H9亚型禽流感病毒实时荧光RT-PCR检测方法的建立与应用     

王楷宬  王素春  樊擎莹  孙亚伟  康京丽  汪洋  刘华雷  黄保续 《中国动物检疫》2019,36(12):52-57

为建立一种快速准确检测H9亚型禽流感病毒基因的检测方法,根据GenBank中H9亚型禽流感病毒血凝素编码基因进行荧光检测引物和探针设计,建立了一种针对H9亚型禽流感病毒的荧光RT-PCR检测方法。利用该方法进行灵敏度和特异性检测,并用本方法和国家标准中的荧光RT-PCR检测方法,同时对临床样本进行检测。结果显示,仅H9亚型禽流感病毒出现了正常荧光检测曲线,而其他病毒及阴性对照均未出现;检测灵敏度为RNA终浓度10~(-4) ng/μL(1.30×10~4 copies/μL);临床样本检测结果与国标方法一致,符合率为100%。结果表明,该方法特异性强、灵敏度高,可用于H9亚型禽流感病毒检测。  相似文献   

H5亚型高致病性禽流感病毒抗原性变异分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

蒋文明  李金平  侯广宇  彭程  刘朔  王素春  张玉新  陈继明 《中国动物检疫》2016,33(9):27-32

为深入了解我国H5亚型高致病性禽流感病毒的抗原性变异情况及其规律,对我国2012—2015年分离的H5亚型高致病性禽流感病毒进行了HA基因的扩增、测序与遗传进化分析。结果发现这些流行毒株主要分布在第2.3.2.1分支、第2.3.4.4分支和第7.2分支。制备流行毒株的单因子阳性血清,与相应疫苗株进行交叉血凝抑制试验,计算抗原相关系数,并对各分支流行毒与相应疫苗之间的HA1主要抗原位点差异进行分析。结果表明,Re-4、Re-5、Re-6、Re-7、Re-8疫苗株之间的血凝抑制抗原相关系数在0.17~0.67之间,表明不同分支之间的抗原性有较大差异。随着时间的推移,分支内流行毒与疫苗之间的血凝抑制抗原相关性差异会越来越大,抗原性变异程度增加,这与HA1主要抗原位点差异分析的结果一致。因此,要取得理想的防控效果,必须及时更新疫苗,使用与流行毒匹配性更好的疫苗。这些数据为深入了解H5亚型高致病性禽流感病毒的抗原变异和对该病毒的防控提供了技术支持。  相似文献   

高通量测序技术检测鸽群中病毒感染状况     

王楷宬  庄青叶  邱源  刘朔  王素春  彭程 《中国动物检疫》2018,35(5):81-84

为了解我国鸽子病毒感染状况,采用高通量测序方法,对华东地区肉鸽携带的病原进行了检测,共检测到5种主要感染病原,包括禽轮状病毒、鸽圆环病毒、鸽星状病毒、鸽冠状病毒和鸽微RNA病毒B。除鸽圆环病毒外,其余4种病毒均在我国鸽群中首次被发现。该检测结果对我国的鸽群疫病监测和防控具有重要意义,同时证实高通量技术能够检测出动物群体中的主要感染病原,是动物疫病检测的新思路,有利于全面掌握动物病原感染状况,及时预警、处置和防控动物疫病的发生。  相似文献   

通用引物扩增甲型流感病毒基因组及其高通量测序     

王楷宬  邱源  纪海旺  彭程  庄青叶  王通  王素春  于建敏  许荣强  陈继明 《中国动物检疫》2017,34(1):90-93

为探索使用高通量测序方法测定甲型流感病毒的基因组,设计了一对通用引物进行甲型流感病毒全基因组的RT-PCR扩增,并分析了该方法的敏感性。结果显示,该方法能够扩增的甲型流感病毒多种亚型的全部8个节段的基因,其扩增敏感性为100 pg RNA。  相似文献   

2014—2016年华东地区某市活禽市场禽流感流行病学调查与分析     

蒋文明  王艳  李金平  侯广宇  彭程  刘朔  王素春  黄保续  陈继明 《中国动物检疫》2017,34(1):14-18

为了解华东地区某市活禽市场中禽流感病毒的污染状况,2014—2016年对该市活禽市场的家禽进行了禽流感流行病学调查。结果显示:该市活禽市场禽流感病毒污染面较广,94.12%的市场存在禽流感病毒污染;H9N2亚型病毒感染率较高,样品总体阳性率为22.66%,场点总阳性率为94.12%;H7N9亚型病毒感染率经历了一个升降过程,2015年上半年达到高峰,之后显著降低;农贸市场中的H7N9亚型病毒分离率显著高于批发市场。本次调查未在活禽市场中检出H5亚型高致病性禽流感病毒。这些数据为深入了解活禽市场中禽流感病毒的污染状况和该病防控措施的制定提供了技术支持。  相似文献   

鄱阳湖与青海湖地区野鸟H9N2亚型禽流感病毒的生物学特性     

蒋文明  侯广宇  彭程  王素春  李金平  陈继明 《中国动物检疫》2017,34(6):10-13

为了解我国野鸟中H9N2亚型禽流感病毒的分布与特征,2015—2016年对鄱阳湖与青海湖地区野鸟中的H9N2病毒进行监测,结果共分离到12株H9N2亚型禽流感病毒。对分离的病毒进行HA和NA基因序列测定、受体分析和SPF鸡、Balb/c小鼠的感染性试验,结果显示:12个分离株的HA裂解位点基序均为PSRSSR/GLF,符合低致病性禽流感病毒的分子特征;HA蛋白受体结合位点处第226位氨基酸残基为亮氨酸(L),具有结合人样流感病毒受体的分子特征;受体结合试验表明,分离毒株既能结合禽样受体,也能结合人样受体;SPF鸡攻毒试验表明,分离株为低致病性毒株;Balb/c小鼠的感染性试验表明,分离株只在小鼠的上呼吸道鼻甲和肺中有限复制,未见明显临床症状。  相似文献   

禽星状病毒研究进展     

张富友  邓春冉  王素春  于晓慧  蒋文明  尹馨  李金平  王楷宬  刘华雷  徐丽娜  李阳 《中国动物检疫》2022,39(5):83-91

禽星状病毒(avian astrovirus,AAstV)属于星状病毒科,包含多种亚型,可以引发禽肾炎、鸭肝炎以及火鸡腹泻等多种疾病,禽类感染后表现生长发育迟缓、产蛋下降,严重时可导致死亡,给养殖业造成一定的损失.此外,AAstV具有感染人的潜在风险.目前AAstV的致病机理暂不清楚,只有火鸡星状病毒引发肠炎的致病机制...  相似文献   

临床样本中水貂嵌杯病毒的全基因组分析     

王楷宬  庄青叶  邱源  王素春  侯广宇 《畜牧兽医学报》2018,(4)

为分析水貂嵌杯病毒中国株的特性,采用高通量测序方法测定青岛某养殖场检测的水貂嵌杯病毒的基因组,并对其进行特性分析与比较基因组研究。结果显示,该病毒全基因大小为8 427bp,具有与其他嵌杯病毒相似的结构和基因顺序,5′端具有帽子结构,3′端具有A尾,其与19株代表性毒株的全基因组和衣壳蛋白氨基酸序列同源性分析都证实该病毒与我国2011年报道的水貂嵌杯病毒同源性高,BLAST进一步确认该病毒不属水貂肠道嵌杯病毒,分析结果也对了解嵌杯病毒中各种未分属病毒的分类提供参考。  相似文献   

H5、H7和H9亚型禽流感病毒四重荧光RT-PCR检测方法的建立与应用     

王素春  仲焕香  姜楠  姜利建  潘子豪  孙福亮  刘华雷  黄保续  王楷宬 《畜牧兽医学报》2020,51(6):1429-1437

旨在提高对禽流感病毒（avian influenza virus，AIV）检测效率，及时发现疫病。本研究通过分析M基因以及H5、H7和H9亚型的HA基因序列保守区域，设计并合成了相关探针和引物，建立了禽流感病毒（AIV）四重荧光RT-PCR检测方法，该方法可在检测禽流感病毒（AIV）的同时，确定病原是否为H5、H7和H9亚型。结果显示，该检测方法耗时短、特异性好、检测下限达到10^-5 ng·μL^-1。采用该方法检测临床采集的13个活禽交易市场的384份禽咽喉和泄殖腔双拭子样品，经检测，其中有60份样品为流感病毒阳性，且全部是H9亚型，该结果与行业标准方法（NY/T 772—2013）检测结果一致，κ值为1（P<0.001）。本方法能实现对禽流感病毒及H5、H7和H9亚型的高通量快速检测，将在AIV快速检测中发挥重要作用。  相似文献   

甲型流感病毒快速分型与分析软件的开发与试用     

王楷宬  王通  庄青叶  邱源  彭程  王素春  陈继明 《中国动物检疫》2016,33(4):80-84

甲型流感病毒危害动物和人类健康,其亚型多、突变率高、易发生重配,因此对其进行检测及流行毒株基因分析尤为重要。为解决传统方法进行大量甲型流感病毒序列分型和分析时存在的费工耗时、人为错误多等问题,结合实际工作需要,使用Perl语言建立了一套lunix系统下的甲型流感病毒快速分型与分析软件,并试用其对Gen Bank中所有宿主为鸭的甲型流感病毒进行了分析。结果显示,该软件可在较短的时间内完成大量序列的分析、分型和遗传进化研究,可用于甲型流感病毒的大规模流行病学调查分析。  相似文献