鳜hepcidin cDNA的分子克隆及序列分析   总被引：6，自引：0，他引：6  

刘碧莲  白俊杰  劳海华  叶星  简清 《中国水产科学》2006,13(6):995-1000

Hepcidin是近年来发现的一类具有独特性质的抗菌肽，根据C-enBank中收录的鱼类抗菌肽hepcidin的cDNA序列设计一对简并引物，用RT-PCR方法从鳜（Sinipercachuatsi）肝脏组织中克隆到hepcidin的cDNA，并构建pMD18-T-hep-cidin载体进行序列测定和分析。结果表明，该cDNA长为381bp，其中第20-277位是该基因的开放阅读框（ORF），编码86个氨基酸，形成由信号肽（24个残基）、前肽（42个残基）和成熟肽（20个残基）3部分序列组成的前体肽，与已报道的其他鲈形目鱼类hepcidin相比较，核苷酸序列的同源性为72．2％-92．0％，所推导的成熟肽与包括人类在内的其他生物hepcidin成熟肽的同源性在50％-86．4％，都含有8个保守的cys残基，可形成4个链内二硫键。鳜hepcidin cDNA片段的获得为以后的重组表达奠定了实验基础，也为抗菌肽hepcidin家族找到了新的成员。  相似文献   

翘嘴红鲌肝脏G6Pase催化亚基的克隆以及摄食和饲料中碳水化合物对其表达的影响   总被引：4，自引：0，他引：4  

唐永凯  俞菊华  刘波  戈贤平 《水产学报》2007,31(1)

本文采用RT-PCR和RACE法分离、克隆了翘嘴红鲌G6Pase催化亚基基因全长cDNA,共1900 bp [不含poly(A)], 包括49 bp 5'非翻译区,1068 bp阅读框以及含Poly(A)信号AATAAA的778 bp 3'非翻译区[不包括Poly(A)].阅读框共编码355个氨基酸,分子量为39.89 ku.序列比对分析表明翘嘴红鲌G6Pase与斑马鱼G6Pase的相似性高达95%,与鼠、狗、人G6Pase的相似性为63%,和光滑爪蟾、金头鲷、河豚等G6Pase的相似性分别为69%、55%、76%,并具有G6Pase特有的3个保守基序.为了研究摄食以及饲料中碳水化合物对G6Pase的影响,使用实时定量RT-PCR分别测定了饲喂等能但不含碳水化合物和含23.98%碳水化合物的饲料的翘嘴红鲌肝脏G6Pase基因的表达水平,在使用上述饲料饲喂8周后,禁食48 h, 然后测定禁食和摄食后3、6、12、24 h G6Pase mRNA的表达量,结果显示摄食后12 h,两组G6Pase的表达明显增加,说明摄食影响G6Pase基因的表达,禁食和摄食后3～12 h,含糖组G6Pase基因的表达量为无糖组的2～4倍,这表明碳水化合物可以诱导G6Pase mRNA的表达.  相似文献   

鹅FSHβ基因克隆及序列分析     

李欣钰  陈阳  俞钦明  徐琪  何娇娇  兰旅涛  陈国宏 《中国家禽》2014,(2)

促卵泡激素β亚基(FSHβ)基因是动物繁殖性状的一个重要候选基因,对鹅产蛋量具有重要的调节作用。本研究以鹅垂体组织总RNA反转录的cDNA为模板,分别采用RT-PCR和RACE技术扩增鹅FSHβcDNA序列,包含:16 bp 5′UTR,396 bp开放阅读框(ORF)和3′端非翻译区2个不同的剪接体,其大小分别为518 bp和780 bp。经生物信息学软件分析,发现鹅FSHβ基因编码的蛋白为亲水蛋白,且存在信号肽序列切割位点,则推测其为分泌蛋白。本研究首次成功获得了鹅FSHβ基因的cDNA全长序列并进行了分析,可为全面解析鹅FSHβ基因的分子结构及功能提供一定的参考。  相似文献   

专家文库     

曾智勇 《动物科学与动物医学》2014,(3):4-4

曾智勇,男,1978年9月生,四川威远人,博士,贵州大学教授、硕士研究生导师、贵州大学学术骨干、动物科学学院本科教学实验中心主任,贵阳市科技特派员。2001年毕业于四川农业大学兽医专业;2001-2006年于四川农业大学预防兽医学专业硕博连读,获农学博士学位。2006年12月毕业至今,于贵州大学动物科学学院从事教学科研工作。  相似文献   

(捺)叶片β-羟脂酰-CoA脱水酶(HCD)基因全长cDNA的分离与表达研究     

赵利  王玉珍  吕恃衡  潘东明  姜翠翠  陈桂信 《北方园艺》2014,(16)

以(Prunus salicina Lindl.var.cordataJ.Y.Zhangetal)5个不同生长发育时期叶片为试材,根据已构建的5个不同生长发育时期叶片的均一化全长cDNA文库,分离得到了一个羟脂酰-CoA脱水酶(HCD)基因,命名为PsHCD。对PsHCD基因生物信息进行分析,同时利用Real-time PCR检测PsHCD基因在叶片中5个不同生长发育时期的表达量。结果表明:该基因的cDNA开放阅读框编码区为第322个核苷酸到第987个核苷酸,编码221个氨基酸残基,5′UTR长度为321bp,3′UTR长度为156bp。利用TMHMM server软件分析,该基因编码的蛋白质有4个跨膜区域,PSORTⅡPrediction软件分析推测,亚细胞定位于内质网、微体和溶酶体中。实时荧光定量PCR结果表明,PsHCD的表达量随着叶片生长逐渐升高,在展开叶时达到最高峰,在幼叶到成熟叶时处于一种稳定水平,随后降低,老叶表达量最低。  相似文献   

长白山野生膜荚黄芪cDNA文库的构建与初步鉴定     

秦嘉泽  全雪丽  田海丽  具红光  吴松权 《北方园艺》2014,(24)

以长白山区野生膜荚黄芪根和叶为试材,参照TRIzoL说明书提取总RNA,采用SMART技术构建其全长cDNA文库,为分子水平上揭示膜荚黄芪次生代谢调控机制提供充足的基因资源。结果表明:原始文库滴度为4.8×105 cfu/mL,重组率接近99.1%,插入片段大于0.5kb,平均大小1.54kb。所构建的cDNA文库的库容量、克隆效率和全长率满足挖掘膜荚黄芪次生代谢相关基因的要求。  相似文献   

奥利亚罗非鱼DMO cDNA的分离和克隆     

唐永凯 《水产学报》2005,29(3):300-306

采用RTPCR和RACE法分离和测定了奥利亚罗非鱼DMOcDNA的全序列。得到1571bp[不含poly(A)]的全长cDNA,包括148bp5’非翻译区,1230bp阅读框以及含Poly(A)信号AATAAA的193bp3’非翻译区[不包括Poly(A)]。阅读框共编码409氨基酸,与尼罗罗非鱼DMO编码的氨基酸序列进行比较,同源性为96.3%,表明DMO在同一物种中差别较小。而与尼罗罗非鱼,红鳍东方豚,虹鳟,青鱼将,鼠,人等动物的DMRT1编码的氨基酸序列进行比较,同源性分别为:25.7%,25.8%,24.3%,29.7%,22.5%,22.0%,这说明DMO和DMRT1可能是两个不同的基因。  相似文献   

鲤（Cyprinus carpio）生长激素cDNA的分子克隆及其DNA序列的比较↑（*）          下载免费PDF全文

赵晓祥  杨学成  李晶  李莹  张淑梅  杨志兴 《中国水产科学》1995,2(5)

  相似文献   

羊驼核糖体蛋白S5(RPS5)全长基因的筛选及其序列分析     

李鹏飞  董常生  杜海燕  范瑞文  白瑞  朱芷葳 《畜禽业》2006,(24):6-9

本研究利用southernblotting技术从羊驼皮肤cDNA文库中筛选出核糖体蛋白S5(RibosomalproteinS5,RPS5)基因,测序结果表明该片断大小为436bp,含有一个完整的ORF。并利用生物信息学方法对该基因进行了分析,发现该基因编码的氨基酸在第1到88位之间含有一个典型的CARD结构域,即六个反平行的螺旋结构形成的结构域,该结构域对RPS5基因功能的体现起决定作用。  相似文献   

草鱼生长激素cDNA基因的克隆及序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

杨瑶  张海萍  张爱萍  周天强 《水产养殖》2001,(3):32-35

通过反转录PCR技术，从草鱼脑垂体的总RNA中获得一特异cDNA片段，经克隆后测序，结果表明，该片段长633bp，与报道的草鱼生长激素基因相比，有10个碱基的差异，而推导的蛋白质仅1个氨基酸残基的差异，推测为草鱼生长激素cDNA基因。  相似文献