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禽流感病毒分离株A/Chicken/Xinjiang/1/96(H14N5)NP基因序列分析 总被引：1，自引：0，他引：1
对ＲＴＰＣＲ扩增的禽流感病毒Ａ／Ｃｈｉｃｋｅｎ／Ｘｉｎｊｉａｎｇ／１／９６（Ｈ１４Ｎ５）分离株核蛋白基因进行了序列分析。结果表明：所克隆的基因包含了全部核蛋白阅读框架,编码区为１４９４个核苷酸。比较性研究表明,该毒株与Ａ／Ｍａｌａｒｄ／Ａｓｔｒａｋｈａｎ（Ｇｕｒｊｅｖ）／２６３／８２（Ｈ１４Ｎ５）有很高的同源性,而与人流感病毒株有较大,显示出明显的禽流感病毒特征。 相似文献
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禽流感病毒分离株A／Chicken／Xinjiang／1／96（H14N5）NP基因序列 … 总被引：2，自引：0，他引：2
对ＲＴ－ＰＣＲ扩增的禽流感病毒Ａ／Ｃｈｉｃｋｅｎ／Ｘｉｎｊｉａｎｇ／１／９６（Ｈ１４Ｎ５）分离株核蛋白基因进行了序列分析。结果表明：所克隆的基因包含了全部核蛋白阅读框架,编码区为１４９４个核革酸,比较性研究表明,该毒株与Ａ／Ｍａｌｌａｒｄ／Ａｓｔｒａｋｎａｈ（Ｇｕｒｊｅｖ）／２６３／８２（Ｈ１４Ｎ５）有很高的同源性,而与人流感病毒株有较大,显示出明显的禽流感病毒特征。 相似文献
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新城疫病毒弱毒株分子生物学特性的研究 总被引：3，自引：0，他引：3
于１９９６年从长春地区一养鸡场分离到一株新城疫病毒（ＮＤＶ长春株）,经过病毒生物学特性的研究表明该ＮＤＶ毒株为弱毒株。将ＮＤＶ长春株纯化培养后,提取病毒ＲＮＡ,经ＲＴ－ＰＣＲ扩增Ｆ基因,并测定出Ｆ基因的全部核苷酸序列为１７５８ｂｐ,编码有５５３个氨基酸残基。与国内外发表的部分ＮＤＶ病毒的强毒株和弱毒株的相同序列进行比较,其核苷酸同源性在８８．２％￣９６．７％之间,氨基酸同源性在９０．１％￣９８．１％之间,并与所有弱毒株Ｆ蛋白裂解位点区（１１２￣１１７）氨基酸序列Ｇｌｙ－Ａｒｇ／Ｌｙｓ－Ｇｌｎ－Ｇｌｙ／Ｓｅｒ－Ａｒｇ－Ｌｅｕ相同,从基因和分子水平上进一步证明ＮＤＶ长春株为ＮＤＶ弱毒株。 相似文献
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禽流感A／鸡／北京／1／96（H9N2）株核蛋白基因克隆和序列分析 总被引：17，自引：3，他引：14
本研究采用ＰＴ－ＰＣＲ法从禽流感Ａ／鸡／北京／１／９６（Ｈ９Ｎ２）株克隆了核蛋白（ＮＰ）基因。ＮＰ基因全长１４９７ｂｐ,编码４９８个氨基酸。将其序列与数株Ａ型流感病毒ＮＰ序列进行比较,相互间同源性在９６．６％～９５．４％。这一结果为研究核酸探针和其它方法诊断禽流感奠定了基础 相似文献
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禽流感病毒分离株 A/Chicken/Wangcheng/4/2001(H9N2)核蛋白基因(NP)的克隆和序列分析 总被引：1，自引：0，他引：1
用无特定病原体 (ＳＰＦ)鸡胚增殖禽流感鸡体分离株Ａ／Ｃｈｉｃｋｅｎ／Ｗａｎｇｃｈｅｎｇ／４／２００１(Ｈ９Ｎ２)(ＷＣ２００１),提取病毒总ＲＮＡ。根据已发表的Ａ型流感病毒株ＮＰ基因序列 ,设计一对引物 ,运用反转录 -聚合酶链反应(ＲＴ -ＰＣＲ)扩增该病毒分离株的ＮＰ基因 ,克隆后进行序列测定。序列分析表明 ,扩增的ＮＰ基因为相应的开放阅读框架。ＷＣ２００１株ＮＰ基因序列与数株Ａ型流感病毒ＮＰ序列进行比较 ,相互间同源性在８０%左右 ,其中与Ａ／Ｄｕｃｋ／ＨｏｎｇＫｏｎｇ／Ｙ２８０／９７(Ｈ９Ｎ２)有很高的同源性 ,而与人流感病毒株和猪流感病毒株差异较大 ,显示禽流感病毒特征。 相似文献
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禽流感病毒分离株A／Goose／Guangdong／3／96（H5N1）HA基因序 … 总被引：3，自引：0，他引：3
采用ＲＴ－ＰＣＲ技术,以Ａ/Ｇoose/Ｇuangdong/３/９６（Ｈ５Ｎ１）ＲＮＡ为模板,扩增了１．７３kd的ＨＡ全基因cＤＮＡ。将ＨＡcＤ－ＮＡ克隆后进行了序列测定,测序结果表明所扩增的１７２８个苷酸片段包含了完整的ＨＡ基因的开放阅读框架和上下游引物序列、蛋白质合成的起始密 码子和终止密码子。核苷酸序列比较分析结果表明：Ａ/Ｇoangdong/３/９６（Ｈ５Ｎ１）与Ａ/Ｇoose/Ｇuangdkng/１/９６（Ｈ５Ｎ１）有１１个核苷核苷 相似文献
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采用反转录－聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）方法，以自行设计的Ｈ７和Н５亚型禽流感病毒血凝素（ＨＡ）基因特异的两对引物，分别扩增了禽流感病毒Ａ／ＡｆｒｉｃａｎＳｔａｒｌｉｎｇ／９８３／７９（Ｈ７Ｎ１）株和Ｇ株（广东鹅体分离株，Ｈ５Ｎ１）约１．７ｋｂ的ＨＡ全基因ｃＤＮＡ。将所扩增的两个基因ｃＤＮＡ未端经Ｔ４ＤＮＡ聚合酶修饰后分别插入ｐＵＣ１８和ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ质粒中，得到了两个基因的重组质粒。本研究为国内禽流感病毒分子生物学研究奠定了基础 相似文献
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禽流感病毒核蛋白基因在重组杆状病毒中的表达 总被引：11，自引：3，他引：8
利用ＲＴ－ＰＣＲ方法成功地扩增了我国禽流感病毒分离株Ａ／Ｘｉｎｇｊｉａｎｇ／１／９６（Ｈ１４Ｎ５）的核蛋白（ＮＰ）基因,其限制性内切酶图谱和核苷酸序列与鸭源的标准Ｈ１４Ｎ５毒株几乎完全一致,与其它毒株则有较大差异,说明该鸡源分离株与鸭源毒株有非常近的亲缘关系。将ＮＰ基因定向克隆到杆状病毒转移载体ｐＶＬ１３９３中,再与杆状病毒线性ＤＮＡ（ＢＡＣ－Ｎ－ＢｌｕｅＤＮＡ）共转染于Ｓｆ９昆虫细胞中,经过三次蚀斑筛选,获得重组病毒ｒＢ２。用其细胞表达产物裂解后作ＳＤＳ－ＰＡＧＥ蛋白电泳、Ｗｅｓｔｅｒｎ－ｂｌｏｔ和ｄｏｔ－ＥＬＩＳＡ,结果表明ＮＰ基因在杆状病毒系统中获得了表达。同时用表达产物作琼脂扩散试验,结果表明表达产物与现行标准禽流感琼扩抗原具有相同的生物学活性。 相似文献
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不同传染性法氏囊病病毒分离株VP2基因部分核酸序列及其编码蛋白的比较 总被引：3，自引：1，他引：2
根据已报告的传染性法氏囊病病毒（ Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ） ｃ Ｄ Ｎ Ａ 序列,在病毒 Ｖ Ｐ２ 区域,设计 １ 对引物,并在 ２ 引物上分别加 Ｐｓｔ Ⅰ和 Ｅｃｏ Ｒ Ｉ酶切位点。对 ２ 个 Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ 分离株 Ｊ Ｓ３ 和 Ｊ Ｓ４,用异硫氰酸胍酚氯仿抽提一步法提取病毒 Ｒ Ｎ Ａ,然后进行逆转录和 Ｐ Ｃ Ｒ 扩增,将扩增片段经酶切纯化后克隆于 ｐ Ｕ Ｃ１８ 质粒载体中,以双脱氧链末端终止法测定 ｃ Ｄ Ｎ Ａ 序列。将测定的分离株与标准对照株（ Ｓ１） Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ Ｖ Ｐ２ 基因片段的核苷酸序列进行计算机分析比较, Ｊ Ｓ３ 与 Ｓ１ 的同源性为 ９７％ , Ｊ Ｓ４ 与 Ｓ１ 的同源性为 ９７％ , Ｊ Ｓ３ 与 Ｊ Ｓ４ 的同源性为 ９９％ 。推导编码蛋白氨基酸序列, Ｊ Ｓ３ 和 Ｓ１ 的同源性为 ９７％ , Ｊ Ｓ４ 与 Ｓ１ 的同源性为 ９６％ , Ｊ Ｓ３ 和 Ｊ Ｓ４ 的同源性为 ９８％ 。这表明在我国流行的 Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ 毒株与标准毒株相比不仅在免疫学反应上有差异,而且在病毒核酸序列上有变异,这种变异是造成疫苗免疫失败或免疫逃避的分子基础。 相似文献
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H9N2亚型禽流感病毒自1994年在中国首次发现以来,一直在家禽中流行,其导致的产蛋下降和发病死亡给养禽业发展带来严重危害。以前的研究发现中国的H9N2亚型禽流感病毒在进化过程中形成多个基因型,其表面抗原蛋白血凝素基因(HA)可被划分为以A/chicken/Beijing/1/94、A/quail/Hong Kong/G1/97(G1)和A/chicken/Heilongjiang/35/01等为代表的3个亚群,神经氨酸酶基因(NA)可被划分为以A/chicken/Beijing/1/94、A/quail/Hong Kong/G1/97(G1)和A/chicken/Hong Kong/G9/97(G9)等为代表的3个亚群。其中类G1病毒的HA基因只在香港分离株中出现。本研究对我国2003年～2004年从禽类中分离的H9N2亚型禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因进行测定和遗传演化分析,结果表明其中11株病毒的HA基因属于CK/BJ/1/94群系,NA基因属于CK/BJ/1/94或DK/HK/G9/97群系,并首次发现两株病毒含有类G1病毒HA和NA基因,而且这些类G1病毒具有不同的抗原性以及人流感病毒的受体结合位点。本研究结果提示应对H9N2病毒的防治及其公共卫生意义予以高度重视。 相似文献
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Shortridge KF Gao P Guan Y Ito T Kawaoka Y Markwell D Takada A Webster RG 《Veterinary microbiology》2000,74(1-2):141-147
This account takes stock of events and involvements, particularly on the avian side of the influenza H5N1 'bird flu' incident in Hong Kong SAR in 1997. It highlights the role of the chicken in the many live poultry markets as the source of the virus for humans. The slaughter of chicken and other poultry across the SAR seemingly averted an influenza pandemic. This perspective from Hong Kong SAR marks the coming-of-age of acceptance of the role of avian hosts as a source of pandemic human influenza viruses and offers the prospect of providing a good baseline for influenza pandemic preparedness in the future. Improved surveillance is the key. This is illustrated through the H9N2 virus which appears to have provided the 'replicating' genes for the H5N1 virus and which has since been isolated in the SAR from poultry, pigs and humans highlighting its propensity for interspecies transmission. 相似文献
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禽流感病毒分离株A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)HA基因序列分析 总被引：20，自引：4，他引：16
采用RT_PCR技术,以A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)RNA为模板,扩增了1.73kb 的HA 全基因cDNA。将HAcDNA克隆后进行了序列测定,测序结果表明所扩增的1728 个核苷酸片段包含了完整的HA基因的开放阅读框架和上下游引物序列、蛋白质合成的起始密码子和终止密码子。核苷酸序列比较分析结果表明:A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1) 与A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)有11 个核苷酸差异,同源率99.4% ;与A/HongKong/156/97(H5N1) 有25 个核苷酸差异,同源率98.6 % ;与A/Chicken/HongKong/258/97 (H5N1) 有30 个核苷酸差异,同源率98.3% ;它们的氨基酸序列同源率依次分别为99 .2 % 、98.6% 和98.1% 。受体结合位点的氨基酸序列完全一致;HA裂解位点氨基酸序列也完全一致,各有5 个碱性氨基酸插入。这说明上述4 个流感病毒分离株可能来自同一个祖先,具有相同的毒力和相似的生物学特性。 相似文献
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Pathogenicity of a Hong Kong-origin H5N1 highly pathogenic avian influenza virus for emus, geese, ducks, and pigeons 总被引：17，自引：0，他引：17
The H5N1 type A influenza viruses that emerged in Hong Kong in 1997 are a unique lineage of type A influenza viruses with the capacity to transmit directly from chickens to humans and produce significant disease and mortality in both of these hosts. The objective of this study was to ascertain the susceptibility of emus (Dramaius novaehollandiae), domestic geese (Anser anser domesticus), domestic ducks (Anas platyrhynchos), and pigeons (Columba livia) to intranasal (i.n.) inoculation with the A/chicken/Hong Kong/220/97 (H5N1) highly pathogenic avian influenza virus. No mortality occurred within 10 days postinoculation (DPI) in the four species investigated, and clinical disease, evident as neurologic dysfunction, was observed exclusively in emus and geese. Grossly, pancreatic mottling and splenomegaly were identified in these two species. In addition, the geese had cerebral malacia and thymic and bursal atrophy. Histologically, both the emus and geese developed pancreatitis, meningoencephalitis, and mild myocarditis. Influenza viral antigen was demonstrated in areas with histologic lesions up to 10 DPI in the geese. Virus was reisolated from oropharyngeal and cloacal swabs and from the lung, brain, and kidney of the emus and geese. Moderate splenomegaly was observed grossly in the ducks. Viral infection of the ducks was pneumotropic, as evidenced by mild inflammatory lesions in the respiratory tract and virus reisolation from oropharyngeal swabs and from a lung. Pigeons were resistant to HK/220 infection, lacking gross and histologic lesions, viral antigen, and reisolation of virus. These results imply that emus and geese are susceptible to i.n. inoculation with the HK/220 virus, whereas ducks and pigeons are more resistant. These latter two species probably played a minimal epidemiologic role in the perpetuation of the H5N1 Hong Kong-origin influenza viruses. 相似文献
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Soltanialvar M Shoushtari H Bozorgmehrifard M Charkhkar S Akbarnejad F 《Tropical animal health and production》2012,44(3):419-425
A total of 512 tissue samples collected from 30 farms located in various states of Iran during 2008–2009 as part of a program
to monitor avian influenza viruses (AIVs) infection in Iran’s poultry population. To determine the genetic relationship of
Iranian viruses, neuraminidase (NA) genes from ten isolates of H9N2 viruses isolated from commercial chickens in Iran during
2008–2009 were amplified and sequenced. The viruses’ neuraminidase gene was >90% similar to those of A/Quail/Hong Kong/G1/97
(H9N2) sublineage. The neuraminidase stalk regions in these Viruses had no deletion as compared to that of chicken/Beijing/1/94
sublineage (Beijing-like viruses) and the two human isolates A/HK/1073/99, A/HK/1074/99. Phylogenetic analysis of neuraminidase
(NA) gene showed that it shares a common ancestor A/Quail/Hong Kong/G1/97 isolate which had contributed the internal genes
of the H5N1 virus. The results of this study indicated that No (Beijing-like) virus and (Korean-like) virus were found in
chickens in Iran, and the NA genes of H9N2 influenza viruses circulating in Iran during the past years were well conserved
and the earlier Iranian isolates may be considered to represent such a progenitor. 相似文献
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为了解H5N1亚型禽流感病毒经自然途径感染SPF鸡后，病毒的致病能力与NS基因的关系，本文主要从病理学角度比较了两株利用反向基因操作技术拯救的病毒RGSGD／1／96和RGSGD／1／2NS的致病能力。虽然只有NS基因不同，但是这两株病毒经鼻腔感染4周龄SPF鸡后表现出完全不同的致病能力，RGSGD／1／96对鸡的致死率为100％，感染鸡只的各组织脏器均可发现严重的病理损伤，该病毒在鸡体内复制能力很强，感染后3d、6d，各组织脏器均可发现大量的病毒抗原；GSGD／1／2NS对鸡的致死率为0，病毒在感染鸡体内只引起肺间质少量淋巴细胞浸润，免疫组织化学检查未发现病毒抗原信号。由于两株病毒只有NS基因不同，说明NS基因决定了H5N1亚型禽流感病毒A／goose／Guangdong／1／96对SPF鸡的致病能力。 相似文献
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本研究利用血凝抑制试验(HI)、反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)、基因测序等方法,对广东省某活禽交易市场进行流行病学调查时获得的两株非H5、H9亚型禽流感病毒65株和C7株进行了亚型鉴定。结果表明这两株病毒均具有血凝活性,且能被抗H6亚型禽流感病毒标准阳性血清特异性抑制。用针对禽流感病毒的M基因、H6亚型禽流感病毒HA基因、N2亚型禽流感病毒NA基因特异性鉴定引物对65株和C7株进行RT-PCR扩增,分别获得特异性目的片段。测序及BLAST分析表明两株分离株与H6N2亚型禽流感广东分离株的HA基因和NA基因核苷酸序列相似性均高达95%以上。将该两分离株鉴定为H6N2亚型禽流感病毒,并命名为A/Chicken/Guangdong/65/2009、A/Chicken/Guangdong/C7/2009。 相似文献
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近年来中国H9亚型禽流感分离株谱系分析 总被引：7，自引：0，他引：7
从GenBank中下载所有来自中国（含港、澳、台）的H9亚型禽流感病毒血凝素基因885条核苷酸序列（长度≥900bp）,用MEGA5.0软件进行谱系分析。结果表明我国近年来H9亚型禽流感病毒以第h9.4.2.5分支为主（代表株为A/chicken/Guangxi/55/2005）,而不是WHO新近报告所列出的4株病毒（A/Quail/HongKong/G1/97、A/chicken/HongKong/G9/97、A/duck/HongKong/Y280/97、A/HongKong/33982/2009）所代表的分支。此分析结果对于研制针对这一病毒感染的疫苗有重要指导意义。 相似文献