伪狂犬病病毒Ea株gM和gN基因的克隆与结构分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

肖少波  陈焕春  方六荣  王革飞  马相如 《中国预防兽医学报》2002,24(3):171-174

gM和Ng是最近经经典免疫沉淀法确定的伪狂犬病病毒（PRV）第三对异源糖蛋白二聚体。根据PRV国外Ka株的核苷酸序列，设计两对分别包含gM和Ng完整编码的特异性引物，以PRV国内地方分离株（Ea株）的细胞感染物为模板，PCR扩增出大小约1．2kb和0．3kb的特异性片段。将扩增物克隆到杆状病毒转座载体pEastBacl中，酶切鉴定证实后进行序列测定。结果表明：Ea株gM、Ng基因分别编码394和98个氨基酸，与Ka株的同源性分别为98．4％和97．6％。DNATool和DNASIS软件对gM、Ng进行二级结构预测，发现gM存在8个潜在跨膜区和一个N－糖基化位点，是典型的能反复多次跨膜的Ⅲ型糖蛋白；gN具有N－端信号肽序列、C－端跨膜区和潜在0－糖基化位点，属Ⅰ型糖蛋白。上述结果为下一步深入研究gM、Ng的相互作用位点及二聚体的功能奠定了功能。  相似文献   

严重急性呼吸道综合征(SARS)病毒基因组比较分析与进化研究     

马相如  郭爱珍  肖少波  金梅林  陈焕春 《华中农业大学学报》2003,22(6):523-528

“严重急性呼吸道综合征”(SARS)由于危害严重，引起人们的高度重视，在各国科研人员努力下，目前已完成了十几个毒株的分离与全基因组测序工作。本研究对世界各地分离的SARS毒株的基因组全序列进行比较，发现不同毒株的同源性在99．8％以上，SARS病毒的遗传稳定性较高；将SARS病毒与其它冠状病毒基因组以及编码蛋白质序列进行比较分析，证实SARS病毒是一种新的冠状病毒，可能进化起源较早，并发现SARS病毒和牛冠状病毒同源程度最高。SARS病毒orflab、orfla、S、M、N编码区氨基酸序列和牛冠状病毒同源程度最高，鼠肝炎病毒次之。  相似文献   

伪狂犬病病毒鄂A株gC基因的克隆、序列分析及其在大肠杆菌中的表达   总被引：3，自引：0，他引：3  

肖少波  陈焕春  方六荣  洪文洲  何启盖  马相如 《中国农业科学》2002,35(2):202-206

 以伪狂犬病病毒国内地方分离株 (鄂A株 )为材料 ,采用核酸杂交、DNA重组技术直接从基因组DNA中克隆了最主要的保护性抗原基因gC ,测定了全序列并对其原核表达产物作为血清学诊断抗原进行了初步探讨。结果表明 :所克隆的 gC基因全长 175 5bp(含启动子序列和 poly(A)信号序列 ) ,具有典型I型膜蛋白结构特征。同具有代表性的国外标准株NIA 3株、IndianaS株相比 ,多个酶切点不同 ,尤其是具有分型意义的BamHI位点消失 ;氨基酸水平上也存在一定程度的差异 ,鄂A株 gC可编码 4 87个氨基酸残基 ,而以往所报道的gC均只编码 4 78或 4 79个氨基酸 ,有意义的是功能区突变较多 ,并存在连续 7个氨基酸残基的插入。同 pET 2 8a的 6xHis Tag融合的gC基因完整编码区在大肠杆菌中获得高效表达 ,融合蛋白分子量为 6 2ku ,能同伪狂犬病病毒高免血清发生特异性反应。纯化的表达产物作为ELISA和乳胶凝集诊断抗原 ,具有很高的敏感性和特异性  相似文献   

伪狂犬病病毒gI/gE双缺失通用转移载体的构建与初步应用   总被引：2，自引：0，他引：2  

方六荣  陈焕春  肖少波  马相如  王革非 《中国兽医学报》2003,23(1):4-6

对含伪狂犬病病毒（peudorabies virus,PRV)Ea株gI、gE、11K全基因，gD、28K基因部分编码区的质粒pSK4.5进行改造，消除其中的BamH1和Not1位点，将晚期基因gG的启动子、多克隆位点以及SV40poly(A)同时插入改造后的质粒pSKBN的Stu1和BstEⅡ位点，取代gI和gE的部分编码区，构建了由gG启动子驱动的gI/gE双缺失通用转移载体pgGIE-Uni。序列分析进一步证实，至少有8个单一酶切位点可供外源基因直接插入，上下游倒翼分别为0.8kb和2.4kb。将猪繁殖-呼吸障碍综合征（兰耳病）主要抗原基因ORF5插入pgGIE-Uni的BamHI和Not1位点之间，构建了含ORF5的转移质粒pgGIE-ORF5。上述结果为进一步研制猪伪狂犬病-兰耳病的2价基因工程疫苗奠定了基础。  相似文献   

猪圆环病毒(PCV)序列分析与进化   总被引：5，自引：4，他引：5  

马相如  陈焕春  肖少波  刘正飞  曹胜波  张利达 《中国兽医学报》2004,24(2):105-108

从 Gen Bank数据库下载了世界各地分离的猪圆环病毒基因组全序列 ,并对其进行多重比对 ,绘制系统进化树 ,发现来自同一国家或地区的 PCV毒株亲缘关系较近。提取 PCV ORF1编码的蛋白质序列 ,进行多序列比较 ,分析保守氨基酸序列 ,搜索结构域相似序列 ,结果发现玉米线条病毒属与 PCV的起源有密切的关系。此外 ,在数据处理过程中通过自编程序结合互联网及免费软件 ,能迅速进行大规模序列比较分析 (35个序列以上 ) ,提高了生物数据分析处理的速度。  相似文献   

伪狂犬病病毒Ea株UL31基因克隆、序列分析及其在大肠杆菌中的表达   总被引：2，自引：0，他引：2  

马相如  胡勤芹  肖少波  方六荣  陈焕春 《中国预防兽医学报》2004,26(2):86-89

以伪狂犬病病毒Ea株基因组DNA为模板,通过PCR扩增含UL31基因的1 000bp片段,扩增产物克隆于pMD18-T中,双脱氧末端终止法序列测定.通过OM1GA2.0软件包分析发现,Ea株UL31基因编码271个氨基酸,蛋白质分子量为30.38 kD,与Ka株UL31基因核苷酸与氨基酸序列同源性均在98%以上.将α-疱疹病毒亚科9个不同成员UL31同源基因编码的氨基酸序列进行多重比对分析,发现4个保守的功能性结构域.将该片段插入原核表达载体pGEX-KG中GST下游,构建的原核表达质粒pGEX-UL31在大肠杆菌BL32(DE3)中获得了高效表达,SDS-PAGE结果显示,表达的融合蛋白质分子量为56 kD.  相似文献