Inhibition of hirame rhabdovirus growth by RNA aptamers     

S D Hwang  N Midorikawa  P Punnarak  Y Kikuchi  H Kondo  I Hirono  T Aoki 《Journal of fish diseases》2012,35(12):927-934

RNA aptamers are artificial nucleic acids that specifically bind to a wide variety of targets. They are an effective tool for pharmaceutical research and development of antiviral agents. Here, we describe four Hirame rhabdovirus (HIRRV)‐RNA aptamers (H1, H2, H3 and H4) that we obtained from an in vitro process called the systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX). The HIRRV‐RNA aptamers specifically bind to HIRRV. Hirame natural embryo (HINAE) cells treated with virus and the RNA aptamer showed a decrease in appearance of cytopathic effect when compared with control (treated only with virus). Rhodovulum sulfidophilum was transformed with genes for the RNA aptamers, and the aptamers were detected in the culture medium, indicating that they were secreted from the cells. Thus, the recombinant R. sulfidophilum might be a powerful tool for the prevention of HIRRV in aquaculture.  相似文献   

草鱼肠系膜脂肪组织高质量总RNA提取方法的研究     

姜鹏  骆丽婷  李胜杰  樊佳佳  马冬梅 《水产科学》2021,(2):166-171

基于传统的酸性酚—异硫氰酸胍—氯仿一步提取法,比较分析多种优化操作步骤,摸索出一种高质量提取体质量为80～150 g草鱼肠系膜脂肪组织总RNA的改良方法.试验结果显示,相较于肝脏、脾脏、肠道等脏器组织,草鱼肠系膜脂肪组织RNA丰度低,且极易在样品前处理阶段出现顽固性降解问题.探索发现,将取样量增至约30 mg,可提升R...  相似文献   

饥饿和补偿生长对史氏鲟幼鱼摄食、生长和体成分的影响   总被引：18，自引：8，他引：18  

高露姣 《水产学报》2004,28(3):279-284

报道了饥饿和再投喂对史氏鲟幼鱼摄食、生长以及生化组成的影响.22±2℃条件下,随着饥饿时间延长,幼鱼白肌的RNA/DNA比值不断减小,体重逐渐下降,后者与同期对照组之间存在极显著性差异(P<0.01).饥饿7d,鱼的肝糖原和肌糖原含量显著降低(P<0.05),但随着饥饿时间的延长,肝糖原和肌糖原含量则出现不同程度的回升;脂肪含量和蛋白质含量分别在饥饿14d和21d时下降幅度最大,提示史氏鲟幼鱼动用储存物质的顺序依次是糖原、脂肪和蛋白质.而饥饿过程中鱼体水分和灰分含量则有所上升.恢复投食后,饥饿幼鱼的摄食强度增大,生长加快,其中7d、14d饥饿组幼鱼的RNA/DNA比值达到或接近正常投喂组水平,但21d饥饿组的比值仍明显低于正常投喂组(P<0.05).恢复投食30d后,7d和14d饥饿组幼鱼体重接近对照组(P>0.05),21d饥饿组的终体重未能赶上对照组(P<0.05),这表明史氏鲟幼鱼的补偿生长随饥饿时间不同而异.试验结束时,各处理组鱼体生化组成与正常投喂组没有显著差异(P>0.05).  相似文献   

利用DAD1反义片段转化创建菜薹可调控雄性不育材料   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈国菊  徐飞  雷建军  曹必好 《园艺学报》2009,36(5):685-692

 菜薹因为没有好的雄性不育材料或自交不亲和系,至今尚无一代杂种用于生产,根据拟南芥及白菜型油菜的花药不开裂基因DAD1的保守序列设计引物,扩增菜薹的DAD1基因片段（DAD1F）,构建反义DAD1F植物表达载体,用农杆菌介导法转化菜薹,对转基因植株进行分子检测,鉴定其雄性不育性并进行育性恢复试验.克隆得到的菜薹的DAD1基因片段大小为678 bp,命名为BrcpDAD1F,其序列与拟南芥和白菜型油菜的DAD1高度同源,同源率分别为88％和99％;共得到了12株转基因植株,有6株在转录水平上得到表达,表现为雄性不育,花器官畸形,花粉活力低,萌发率不到10％,且开花后不能结角果或结空角果,或者得到极少种子但种子不萌发;用对照的花粉给转基因植株授粉可使其正常结实.以500 μmol·L^-1茉莉酸甲酯处理可使其雄性不育得到恢复,花粉可以在柱头和培养基上萌发,具有受精能力。T₁代可育株与不育株的比例都呈1:3分离, T₂代不同株系的育性分离比例不同,有些株系继续呈1:3的分离,有些株系全是可育株或全是不育株,说明反义抑制呈单基因稳定遗传。  相似文献   

Cloning and characterization of transcripts differentially expressed in the pulp of ripening papaya     

João Paulo Fabi  Franco Maria LajoloJoão Roberto Oliveira do Nascimento 《Scientia Horticulturae》2009

  相似文献   

锦鲤保护性组织RNA提取及引物扩增研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

王亚军  刘必谦  吴立山  洪松柏 《水生态学杂志》2008,29(2):116-119

从养殖锦鲤各种组织中提取完整的RNA, 是分子生物学研究锦鲤应激表达、体色变异、生长发育等功能基因表达的关键实验。在不伤害养殖锦鲤个体健康的情况下, 取用鱼体的鳍条、鳞片、鳃丝、血液4种保护性组织,可以最大程度地减少对珍贵锦鲤个体的损伤, 并达到研究相关基因表达的目的。本研究利用TR izo l法提取RNA, 获得的各样品RNA条带完整、纯度高。结果表明, 4 种保护性组织提取的RNA 经过逆转录反应, 得到了高质量的CDNA。内标基因( B- actin)、热激蛋白基因( hsp70)、金属硫蛋白基因(MT)扩增得到清晰的条带, 通过NCB I数据上的BLAST比对证明, 各序列的同源性在95%以上。利用本研究的方法, 可以充分保护养殖锦鲤个体的完好性, 用于进一步的分子生物学研究。  相似文献   

二穗短柄草叶绿体RNA编辑位点的预测及其鉴定     

石文清  邓平川  李变丽  牛善策  聂小军  王乐  Abdul·Wahid·Baloch  宋卫宁 《麦类作物学报》2012,32(1):28-35

RNA编辑是陆生植物叶绿体转录后基因表达调控的一种重要方式。为进一步探讨单子叶植物RNA编辑功能及其发生机制,本研究通过生物信息学方法,对二穗短柄草叶绿体的81个蛋白编码基因的RNA编辑位点进行了预测和鉴定分析,结果发现78个基因存在编辑位点,共检测到176个编辑位点,都是C到U的转换。其中ndhB最多,为14个编辑位点。为验证预测结果,利用blast工具比对了NCBI的二穗短柄草EST数据库,最终确定存在于17个基因中的34个编辑位点是真实存在的,其中19个为沉默编辑,15个为有效编辑。与5个不同单子叶禾本科物种18个蛋白编码基因的RNA编辑位点的比较发现,在rpoB-206位点,只有二穗短柄草发生了编辑,且只有ndhD-295(293)为部分编辑位点。  相似文献   

富含多糖甜玉米幼穗RNA提取及高温胁迫基因表达分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

李余良  张丽华  赵楠  胡建广  刘建华  郑锦荣 《玉米科学》2013,21(4):38-41

以改良Trizol试剂法从富含多糖的甜玉米幼穗中提取高质量、完整的总RNA,利用实时荧光定量PCR对高温胁迫下粤甜13雌穗发育的8个差异表达基因进行分析。结果表明,8个基因分为上调表达和下调表达,实时荧光定量PCR和测序法基因表达谱检测的基因上调或下调表达的趋势一致,上调表达基因ZM2G058057和下调表达基因ZM2G059964、ZM2G044670相对表达量较高,可能在高温胁迫影响甜玉米幼雌穗发育过程中起更重要的作用。  相似文献   

RNA干扰技术在小麦中的应用研究进展     

柳觐  相微微  张怀刚 《麦类作物学报》2009,29(4):725-729

小麦是六倍体,其染色体组中存在着大量的同源基因,其育种的主要目标是获得可遗传的优良性状.RNA干扰(RNAi)是指由双链RNA介导的转录后基因沉默.该技术具有两大特点:一是可同时沉默多基因家族及多倍体中的同源基因;二是其沉默效应可在后代中稳定遗传.这使得RNAi在小麦功能基因组学和品质改良研究中的应用具有独特优势.本文对RNAi在小麦功能基因组学和品质改良研究中的应用及研究进展进行了总结,指出了目前存在的问题,并阐明了RNAi在小麦研究中的应用前景.  相似文献   

ApoB RNA编辑高效蛋白检测体系的构建     

李慧萍江文娇  齐庆远 《安徽农业科学》2014,(10):2865-2867

[目的]建立一个载脂蛋白B(apoB)RNA编辑蛋白检测体系。[方法]在慢病毒表达质粒载体pCSII-CMV-IRES-Neor中插入apoB RNA编辑保守序列,并在其2端嵌入红色荧光蛋白(DsRed)、绿色荧光蛋白(GFP)表达序列,以此慢病载体转染大鼠肝癌细胞系CBRH-7919获得稳定表达。采用共聚焦显微镜测序方法检测apoB RNA的编辑。[结果]目的指示基因能够在CBRH-7919细胞中稳定表达,表现出指征RNA编辑的多色特征。[结论]试验成功构建了在细胞水平上以颜色变化指示apoB RNA编辑的检测体系,该体系为快速检测以apoB RNA编辑为靶的降胆固醇药物筛选提供了基础。  相似文献