基于转录组测序分析内蒙古绒山羊毛囊退行期与休止期差异表达基因     

苏蕊  刘燕  范一星  乔贤  李晓凯  张磊  丽春  何利兵  王瑞军  李金泉 《黑龙江畜牧兽医》2018,(17)

为了探究内蒙古绒山羊次级毛囊(SHF)退行期到休止期以及相应时间点的初级毛囊(PHF)的差异表达基因,试验对3只内蒙古绒山羊阿尔巴斯型2周岁成年母羊的退行期和休止期的初、次级毛囊进行转录组测序,并采用生物信息学方法分析数据;在检测测序质量合格的基础上,进行差异表达基因的筛选、GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果表明:在次级毛囊中,退行期(1月份)与休止期(3月份)分别对比到50 626个和50 628个转录本,其中1 199个差异表达基因中有953个上调基因和246个下调基因;初级毛囊在这两个时间点分别比对到50 629个和50 626个转录本,其中1 977个差异表达基因中有1 258个上调、719个下调;这两个时期中,共有100个差异表达基因同时比对到初级毛囊与次级毛囊中。GO功能富集结果显示,次级毛囊两个时期的差异表达基因主要富集在肌肉重建、肌丝滑动等功能上;初级毛囊两个时期差异表达基因主要富集在翻译延伸、转录拼接等功能上。  相似文献   

内蒙古绒山羊4个群体遗传多样性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

赵艳红  王梦一  苏蕊  刘志红  武瑞兵  张燕军  李金泉  包跃先 《湖北农业科学》2012,51(8):1681-1683

选用30个微卫星座位,对内蒙古绒山羊4个种群(阿尔巴斯、二狼山、乌珠穆沁、阿拉善)的176份样本进行遗传多样性检测,结果表明,内蒙古绒山羊4个群体均具有丰富的遗传多态性.4个种群的期望杂合度(He)、平均多态信息含量(PIC)和平均有效等位基因数(Ne)分别为0.735 4～0.783 2、0.623 6～0.639 1、2.57～4.92;阿尔巴斯绒山羊与二狼山绒山羊遗传距离较近;阿拉善绒山羊与乌珠穆沁绒山羊遗传距离则较近.此研究为开展内蒙古绒山羊种质特性研究及资源保护和利用提供了科学依据.  相似文献   

Wnt10b参与外源褪黑激素促进绒山羊绒毛生长的研究     

丽春  张文广  常子丽  杨文柱  张燕军  苏蕊  李金泉 《中国畜牧杂志》2012,48(7):5-8

本实验旨在研究Wnt10b在内蒙古成年绒山羊皮肤中的表达变化规律和褪黑激素(MT)对其表达量的影响。每隔1个月按照2 mg/kg BW的剂量在受试内蒙古成年绒山羊耳后皮下埋植MT。连续采集12个月(从2009年8月到2010年7月)的肩胛部皮肤样品,应用实时荧光定量PCR技术检测Wnt10b的表达量。结果表明:Wnt10b在内蒙古成年绒山羊皮肤组织中毛囊生长中期和休止前期高表达;埋植MT提高了Wnt10b在内蒙古成年绒山羊皮肤组织中毛囊休止期和退行期的表达量。结果提示,Wnt10b参与内蒙古绒山羊毛囊生长的信号传递过程,并在退行期和休止期转变过程中发挥作用;Wnt10b参与了外源MT促绒毛生长的毛囊周期性变化过程。  相似文献   

山羊产业可持续发展关键因素分析          下载免费PDF全文

王瑞军  王志英  张燕军  苏蕊 《家畜生态学报》2012,41(2):77-81

  相似文献   

内蒙古绒山羊(阿拉善型)线粒体基因组序列测定及分析     

苏蕊  杨钟  丽春  李晓凯  马宇浩  李金泉 《华北农学报》2018,(5)

为了研究内蒙古绒山羊线粒体基因组序列组成及不同品种系统发育关系,明确绒山羊的起源、进化、不同类群的分化以及特定遗传特性形成机制,以内蒙古绒山羊(阿拉善型)为试验研究对象,对其线粒体基因组进行了序列测定和分析。结果表明,测序共得到2 551 175 100 bp碱基数,Q20为95. 40%,文库构建质量好,测序结果准确性高,得到长度为16 642 bp完整的闭合环状线粒体基因组,其GC含量为39. 17%,K-mer为53 bp。从NCBI下载其他绒山羊品种的线粒体基因组序列信息,进行系统发育分析,结果表明,内蒙古绒山羊的3个类群距离比较近,其中,阿拉善型和二狼山型的关系最近,阿尔巴斯次之;内蒙古绒山羊和辽宁绒山羊可以分为单独的2个类群,与国外品种San Clemente的距离最远。  相似文献   

转录组测序技术在绒毛用羊中的应用研究进展     

李晓燕  王晓铄  王乐乐  张燕军  苏蕊  王瑞军  李金泉 《中国畜牧兽医》2015,42(7):1692-1698

高通量转录组测序技术在绒毛用羊参考转录组信息的研究过程中发挥着越来越重要的作用。作者主要介绍采用二代高通量测序技术(以RNA-Seq为主),挖掘绒毛用羊产毛、产绒等重要功能性状的分子标记,重点分析新发现的山羊新基因及与绒毛用性能相关的候选标记,为调控绒毛生长的分子机制、相关基因表达调控网络及绒毛分子育种等工作的深入研究提供参考。  相似文献   

蛋白质组学技术的应用研究     

韩文静  张燕军  王乐乐  李晓燕  苏蕊  王瑞军  李金泉 《中国畜牧兽医》2015,42(11):2928-2934

蛋白质组学是探索细胞内蛋白质之间的相互作用及其变化规律的学科,近年来它被广泛应用于生命科学的各个领域,蛋白质组学还提供了一套在整体、动态水平上研究蛋白质的工具,大规模蛋白质组学技术的建立又极大地推动了蛋白质组学的研究进展。这些技术不但可以进行蛋白质的提取和分离,还可以进行目的蛋白的鉴定和分析。作者简述了蛋白质组学技术在疾病、皮肤、毛囊发育周期等方面的研究成果,以期为深入在绒毛用羊领域的研究提供借鉴。  相似文献   

影响稻谷脂肪酸值测定的因素     

苏蕊雨 《粮油仓储科技通讯》2009,25(6):49-50

脂肪酸值是稻谷储存品质的判定指标之一,测定脂肪酸值时样品的粉碎细度,测定环境的温、湿度,滴定终点的判断等,都会影响测定结果的准确性。  相似文献   

不同品种山羊Hoxc9基因的克隆及序列比较分析          下载免费PDF全文

张燕军  李金泉  尹俊  张文广  苏蕊  王瑞军 《南方农业学报》2014,45(2):299-304

[目的]分析不同山羊品种Hoxc9基因序列及其推导氨基酸的差异性,为探索Hoxc9基因在山羊毛囊生长发育中的作用机制及研究绒山羊绒毛分子调控机理奠定基础.[方法]根据GenBank上已发表的Hoxc9基因序列设计3对引物,利用PCR扩增安哥拉山羊、萨能奶山羊、藏山羊、波尔山羊4个山羊品种的Hoxc9基因序列,然后与前期研究获得的绒山羊Hoxc9基因序列进行对比分析.[结果]利用设计的3对引物均能克隆获得安哥拉山羊、波尔山羊、萨能山羊和藏山羊的Hoxc9基因,与绒山羊Hoxc9基因比较,其5'UTR序列同源性为99.2%~100.0%,3'UTR序列同源性为99.0%~100.0%,cDNA序列同源性为99.5%~100.0%,内含子序列同源性为99.2%~99.7%,推导氨基酸序列同源性为98.8%~100.0%.Hoxc9蛋白质序列比较分析发现,安哥拉山羊和波尔山羊氨基酸的变异未造成Hoxc9蛋白质功能位点改变,但其二级结构有4处不同.[结论]不同山羊品种Hoxc9基因序列的同源性比较高,但也存在差异性.  相似文献   

影响青海细毛羊早期性状非遗传因素的研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

王鹏宇  官却扎西  祁全青  李发林  张海刚  李光梅  德毛  白堃  王志英  杨慧茹  王瑞军  刘慧  张燕军  苏蕊  张文广  李金泉 《内蒙古农业大学学报(自然科学版)》2011,(4):29-33

以年度(YEAR)、场(HERD)、性别(SEX)、母亲年龄(DAGE)作为固定效应,应用方差分析方法,系统分析了2005～2010年间青海细毛羊早期性能记录。结果显示,年度、场对青海细毛羊早期性状均有显著影响,母羊年龄对初生重、断奶重、周岁剪毛前体重有显著影响,性别对初生重,断奶重,周岁剪毛前体重、周岁产毛量、羊毛长度、羊毛细度影响显著;所有性状均随母亲年龄的增加呈上升趋势,研究结果将为优化群体周转结构,建立青海细毛羊早期生产性状遗传评价模型提供科学依据,最终为该品种羊的早期选种奠定基础。  相似文献