瓜类褪绿黄化病毒及其系统进化分析     

韩盛  麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔  杨渡  温且木·阿布列孜  玉山江·麦麦提 《新疆农业科学》2021,58(5):866-872

【目的】检测新疆南疆7个县/市瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus, CCYV),进行系统发育分析,为新疆南疆CCYV预警和防控提供参考。【方法】于2019年,从中国新疆南疆7个县/市采集带有黄化特征的51份甜瓜叶片样品,RT-PCR进行CCYV的检测,进行特异性片段的克隆、测序和系统发育分析。【结果】中国新疆巴楚县、阿克苏市、莎车县、伽师县、疏勒县、疏附县均未检测到CCYV,而洛浦县的13份样本中,8份检出为CCYV阳性,检出率为61.53%,洛浦县CCYV特异性片段克隆测序获得了685 bp的核酸序列,与GenBank中的CCYV分离物外壳蛋白(Coat protein, CP)的一致性达到100%。所得序列与中国新疆(吐鲁番)、中国其他省、苏丹、日本、塞浦路斯、黎巴嫩的CP基因聚在I组(Group),沙特阿拉伯的分离物聚在Ⅱ组,伊朗的分离物聚在Ⅲ组。【结论】CCYV在中国新疆南疆洛浦县甜瓜产区发生,与中国新疆吐鲁番、中国其他省及周围国家的CCYV分离物亲缘关系很近,且群体遗传变异很小。  相似文献   

猪乙型脑炎病毒GZ0409-31分离株E基因遗传进化分析     

《中国兽医杂志》2017,(9)

本研究采用RT-PCR方法对分离自贵州省发病猪睾丸组织中的流行性乙型脑炎病毒GZ0409-31株的E基因进行克隆和序列测定,利用生物信息学软件对E基因核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行分子遗传进化关系分析。结果表明,乙型脑炎病毒GZ0409-31毒株与基因Ⅲ型的乙脑病毒毒株属同一分支,遗传进化关系较近。  相似文献   

5种蔷薇科树种多酚氧化酶比较基因组学分析     

闫洪波  李桂琴  宋亚伟  孟钰玉  王云松  关军锋 《热带作物学报》2017,(2):320-327

蔷薇科植物中有多种具有重要价值的水果,如苹果、梨、桃、草莓和黑树莓等。这些水果普遍容易发生由多酚氧化酶(PPO)介导的酶促褐变而导致重大经济损失,从全基因组角度分析比较PPO基因家族,有助于加深对PPO基因家族和功能的认识。采用比较基因组学的方法,对这5种植物的PPO基因家族进行了基因鉴定、染色体定位、编码蛋白的亚细胞定位、内含子统计分析、基因系统进化、基因倍增与丢失等特征分析。从这5种植物中,共计鉴定出了42个PPO基因,其中6个基因被认定是假基因;绝大多数基因编码的蛋白定位于叶绿体,2个定位于线粒体,3个是分泌型蛋白;PPO基因在染色体上有串联重复和散布两种形式;9个基因具有内含子,聚类结果显示可以将它们分为6个类型,每个基因类型在进化过程中都发生过基因倍增和丢失;同型基因内含子的位置和大小具有相似性。这些结果揭示蔷薇科植物PPO基因内含子是伴随着基因倍增产生的,基因倍增也是推动PPO基因多样化的重要动力,PPO基因倍增和丢失差异导致PPO基因数量在不同物种之间产生差异。  相似文献   

芸薹属及其他异源多倍体植物的基因表达特征研究进展     

张大为  谭晨  李再云 《中国油料作物学报》2018,40(3):438

远缘杂交及异源多倍化导致许多重要作物的起源与进化，而芸薹属栽培异源四倍种是研究作物异源多倍化的模式系统之一。异源多倍体是如何调控及协调来自不同二倍体祖先的不同基因组的遗传行为及基因表达，是过去二十年间的研究热点和重要的生物学问题。利用不断发展的分子生物学技术，一方面揭示出芸薹属及其他多倍体物种基因组表现出动态性质，即在形成初期及长期进化过程中持续发生遗传及表观遗传的变化；另一方面发现异源多倍化过程中伴随着大量的基因表达模式改变，包括非加性表达、超亲表达、表达水平显性、部分同源偏向表达、基因剂量平衡效应等现象。上述基因组结构、表观遗传改变以及基因表达模式的调控，使新产生的多倍体得以成功进化为新物种。  相似文献   

猪Delta冠状病毒的流行病学调查及M基因序列分析     

马玉飞  李本强  陶洁  程靖华  刘雷  刘惠莉 《上海农业学报》2020,36(1)

为了解猪Delta冠状病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)在发生腹泻疫情猪群中的感染情况,根据PDCoV M基因的保守序列设计了一对检测引物,建立了猪Delta冠状病毒的的检测方法,其最低核酸检测限量为3.92×10~3 copies/μL,特异性和灵敏度均较好。利用该方法对2015—2017年上海周边猪场的518份猪腹泻粪便样品进行检测,检测出25份PDCoV阳性样品,阳性感染率达4.8%。在所检出的阳性样本中,PDCoV与猪嵴病毒(Porcine kobuvirus,PKV)和猪星状病毒(Porcine astrovirus,PAstV)的混合感染率较高,分别为40%和48%;PDCoV与猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)混合感染率为8.0%,未检测到PDCoV与猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TEGV)混合感染的样本。随机选取10份PDCoV阳性样本,对扩增的M基因片段同源性进行分析,结果发现,10份样品中核苷酸同源性达95.0%—99.6%,与GenBank登录的PDCoV毒株的同源性为96.1%—100%,说明目前流行的PDCoV毒株的遗传差异不大,该研究可为了解PDCoV流行情况提供参考依据。  相似文献   

树木挥发物对植食性昆虫的诱导抗性   总被引：1，自引：0，他引：1  

陆群  张玉凤 《内蒙古林业科技》2001,(2):32-34,43

树木挥发物质对植食性昆虫取食，产卵所产生的诱导抗性是树木与昆虫的长期协同进化过程中的必然结果，树木与植食性昆虫之间发展了一套互相调节，自身开拓资源，产生生存对策的复杂相互关系，本文着重阐明了树木与植食性昆虫的互相策略，诱导抗性的生物化学基础以及诱导抗性在调节植食性昆虫种群中的重要性。  相似文献   

鸡的热应激反应及防治措施     

朱锐广 《山东畜牧兽医》2006,(1):28-29

应激反应是机体在长期进化过程中形成的一种扩大适应范围的生理反应,是一种特殊的生理状态。热应激是指动物在高温的环境条件下所表现出来的一系列异常反应。在夏季持续的高温、高湿环境下,鸡群受热应激的影响,采食量减少,体重下降,肉鸡生长缓慢,蛋鸡产蛋下降,给养鸡业带来一定  相似文献   

动物的活化石——鸭嘴兽     

阙秀如 《森林与人类》2005,25(11):94-95

朋友!你见过鸭嘴兽吗?当我学习动物学的时候,老师介绍鸭嘴兽的特殊形态、生活习性和在动物界的特殊地位,给我留下深刻的印象。他说鸭嘴兽既属于哺乳类的脊椎动物,却又是卵生的;它长有鸟类的喙,也像鸟类一样具有自己营造窝巢、卵雏的本领,可它又能像鱼类一般自如地在水中游行;生  相似文献   

HSP70在小鼠睾丸中定位与表达研究     

李晟阳  罗光彬  石娇  何丽华  赵立虎 《现代畜牧兽医》2005,(7):16-17

1974年，Tissiers利用SDS凝胶电泳技术首次证明，热应激能诱导果蝇体内产生一组蛋白质，他把因环境温度升高诱导细胞合成的这组蛋白质，称为热激蛋白(HSPs)。HSPs是动物在不良因素作用下所产生的一组特殊蛋白质，任何应激均可诱导机体的HSPs合成增加，它能使动物迅速适应环境的变化，保护机体不受或少受损害。有研究表明，HSPs在正常细胞内也有表达。HSP70家族成员众多，它们在进化上高度保守，种属间同源性高，可分为热诱导型和非热诱导型。  相似文献   

昆虫滞育及滞育关联蛋白   总被引：1，自引：0，他引：1  

曾庆礼陈芳艳  张冬燕林健荣 《广东蚕业》2004,38(2):37-41

昆虫属于变温动物，其生命活动受环境条件的影响，极端的高温或低温影响其正常生活，同时也威胁昆虫种和个体的生命维持，在漫长的进化过程中，昆虫对环境条件的不断适应和环境对昆虫个体的选择，最终出现了昆虫滞育的特性。  相似文献