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<正> 一、BLUP的含义及其使用方法BLUP是一种使育种值估计公式达到“最佳线性无偏予测”的方法,引号中的英文字首就是“BLUP”,即:Best——“最佳的”,意指估计育种值(I)和客观存在的真值(T)之间的误差是最小的。Linear——“线性的”,意指估计育种值I是记录值y~*的线性函数,旨在便于计算。Unbiased——“无偏差的”,意指要计算出环境影响(?),不让它造成估计偏差。Prediction——“予测”,意指估计育值(I)是对真值(T)的予测。 相似文献
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两套大规模估计家畜育种值的微机软件 总被引：3，自引：0，他引：3
毋庸置疑,家畜选种的目的在于获得遗传进展,因此,遗传进展的大小是评定育种工作优劣的最重要指标。而遗传进展SR=γ_(Al)·i·δ_(A/L),就是说,影响遗传进展的因素主要是育种值估计的准确性γ_(Al),选择强度i,世代间隔L。这里仅仅讨论育种估计的准确性γ_(Al)。育种值估计的准确性取决于育种值的估计方法以及提供估计的资料类型和数量。育种值的估计方法有多种,如平均数法、母亲一女儿比较法、相对育种值法、同期同龄比较法(cc),以及BLUP(最佳线性无 相似文献
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应用总性能指数(TPI)评定西门塔尔种公牛 总被引：1，自引：0，他引：1
<正> 前言应用正确的方法计算种公牛的育种值,对于准确地选择种公牛,改良牛群的遗传特性,提高牛群质量,获得更大的经济效益,无疑是十分重要的。过去对于种公牛的评定方法,只是根据单个性状育种值的高低作为唯一的标准,忽略其他一些重要的经济性状,无疑是一个很大缺点。目前应用最广泛的是总性能指数法(TPI),即多项性状估计的育种值综合为一个指数,根据指数大小选择种公牛。为消除畜群间、年季间和季度间的差异,在计算各性状育种值时,可用最佳线性无偏预期法(BLUP)或改进的同龄比较法(MCC)。本文重点以改进的同龄比较法(MCC)计算总性能指数(TPI),对我国西门塔尔种公牛评定作以研究。 相似文献
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黑龙江省种公牛用动物模型预测育种植 总被引：2，自引：0，他引：2
在奶牛改良中，种公牛占各相关通径合计贡献度的65％(VanVleck,1977)，其中从种公牛到女儿牛的通径占26％，从种公牛到人工授精后备种公牛(儿子牛)的通径占39％。因此正确估计种公牛育种值是奶牛改良的必须条件，为了提高种公牛评价的准确性，黑龙江省不断改进种公牛的评价方法，先后应用了母女比较法(1962)，女儿同期比较法(1971)，群伴比较法(1972)，总性能指数法(1983)，公牛模型BLUP法(1985)。目前在黑龙江省奶牛后裔测定中仍使用公牛模型BLUP法，这种方法优点是可把公牛间的亲缘关系、公牛的组别、牛场、年度和季节等进行校正，准… 相似文献
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旨在将整合元共祖的一步法(single-step genomic best linear unbiased prediction with metafounders,MF-SSGBLUP)应用到基因组联合育种中,并与其他经典基因组选择方法进行比较分析。本研究使用QMSim软件模拟3个系谱相互独立的奶牛群体;分别使用广义最小二乘法(generalized least squares,GLS)和原始方法(naïve,NAI)估计不同群体间的祖先关系矩阵Γ;将MF-SSGBLUP、SSGBLUP和BLUP用于3个模拟群体的联合育种,评估各方法在遗传参数和育种值估计方面的差异。在不同遗传力下,GLS所得的Γ矩阵在对角线元素上略低于NAI法,在非对角线元素上没有明显差异,且基因组关系矩阵与基于元共祖构建的亲缘关系矩阵对角线元素相关系数(0.750~0.775)高于基因组关系矩阵与传统的亲缘关系矩阵相关系数(0.508~0.572)。MF-SSGBLUP遗传力估计值(0.138、0.140、0.297和0.298)与当代群体遗传力(0.107和0.296)的偏差小于其余两种方法(0.145、0.173、0.273和0.340),且MF-SSGBLUP估计育种值准确性(0.888~0.908)高于SSGBLUP法(0.863~0.876)和BLUP法(0.854~0.871)。表明,MF-SSGBLUP的遗传参数估计值无偏性更好,估计育种值准确性更高。根据上述模拟数据结果表明,在联合育种中,整合元共祖的基因组选择方法优于其他经典基因组选择方法。 相似文献
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BLUP法是数理统计在遗传学上的应用,基于线性代数和数理统计模型方法。对于BLUP法估计育种值模型可以分为公畜模型、公畜一母畜模型、外祖父模型、动物模型及简化动物模型,其中公畜模型未能对影响后代的母畜效应进行有效的计算,在同质选配过程中会对公畜效应的预测带来一定的偏差,同时也不能预测后代的个体效应;公畜一母畜模型也不能预测后代个体效应,而外祖父模型适用于种公牛评定,缺点也与上述2种模型一样。因此根据实际情况,对宁乡猪进行育种值估计时采用动物模型,其一般形式为： 相似文献
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BLUP 法是估计家畜加快遗传效应的最有效方法之一,因此它广泛地应用于种公畜的评定。BLUP 法根据不同育种资料来源可分为固定模型、随机模型、混合模型、公畜模型和动物模型等。目前应用最广的是公畜模型的混合模型,即根据后代(主要是女儿)的记录估计种公畜的育种值,因此它主要应用 相似文献
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多性状动物模型BLUP(Best Linear UnbiasedPrediction)法是当今世界上先进的育种值估计方法,能消除各种环境因素的影响,利用各种亲属资料,考虑选择近交及性状间遗传相关等因素,准确地同时估计出种畜各性状育种值以及综合育种值,并能比较场内,场间,地区间甚至国家间种畜优劣,可加速优良种畜的推广利用,提高种畜质量。 相似文献
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应用动物模型BLUP法估计了阿尔巴斯白绒山羊种羊场1989-1998年共10个年度3 981只个体的抓绒量和体重的单性状育种值,以及这两个性状的综合育种值.在模型中考虑的固定效应有年龄效应和性别-群体-年度效应、随机效应有个体的加性效应和个体永久性环境效应.比较育种值选择与表型值选择的结果表明:①公羔依据断乳重选择与依据育种值选择的结果差异较大;②育成母羊依据表型值选择与依据综合育种值选择的结果差异极显著(P<0.01);③育成公羊依据表型值选择与依据综合育种值选择的结果差异极显著(P<0.01);④种公羊依据抓绒量和体重的表型值选择结果分别与依据各自性状育种值选择结果的秩相关均未达到显著水平(P>0.05).研究表明:内蒙古白绒山羊应用个体表型值选种存在准确性较差的缺点;动物模型BLUP法适合用于内蒙古白绒山羊的选种.并根据生产实际情况提出了一套选择种公羊的具体方法. 相似文献
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动物模型BLUP法应用于肉用山羊育种的探讨 总被引：1，自引：0，他引：1
BLUP法 (BestLinearUnbiasedPrediction) ,即最佳线性无偏预测法 ,是美国数量遗传学家C R Henderson在 2 0世纪5 0年代初提出的。这个方法也由过去的公畜模型 (SireModel )过渡到了动物模型 (AnimalModel ) ,并成为当今世界最先进的育种值估计方法 ,广泛应用于种畜的遗传评定。本文综述了BLUP法的基本原理、优点以及我国肉用山羊育种的现状 ,提出了将BLUP法应用于肉用山羊育种的技术路线、现有基础和亟待解决的问题。 相似文献
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本文综述了家禽育种中商业应用的一些新技术的发展。在常规育种方面,评估了估计育种值的“最佳线性无偏预测”(BLUP)方法和“青年选择”方案;在分子遗传技术领域内,讨论了“DNA指纹”和“基因转移”的某些问题。 相似文献
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魏廷虎 《上海畜牧兽医通讯》2011,(5):41-41
畜牧业生产实践中,种畜种用价值的评定是一个很重要的环节。现代选择理论的发展已为种畜提供了多种评定方案,如育种值估计、合并选择指数、综合选择指数以及最佳线性无偏估计（BLUP）等。 相似文献
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奶牛泌乳曲线数学模型的遗传分析 总被引：7，自引：3，他引：7
本文采用Wood、改进多项式、回归模型各参数估值及拟合、预报奶量进行了方差分析,遗传力、遗传相关估计及BLUP法育种值估计。方差分析结果表明,产犊季节和胎次对各性状具有较为显著的影响。各遗传相关的估值均较高,这是由环境因素及取样情况所致。实际及估计305天产奶量的遗传力估值较高,Wood模型参数c、改进多项式模型参数d及回归模型参数d、e的遗传力估值也相对较高。各估计、预报奶量及各选定模型参数的BLUP育种值排队序号与实际305天产奶量BLUP育种值排队序号均呈极显著的秩相关(p<0.001).这表明可以用估计和预报奶量及模型参数来评定种公牛的优劣。这对奶牛生产和育种实践具有一定的实践意义。 相似文献
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奶牛体型线性性状的动物模型遗传评估 总被引：6，自引：1，他引：6
本文利用北京市7个奶牛场的奶牛体型线性评定资料,累计收集了4年共1647头母牛的15个线性性状数据,采用最佳线性无偏预测(BLUP,Best Linear Unbiased Prediction)方法,配合个体动物模型(AM,Animal Model),估计了胎次、泌乳月、鉴定日期、奶牛场以及鉴定员等固定环境效应,并计算出了每头奶牛15个线性性状的个体育种值。鉴于奶牛体型线性评定方法在国内正处于推广应用阶段,而BLUP的动物模型方法目前在国内的研究应用也少见报道。本文通过将两者结合起来,估计动物个体的种用价值,结果表明奶牛体型线性评定以第三胎、第三个泌乳月效果较好。经济效益好的场队其牛群也较整齐。不同的鉴定日期、不同的鉴定员对评定结果也略有影响。最后,可以得到剔除固定效应并经过排序用于选择的奶牛个体育种值。处理分析表明效果比较理想,为推动我国的动物育种工作,建议今后在国内大力推广奶牛体型线性评定和动物模型BLUP评估相结合的育种方法和手段。 相似文献
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旨在将多层感知机(multilayer perceptron, MLP)应用于绵羊限性性状基因组选择中，并在多种情况下与其他经典基因组选择方法进行比较分析。本研究利用Qmsim软件模拟2个绵羊群体Pop1和Pop2的表型数据和基因型数据。在MLP中使用人工神经网络(artificial neural network, ANN),线性模型中使用约束性最大似然法(residual maximum likelihood, REML)估计不同群体的遗传参数。利用Python语言自编MLP模型，利用DMU软件实现最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction, BLUP)、基因组最佳线性无偏预测(genomic BLUP)和一步法(single-step GBLUP, SSGBLUP)模型，评估不同情况下各方法遗传力(heritability,h2)和育种值估计方面的差异。各情况下，MLP和SSGBLUP均显著(P<0.05)优于GBLUP和BLUP。在3种情况下MLP的h2估值与SSGBLUP差异不显著：h 相似文献
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继代选育中用BLUP法对公猪进行逆向再评定的研究 总被引：4，自引：0，他引：4
用带亲缘相关阵的BLUP法(BLUP-1),不带亲缘相关阵的BLUP法(BLUP- 2)及最小二乘法(LS),就日增重、背膘厚及外形评分三性状对SD-I系种公猪进行了逆向遗传再评定,以探讨BLUP法在猪继代选育中的应用。结果表明:①对遗传力较高的性状用综合指数法选择是比较理想的;②BLUP法较LS法精确,且以BLUP-1最精确,估计误差方差(PEV)最小;③选育中可用经加权而成的BLUP综合育种值代替多性状育种值。 相似文献
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多性状动物模型BLUP（Best Linear Unbiased Prediction，最佳线性无偏估计）法是当今最先进的一种育种值估计方法，其能消除各种固定环境因素的影响，利用各种亲属资料，考虑近交、选择等遗传因素，准确估计出各性状的育种值及综合育种值．从而大大提高了选种的准确性。浙江加华种猪有限公司从1997年至2005年6月。应用该法对加系大约克种猪4789头场内性能测定记录进行育种值估计，并用其软件（NETPIG）进行综合分析．达100kg体重的日龄在表型和遗传上分别缩短12．67天和2．35天； 相似文献
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美国学者CharlesRHenderson在20世纪50年代初提出了BLUP(BestLinearUnbiasedPrediction)方法,80年代中后期,一些国家开始把这一方法应用于猪的遗传评估中,大大提高了遗传改良的速度。如加拿大自从1985年开始应用BLUP法以来,背膘厚的改良速度提高了50%,达100kg体重日龄的改良速度提高了100%～200%。目前,这一方法已成为猪遗传评估的标准方法。BLUP育种值估计方法之所以能够提高选种的准确性是由于具有以下主要优点:第一,充分利用了所有亲属的信息;第二,可校正固定环境效应,更有效地消除由环境造成的偏差;第三,能考虑不同群体、不同世… 相似文献