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甘蔗宿根矮化病菌 PCR检测体系的优化与应用
引用本文:李文凤,卢文洁,黄应昆,王明强,王晓燕,罗志明.甘蔗宿根矮化病菌 PCR检测体系的优化与应用[J].云南农业大学学报,2011,26(5):598-602.
作者姓名:李文凤  卢文洁  黄应昆  王明强  王晓燕  罗志明
作者单位:云南省农业科学院甘蔗研究所,云南省甘蔗遗传改良重点实验室,云南 开远 661600
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-20-2-2);公益性行业(农业)科研专项资金(ny-hyzx07-019);云南省人才培养项目(2008PY087).
摘    要:为建立能快速灵敏检测甘蔗宿根矮化病 (ratoonstuningdisease,RSD)的 PCR检测方法。本文通过改进模板 DNA的制备方法,在 PCR基本程序的基础上,以甘蔗宿根矮化病菌 (Leifsoniaxylisubsp.xyli,Lxx)16S-23SrDNA基因间隔区特异性引物,调整 PCR扩增反应体系各组分的浓度、反应的退火温度、循环参数等主要因子,优化 PCR反应体系。此检测体系能从感染 RSD的样品中扩增出大小为438bp的特异性片段,而阴性对照和未感染样品则未扩增出任何片断;未优化仅从稀释30倍的蔗汁总 DNA中扩增出 RSD的特异性片段,优化后可以从稀释3000倍的蔗汁总 DNA中扩增出 RSD的特异性片段。对31份田间采集样品检测,未优化的阳性检出率为 32.26%;优化后阳性检出率 74.19%,与 I-ELISA检测结果一致。应用此检测方法可稳定、快速地检测出蔗株是否感染 RSD,且检测效率高,适合于田间大批量样品快速检测。

关 键 词:甘蔗宿根矮化病菌  PCR检测  16S-23S  rDNA  间接酶联免疫吸附法
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