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基于16S rDNA高通量测序技术分析受水灾影响猪场水样的菌群特征
引用本文:洪勃,孙琪,李栋凡,于学祥,库旭钢,何启盖.基于16S rDNA高通量测序技术分析受水灾影响猪场水样的菌群特征[J].畜牧兽医学报,2023(5):2092-2100.
作者姓名:洪勃  孙琪  李栋凡  于学祥  库旭钢  何启盖
作者单位:1. 华中农业大学动物医学院;2. 农业微生物学国家重点实验室;3. 华中农业大学动物疫病诊断中心
基金项目:国家现代农业(生猪)产业技术体系(CARS-35);
摘    要:2021年7月,河南省部分地区突发特大水灾,致使受灾区域内的猪场损失惨重,本研究旨在探究水灾发生后猪场水样中存在的病原菌,为猪场防控可能出现的疾病提供技术支撑。通过实地采样和委托采样的方式,获得了26个受灾猪场中的48份水样,包括19份猪饮用水、22份场内积雨水和7份废弃污水,采用菌落计数和高通量测序技术,对样品的细菌总数和菌群丰度进行分析研究,同时对采集的水样开展消毒剂杀菌试验。结果发现:饮用水、积雨水和污水中的平均含菌量分别为1.55×105、1.88×108和3.70×109 CFU·mL-1,其中污水中的细菌总数最多,其次为积雨水,饮用水中的细菌总数最少,但远超国家饮用水的安全标准。本研究在不同种类的水样中均检测到了链球菌属、埃希氏杆菌属、弓形杆菌属、不动杆菌属和假单胞菌属等潜在的致病菌属,以及嗜低温弓形杆菌、猪链球菌、大肠杆菌、鲍曼不动杆菌和豚鼠气单胞菌等致病菌。杀菌试验显示,氯制剂终浓度达到2 500mg·L-1,作用30 min即可杀灭积雨水和污水中所有的细菌。本...

关 键 词:16S  rDNA  猪场  洪水  细菌
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