团花树α扩展蛋白基因的克隆及表达分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

欧阳昆唏  李俊成  黄浩  刘明骞  陈晓阳 《林业科学》2013,49(9)

采用扩增保守区域、基因组步移及3'RACE技术,在团花树中克隆到15个α-expansin基因的cDNA序列,命名为AcEXPA2-16(GenBank注册号JF922686-JF922700),其相对应的基因组序列GenBank注册号为JF922701-JF922715.包括已知的AcEXPA1,这16个EXPA蛋白的大小及序列高度保守,包括N端的信号肽、3个外显子和2个内含子.通过氨基酸序列比对和系统进化树分析,AcEXPA1-16分为4个亚族,分别为A、B、C和D亚族.定量PCR分析显示AcEXPA1-16基因在同一组织中的表达存在冗余现象,而单个基因在不同的组织中又存在特异表达,尤其AcEXPA8在形成层中的表达水平极高.这表明AcEXPA8在木质部发生的过程中可能起到重要的作用.研究结果为在团花树中研究α-expansin基因与木质部的生长和材质的关系提供信息,并最终为林木分子育种提供潜在的候选基因.  相似文献   

不同O/L值花生品种油酸脱氢酶基因的时空表达特征     

殷冬梅  宋佳静  张幸果  王允  崔党群 《中国油料作物学报》2013,35(2):137

本研究以不同油酸/亚油酸比值（O/L比）花生品种为材料,利用实时荧光定量PCR技术,对四个不同O/L花生品种不同组织中油酸脱氢酶基因（FAD2）的表达进行相对定量分析。结果表明：FAD2基因在不同O/L基因型中组成型表达,其在根、茎、叶中表达量低,在花中表达量最高,显著高于荚果等其它组织中的表达量,且品种间差异达显著水平;花U606和花U12在花、幼荚、成熟荚果中的表达量呈依次下降趋势;花育17和狮油红4号在花、幼荚、成熟荚果中的表达量则呈现高-低-次高的表达趋势,差异达显著水平。    相似文献   

若干定性PCR方法部颁标准在检测转基因混合样品中的应用分析     

李美英  易小平  杨小亮  肖苏生  郭安平 《热带作物学报》2013,34(10):1955-1960

以若干定性PCR方法部颁标准对含有0.5％的4份不同转基因混合样品进行检测,先以通用元件标准中的CaMV35s启动子、NOS终止子对混合样品进行初步定性PCR筛选。结果表明,4份样品中都含有转基因成分。Bt基因特异性标准检测表明,3#和4#样品含有转基因抗虫水稻成分。构建特异性标准PCR检测表明,2#、3#和4#样品含有转基因GTS-40-3-2大豆成分。以MON810、Bt176、NK603转化体事件标准进行品系特异性PCR检测,结果证实：1#和4#样品中含有Bt176转基因玉米成分;3#样品中含有Mon810转基因玉米成分;4份样品中均不含NK603转基因玉米成分。说明农业部颁布的定性PCR方法标准能满足于对多种转基因混合样品的检测,且检测结果准确,可靠。  相似文献   

利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性     

肖冬来  陈丽华  陈宇航  杨菁  黄小菁 《热带作物学报》2013,34(12):2508-2512

以正红菇（Russula griseocarnosa）菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳（Denaturing Gradient Gel Electrophoresis）,获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性。同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,GroupⅠ主要为担子菌门（Basidiomycota）真菌,GroupⅡ主要为子囊菌门（Ascomycota）真菌,GroupⅢ为未知真菌,GroupⅣ主要为节肢动物门生物（Arthropoda）。  相似文献   

虎源大肠杆菌耐药性的检测与分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

薛原  李凤勇  孙静  柴龙会  吴庆明  周明  黄显光  华育平 《经济动物学报》2013,17(1):31-34

对黑龙江省哈尔滨市东北虎林园虎源大肠杆菌进行分离培养,开展大肠杆菌耐药性调查。采用纸片扩散法测定各分离菌株对14种抗生素的敏感性,结果表明:虎源大肠杆菌各分离株对各抗生素的敏感性不同。对氨苄西林高度耐药,耐药率为100%;对四环素、复方新诺明的耐药率也均在80%以上;对氨曲南、阿莫西林/克拉维酸钾敏感率为70%以上。  相似文献   

安徽白山羊不同组织miR-143表达丰度的Real-time PCR检测     

张晓东  凌英会  李运生  张运海  丁建平  章孝荣 《中国草食动物》2013,(2):5-8

MicroRNA(miRNA)是一类重要的非编码小RNA分子,其通过对靶基因的转录后调控广泛参与真核生物生殖、发育、病毒防御、细胞增殖和凋亡、脂肪代谢等多种生命活动。采取比较基因组学方法,在对其他7种哺乳动物直向同源基因序列分析的基础上,设计特异性引物,应用实时定量PCR技术测定安徽白山羊心、肝、脾、肺、肾、卵巢、子宫、输卵管、肌肉等9种组织中miR-143的表达情况。结果表明,依据同源基因设计的引物,可以进行山羊miR-143基因特异性检测。安徽白山羊miR-143表达丰度以肺脏最高,肝脏最低;7种组织相对表达量由高到低依次为:肺、子宫、心、脾和卵巢、输卵管和肌肉、肾、肝。研究结果为进一步研究miR-143在山羊组织分化及生长发育过程中的作用提供了借鉴。  相似文献   

针对fimW基因沙门氏菌的特异性PCR检测     

张江英  董立伟  王小舟  朱国强 《中国预防兽医学报》2013,35(10)

为建立沙门氏菌快速检测方法,本研究根据沙门氏菌Ⅰ型菌毛蛋白调控基因fimW设计一对引物,建立PCR检测方法,并对收集的A群～F群14个血清型40株沙门氏菌和5种12株非沙门氏菌菌株进行PCR扩增.结果显示所有沙门氏菌均扩增出与预期(477 bp)相符的特异性片段,而非沙门氏菌扩增结果均为阴性.另外,以肠炎沙门氏菌50336株DNA为模板,敏感性试验结果显示该方法可以检测出扩增体系中1pg DNA染色体和102cfu的沙门氏菌.表明本研究建立了检测沙门氏菌简洁、敏感、特异的PCR方法.  相似文献   

鸭源鸡杆菌双重PCR检测方法的初步建立     

皇甫和平  杨霞  赵军  王川庆  陈陆  常洪涛  王新卫  刘红英  姚慧霞 《中国预防兽医学报》2013,35(8)

为建立鸭源鸡杆菌(G.anatis)双重PCR检测方法,并对鸡杆菌分离株进行种类鉴定,本研究根据GenBank中G.anatis12656-12株的gtxA基因序列设计一对PCR引物,合成扩增rpoB基因的引物作为内参基因,建立了G.anatis双重PCR检测方法.检测结果显示:以G.anatis Yu-PDS-RZ-1-SLG株DNA为模板进行的双重PCR检测能够扩增出两条目的片段;其它16株细菌包括副鸡禽杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、沙门氏菌、福氏志贺菌和奇异变形杆菌均只扩增出了一条目的片段;该方法可以检测到浓度为6.5×102 cfu/mL的G.anatis;34株鸡杆菌分离株均扩增出了两条预期大小的目的片段.此外,序列分析结果表明,10株鸡杆菌河南分离株的rpoB基因序列与鸭源鸡杆菌种参考株(CCUG15563)的同源性最高(97.5％～99.0％),属于鸭源鸡杆菌种.本研究建立的G.anatis双重PCR检测方法,可用于含gtxA基因鸡杆菌菌株的鉴定及临床病原学诊断.  相似文献   

山羊和绵羊嗜血支原体PCR检测方法的建立与应用     

刘明明  张守发  贾立军  梁晚枫  薛书江  宋建臣 《中国预防兽医学报》2013,35(8):648-650

为建立羊嗜血支原体(M.ovis)病快速检测方法,本实验根据GenBank中登录的羊M.ovis 16S rRNA基因序列设计一对引物,以山羊和绵羊M.ovis基因组DNA为模板,建立M.ovis PCR检测方法,并进行特异性、敏感性及临床应用试验。结果显示,建立的M.ovis PCR检测方法扩增片段大小为508 bp,与GenBank中M.ovis参考株同源性达99%以上,该方法与猪嗜血支原体、牛嗜血支原体等病原体无交叉反应,最低检测40个拷贝的DNA;通过对延边地区60份山羊和绵羊血液样本的检测结果表明,建立的PCR检测方法具有特异、敏感、准确等优点,完全适用于M.ovis的检测。  相似文献   

鸡奇异变形杆菌的分离鉴定及药敏分析     

杨金丽  喻永福  王娟  赵德宏  李富祥 《上海畜牧兽医通讯》2013,(4):30-31

从云南某鸡场发病鸡肝脏中分离到一株革兰氏阴性多形性小杆菌,并进行生理生化鉴定、16SrDNA基因比对鉴定、致病性试验和药敏试验。试验结果表明：该分离株分解葡萄糖、乳糖、半乳糖和木糖,产酸产气,迅速分解尿素,H2S试验阳性,结合分离株的培养特性和革兰氏染色镜检结果,将分离株初步鉴定为鸡奇异变形杆菌;分离株16srDNA核苷酸序列与GenBank上其它鸡奇异变形杆菌之间的同源性高达99％～100％,与ALK428（基因登录号KC456557）为代表的许多奇异变形杆菌菌株之间的核苷酸同源性高达100％,将分离菌株进一步鉴定为鸡奇异变形杆菌;分离株对小白鼠有强致病性,对头孢噻肟敏感,对青霉素、氨苄西林、头孢噻吩、链霉素、卡那霉素、氧氟沙星、磺胺嘧啶、氟苯尼考等多种抗生素表现严重的多重耐药性。  相似文献