中国肉牛单核苷酸多态性个体识别体系构建     

高春燕  杨波  尹佳锋  王瑞  康彦杰  郭文新  张宝 《安徽农业科学》2014,(25):8513-8515

[目的]筛选一套能用于我国肉牛进行大规模亲子鉴定的SNP体系。[方法]运用HAPMAP数据结合文献寻找可用于我国肉牛亲子鉴定的SNP位点,筛选SNP位点及确定数目,运用相关公式计算其个体识别力和筛选结果的可信度。[结果]依据筛选标准共选择出38个符合标准的SNP位点,平均多态信息含量为0.364 5,平均观察杂合度为0.478 0。[结论]经分析38个SNP位点多态信息含量、个体识别力及累计个体识别力均符合等位基因数、杂合度、个体识别力等方面的要求,可用于我国大规模肉牛厂进行SNP个体识别鉴定需求。  相似文献   

不同来源花生品种的ISSR分析及亲缘关系研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

王天菊  白德胜  何龙飞  李创珍  韦善清 《花生学报》2011,40(2):7-12

利用13对ISSR引物对28个栽培种花生品种进行PCR扩增,研究这些品种的DNA多态性及其亲缘关系。结果表明,有7对引物检测到明显的多态性,从28个花生品种中扩增出90条带,其中多态性带达到79条,多态性比率为87.8%,平均每个引物可扩增出12.86条带,11.29条为多态性条带。品种间的遗传相似系数值在0.411~0.800之间,平均为0.620。在UPGMA聚类分析简单匹配系数值为0.57处,可把28个花生品种分成3个品种群。由此表明,这些不同来源的花生品种具有较高的DNA多态性,亲缘关系不同。  相似文献   

柑橘CHS基因序列多态性及表达水平对类黄酮生物合成的影响     

王志彬  申晚霞  朱世平  薛杨  赵晓春 《园艺学报》2015,42(3):435-439

查尔酮的合成是类黄酮生物合成途径中的一个关键节点。从10个柑橘种质中克隆了查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)基因,并对其不同时期的果实和叶片中的类黄酮含量进行了测定,分析了CHS基因的序列多态性与类黄酮含量之间的关系;同时通过qRT-PCR检测了CHS基因在不同种质之间以及同一种质的不同组织间的表达差异。结果表明,柑橘CHS基因的核苷酸序列高度保守,相似度达98%以上。聚类分析表明,CHS氨基酸序列的多态性有物种特异性,而且与类黄酮含量有一定的相关性。CHS基因的表达水平在不同种质、部位及生长发育时期有显著差异,这些差异与类黄酮的含量有显著的相关性,说明CHS基因对类黄酮的生物合成有明显影响。  相似文献   

利用 HPLC 分析菠萝愈伤组织 DNA 甲基化水平     

林文秋  肖熙鸥  张红娜刘胜辉  孙伟生  李运合  吴青松 《热带作物学报》2018,39(11):2220-2224

建立菠萝 DNA 甲基化水平的 HPLC 测定方法，分析菠萝愈伤组织 DNA 甲基化水平变化，为进一步研究菠萝 体细胞无性系变异机理奠定基础。通过对流动相和水解温度等条件的优化，建立菠萝 DNA 甲基化水平的检测方法。结 果表明，分离 C 和 5m-C 的最佳流动相为甲醇∶磷酸二氢钾∶三乙胺为 10∶90∶0.2（V/V），pH 3.0，DNA 的最佳水解 温度为 90 ℃。利用此体系分析菠萝愈伤组织和胚性愈伤组织的 DNA 甲基化变化，结果表明，菠萝愈伤组织在分化过 程中 DNA 总甲基化水平呈动态变化，变化范围为 5.14%~96.86%。此外，胚性愈伤组织甲基化水平低于非胚性愈伤组 织。推测 DNA 甲基化影响菠萝愈伤组织的分化及胚性愈伤组织的形成。  相似文献   

不同浓度氯霉素对大肠杆菌质粒扩增的影响     

陈绪美  尹志勇  檀军  田莹  李卓  郭建军 《山地农业生物学报》2020,39(6)

  相似文献   

山西黑猪肌细胞生成素基因部分序列的扩增     

刘勇 《国外畜牧学(猪与禽)》2014,(6):55-56

肌细胞生成素在肌细胞的分化过程中起着关键的正向调节作用。根据猪的肌细胞生成素的基因序列设计特异性的扩增引物,以山西黑猪为研究对象,通过PCR扩增,获得长度为1 493 bp的序列,经测序和基因的同源性比对得出山西黑猪的基因序列与家猪等动物有较高的同源性。结果表明:肌细胞生成素基因可能在山西黑猪肌肉组织发育过程中发挥重要的调控作用。为今后改良黑猪的肌肉品质奠定理论基础。  相似文献   

m6A甲基化在鸡肌肉生长发育中的表达研究     

丁浩  林月月  张涛  张闪闪  吴玉麟  段严军  巩用双  谢恺舟  王金玉  戴国俊  张跟喜 《中国畜牧兽医》2021,48(5):1525-1534

试验旨在研究RNA m6A修饰相关基因去甲基化酶Alk B同源蛋白5（Alk B homologue 5，ALKBH5）、去甲基化酶肥胖相关蛋白（fat mass and obesity-associated protein，FTO）、甲基转移酶样蛋白3（methyltransferase like 3，METTL3）、甲基转移酶样蛋白14（methyltransferase like 14，METTL14）和成肾细胞瘤1-结合蛋白（Wilms’tumor 1-associating protein，WTAP）在鸡骨骼肌发育过程中的表达，分析其与骨骼肌m6A甲基化水平的相关性。首先，利用实时荧光定量PCR技术检测m6A甲基化相关基因在金茅花鸡12（E12）、14（E14）、16（E16）、18（E18）胚龄和1日龄腿肌和胸肌组织中mRNA表达水平，以及其在鸡成肌细胞50%、100%增殖期和1、2、3、4、5 d分化期的mRNA表达水平；随后，利用m6A甲基化试剂盒检测金茅花鸡E12和1日龄腿肌和胸肌组织中m6A甲基化修饰水平，与m6A甲基化相关基因表达水平进行相关性分析。结果显示，m6A去甲基化基因ALKBH5和FTO mRNA表达水平在骨骼肌发育过程中显著上调（P<0.05），即在E12、E14低表达，E16、E18逐渐上调，1日龄达到最高。m6A甲基化写入基因METTL14、METTL3和WTAP mRNA表达水平在E12、E14、E16逐渐上升，E18下降，随后至1日龄表达量回升。在细胞增殖过程中，ALKBH5、FTO、METTL14、METTL3和WTAP基因表达均上调；在细胞分化过程中ALKBH5和FTO基因表达水平显著上调（P<0.05），在分化第5天达到最高。METTL14、METTL3和WTAP基因mRNA表达水平在细胞诱导分化的1、2、3、4 d表达量呈下降趋势，而在诱导分化的第5天有所回升。甲基化水平检测结果显示，腿肌和胸肌m6A甲基化水平变化趋势一致，均在胚胎发育过程中显著下降（P<0.05），至1日龄达到最低。相关性分析结果显示，鸡骨骼肌RNA m6A甲基化水平与m6A去甲基化修饰基因ALKBH5、FTO mRNA表达水平呈显著负相关（P<0.05）。综合以上试验结果，推测m6A甲基化修饰与鸡骨骼肌发育相关，而去甲基化基因ALKBH5、FTO可能通过调控RNA m6A甲基化水平，影响鸡骨骼肌发育。本研究结果为进一步研究m6A甲基化修饰调控鸡骨骼肌生长发育的功能和分子机制提供理论依据。  相似文献   

浅析日本与欧盟经济伙伴关系协定农产品降税模式及对中国自贸区农业谈判的启示     

刘芳菲 《世界农业》2020,(10)

2019年2月1日,日本与欧盟经济伙伴关系协定(以下简称日欧协定)正式生效,双方承诺取消绝大多数商品的进口关税。日本对农业高度保护,自由贸易区(以下简称自贸区)谈判中一贯对农产品慎重开放。经梳理,在日欧协定中,日本针对不同农产品采取了灵活的开放方式,对敏感农产品采用了维持关税、部分降税、保留既有贸易制度、增设国别配额、设置特保措施等不同类型的保护手段,使得国内敏感产业可以在一定程度上抵御进口冲击。相较之下,中国已建成自贸区中农业开放水平总体较高,对敏感农产品的保护措施比较简单。借鉴日本经验,未来中国在开展自贸区农业谈判过程中,宜基于不同产品的产业特征和敏感性,有针对性地设计开放手段,大胆创新对敏感农产品的保护措施,积极推动构建农业对外开放新格局,同时保障国内粮食安全、小农生计和乡村振兴发展需要。  相似文献   

稻田土壤中汞的微生物甲基化研究进展     

高润霞  罗文倩  胡海艳  朱金山  罗友进 《宁夏农林科技》2020,61(1)

  相似文献   

基于磁珠富集法开发的15个三角鲂多态性微卫星标记的特性分析     

刘凯  谢楠  冯晓宇  马恒甲 《浙江农业科学》2020,61(1):144-146

利用磁珠富集法分离微卫星序列,以开发三角鲂(Megalobrama terminalis)微卫星分子标记。将三角鲂基因组DNA经限制性内切酶RsaⅠ酶切、回收后构建三角鲂基因组PCR文库。用生物素标记的微卫星探针(CA)₁₀与PCR文库杂交,通过磁珠富集含有微卫星序列的DNA片段,将洗脱所得片段进行PCR扩增、克隆及筛选后,共获得15对有效引物。利用获得的15对引物对36尾三角鲂进行多态性分析,15个微卫星标记的观测杂合度范围为0.000 0~0.818 2,期望杂合度范围为0.081 8~0.922 6,多态信息含量范围为0.078 9~0.899 9。其中,6个微卫星标记达到Hardy-Weinberg平衡。本研究制备的15对微卫星标记可用于评估三角鲂种群的遗传参数,为三角鲂种质资源的开发、保护提供有用的遗传标记。  相似文献