆虫病原线虫斯氏属和异小杆属的47个品系进行rDNA—ITS PCR—RFLP分析，研究其DNA多态性，并构建了分子系统发育树状图。各品系的ITS区无明显的长度差异，PCR—RFLP分析将47个品系分为斯氏属和异小杆属两大类，两属线虫又分别分为11组和4组。所得结果丰富了ITS PCR—RFLP图谱库，为弄清我国的昆虫病原线虫与国外种类的分子系统发育关系及未定名线虫的鉴定提供重要依据，同时为筛选适合的线虫种类防治害虫奠定基础。  相似文献   

刺梨及其近缘种PCR实验体系的建立与优化   总被引：13，自引：2，他引：13  

文晓鹏  邓秀新 《果树学报》2003,20(1):35-39

以刺梨及其近缘种月季为试材,进行了RAPD-PCR实验参数的确立和优化试验。结果表明,刺梨及月季25μL反应体系的最优组成为2.5μL10×反应缓冲液,2mmol/LMg2+,0.2mmol/LdNTP,1.6mg/L模板DNA,0.4μmol/L随机引物和1.2UTaqDNA多聚酶。经PCR扩增验证,此反应体系亦适宜于刺梨的部分近缘种,可有效用于RAPD分析;通过将退火温度提高至50℃或采用“Touchdown”扩增程序,并在50μL反应体系中适当增加特异引物对浓度(1.0μmol/L),模板DNA(4.0mg/L)和TaqDNA多聚酶(3.0U/管)的使用量,建立起适合于刺梨特异DNA片段检测及回收的特异PCR扩增实验体系,为刺梨的分子克隆奠定了技术基础。  相似文献   

应用聚合酶链式反应鉴定新疆棉花落叶型黄萎病菌   总被引：9，自引：0，他引：9  

张莉  段维军  李国英  宋蓓 《植物检疫》2004,18(5):266-268

用一对棉花落叶型黄萎病菌的特异性引物D1和D2进行PCR扩增,对于落叶型黄萎病菌,该对引物可特异性地扩增产生一段550bp的产物,而非落叶型黄萎病菌则不能被扩增.供试的35个新疆黄萎菌系中,有3个菌系扩增出550bp大小的落叶型黄萎病菌特异性片段,表明目前新疆已存在落叶型黄萎病菌,用此技术可快速、准确地检疫和鉴定落叶型黄萎病菌.  相似文献   

新扬州鸡IGF-1基因多态性与早期生长速度关系的研究   总被引：9，自引：2，他引：9  

王志跃  范刚  杨海明  汪张贵  盛东风  刘桂琼 《中国家禽》2004,26(24):9-12

以150只非同胞新扬州鸡为材料，采用PCR—RFLP法检测了该基因5’调控区DNA序列多态性，并运用线性模型统计方法分析了多态性与初生重和12周龄体重的关系。结果显示：新扬州鸡IGF-1基因5、调控区自然存在两种不同DNA序列，经。PstⅠ酶切后出现3种基因型(“-／-”、“-／ ”、“ ／ ”)，基因型分布符合哈代一温伯格定律。各基因型个体的初生重、12周龄体重的最小二乘均数存在“-／-”＞“ ／-”＞“ ／ ”的趋势，且“-／-”型个体的12周龄体重显著高于“ ／ ”型个体(P＜0．05)。  相似文献   

三江白猪线粒体DNA-RFLP的分析     

杨隽李馨  耿忠诚 《黑龙江畜牧兽医》2004,(3):11-13

采用22种限制性内切酶分析了三江白猪线粒体DNA的多态性。结果表明：在60头个体中检出30种限制性态型．归结为7种基因单倍型；其间的差异来自少数限制性位点的突变。单倍型间平均遗传距离为0．35%，群体遗传多态程度为0．044％。三江白猪遗传多样性非常贫乏，说明三江白猪与地方种猪起源于一个共同祖先，在品种形成早期受到创立者效应的制约。  相似文献   

应用聚合酶链式反应(PCR)技术检测野猪的氟烷基因   总被引：2，自引：0，他引：2  

袁子国耿忠诚  靳锐迟兆江  李修明刘丽丽 陈建华 《黑龙江畜牧兽医》2005,(5):14-16

猪应激综合征(Procine Stress Syndrome,PSS)是指猪在应激因子的作用下发生恶性高热综合症(Malignant Hyperthermia Syndrome，MHS)。试验随机选取18头纯种野猪提取基因组DNA进行聚合酶链式反应，扩增得到RYR。基因特异片段，经过HhaⅠ酶切阳性鉴定可断定这18头猪的RYR1基因都没有发生突变，因此不存在猪应激综合征问题。  相似文献   

以催乳素受体基因作为撒坝猪部分生产性能候选基因的研究   总被引：8，自引：0，他引：8  

李国治  连林生  鲁绍雄  严达伟 《养猪》2005,(4):36-38

此文运用PCR-RFLP技术检测催乳素受体(PRLR)基因在撒坝猪群体中的多态性分布,并采用最小二乘分析模型初步统计分析基因多态性与部分生产性能的相关性。结果表明,PRLR基因等位基因B及其基因型BB在群体中占优势,频率分别为0.6594和0.4438;PRLR基因在群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态;头胎繁殖性状有利等位基因B对生长性状无不利影响。  相似文献   

利用血液蛋白及酶多态性分析技术鉴定山羊亲缘关系的研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

张涛  陈玉林  路宏朝  张恩平  张亚妮 《中国草食动物》2005,25(4):8-9

选择血红蛋白(Hb)、运铁蛋白(Tf)、亮氨酸胺肽酶(LAP)、前白蛋白3(Pa3)、淀粉酶(Amy)对可能为同卵双生波尔山羊的亲缘关系鉴定。结果发现，除淀粉酶(Amy)和亮氨酸胺肽酶(Lap)外，其余位点均有多态性。由蛋白位点的基因型判定羔1、羔2基因型完全一致，是供体后代的概率为75G，受体后代的概率为22．8％，从而确认羔1、羔2的双亲为供体公羊和供体母羊。  相似文献   

Rapid detection of contagious ecthyma by loop-mediated isothermal amplification and epidemiology in Jilin Province China     

Kai WANG  Hongze SHAO  Zhihua PEI  Guixue HU 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2016,78(1):125-128

The aim of this experiment was to develop a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay and to research the recent epidemiology of contagious ecthyma in Jilin Province, China, using the assay. A LAMP assay targeting a highly conserved region of the F1L gene was developed to detect contagious ecthyma virus (CEV). Three hundred and sixty-five cases from 64 flocks in 9 different areas of Jilin Province, China, from 2011 to 2014 were tested using the LAMP assay. The results showed that the sensitivity of the LAMP assay was 100 copies of the standard plasmid, which is 100-fold higher than the sensitivity of PCR. No cross-reactivity was observed with capripoxvirus, fowlpox virus, foot-and-mouth disease virus serotype O, foot-and-mouth disease virus serotype Asia I and bluetongue virus. The average positive rate was 19.73% (72/365), and the positive rate was highest in lambs aged 1–6 months. Our results demonstrated that CEV infection was very widespread in the flocks of Jilin Province and that the LAMP assay allows for easy, rapid, accurate and sensitive detection of CEV infection.  相似文献