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PRRSV-GP5基因的克隆及其蛋白结构和B细胞表位预测
引用本文:陈军义,王开功,罗险峰,周碧君,文明,程振涛,张双翔,路宪礼,刘飞.PRRSV-GP5基因的克隆及其蛋白结构和B细胞表位预测[J].中国兽医学报,2011,31(6).
作者姓名:陈军义  王开功  罗险峰  周碧君  文明  程振涛  张双翔  路宪礼  刘飞
作者单位:1. 贵州大学动物科学学院,贵州贵阳,550025
2. 贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州省动物疫病研究所,贵州贵阳550025
3. 贵州省动物疾病预防控制中心,贵州贵阳,550000
基金项目:贵州省农业攻关项目[黔科合NY字(2009)3071号]; 国家科技部支撑计划项目(2007BAD53B03); 贵州省科技厅重大专项子项目(20086011); 贵阳市农业局科技计划项目([2008]动防-03号); 贵州省农业委员会科技计划项目(2009-09)
摘    要:应用RT-PCR扩增PRRSV-GP5目的基因,将纯化DNA与pMD18-T载体连接并转化入DH5α菌株,将阳性重组质粒进行测序和同源性对比。以此基因为材料,应用同源模型化的方法建立其3D结构和DNAStar软件预测其二级结构、亲水性、抗原指数、表面可及性及柔韧性,并综合分析了其B细胞抗原表位。结果表明,该基因高度保守,同时PRRSV-GP5蛋白呈现较规则的空间结构,其肽段32~36、51~53、140~142、146~151和196~197可能是其优势B细胞抗原表位区域,该结果将为PRRSV-GP5基因工程疫苗的研究和体外表达产物的应用提供理论依据。

关 键 词:PRRSV  GP5基因  克隆  蛋白结构  B细胞抗原表位  

Clone prediction of protein structure and B cell epitopes for PRRSV-GP5
CHEN Jun-yi,WANG Kai-gong,LUO Xian-feng,ZHOU Bi-jun,WEN Ming,CHENG Zhentao,ZHANG Shuang-xiang,LU Xian-li,LIU Fei.Clone prediction of protein structure and B cell epitopes for PRRSV-GP5[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2011,31(6).
Authors:CHEN Jun-yi  WANG Kai-gong  LUO Xian-feng  ZHOU Bi-jun  WEN Ming  CHENG Zhentao  ZHANG Shuang-xiang  LU Xian-li  LIU Fei
Institution:CHEN Jun-yi1,WANG Kai-gong1,2,LUO Xian-feng3,ZHOU Bi-jun1,WEN Ming1,CHENG Zhen-tao1,ZHANG Shuang-xiang1,LU Xian-li1,LIU Fei1(1.College of Animal Science,Guizhou University,Guiyang 550025,China,2.Guizhou Animal Disease Institute,3.Guizhou Centers of Animal for Disease Prevention and Control,Guiyang 550000,China)
Abstract:
Keywords:PRRSV  GP5 gene  clone  protein construction  B cell epitope  
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