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应用DGGE技术分析自然免耕土与普通耕作土细菌群落的多样性
引用本文:马振刚,马淑华,张时恒,贾俊杰,李田,潘国庆,周泽扬.应用DGGE技术分析自然免耕土与普通耕作土细菌群落的多样性[J].江苏农业学报,2011,27(6).
作者姓名:马振刚  马淑华  张时恒  贾俊杰  李田  潘国庆  周泽扬
作者单位:1. 西南大学农业部蚕桑学重点实验室,重庆,400716
2. 西南大学农业部蚕桑学重点实验室,重庆400716;重庆师范大学生命科学学院,重庆400047
基金项目:高等学校学科创新引智计划项目,西南大学研究生科技创新基金项目
摘    要:为探明免耕土壤与普通耕作土壤环境中细菌群落的多样性,获取相关优势菌落信息,该研究利用宏基因组学方法获得免耕土和普通耕作土样品总DNA,利用PCR获得16SrDNAV3片段,并进行变性梯度凝胶电泳(Denaturation gradient gel electrophoresis),通过微生物种群丰富度比较两样品中群落的丰富性,同时选取相关DNA条带进行克隆、测序和生物信息学分析.结果显示:免耕土壤中细菌群落多样性更加丰富;两类型土壤样品间细菌群落组成具有显著差异,证明耕作制度影响了土壤细菌群落结构.BLAST分析与系统发生分析结果表明,免耕土壤中特异存在的细菌群落与具有生物固氮、降解甲苯和倍硫磷等特性的细菌序列相似性较高或进化关系较近,推测其在免耕土壤肥力、有毒物质降解及有机质转变等过程中起作用.

关 键 词:免耕土  DGGE  16S  rDNA  细菌群落  自净能力

Analysis of bacterial communities in no-tillage and tillage soils by denaturing gradient gel electrophoresis
MA Zhen-gang , MA Shu-hua , ZHANG Shi-heng , JIA Jun-jie , LI Tian , PAN Guo-qing , ZHOU Ze-yang.Analysis of bacterial communities in no-tillage and tillage soils by denaturing gradient gel electrophoresis[J].Jiangsu Journal of Agricultural Sciences,2011,27(6).
Authors:MA Zhen-gang  MA Shu-hua  ZHANG Shi-heng  JIA Jun-jie  LI Tian  PAN Guo-qing  ZHOU Ze-yang
Abstract:
Keywords:
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