基于转录组数据分析环形泰勒虫对诱导宿主细胞转化相关基因的影响     

赵保才  赵帅阳  关贵全  罗建勋  曹天行  张志刚  石苗  刘军龙  赵洪喜 《畜牧兽医学报》2022,53(12):4398-4409

本试验主要通过研究布帕伐醌(BW720)处理前后,环形泰勒虫转化牛单核细胞(TaNM Ⅰ)转录组数据的变化情况,为进一步研究环形泰勒虫诱导宿主细胞转化的分子机制奠定基础。以环形泰勒虫感染的牛单核细胞为试验材料,设置对照组(二甲基亚砜,DMSO)和试验组(BW720),利用Illumina HiSeq4000测序平台进行高通量测序,将测序得到的原始数据(Raw reads)与GenBank和Rfam数据库进行比对过滤,通过质控获得最终数据(Clean read)。利用Venn分析软件筛选出DMSO组和BW720组中差异表达明显的基因,进行功能注释(GO)以及信号通路(KEGG)分析。随机选择10个基因,利用荧光定量PCR (qPCR)检测基因在不同处理条件下细胞中的表达量。在验证测序结果的准确性后,选出差异表达明显的基因,分析其在TaNM Ⅰ细胞的凋亡、增殖等信号通路方面的作用。结果显示：BW720组和DMSO组中分别得到6 854 019 704和6 627 265 854条Raw reads,过滤、质控后分别得到22 925 606和22 171 427条Clean reads。BW720组和DMSO组中筛选出差异表达明显的基因共计4 054个(P＜0.05),其中,2 146个基因显著上调,1 908个基因显著下调;进一步筛选出共同差异表达的基因367个,其中,显著上调的196个,显著下调的171个。同时,qPCR验证随机选择10个基因的表达趋势与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠。然后对差异表达基因进行GO功能注释,筛选到与细胞增殖相关的20个生物学过程、15个细胞组分以及11个分子功能条目。KEGG富集分析结果显示,在Top20的信号通路中筛选出与环形泰勒虫转化细胞有关的一些信号通路,如：癌症信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。对这些信号通路进一步分析发现：PI3KR3、FOXO1、IL23A、FZD3、AKT、MMP9等基因在环形泰勒虫转化细胞的研究中也有相关文献的报道。本研究表明,在TaNM Ⅰ细胞中DAPK1、FZD3、FOXO3、PI3KR3等可能在感染细胞无限增殖的过程中发挥作用,为后续研究TaNM Ⅰ细胞无限增殖机制奠定了基础。  相似文献   

连花柴芩可溶性粉对鸡风热犯肺证的临床试验研究     

王学方  归荣  陈功义  王伟  张红英  王学兵  李晓 《中国畜牧兽医》2022,49(9):3610-3621

【目的】 研究连花柴芩可溶性粉对风热犯肺所导致的鸡发热、咳嗽、食欲减退、口渴喜饮等证候的临床疗效。【方法】 采用鸡传染性支气管炎病毒人工攻毒建立风热犯肺证肉鸡病例模型,将出现典型风热犯肺证临床症状的150只鸡纳入到试验中,并随机分为5组,30只/组,分别为连花柴芩可溶性粉高、中、低剂量组（连花柴芩可溶性粉浓度分别为4、2、1 g/L）,麻杏石甘颗粒药物对照组（1 g/L）,模型对照组,另设30只为健康对照组。除健康对照组和模型对照组外,各试验组连续饮水给药5 d,记录给药前后鸡的精神状态、体温、呼吸道症状、采食及饮水的变化,并检测各组鸡的免疫器官指数、外周血免疫细胞亚群指标,综合考察连花柴芩可溶性粉的临床疗效。【结果】 连花柴芩可溶性粉高、中剂量组对风热犯肺所致的鸡发热、咳嗽的总有效率分别为90.00%和86.66%,显著高于模型对照组（P<0.05）,且对病鸡采食量下降、饮水量增多具有较好的缓解效果（P<0.05）;连花柴芩可溶性粉能提高病鸡免疫器官指数,促进病鸡外周血中CD3⁺、CD4⁺、CD8⁺ T淋巴细胞增殖,且连花柴芩可溶性粉高、中剂量显著高于模型对照组（P<0.05）。【结论】 连花柴芩可溶性粉对风热犯肺所致的鸡发热、咳嗽、食欲减退、口渴喜饮具有较好的缓解和治疗效果,结合药物量效关系和经济成本等因素综合考虑,推荐连花柴芩可溶性粉临床应用剂量为2 g/L,饮水给药,连用5 d。  相似文献   

马尾松中龄施肥木材密度和干缩率的研究     

夏玉芳 《浙江林业科技》2001,21(6):1-5,13

选用广西马尾松龄施肥材料（连续观测13年），根据国际《木材物理力学试验方法》，研究了施肥对木材密度和干缩率的影响，结果表明：N、P、K三要素中，以N、P肥对木材密度和干缩率的影响较大。⑴总的来说P增加木材密度和干缩率，N肥降低木材密度木材干缩率。N、P肥降低木材差异干缩。施K肥对木材密度和干缩率的影响规律性不明显。⑵N、P、K施肥对木材密度和干缩率的影响及其变化程度，与肥种、施肥量、树干部位、木纹方向、气干或全干状态有关。施P肥木材密度具有增加的趋势，而且树干下部基本密度方差分析各处理间差异显著。N、K肥对木材密度的影响，规律性不明显。P肥使木材干缩率增加，P肥主要增加的是全干干缩率和径向气干干缩率，特别是树干下部径向气干干缩率各处理间差异显著。K肥对干缩率的影响规律性不明显，有待进一步研究。⑶为了保证木材质量，对于纤维用材林，主要施P肥；对于结构用材林，可施P肥，适当考虑N肥、K肥施用应慎重。  相似文献   

雷公藤和昆明山海棠形态变异的研究   总被引：8，自引：3，他引：8  

斯金平  阮秀春  郭宝林  许元科  黄文华 《浙江林业科技》2005,25(1):1-4

对雷公藤种质资源进行调查,建立种质资源收集库,定期观察雷公藤表型性状,研究形态标记的遗传变异,结果表明,雷公藤与昆明山海棠的叶片大小、叶背白粉、花序大小等主要分类特征存在显著的差异,但其变异是连续的,而且地理分布也是连续的;昆明山海棠、雷公藤均能适应长江流域的气候条件,但不同种源生长情况及主要活性成分含量存在明显的差异.雷公藤与昆明山海棠现行分类问题值得商榷,两者应属同一种植物,雷公藤与昆明山海棠的遗传多样性预示着遗传改良具有巨大的潜力.  相似文献   

哈茨木霉天冬氨酸蛋白酶基因SA76的3＇RACE扩增和序列分析     

刘燕  杨谦 《林业研究》2007,18(2):139-143

由EST获得全长cDNA对于结构基因组学和功能基因组学都是至关重要的,cDNA末端快速扩增技术RACE是该领域中的重要研究方法.利用BD SMART RACE技术扩增编码分泌天冬氨酸蛋白酶SA76基因的3＇末端,将其与哈茨木霉cDNA文库中的SA76基因的EST序列进行序列拼接,获得2019bp的全长cDNA序列,其开放读码框长1593bp,5＇非编码区266bp,3＇非编码区201bp,编码530个氨基酸,有信号肽.哈茨木霉天冬氨酸蛋白酶基因与玉蜀黍赤霉、粗糙脉孢菌、球毛壳菌天冬氨酸蛋白酶基因的同源性分别为53%, 37%, 36%.利用BD SMART RACE技术首次从哈茨木霉中克隆天冬氨酸蛋白酶基因,为验证SA76基因的功能奠定基础,为进一步研究蛋白酶的作用机制及生物防治功能提供依据.  相似文献   

南方铁杉与长苞铁杉物理力学性质研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

李平宇 《福建林业科技》1993,20(1):16-23

本文对产于福建省武夷山市的南方铁杉和连城县的长苞铁杉进行了较系统的材性试验研究,提供了必要的该铁杉属木材的物理力学性质指标。  相似文献   

Comparing the model forms estimating generalised diameter-height relationships in Tecomella undulata plantations in hot arid region of India   总被引：1，自引：0，他引：1  

Vindhya Prasad Tewari 《林业研究》2007,18(4):255-260

Four generalised diameter-height equations were developed and compared for pure and even-aged stands of Tecomella undulata in hot arid region of Rajasthan State in India. The data used to fit the equations consisted of 1 540 diameter-height observations collected from the plots laid out in uniformly stocked stands of varying age and density. The performance of four equations was tested by non-linear least squares regression and evaluated using different statistical criteria. Finally, these equations, with the same values of coefficients ob- tained during the fitting phase, were validated by an independent data set consisting of 854 diameter-height observations. Overall, equation （4） （Hui and Gadow function） was found to perform best for both the fitting data set as well as validation data set.  相似文献   

稳定表达山羊SLAM受体的BHK-21细胞系的建立及应用     

张家林  李翠翠  谢梅梅  王子龙  陈伟业  步志高 《中国预防兽医学报》2015,37(7)

信号淋巴激活分子(SLAM)又称为CD150,是小反刍兽疫病毒(PPRV)和犬瘟热病毒(CDV)等麻疹病毒属病毒感染淋巴细胞的主要受体,在病毒侵入细胞中发挥重要作用。为建立稳定表达山羊SLAM(g SLAM)的真核细胞系,本研究将人工合成的g SLAM基因克隆至真核表达质粒p IRESpuro3中,并在该基因的3'端引入Flag标签序列作为分子标记,构建了重组质粒p IRES3-g SLAM。将该重组质粒转染BHK-21细胞,经嘌呤霉素加压筛选及采用表达绿色荧光蛋白(GFP)的重组PPRV病毒(r PPRV/GFP)感染鉴定后,筛选到稳定表达g SLAM基因的细胞系。r PPRV/GFP感染和western blot鉴定表明,无论是否有嘌呤霉素压力的存在,该细胞系在传代至第20代,仍能稳定表达g SLAM蛋白。由于g SLAM氨基酸序列与犬的同源性较高,以表达GFP重组CDV强毒株(r CDV/GFP)感染该细胞系,病毒可以感染且能形成明显的细胞病变,表明该细胞系可用于CDV强毒分离和致弱机制等相关研究。  相似文献   

SUSCEPTIBILITY ARTIFACTS ON T2*‐WEIGHTED MAGNETIC RESONANCE IMAGING OF THE CANINE AND FELINE SPINE          下载免费PDF全文

Laura J. Hammond  Silke Hecht 《Veterinary radiology & ultrasound》2015,56(4):398-406

The T2*‐weighted gradient recalled echo sequence is a sensitive means to detect blood degradation products. While not a routine sequence in magnetic resonance imaging of the spine in small animals, it can provide additional valuable information in select cases. The goal of this retrospective, cross‐sectional study was to describe findings when acquiring this sequence during magnetic resonance imaging examination of the spine in small animals. The University of Tennessee's veterinary radiology database was searched for dogs and cats that underwent magnetic resonance imaging for suspect spinal disease in which a T2*‐weighted gradient recalled echo sequence was acquired and susceptibility artifact was identified. The following information was recorded: signalment, clinical signs, location and appearance of susceptibility artifact, and final diagnosis. Thirty‐nine cases were included in the study. Extradural susceptibility artifacts were observed in cases of intervertebral disc herniation with or without associated hemorrhage (n = 28), extradural hemorrhage associated with spinal trauma (n = 2), hemophilia (n = 1), and in a cystic extradural mass (n = 1). Remaining lesions displaying susceptibility artifact were intramedullary and included presumptive acute noncompressive nucleus pulposus extrusion (n = 2), hematoma (n = 1), hemangiosarcoma metastasis (n = 1), intramedullary disc extrusion (n = 1), presumptive meningomyelitis (n = 1), and a mass of undetermined etiology (n = 1). Inclusion of a T2*‐weighted gradient recalled echo sequence may be helpful in spinal magnetic resonance imaging when standard imaging sequences are ambiguous or intramedullary lesions are observed.  相似文献   

Development and application of multiple immunofluorescence staining for diagnostic cytology of canine and feline lymphoma          下载免费PDF全文

Mariko Sawa  Akira Yabuki  Asuka Setoguchi  Osamu Yamato 《Veterinary clinical pathology / American Society for Veterinary Clinical Pathology》2015,44(4):580-585

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