一种基于RPA的番茄褪绿病毒检测方法     

宋建  薛俊  孙海波  王姝  金凤媚 《植物保护》2020,46(4):168-170

番茄褪绿病毒Tomato chlorosis virus(ToCV)引起番茄褪绿病毒病,给番茄生产造成严重危害。开发快速准确的检测方法对该病害的防控具有重要意义。利用番茄褪绿病毒外壳蛋白(CP)基因序列,设计特异性引物,建立了ToCV的重组酶聚合酶等温扩增(recombinase polymerase amplification, RPA)检测方法,同时分析了该方法的灵敏度和特异性。结果表明,建立的ToCV-RPA方法在38℃恒温下40 min可从ToCV阳性的番茄样品中扩增出246 bp的特异性条带。扩增时间短,对设备要求低,且与番茄其他病毒无交叉反应,特异性好,灵敏度可达到PCR方法的10倍,适用于ToCV的快速检测。  相似文献   

ToCV和TYLCV复合侵染番茄后部分病毒基因序列分析及实时荧光定量PCR分析     

宋建  薛俊  金凤媚  孙海波  张越  王姝  范寰  周祥明  陈锐 《华北农学报》2019,34(2)

番茄褪绿病毒病(ToCV)和番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)存在复合侵染的现象,其发病率逐年递增,成为一种新的威胁番茄产业的病毒病害。为了研究复合侵染样品中2种病毒的互作和基因变异情况,对天津番茄产区发生的TYLCV全基因组和ToCV的CP基因和HSP基因进行了克隆和序列分析。结果表明,与单独侵染样品进行比对,TYLCV的基因序列在复合侵染的样品中共有6处碱基发生了变异,分别为73位A→C、92位A→G、347位C→T、1 209位C→T、1 618位A→G、2 107位A→T,除73位和92位的变异未在编码区,其余的变异碱基均在ORF框内,其中1 209位为同义突变,其他均发生了错义突变。ToCV的CP基因有1处同义突变,ToCV的HSP基因共有4处碱基变异,其中826位由T→C和1 166位由G→A均为同义突变,1 395位和1 630位均由A→G,为错义突变。利用实时荧光定量PCR技术对单独侵染和复合侵染的番茄样品中TYLCV和ToCV病毒积累量进行分析。结果表明,在田间单独侵染和复合侵染的样品中, TYLCV的拷贝数差异不显著,ToCV的拷贝数在单独侵染和复合侵染的样品中差异也不显著。在复合侵染的样品中,TYLCV的拷贝数约为ToCV的262～436倍。  相似文献   

番茄裂果与果皮结构的关系及其杂种优势表现   总被引：3，自引：0，他引：3  

刘仲齐  薛俊  金凤媚  白艳玲 《华北农学报》2007,22(3):141-147

以4份抗裂番茄为母本,3份易裂番茄和1份抗裂番茄为父本,按照不完全双列杂交设计配制4×4的杂交组合,研究8个亲本和16个F1的裂果特性与果皮结构的关系,分析它们的杂种优势表现.结果表明,易裂基因型的果皮较薄,抗裂基因型的果皮普遍较厚,但也有果皮薄而抗裂能力强的基因型.裂果特性有明显的杂种优势,优势的方向在不同组合间有很大的差异.亲本的一般配合力对杂种后代的抗裂时间发挥了决定性作用.对利用结构特征改良番茄抗裂能力的潜力进行了讨论.  相似文献   

水稻耐盐转基因及分子标记的研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

金凤媚  薛俊  郏艳红  刘仲齐 《天津农业科学》2005,11(3):8-11

回顾水稻耐盐性研究的历史;概述水稻的渗透调节物质如脯氨酸、海藻糖、甜菜碱、糖醇类等对盐胁迫的生理反应及转基因研究;介绍分子标记在水稻耐盐育种上的应用。  相似文献   

不同番茄品系吸收和积累镉能力的差异     

宋建  金凤媚  薛俊  刘仲齐 《安徽农业科学》2016,(5):33-35

[目的]研究不同番茄品系吸收和积累Cd能力的差异。[方法]采用水培和盆栽试验,研究不同Cd浓度胁迫下2种番茄品系不同组织器官(根、茎、叶)和果实Cd吸收量来筛选Cd低积累番茄品种。[结果]番茄是Cd敏感型的植物,外界Cd浓度的变化可引起体内Cd含量的变化,且呈正相关。不同Cd浓度胁迫条件下番茄各器官的Cd含量从大到小顺序为根、茎、叶、果实。[结论]低积累品种FB6中的Cd含量和变化幅度都低于高积累品种ZF6,可进一步用于番茄的无害化栽培。  相似文献   

天津地区番茄褪绿病毒的分子检测与基因组部分序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

金凤媚  薛俊  宋建  于海涛  段红英 《华北农学报》2016,(2):23-27

为了确定天津番茄产区是否发生了番茄褪绿病毒病,了解该病毒天津分离物的主要基因是否发生变异,对该地区发生的To CV进行了分子检测,并对该病毒的外壳蛋白(CP)和热激蛋白70类似物(Hsp70h)的核苷酸和氨基酸进行了序列分析。结果表明,天津分离物CP蛋白的核苷酸和氨基酸序列与已报道的具有代表性的不同国家的分离物相似性均在97.3%以上。Hsp70h蛋白的核酸和氨基酸序列与已报道的具有代表性的不同国家的分离物相似性均在97.2%以上。表明CP和Hsp70h蛋白是2个最保守的蛋白。这是首次在分子水平上证明番茄褪绿病毒在天津地区为害。  相似文献   

半定量RT-PCR技术的研究及应用   总被引：2，自引：1，他引：1  

金凤媚  薛俊  郏艳红  刘仲齐 《天津农业科学》2008,14(1):10-13

介绍了半定量逆转录多聚合酶链式反应(RT-PCR)技术的原理和实验过程中潜在的问题,并且讨论了该技术在实际中的应用。  相似文献   

番茄抗病基因Sw-5和Ty-3a的多重PCR检测体系的建立     

金凤媚  薛俊  宋建  王姝  张越 《北方园艺》2017,(11):115-118

以含有斑萎病毒和黄化曲叶病毒抗病基因和感病基因的番茄为试材,采用多重PCR方法,建立番茄抗斑萎病毒Sw?5和抗番茄黄化曲叶病毒的Ty?3a基因同时扩增的体系,以期为番茄分子标记抗病育种提供更省时、省力、经济的方法。结果表明:多重PCR扩增的特异性片段与单引物扩增片段完全一致,与Sw?5基因紧密连锁的SCAR标记,在抗病基因型中可扩增出574bp的条带,感病基因型中扩增出464bp的条带;与Ty?3a基因紧密连锁的SCAR标记,在抗病基因型中可扩增出630bp的条带,感病基因型中扩增出320bp的条带,多重PCR体系可在同一PCR反应体系中对2个抗病基因进行筛选鉴定及苗期早期辅助选育。  相似文献   

利用等位基因特异性PCR技术检测番茄高色素基因hp1和hp2的SNP   总被引：2，自引：0，他引：2  

金凤媚  杨迎霞  薛俊  郏艳红  刘仲齐 《农业生物技术学报》2009,17(5):851-857

摘要：番茄高色素基因hp1和hp2突变体与野生型基因相比均发生了单碱基的点突变,常规PCR技术很难把它们区分开。本试验对碱基错配类型和位置与特异性PCR的关系进行了研究。结果表明：引入TA-TG双碱基错配的引物,退火温度在49.3+0.1℃时能把hp1基因的突变位点和野生型的对应位点区分开来。引入T-C碱基错配的引物,退火温度在53.5+0.1℃时能把hp2基因的突变位点和野生型的对应位点区分开来。错配碱基在引物3′端的位置对PCR的特异性影响不大。  相似文献   

早熟机采加工番茄新品种新番48 号的选育     

曾沂辉  薛琳  王诚军  高明  金凤媚  祝晏兵  李英  孙秀霞 《中国蔬菜》2014,1(12):47

新番48号是以F19-3-1-1 为母本，以TD-06-2为父本配制而成的早熟机采加工番茄一代杂种。直播生育期87 d（ 天），
株高65 cm，株型开展，叶色深绿，6～7 个分枝，第1 花序节位为第7 节，果实椭圆形，果形指数1.2，果色深红，光亮，
无绿果肩，2～3 心室，平均单果质量70～75 g。番茄红素含量123 mg·kg^-1，可溶性固形物含量4.64%，总酸含量0.38%。
果实耐压，田间耐贮性较好，适合机械化采收或人工一次性采收。平均每667 m² 产量8 000 kg 以上。适合新疆南北疆、甘肃
等地种植，用于生产番茄酱。  相似文献