植物无融合生殖、杂种优势与甲基化的作用     

陈文充  董昂  吴慧敏  叶生月  胡欢欢  闫道良  曾燕如  章建龙 《分子植物育种》2019,17(4):1276-1282

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山核桃(Carya cathayensis)种子生长发育过程转录组的初步分析     

董昂  赵国淼  胡欢欢  陈文充  叶生月  曾燕如 《分子植物育种》2018,(12)

山核桃(Carya cathayensis)是浙江省重要的经济树种,其种子脂类含量极高,达69.80%~74.01%。本研究采用Illumina Hi Seq TM 2000高通量测序技术对高油种子生长发育过程(6个时间点)采集的种胚及胚乳进行转录组分析,经组装拼接共获得Unigene 110 959条,占总转录本数的53.93%,并有39 560个Unigene至少在7个数据库中的一个数据库中获得注释。这些注释的基因GO分类共涉及47个生物学功能,KOG分类成26组,KEGG代谢通路分成5个分支。基因差异表达分析表明,胚乳在种子生长发育被吸收的过程中基因表达量不低,上下调基因数均是先增加后减少,而同一时间点上下调胚与胚乳差异表达基因(DEG)数均逐渐增加。DEG聚类分界点在7~8月之间。初步发现山核桃种子生长发育过程涉及脂类合成的途径21个,相关基因571个。这些结果为山核桃日后成油机理的研究打下了基础。  相似文献   

榧树半同胞子代幼苗生长性状的遗传参数估算   总被引：1，自引：1，他引：0       下载免费PDF全文

叶淑媛  董雷鸣  董昂  喻卫武  戴文圣  曾燕如 《浙江农林大学学报》2020,37(4):817-822

  目的  研究生产上香榧Torreya grandis ‘Merrillii’嫁接繁殖砧木用榧树T. grandis幼苗生长性状的遗传，选育天然优良榧树种质。  方法  以天然林自由授粉的榧树半同胞子代为材料，连续2 a测定榧树幼苗苗高、地径及分枝数，采用常规线性混合模型(LMM)和广义线性混合模型(GLMM)拟合并估算相关的遗传参数，计算了遗传和表型相关系数。  结果  总体上榧树幼苗苗高的变异系数大于地径的变异系数，且随幼苗年龄的增加而降低。各生长性状指标在家系间均存在极显著差异(P＜0.01)，且遗传力都较高，1年生幼苗各指标的遗传力均大于2年生幼苗的遗传力，遗传相关大于表型相关。遗传增益方面则表现为幼苗苗高大于地径及分枝数，以1年生枝条的遗传增益最高。生长表型性状相关分析表明:同批榧树幼苗除分枝数外，各指标间的遗传及表型均有极显著的相关性。  结论  天然群体榧树在生长性状上具有较强的选育潜力，可以根据1年生幼苗的苗高来选择培育砧木的采种树。表3参24  相似文献   

山核桃子代甲基化分析及其与薄壳山核桃甲基化的比较     

胡欢欢  贾宁  唐研耀  董昂  陈文充  夏晓庆  曾燕如 《分子植物育种》2020,(5):1558-1565

为了研究山核桃的遗传,本研究采用MSAP (Methylation sensitive amplification polymorphism)标记分析了山核桃30个半同胞子代群体及薄壳山核桃29个无性系,并在山核桃亲子代间及山核桃与薄壳山核桃间比较了遗传及甲基化水平。研究发现,山核桃半同胞子代群体非甲基化遗传位点(Non-methylation loci,NML)的比例较高,占33.69%,随后依次是内部胞嘧啶甲基化位点(15.18%)、半甲基化位点(9.25%);其遗传多样性(0.110 3±0.028 4)极显著地小于表观遗传多样性(0.568 5±0.112 3)(p<0.000 1);半同胞子代群体间存在显著的遗传与表观遗传分化,且大部分遗传变异和表观遗传变异存在于群体内,说明亲本间存在遗传差异。甲基化水平在山核桃亲子代间无显著差异(p>0.05),说明甲基化存在代际遗传。山核桃中NML的比例远大于薄壳山核桃,两物种表观遗传多样性相当,但薄壳山核桃的遗传多样性要高于山核桃;两物种遗传和表观遗传差异极显著(p<0.000 1),供试个体基于物种的遗传位点可以分别聚类,说明两物种各自个体间有遗传差异。甲基化敏感位点(Methylation-sensitive loci, MSL)及NML在两物种间存在极显著差异,且变异主要存在于物种内,两物种有明显的分化,但从各遗传参数值来讲,两物种又十分相像,正反交基于亲缘关系可行。不同于山核桃,薄壳山核桃遗传位点对甲基化位点影响极显著。  相似文献   

山核桃甲基化敏感扩增多态体系的建立与甲基化初步分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

陈文充  贾宁  董昂  闫道良  曾燕如 《浙江农林大学学报》2019,36(3):468-478

山核桃Carya cathayensis为浙江省重要的经济树种。近年来细胞生物学及分子标记的研究发现,山核桃中存在无融合生殖,天然群体的多态性不佳,存在印迹数量性状位点（iQTLs）。iQTLs与DNA甲基化有关,而DNA甲基化对生物表观遗传调控起着重要的作用,是可遗传的生物现象。甲基化敏感扩增多态（MSAP）是基于PCR扩增多态性的DNA甲基化检测方法。在建立山核桃MSAP标记体系的基础上对来自3个天然居群的山核桃单株样品进行了分析。结果表明:山核桃存在甲基化,非甲基化相对水平大于总甲基化相对水平,且两者间差异极显著（Wilcoxon Rank Sum检验P < 0.001）,内侧胞嘧啶甲基化相对水平远大于半甲基化相对水平,且两者间差异极显著（分子方差分析及邓肯多重比较,P < 0.001）;天然居群山核桃内侧胞嘧啶甲基化相对水平高,则半甲基化相对水平和非甲基化相对水平则相对较低,反之亦然;居群间存在明显的表观遗传分化,主要变异存在于居群内。此外,山核桃的MSAP体系可用于薄壳山核桃Carya illinoensis,2个物种在位点及位点数上存在差异。  相似文献