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利用Tandem Repeats Finder程序,以大于15 bp,匹配值为80%的标准,对已经公布的 1 162 745 条玉米EST序列中的SSR进行查找,共发现一至六核苷酸重复的SSR序列84 314个,占1 162 745个EST序列的7.25%。组成这些SSR的主要基序有A, C, AG, GGC, AGG, AAC, AAGT, AAAT, ACAT, AGAT, AGGT, AGAGG, AAAAG, AGGGG, AAAGC, GCCGAG, CGGCGT, CGCCGG, GCGGCA和CGCTGC,且以单核苷酸重复的SSR数量最多,为75 917个,其次是六核苷酸重复,为2 903个,这两类重复的SSR占总数的93.48%,四、五核苷酸重复的SSR数量较少,分别为772和779个。值得注意的是,所有这些在玉米EST中发现的SSR序列的碱基数都大于24 bp。这暗示利用这些SSR序列有可能开发出一批扩增效果好,多态性高的SSR分子标记,有助于玉米高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能等研究。 相似文献
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从经营管理方式来看,云南省华宁县柑桔试验示范基地大致可分为科研单位主导型、企业主导型、政府主导型和种植大户主导型等四种类型。无论谁主导,以基地带动农户,共建品牌、开拓市场的发展目标却是一致的。立足当地实际,努力创新发展模式,或许这才是华宁柑桔带给我们的启示。 相似文献
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【导读】独特的自然气候环境造就了华宁柑桔丰产、优质和成熟早等优势,柑桔已成为当地果农增收致富的支柱产业。提高“华宁柑桔”品牌知名度,推进标准化生产,加大无病毒苗木繁育体系建设,推进老果园更新改造等,是推动华宁柑桔持续健康发展的现实选择。 相似文献
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玉米EST序列中微卫星的频率和分布 总被引:3,自引:0,他引:3
利用Tandem Repeats Finder程序,以大于15 bp,匹配值为80%的标准,对已经公布的1 162 745条玉米EST序列中的SSR进行查找,共发现一至六核苷酸重复的SSR序列84 314个,占1 162 745个EST序列的7.25%.组成这些SSR的主要基序有A,C,AG,GGC,AGG,AAC,AAGT,AAAT,ACAT,AGAT,AGGT,AGAGG,AAAAG,AGGGG,AAAGC,GCCGAG,CGGCGT,CGCCGG,GCGGCA和CGCTGC,且以单核苷酸重复的SSR数量最多,为75 917个,其次是六核苷酸重复,为2 903个,这两类重复的SSR占总数的93.48%,四、五核苷酸重复的SSR数量较少,分别为772和779个.值得注意的是,所有这些在玉米EST中发现的SSR序列的碱基数都大于24 hp.这暗示利用这些SSR序列有可能开发出一批扩增效果好,多态性高的SSR分子标记,有助于玉米高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能等研究. 相似文献