| DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究 |
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| 引用本文： | 周建设,张驰,刘海平,马波,王万良,曾本和,牟振波.DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究[J].淡水渔业,2019(1):33-41. |
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| 作者姓名： | 周建设 张驰 刘海平 马波 王万良 曾本和 牟振波 |
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| 作者单位： | 西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;河南农业大学牧医工程学院;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所 |
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| 摘 要： | 为确定DNA条形码技术在西藏水系裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)物种鉴定中的可行性,利用西藏水系所采集260尾裂腹鱼亚科样本,测定其线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(COI)基因片段序列,计算遗传距离,构建系统发育树,并与GenBank中相关序列进行比对。260个样本经检测均获得有效COI基因扩增片段,COI基因碱基组成偏倚明显,A+T含量为54.74%,显著高于G+C含量(45.26%)。基于Kimura双参数模型计算遗传距离,遗传距离阈值设置为0.02时,260个样本可被鉴定到种的为249尾样本,11尾由于样本量少,数据库中存在多个命名,只鉴定到属,其中与形态学鉴定一致的179尾样本,一致率为68.8%,裂腹鱼亚科裸鲤属(Gymnocypris)不能通过COI基因鉴定到种,拉萨裂腹鱼(Schizothoracinae)、异齿裂腹鱼(S.schizothorax o#x02BC;connori)、巨须裂腹鱼(S.macropogon)3个种之间的遗传距离阈值以0.02不能有效鉴别,而遗传距离阈值以0.01作为这3个种的鉴定标准,可达到有效鉴别的目的。基于邻接法构建系统发育树,裂腹鱼亚科鱼类形成一个支持率较高的单系群,Bootstrap检验支持率为99%,系统进化树聚类方式与以遗传距离值为标准的鉴定结果一致,很好地反映了水系物种间的地理和历史联系。
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| 关 键 词： | 西藏 裂腹鱼 DNA条形码 COI 物种鉴定 |
Studies on identification of Schizothoracinae population in Tibet water system by DNA barcode |
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