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相似文献
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1.
黑麦重复序列在检测小麦品种中外源染色体的应用   总被引:2,自引:0,他引:2  
本研究根据RAPD引物OPH20在黑麦中扩增出的特异序列pSc20H.2设计一对PCR引物pSc20ht-23/24,以来源于黑麦的小麦抗叶锈近等基因系材料TcLr45及感病对照Thatcher为亲本进行PCR扩增。并对42个小麦抗叶锈近等基因系及103个小麦品种材料进行检测。引物pSc20ht23/24在TcLr45中扩增出一条约750bp的条带,而在Thatcher中无扩增条带。对该特异片段回收、克隆测序为734bp。42个小麦抗叶锈近等基因系检测在TcLr26中扩增出与TcLr45相同的条带,而在同样来源于黑麦的小麦抗叶锈近等基因系TcLr25中未扩增出该条带;中国春-Imperial黑麦附加系1R-7R中除5R外均扩增出该条带;13个1B/1R易位系小麦品种也扩增出该条带;90个地方小麦品种中有16个扩增出该条带,6个品种经系谱分析具有黑麦遗传背景,表明该标记可用于检测小麦中含有的除黑麦5R染色体之外的外源染色质。  相似文献   

2.
为了深入了解7个大穗型小麦品系的遗传基础及更好地利用其对小麦进行遗传改良,利用SSR技术,对从小麦-黑麦代换系5R/5A与6R/6A杂交后代中选育的大穗型品系08-4、08-5、08-6、08-7、08-8、08-9、08-12进行了分析。结果表明,使用位于黑麦染色体上的17个SSR引物,在15个引物位点上,7个品系带型同普通小麦的相似。从所用引物中筛选出引物Xgwm247-6RL,在08-4、08-8、08-12和黑麦中扩增出约168bp、178bp、190bp 的三条黑麦特异片段,证明了品系08-4、08-8、08-12 中导入了黑麦6R染色体长臂的遗传物质。由于这些品系具有大穗、多小穗等优良性状,是有经济价值和利用价值的遗传材料。  相似文献   

3.
根据小麦盐胁迫诱导和茎秆组织相关EST序列开发了81对EST-SSR引物, 其中67、46、18和61对分别在小麦、黑麦、簇毛麦和大麦基因组中稳定扩增, 在不同小麦和大麦品种间具有多态性的引物分别有22和23对。利用小麦缺体-四体系共定位了43对引物的81个位点, 其中A、B和D染色体组上分别有29、30和22个位点, 涉及除4B、3D和6D外的18条染色体。此外30对引物在黑麦基因组中具有特异扩增, 其中8对分别在黑麦1R、4R、5R和R7染色体上具有特异扩增, 7对在多条黑麦染色体具有相同扩增。这些新标记可有效用于小麦及其近缘物种的遗传作图与比较遗传研究。  相似文献   

4.
六倍体小黑麦种质资源遗传多样性分析   总被引:3,自引:1,他引:2  
利用RAPD标记对10份六倍体小黑麦、1份普通小麦和1份黑麦种质资源遗传多样性进行了分析,19个RAPD引物中,有10个引物(52.63%)可扩增出清晰且具多态性的条带。10个引物共产生385条DNA片段,其中384条具有多态性,多态性比率为99.74%,不同引物扩增带数变幅为8~71条,平均为38.5条,扩增产物的片段大小为298~3 054 bp,材料间的遗传距离变化范围在0.724~0.833之间。对12份供试材料的遗传关系进行聚类分析,在平均GD值0.77水平上可将12份供试材料分为3类。研究结果为将六倍体小黑麦的优良基因导入到普通小麦中提供了理论依据。  相似文献   

5.
对来源于普通小麦的4种不同类型分子标记在黑麦的通用性进行比较,明确它们在黑麦扩增的有效性和多态性。335对引物对普通小麦品种兰考矮早八和黑麦进行PCR扩增,结果表明,有80对SSR、93对EST-SSR、33对EST-STS和98对PLUG引物可以在黑麦中扩增出清晰的DNA条带,分别占所用引物的80.0%、93.0%、94.3%和98.0%,表明基于小麦开发的这4种引物均可以用于黑麦遗传物质检测。进一步分析不同类型引物在普通小麦品种兰考矮早八和黑麦间的多态性,发现PLUG引物在二者间的多态比例最高,达到96.0%;SSR引物的多态比例相对较低,为86.0%;EST-SSR和EST-STS多态引物比例基本一致,分别为90.0%和91.4%。总的来看,来自小麦EST序列的引物(EST-SSR,EST-STS和PLUG)在黑麦的通用性和多态性均优于基因组SSR,其中PLUG引物在黑麦的通用性最好。  相似文献   

6.
以8077s与抗感的籼稻品种丰35亲本及杂交后自交所得的F2群体为材料,采用群分法(Bulked Segregant Analysis, BSA),从210个10mer随机引物,找到两个水稻苯达松敏感池和抗感池之间表现多态性的特异引物——S20和S316,分别产生的标记片段为S20-440和S316-590。它们与bel基因的连锁距离分别为12.132 cM和7.97 cM。对RAPD扩增标记的片段进行克隆、测序,根据测序结果合成两对特异性的SCAR引物,包含原有的RAPD序列。SC01引物在敏感单株中扩增出一条423 bp带;SC02引物在敏感单株中扩增出一条606 bp带,它们的SCAR标记与bel基因的连锁距离为10.66 cM和7.04 cM。应用SCAR标记对水稻恢复系进行了辅助选育。  相似文献   

7.
以抗病性强的奥地利黑麦(Secale cereale L.)为父本,与陕麦611杂交、自交,在衍生后代中筛选出表型整齐一致且抗白粉病性好的株系1530W3和1493E3。研究表明,两个衍生系在形态学和细胞学上已基本稳定,染色体构型为2n=44=22II。采用122个SSR引物对两个衍生系及其亲本进行SSR分析,有5个引物在两个衍生系中可扩增出黑麦的特异性产物,结果表明,黑麦的遗传物质已经导入到普通小麦中。  相似文献   

8.
山西冬小麦品种Waxy蛋白分析及分子标记研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法分析了山西100份小麦品种(系)Waxy蛋白的缺失类型,筛选出缺失Wx-B1蛋白亚基的材料8份。利用2个STS标记和1个SSR标记对不同Waxy蛋白缺失类型进行鉴定,验证其在分子标记辅助育种中的有效性,结果表明:Wx-7A位点的STS引物在野生型中扩增出1条450 bp的特异带,而在缺失Wx-A1蛋白亚基的突变材料中扩增出1条327 bp的特异带;Wx-4A位点的STS引物在野生型中扩增出1条440 bp的特异带,缺失Wx-B1蛋白亚基的突变材料中没有该扩增片段;Wx-7A,Wx-7D位点的SSR引物在野生型中分别扩增出1条265 bp和1条204 bp的特异带,在缺失Wx-A1和Wx-D1蛋白亚基的突变材料中没有扩增出该特异带。这3个标记可以用于分子标记辅助育种。  相似文献   

9.
以甜椒胞质雄性不育恢复系5-2R1和相应的保持系5-2为试材,利用SRAP分子标记技术筛选与甜椒恢复基因相关的分子标记。128对SRAP引物共扩增获得了3796条从100bp至800bp大小不同的条带,平均每对引物组合可扩增出30条清晰的条带,检测到4个多态性位点,其中恢复系材料仅有1个。对该特异片段进行回收、克隆和测序,结果表明该片段全长为259bp。经数据库比对分析表明,该片段与线粒体中的NADH脱氢酶第5亚基(GenBank:EF151914.1)具有81%的同源性;同时,该片段与辣椒BAC克隆PEPBAC 158K24(GenBank:FJ597540.1)的部分序列高度同源。根据序列特点设计特异SCAR引物,对恢复系和保持系进行扩增验证,仅在恢复系中扩增出目的条带,表明已成功地将此SRAP标记转化为简单、稳定的SCAR标记。我们推测本研究获得的SCAR标记可能与胞质雄性不育恢复性状连锁。  相似文献   

10.
簇毛麦1V染色体SSR标记的筛选   总被引:12,自引:3,他引:9  
选用位于普通小麦1A、1B、1D染色体上的32对微卫星引物对普通小麦中国春、簇毛麦、6个中国春-簇毛麦二体附加系和1个普通小麦-簇毛麦二体代换系进行SSR分析,发现引物Xgwm498在簇毛麦中扩增出2条长分别为110 bp和190 bp的片段(即Xgwm498/110和Xgwm498/190), 这两个片段仅在簇毛麦、中国春-簇毛麦1Ha附加系中出现,其余2Ha、  相似文献   

11.
两个抗小麦白粉病新基因的遗传分析与染色体定位   总被引:6,自引:0,他引:6  
YU25是从八倍体小偃麦TAI7047与小麦栽培品种川麦107杂交后代中选育出的对白粉病免疫的小麦育种新材料。以感白粉病小麦品种MY11与YU25杂交和回交的后代F1、F2、BC1F1和BC2F1为材料,采用四川省当前流行的小麦白粉病优势生理小种人工接种,对YU25的白粉病抗性进行了遗传分析。结果表明,YU25含有2对表现免疫反应和高抗反应的显性抗病基因,暂命名为PmE(免疫)和PmYU25(高抗)。用294对小麦微卫星引物和221个F2植株,对这2个基因进行连锁分析,发现小麦微卫星标记Xgwm-297-7B与PmE基因的遗传距离为13.0 cM,而Xgwm-210-2D与PmYU25基因的遗传距离为16.6 cM,因此将PmE和PmYU25分别定位在7BS和2DL上。根据系谱和基因位点分析,推断PmE和PmYU25均为起源于中间偃麦草、不同于已知的抗小麦白粉病基因的2个新基因。小麦育种新材料YU25含有可能来源于小麦-中间偃麦草的染色体多重易位,其细胞学基础和在实际育种中的应用值得进一步研究。  相似文献   

12.
为开发簇毛麦6V染色体短臂特异的分子标记,并利用这些标记对缺失系进行鉴定,选用11个RGA和17对STS引物进行多态性分析,其中1个RGA引物和1对STS引物在对普通小麦扬麦5号、簇毛麦及普通小麦-簇毛麦6VS/6AL易位系进行多态性分析时,分别检测到一条约1 000 bp和约800 bp的多态性片段,将这两个标记转化为稳定的特异性分子标记,分别命名为CINAU17-1086和CINAU18-723。运用这两对引物对一系列材料进行扩增,只有含6V染色体短臂的材料才能扩增出相应的特异条带,表明这两个标记均位于簇毛麦6VS上。进一步利用簇毛麦6VS缺失添加系、易位系将CINAU17-1086标记定位在簇毛麦6VS FL0.58与FL0.70之间,将CINAU18-723标记定位在簇毛麦6VS FL0.45与着丝粒之间。利用这两个特异标记对通过花粉辐射获得的部分簇毛麦6VS结构变异材料进行PCR鉴定,其结果与细胞学鉴定结果一致。CINAU17-1086和CINAU18-723标记可用来快速检测和追踪导入普通小麦背景中的簇毛麦6VS染色体片段,并对缺失系的断点进行了初步界定。  相似文献   

13.
Shotgun survey sequences of flow‐sorted individual rye chromosomes were data mined for the presence of simple sequence repeats (SSRs). For 787,850 putative SSR loci, a total of 358,660 PCR primer pairs could be designed and 51,138 nonredundant SSR marker candidates were evaluated by in silico PCR. Of the 51,138 SSR primer candidates, 1,277 were associated with 1,125 rye gene models. A total of 2,112 of the potential SSR markers were randomly selected to represent about equal numbers for each of the rye chromosomes, and 856 SSRs were assigned to individual rye chromosomes experimentally. Potential transferability of rye SSRs to wheat and barley was of low efficiency with 4.3% (2,189) and 0.4% (223) of rye SSRs predicted to be amplified in wheat and barley, respectively. This data set of rye chromosome‐specific SSR markers will be useful for the specific detection of rye chromatin introgressed into wheat as well as for low‐cost genetic and physical mapping in rye without the need for high‐tech equipment.  相似文献   

14.
小麦-黑麦二体代换系间杂交诱导染色体易位的研究   总被引:2,自引:1,他引:1  
摘 要:小麦-黑麦二体代换系间杂交,是诱导小麦-黑麦染色体易位的重要途径,有理论与应用价值。本研究利用DS1R/1D与DS5R/5A、DS6R/6A杂交,结果表明,F1减数分裂有19个二价体、4个单价体,有部分同源染色体配对和染色体易位现象;F2 对带有黑麦性状的24株普通小麦类型植株进行原位杂交检测,共检测出10株有染色体易位,易位频率为41.6%。易位株系为:06-16-7、06-16-3、06-16-5、06-16-7、06-16-8、06-17-7、0617-11、06-17-15、06-17-16、06-18-5。由于亲本选配、检测植株有一定的目的性,易位植株均表现有一定的应用价值。  相似文献   

15.
Jerzy Drzewiecki 《Euphytica》2001,119(3):279-287
Wheat-rye translocation line (2BS/2RL) has been developed for resistance to biotype L of Hessian fly and agronomically useful traits. AFLP analysis using 64 primer pairs was conducted in order to identify 2RL-specific polymorphisms between “Coker 797” (non-2RL), near-isogenic line (NIL) carrying 2RL, and “Hamlet”. Nine primer combinations identified twelve reproducible polymorphic fragments in the NIL carrying 2RL. These twelve fragments were cloned and sequenced with an aim towards converting AFLP markers into sequence tagged sites (STS). A comparison of the 12 sequences with non-redundant accessions in the NCBI database using the BLAST search option indicated that one fragment of approximately 200 bp in length (amplified using primer combination E+AAC / M+CTA) was highly homologous with the rye-specific repetitive sequence R173-1 and Wis-2-lA, a retrotransposon-like element in wheat. Two STS primers (SJ07 and SJ09) out of twelve STS primer sets enabled the detection of polymorphisms between Coker 797 and NIL carrying 2RL. In order to verify whether the polymorphism detected by primers SJ07 and SJ09 was in fact the result of the presence of 2RL, additional plant material was examined. Amplified products of about 260 bp fragment with the SJ07 primer set were generated in rye cvs.“Chilbohomil” and “Jochunhomil”, triticale experimental line Suwon 15, and wheat experimental line K-14 (1AL/1RS & 2BS/2RL), as well as NIL carrying 2RL and Hamlet, but not in Coker 797 (non-2RL), “Keumgangmil” (non-translocation wheat), KS92WGRC17 (PI592729 /;/ 6BS/6BL-6RL), KS92WGRC19 (P1592731 /;/ 4BS/4BL-6RL), “TAM200” (1AL/1RS), and “Siouxland” (1BL/1RS). Our data suggest that primer set SJ07 amplifies a “2RL-specific” fragment of diagnostic value. This revised version was published online in August 2006 with corrections to the Cover Date.  相似文献   

16.
A genome specific DNA sequence that detects Secale africanum chromatin incorporated into wheat was developed in this study. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to search for genome specific DNA sequences of S. africanum in lines, R111, “mianyang11” (MY11) and wheat-rye 1RS/1BL translocations R25 and R57. A high copy rye-specific DNA segment pSaD15940 of the S. africanum genome was obtained. The sequence of pSaD15 did not show any significant homology to other reported sequences in databases and it is therefore a new repetitive sequence of Secale. PCR primers were designed for pSaD15940, which amplify a clear 887 bp fragment in S. africanum but not in any wheat. The primers also amplified an 887 bp fragment in other accessions of rye, Chinese Spring-Imperial rye chromosome additions and a diverse range of material carrying different rye chromosomes or chromosomal segments. In situ hybridization showed that probe pSaD15940 was specifically hybridized throughout all rye chromosomes arms except for the terminal regions. The advantage of the rye-specific probe developed herein compared to those of previous reports is that it has been shown to be widely applicable to other Secale species. The probe will be useful as a molecular marker for the introgression of S. africanum and other rye chromosome segments into the wheat genome.  相似文献   

17.
Summary The chromosomal assignment of 64 PCR-amplified microsatellite loci and 29 additional fragments amplified by the same primer pairs is described for bread wheat (Triticum aestivum). The distribution over the different chromosomes and chromosome arms appears to be random. The highest proportion of microsatellite loci is found on the B genome, followed by the A and D genome. About half of the primer pairs amplified unique fragments, while the other half amplified additional fragments. 25% of the primer pairs, mostly designed to clones of a PstI-library, amplify fragments on homoeologous chromosomes. In some cases, more than one fragment on a single chromosome or fragments on non-homoeologous chromosomes occurred. The use of an automated DNA sequencer accounts for the accurate resolution of multiple fragments and enables to differentiate between fragments, amplified by a single primer pair, with size differences as small as two base pairs.  相似文献   

18.
小麦抗叶锈病基因Lr45的SSR分子标记   总被引:1,自引:0,他引:1  
用定位于2A染色体的59对SSR、EST-SSR引物,对小麦抗叶锈病基因Lr45进行分子标记,共筛选出11对揭示TcLr45多态性的引物。用157株F2抗感群体对这11对引物进一步检测,得到4个与Lr45共分离的SSR标记(Xgwm95、Xgwm47、Xgwm372和Xgwm122)。将经PAGE检测的标记Xgwm95的抗感差异带及Xgwm47的抗性片段进行克隆测序发现其中含有微卫星序列,且均为二核苷酸重复。Xgwm372和Xgwm122经琼脂糖凝胶电泳发现与Lr45的供体黑麦有共同的标记片段,可直接用于分子标记辅助选择。  相似文献   

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