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同源异型盒基因（homeobox genes,HOX）是在酵母乃至人类等几乎所有的真核细胞中均表达的一类基因。为了探究HOXC10基因表达规律及其生物信息学,采用qRT-PCR方法研究HOXC10基因在8周龄京海黄鸡心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、腿肌、下丘脑和卵巢组织中的表达规律,检测其在300日龄高、低产组卵巢组织的表达差异,并通过多种在线软件对原鸡HOXC10基因进行生物信息学分析。结果显示,HOXC10基因在京海黄鸡腿肌中表达丰度极显著高于其他组织（P < 0.01）,且300日龄高产组中HOXC10基因表达丰度显著低于低产组（P < 0.05）。原鸡HOXC10基因序列与火鸡、野鸽、绿头鸭、人、小鼠、牛、猪、山羊及非洲爪蟾的同源性分别为77.4%、94.8%、98.6%、68.3%、67.9%、66.0%、59.0%、68.1%和79.4%;HOXC10基因共编码354个氨基酸,其中丝氨酸的含量最高,潜在的磷酸化位点有24个,在280~342的氨基酸序列内存在一个同源结构域,蛋白质亚细胞主要定位在细胞核中,且不包含跨膜结构。HOXC10基因在京海黄鸡生长和繁殖的基因调控网络中发挥了重要作用。 相似文献
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旨在根据GenBank 上公布的原鸡GnRHR基因序列设计2对引物,采用RT-PCR方法,从京海黄鸡肌肉组织中克隆GnRHR基因的编码区序列,并使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析,分析GnRHR基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化性质、蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在的磷酸化位点、保守结构域及该基因编码蛋白的二级结构、三级结构等。同时为GnRHR基因和β-actin基因各设计1对引物,采用RT-qPCR的方法研究GnRHR基因在京海黄鸡12个组织和器官中的表达情况。最终成功克隆了京海黄鸡GnRHR基因完整的编码区序列和部分侧翼序列,Blast结果显示,京海黄鸡GnRHR基因与原鸡、番鸭、藏羚羊、野猪、马、小鼠、大鼠、家兔、绵羊、人、牛、黑猩猩和斑马鱼的同源性分别为99．7％,86．7％,55．7％,54．6％,52％,51．6％,50．8％,50％,49．9％,49.6％,49．4％,47．4％和39．3％,并成功构建系统发育树。蛋白质结构分析显示,GnRHR蛋白分子量为45．432 kDa,理论等电点为9．55,包含20种氨基酸,其中,亮氨酸含量最高,占13．8％,赖氨酸含量最低,占0．7％;不稳定系数为65．35,显示该蛋白不稳定;脂溶指数为95．54,总平均疏水指数为0．312,为非水溶性蛋白;该蛋白不属于分泌型蛋白,主要存在于胞膜上,没有信号肽结构,存在16个潜在磷酸化位点和11个糖基化位点;保守结构域分析显示存在2个低复杂度序列和7段跨膜结构,跨膜分析显示该蛋白为7次跨膜蛋白,二级结构预测结果显示,在GnRHR二级结构中,α-螺旋占29．83％,β-折叠占17．18％,无规则卷曲占52．98％,GnRHR蛋白三级结构为复杂的7次跨膜螺旋结构,且为单链蛋白。组织表达分析显示,GnRHR基因主要在垂体中高表达,表达量显著高于其他组织,在其他11个组织和器官中表达量较低。 相似文献
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随着规模化蛋鸡养殖产业的快速发展,养殖密度增大,病原微生物传播途径缩短,有效的消毒是鸡场疫病防控的重要保障。本研究通过开展蛋鸡养殖场人员通道、鸡舍、消毒池和水线四个关键环节的消毒试验,结果显示,蛋鸡场人员通道二氧化氯使用有效浓度为1:50,消毒池氢氧化钠溶液有效浓度为2%,鸡舍复合醛制剂熏蒸消毒有效浓度为1:200；饮水添加过硫酸氢钾复合物粉的有效浓度为1:400。结合蛋鸡产蛋率、料蛋比和抗体水平,整体来看,该蛋鸡场消毒效果良好,实现了消灭病原微生物和切断传播途径,保证了蛋鸡场的生物安全和生产性能,有效预防疫病的发生。 相似文献
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本研究旨在探讨黑素皮质素受体3基因(melanocortin 3 receptor,MC3R)对鸡(Gallus gallus)屠体性状的影响。采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)检测及测序的方法,检测MC3R在京海黄鸡群体中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并对这些多态位点进行连锁不平衡和单倍型分析。结果表明,在MC3R编码区序列(coding sequence,CDS)共检测到6个SNPs位点,各位点间均不存在强连锁不平衡;6个SNPs位点在379只京海黄鸡的群体中形成了5种单倍型和11种单倍型组合。最小二乘法分析结果表明,不同单倍型组合间京海黄鸡屠体性状(包括活体重、屠体重、胸肌重、腿肌重、全净膛重、半净膛重和腹脂重)存在显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01),其中单倍型组合H3H4和H3H3的各种屠体性状均极显著高于单倍型组合H4H5(P<0.01),也显著高于其他部分单倍型组合(P<0.05),为屠体性状优势组合;单倍型组合H4H5各屠体性状均为最低,均显著或极显著低于其他大部分单倍型组合(P<0.05或P<0.01),为屠体性状劣势组合。因此,MC3R可能是影响鸡屠体性状的主效基因或与主效基因连锁,本研究为京海黄鸡屠体性状分子标记辅助选择提供了参考依据。 相似文献
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鸡及许多物种的全基因组测序及相关基因图谱都已宣告完成,但由于注释方法的局限性,还存在许多遗漏的新基因及对现有基因的误差注释。RNA-Seq技术是基于第2代测序技术的转录组学研究方法,该研究利用高通量测序技术对8只（高产组4只、低产组4只）300日龄体重一致、饲养条件相同、产蛋数存在差异的京海黄鸡的卵巢组织所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序,通过分析RNA-Seq获得的京海黄鸡卵巢组织转录组数据,共发现4 431个新转录本,并将所有新转录本与GO、NR、Swiss-Prot、KEGG数据库进行比对和分析,发现了很多潜在的新基因并进行功能注释,为鸡基因组的进一步完善及功能基因的挖掘提供了数据基础。 相似文献
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盐城是长三角地区禽蛋产品主要生产供给基地。2017年全市蛋鸡年末笼存6364.56万只,规模养殖场(户)7819个,规模养殖比例92.17%,蛋鸡产业已成为盐城市农村经济发展的优势骨干主导产业。由于蛋鸡粪石粉含量高、含有较多羽毛,且大多养殖户采用粪槽+刮粪板清粪,蛋鸡粪含水率高,导致处理与利用难度大,严重影响和制约了蛋鸡产业的绿色、可持续发展。为切实有效开展蛋鸡粪处理与资源化利用,加快推进蛋鸡业转型升级和绿色发展。笔者根据盐城市不同蛋鸡养殖场(户)养殖方式、养殖规模、集粪方式等特点,在鸡粪前期处理上,着重开展了鸡粪收集、鸡粪贮存、鸡粪无害化处理等技术的研究与探索;在鸡粪资源化利用上,着重开展了鸡粪直接还田利用、专业肥料化利用、专业能源化利用、发酵塔和带式发酵烘干一体机处理、发酵床降解等模式的研究与探索;在运行机制上,着重开展了第三方“统一收集、集中处置”模式的研究与探索。现将蛋鸡粪处理与资源化利用主要技术与模式总结如下。 相似文献
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2018年10月份,笔者对盐城市盐都区、亭湖区、大丰区和射阳县17个蛋鸡规模场开展蛋鸡常见多发病防治现状调查,并对全市13个蛋鸡临床病例开展实验室检测。通过调查,初步掌握本地区蛋鸡滑液嚢支原体病等疫病流行特点和防治现状;益生菌类、消化酶类、寡糖类和中成药保健制剂作为替抗产品在现有规模蛋鸡场已大量使用并取得明显防治效果。实验室检测结果表明,强力霉素等常用抗生素对蛋鸡致病大肠杆菌耐药性明显提高。综合防治现状调查和检测结果,提出本地区蛋鸡常见多发病防治合理化建议. 相似文献