药用植物苦马豆研究现状及其种质资源收集意义     

王亚男  张雨  郑长远  苏丹丹  刘玉萍  苏旭 《现代农业科技》2021,16(16)

苦马豆是豆科、苦马豆属一种草本或半灌木多年生药用植物,主要分布于中国吉林、辽宁、内蒙古、河北、山西、陕西、宁夏、甘肃、青海、新疆等地,具有重要的生态价值、药用价值和饲用价值。本文综述了苦马豆研究现状,讨论了其种质资源收集对未来进行科学研究和开发利用的重要性和实际意义。  相似文献   

基于流式细胞法和K-mer分析法检测沙鞭基因组大小北大核心CSCD     

刘涛  刘玉萍  富贵  吕婷  刘峰  张雨  苏丹丹  王亚男  郑长远  苏旭 《草业学报》2022,31(12):133-145

禾本科沙鞭属仅包含沙鞭一个种。沙鞭具有根茎繁殖、克隆整合等典型沙生植物特征,是我国内蒙古高原非固定沙地的建群种。本研究采用流式细胞术和K-mer分析方法测定沙鞭基因组大小,建立和优化以芨芨草为内参物种、青海固沙草和方穗山羊草为外参物种的二倍体植物DNA含量(DNA C值)测定体系。研究结果表明:1)沙鞭流式细胞峰值荧光是青海固沙草的2。54倍,是芨芨草的1。35倍,峰值信号远小于方穗山羊草,推测沙鞭基因组大小约为1580。10±5。02 Mb;2)K-mer分析结果表明,沙鞭基因组大小为1563。54 Mb,杂合率1。15%,重复序列比例为66。27%,基因组GC含量为43。4%,属于高杂合、高重复的复杂基因组;3)沙鞭基因组可使用PacBio平台CLR或HiFi模式进行三代测序,测序深度应不低于20×。沙鞭基因组大小的准确测定不仅补充了禾本科针茅族植物的DNA含量数据,同时也为沙鞭基因组测序、进化基因组研究、种质资源开发和利用以及遗传资源保护提供了数据参考,可为针茅族近缘物种基因组大小测定提供借鉴。  相似文献   

沙鞭转录组简单重复序列(SSR)位点特征分析     

毛轩睿  刘玉萍  苏旭  富贵  陈金元  郑长远  刘涛  吕婷  张雨  胡夏宇  杨萍 《草地学报》2022,30(8):1990-2001

沙鞭是禾本科、沙鞭属的一种多年生大型根茎类草本植物，主要分布于青海柴达木盆地和内蒙古高原及其毗邻荒漠地区，具有较强的耐旱、耐寒、耐碱、抗风沙和抗病能力。本研究使用MISA(Microsatellite identification tool)软件对沙鞭全长转录组测序获得的184 076条Unigenes的SSR位点进行搜索和特征分析，共获得3 563个SSR重复序列，分布于56 824条Unigenes上，SSR发生和出现频率分别为30.87%和50.83%；重复类型以单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复为主。单核苷酸重复中，(A/T)_n基元类型占总SSR位点的42.26%；二核苷酸重复优势基元类型为(AG/CT)_n，占总SSR位点的9.29%。SSR数量随重复次数增加而降低；重复次数类型随基元序列长度增长而减少。此外，本研究还得到沙鞭29 444条和10 864条Unigenes的KOG和GO注释，其主要集中于翻译后修饰、蛋白质周转、催化活性和代谢过程。因此，本研究认为沙鞭转录组SSR序列呈现较高的多态性潜能，具有较大的开发价值，为今后沙鞭分子标记开发、辅助育种、种质资源评价提供了理论依据。  相似文献