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以牙鲆为研究对象,利用染色体步移(Genome walking)获得了 Activin 两个β亚基基因的上游部分启动子序列,并对其进行了转录调控元件的生物信息学预测分析。获得了 Activin βA 和βB两个亚基的启动子部分序列,长度分别约为2.7 kb 和2.4 kb;在预测的 Activin βB 转录起始位点(+1位)的上游31 bp 处有1个典型的 TATA box,而在 Activin βA 中未发现 TATA box 的存在。两个基因的启动子上发现了多个转录因子 Sp1、Oct-1、C/EBP、CREB、GATA-1、HNF-3、HNF-1、USF 等结合位点,还发现了与内分泌相关的 Pit-1、ER、PR、GR、RAR、RXR 等结合位点,但肌性转录因子 MyoD、myogenin 和雄性的性别决定基因 SRY 结合位点仅在 Activin βA 启动子中发现。生物信息学分析显示,牙鲆 Activin βA 和βB 表达受到多种潜在因子的调控,二者在调控上有所差异。 相似文献
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EB1作为一种微管末端结合蛋白,在微管聚合和微管正端蛋白复合体的装配中起着关键的作用。以半滑舌鳎cDNA文库为基础,克隆EB1基因。该基因包含777bp的开放读码框,编码推测的氨基酸258个,分子量为29.497kDa。与其他物种EB1序列同源比对发现,该蛋白包括EB1和CH 2个保守的结构域,以及FYF和EEF/Y 2个保守的三联氨基酸位点。同源聚类分析结果显示,EB1蛋白的系统进化较好地反映物种从低等到高等的进化进程。实时荧光定量PCR结果表明,该基因在脑、鳃、心脏、肠、头肾、肝脏、肌肉、卵巢、脾脏和精巢组织中都有表达,其中,卵巢的表达量最高,比表达量最低的肝组织高14.6倍。对细胞迁移能力的研究中发现,细胞迁出能力显示出与荧光定量PCR中选取的组织中EB1的表达量相符的规律,EB1基因表达量越高的组织细胞迁出的能力越强。 相似文献
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以牙鲆为研究对象,利用染色体步移(Genome walking)获得了Activin两个β亚基基因的上游部分启动子序列,并对其进行了转录调控元件的生物信息学预测分析。获得了Activin βA和βB两个亚基的启动子部分序列,长度分别约为2.7 kb和2.4 kb;在预测的Activin βB转录起始位点(+1位)的上游31 bp处有1个典型的TATA box,而在Activin βA中未发现TATA box的存在。两个基因的启动子上发现了多个转录因子Sp1、Oct-1、C/EBP、CREB、GATA-1、HNF-3、HNF-1、USF等结合位点,还发现了与内分泌相关的Pit-1、ER、PR、GR、RAR、RXR等结合位点,但肌性转录因子MyoD、myogenin和雄性的性别决定基因SRY结合位点仅在Activin βA启动子中发现。生物信息学分析显示,牙鲆Activin βA和βB表达受到多种潜在因子的调控,二者在调控上有所差异。 相似文献
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