利用76个微卫星标记分析滇南小耳猪的遗传多样性^*     

霍金龙  霍海龙  苗永旺  李大林  刘丽仙  刘建平  李云辉 《云南农业大学学报(自然科学版)》2008,23(5):638-643

 滇南小耳猪是云南省优良地方猪种之一,其数量大,分布广。为了阐明其群体遗传变异情况,以对其进一步有效保护和合理利用提供科学依据,本研究采用分布在家猪19条染色体上的76个微卫星标记对该猪群体54个个体进行了群体遗传变异检测。共检测到338个等位基因,每个座位的等位基因数在2~8个之间,有效等位基因数在1.9560~5.7143之间,平均每个座位等位基因数(4.4474±1.2044)个,有效等位基因数(35091±09197)个,群体平均杂合度及平均多态信息含量分别为06917±00979和06388±01142。研究结果表明,滇南小耳猪群体遗传多样性较丰富。  相似文献   

云南中甸牦牛的遗传多样性研究   总被引：3，自引：1，他引：2  

田应华  钱林东  凌军  刘丽仙  霍金龙  祁宏  苗永旺 《西南农业学报》2009,22(3)

中甸牦牛是产于滇西北高原的地方品种,为了从分子水平阐明其种质特性,以对其有效保护提供遗传学依据,本研究利用分布在黄牛15条染色体上的15个微卫星标记对中甸牦牛45个样品进行了群体遗传变异分析.共检测到62个等位基因,每个座位的等位基因数从2到6不等,有效等位基因数在1.8243～4.4800,平均每个座位等位基因数4.1333±0.8338个,有效等位基因数3.3645±0.7474个,群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.9599±0.0973、0.6852±0.0879和0.6311±0.1057.结果表明,中甸牦牛群体遗传变异丰富.  相似文献   

文山山地乌骨鸡微卫星DNA多态性分析   总被引：2，自引：2，他引：0  

苗永旺  叶朗惠  陈涛  霍金龙  李大林 《云南农业大学学报(自然科学版)》2009,24(1):63-66

 利用位于家鸡24条染色体上的33个微卫星标记对云南文山山地乌骨鸡50个个体进行了遗传多样性检测。共检测到118个等位基因,每个座位等位基因数目从2到9个不等,平均等位基因数为3.5758±1.5619,有效等位基因数在1.4274~6.1250之间,平均为2.9750±1.1389;群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.8927±0.2172,0.6214±0.1259和0.5447±0.1528。研究结果表明：文山山地乌骨鸡群体内存在丰富的遗传多样性。  相似文献   

中国9个南方黄牛品种和3个引进品种的遗传多样性分析     

王均辉  昝林森  张桂香 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》2008,36(3):1-7

【目的】探讨中国9个南方黄牛和3个引进品种的品种内遗传变异情况及各品种间的亲缘关系。【方法】选用联合国粮农组织和国际动物遗传学会联合推荐的15个微卫星DNA标记,对中国9个南方黄牛品种和3个引进品种的遗传多样性进行分析。【结果】在15个微卫星座位上共检测到237个等位基因,每个座位平均为15.8个;各座位的平均多态信息含量为0.597 2~0.821 7,均表现出高度多态性;各品种的平均杂合度均较高,为0.665 1~0.800 3,平均杂合度最高的是迪庆黄牛,最低的是德国黄牛;12个黄牛品种聚为4类,吉安黄牛、徐闻牛、隆林黄牛、皖南牛和涠洲黄牛聚为第一类;威宁黄牛、务川黑牛和迪庆黄牛聚为第二类;三江牛自成第三类;西门塔尔牛、夏洛来牛和德国黄牛聚为第四类。【结论】15对微卫星座位可作为有效的遗传标记,用于各个黄牛品种的遗传多样性和系统发生关系分析。  相似文献   

利用76个微卫星标记分析滇南小耳猪的遗传多样性   总被引：2，自引：0，他引：2  

霍金龙  霍海龙  苗永旺  李大林  刘丽仙  刘建平  李云辉 《云南农业大学学报(自然科学版)》2008,23(5)

滇南小耳猪是云南省优良地方猪种之一,其数量大,分布广。为了阐明其群体遗传变异情况,以对其进一步有效保护和合理利用提供科学依据,本研究采用分布在家猪19条染色体上的76个微卫星标记对该猪群体54个个体进行了群体遗传变异检测。共检测到338个等位基因,每个座位的等位基因数在2~8个之间,有效等位基因数在1.956 0~5.714 3之间,平均每个座位等位基因数(4.447 4±1.204 4)个,有效等位基因数(3.509 1±0.919 7)个,群体平均杂合度及平均多态信息含量分别为0.691 7±0.097 9和0.638 8±0.114 2。研究结果表明,滇南小耳猪群体遗传多样性较丰富。  相似文献   

大额牛群体遗传多样性的微卫星标记分析     

田应华  霍金龙    李石友  霍海龙  钱林东  徐〓英  凌〓军  杨有昌  法林荣  苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》2011,26(1):41-47

 利用26对黄牛微卫星引物,对分别来自云南省泸水县凤凰山大额牛保种区和贡山县独龙野牛种源保护基地的2个大额牛群体进行遗传变异分析,研究其群体内的遗传变异和群体间的遗传分化。结果共检测到105个等位基因,每个座位的等位基因数从2~6不等,所有座位平均等位基因数、平均有效等位基因数、平均期望杂合度、平均多态信息含量分别为4.0385±0.9999,3.1393±0.9507,0.6490±0.1246和0.5904±0.1334,表明大额牛群遗传多样性比较丰富。F统计量、基因流、Nei氏遗传距离和遗传相似系数等值反映出两个群体遗传差异较小,遗传分化不明显,遗传一致性较大。  相似文献   

云南屏边大围山微型鸡遗传多样性^*   总被引：2，自引：0，他引：2  

贾俊静  文生萍  熊保良  马振峰  苗永旺  张曦  李琦华  曹振辉  葛长荣 《云南农业大学学报(自然科学版)》2009,24(5):654-660

 云南屏边大围山微型鸡是我国具有独特遗传特性的、属于亚热带热带型早熟地方家禽品种。研究采用了33个家鸡特异性的微卫星标记对该鸡种自然群体中30个个体进行了多态性电泳检测,目的在于阐明其群体遗传变异和遗传结构状况。研究结果显示：33个微卫星座位共检测到65个等位基因,每个座位的等位基因数在1～3个之间,这些等位基因的频率大小在0.0333～1.000之间,平均每个座位的等位基因数为1.9697个,有效等位基因数在100～263个之间, 平均有效等位基因数为1.6846。群体平均杂合度（H）和群体平均多态信息含量（PIC）为0.1737和0.3279。结果表明,大围山微型鸡群体平均杂合度和群体平均多态信息含量较低,纯合度较高,未受到其它外来血液的混杂,是一个封闭的原始群体,具有较高的遗传一致性  相似文献   

华东4个鹌鹑群体微卫星标记的遗传多样性检测     

戴国俊  王金玉  谢恺舟  李宁川  何远清 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2006,27(1):29-33

在DNA水平上检测了华东地区4个亲源关系不同的鹌鹑群体的3个微卫星座位遗传变异,每一位点均检测到4~5个等位基因,各位点的基因多态比例接近100%。为检测这一地区鹌鹑遗传多态性水平,估计了每个位点的基因杂合度和各群体的基因平均杂合度。结果表明:基因平均杂合度为(0.462 7±0.03)~(0.634 5±0.05),4个群体的平均值按由小到大排列分别为0.462 7、0.514 6、0.554 9和0.634 5,平均有效等位基因数为(1.868 8±0.12)~(2.798 1±0.43),平均多态信息含量为0.376 7~0.571 3,累积辨别力达到95.76%;聚类分析表明,华东地区鹌鹑群体间存在高水平的遗传变异,微卫星标记检测鹌鹑群体间的遗传多样性非常合适。  相似文献   

利用微卫星标记分析蓝孔雀群体的遗传多样性^*     

陈涛  苗永旺  霍金龙  魏红江  叶朗惠  潘伟荣  田应华 《云南农业大学学报(自然科学版)》2006,21(3):346-350

 蓝孔雀不仅具有观赏价值,其作为特禽来养殖也具有较高的经济价值。为了进一步了解蓝孔雀群体的遗传变异状况,筛选出10对家鸡微卫星引物,利用PCR、聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对西双版纳蓝孔雀群体的59个个体进行了遗传多样性检测。10个微卫星座位共检测到35个等位基因,各基因座位的等位基因数为2~5个,平均每个座位的等位基因数和有效等位基因数分别为3.50和3.00个;群体平均多态信息含量为0.5533,平均杂合度为0.6168。表明蓝孔雀群体遗传多样性丰富。  相似文献   

用20个微卫星标记研究鲁西黄牛和渤海黑牛的遗传多样性   总被引：3，自引：0，他引：3  

王敏强  李萍莉  陈礼学  赵明日  陈宏 《河北农业大学学报》2006,29(6):76-81

用20个微卫星座位分析了鲁西黄牛、渤海黑牛及用作参照的秦川牛品种的遗传多样性。3个中国黄牛品种在20个座位的等位基因数为4~25个,平均等位基因数接近9个。各座位等位基因长度与欧洲普通牛相似,但平均等位基因数高于报道的欧洲普通牛和部分中国其它黄牛品种。3个品种在不同座位均发现部分特有基因,以渤海黑牛居多,在3个座位检测到7个特有基因。平均有效等位基因数达到6个以上,平均杂合度接近0.8,平均多态信息含量约为0.85,这几项变异参数在3个品种间没有明显差异,但高于欧洲普通牛群体和报道的中国部分黄牛群体的相应值。结果表明,3个品种在当地生态条件下,经数千年的选育积累了丰富的遗传变异,属宝贵的遗传资源。遗传相似度分析结果显示,渤海黑牛先与秦川牛聚为1类,再与鲁西黄牛聚在一起,引证了鲁西黄牛受瘤牛血统影响较大的结论。  相似文献   

利用多重荧光PCR分析秦川牛遗传多样性     

王均辉  昝林森  张桂香  王志刚  齐国强  韩旭 《安徽农业科学》2007,35(20):6051-6053

[目的]分析秦川牛的遗传多样性,加强对该品种资源的保护。[方法]利用15个微卫星座位,运用多重荧光PCR技术对59头秦川牛个体的基因组DNA进行扩增,通过等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度和有效等位基因数分析秦川牛品种的遗传多样性。[结果]结果表明:在15个座位的等位基因数为5～18个,平均等位基因数为10.3个;各座位上的杂合度都较高,平均杂合度为0.7959;平均有效等位基因数为5.3066;15个座位中多态信息含量为0.6441～0.8649,均为高度多态。[结论]通过荧光标记可用于牛品种遗传多样性的分析,并可为进一步QTL定位和标记辅助选择研究提供参考。  相似文献   

务川黑牛微卫星座位遗传多样性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

吴芸  蒋自立  田雄  马培江 《河南农业科学》2012,41(12)

以贵州地方牛优良品种务川黑牛为研究对象,选取分布于其7条染色体上的ETH10、ILSTS033、CSSM66、BM2113、ETH225、BM1818和CSRM60共7对微卫星引物进行遗传多样性分析。结果共检测到21个等位基因,每个微卫星座位等位基因数为2～5个,7个微卫星座位均未达到Hardy-Weinberg平衡。7个位点的平均等位基因数、平均有效等位基因数、平均期望杂合度、平均多态信息含量分别为3.000 0±1.154 7、2.377 3±0.585 4、0.558 4±0.101 6、0.475 9±0.125 1,说明务川黑牛具有良好的遗传多样性。为务川黑牛种质资源保存和改良提供了试验基础。  相似文献   

云南主要地方牛种横纹肌组织形态学研究     

田允波  葛长荣  谢萍 《云南农业大学学报(自然科学版)》1998,13(4):401-406

 采用组织学、电镜方法对云南主要地方牛种大额牛、云南瘤牛、中甸牦牛、迪庆黄牛和中甸犏牛的肌纤维特性作了系统研究.5个牛种背最长肌的肌纤维直径(μm)分别为57.48±1.15,109.45±1.84,100.38±6.25,90.38±5.31和97.35±9.62;肌纤维密度(根/mm²)分别为201.54±2.66,115.45±4.04,106.30±10.10,90.38±5.31和92.35±9.62;肌束内纤维数(根)分别为73.23±8.90,34.32±8.77,36.32±8.30,47.62±8.90和40.40±8.79.肌节长度(μm)以大额牛公牛最长(1.706 5),云南瘤牛去势公牛居中(1.467 0),云南瘤牛公牛最短(1.205 0).  相似文献   

盐津乌骨鸡微卫星DNA多态性研究^*   总被引：2，自引：0，他引：2  

陈涛  苗永旺  霍金龙  杨泽宇  罗正雄  徐志兰  张昌东  宁勤刚 《云南农业大学学报(自然科学版)》2007,22(4):543-546

 筛选了33对微卫星引物对盐津乌骨鸡的53个个体进行了遗传多样性检测分析，共检测到136条DNA片段，每个座位观察等位基因数从2个到8个不等，群体等位基因数平均为4.12个，平均有效等位基因数为3.18，平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.623 2和0.571 2。以上数据表明：盐津乌骨鸡群体遗传多态性较高。  相似文献   

人工饲养蓝狐微卫星DNA的多态性     

傅凯  白素英  金煜 《东北林业大学学报》2010,38(2)

选取16个微卫星位点对5个蓝狐群体进行遗传多态性研究,利用PopGen32和MEGA4对5个群体的等位基因数、有效等位基因数、等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数进行了分析。结果表明:5个群体137个个体共计检出162个等位基因,每个位点等位基因数为4～13。位点多态信息含量为0.17～0.84,5个群体中3个群体为高度多态性,其余2个群体为中度多态。位点的观测杂合度为0.18～0.89,位点的期望杂合度为0.18～0.86,茂兴湖群体的杂合程度均高于其他4个种群。选取的16个微卫星位点均表现出较高的多态性,在蓝狐多样性分析中具有一定的有效性,可用于蓝狐遗传多样性的分析。  相似文献   

凡纳滨对虾3个亲本及其子代群体的SSR分析（摘要）（英文）   总被引：1，自引：0，他引：1  

栗志民  谢丽  叶富良  陈国良 《农业科学与技术》2010,11(3):57-61

利用微卫星标记技术,采用8对微卫星引物对凡纳滨对虾3个亲本群体（OI Q、SIS Q、Kona Bay Q）及其子一代（OI Z、SIS Z、Kona BayZ）共计120个个体进行遗传分析。计算6个群体在8个微卫星位点上的平均等位基因数（Na）、平均有效等位基因数（Ne）、平均观测杂合度（Ho）、平均期望杂合度（He）、平均多态信息含量（PIC）和平均Hardy-Weinberg平衡指数（D）,以上各参数均采用群体遗传学分析软件POP-GENE3.2处理,同时根据Nei的方法计算群体间的遗传距离和遗传相似系数。运用MEGA3.0软件,采取UPGMA方法根据6个群体的遗传距离进行聚类。结果表明：8对微卫星引物在6个群体中共检测到28个等位基因,每个位点的等位基因数为2 ～6个,平均等位基因数为3.5;各位点的期望杂合度均比观测杂合度高;多态信息含量（PIC）值为0.479 4 ～0.769 9,说明这8个位点在凡纳滨对虾中具有较高的信息含量。在亲本和子代群体遗传结构分析中,子代的有效等位基因数、杂合度和多态信息含量等指标均略低于亲本群体,但子代的遗传多样性并未受到太大影响,仍保持较好的遗传力。  相似文献   

凡纳滨对虾三个亲本及其子代群体的SSR分析     

栗志民  谢丽  叶富良  陈国良 《安徽农业科学》2010,38(13):6735-6738

利用微卫星标记技术,采用8对微卫星引物对凡纳滨对虾3个亲本群体（OIQ、SISQ、Kona Bay Q）及其子一代（OIZ、SISZ、Kona Bay Z）共计120个个体进行遗传分析。结果表明,8对微卫星引物在6个群体中共检测到28个等位基因,每个位点的等位基因数为2～6个,平均等位基因数为3.5;各位点的期望杂合度均比观测杂合度高;多态信息含量（PIC）值为0.4794～0.7699,说明这8个位点在凡纳滨对虾中具有较高的信息含量。在亲本和子代群体遗传结构分析中,子代的有效等位基因数、杂合度和多态信息含量等指标均略低于亲本群体,但子代的遗传多样性并未受到太大影响,仍保持较好的遗传力。  相似文献   

西藏阿里地区改则县两个牦牛遗传资源群体评估     

巴桑旺堆 《现代农业科技》2019,(16)

本研究利用18对微卫星对西藏阿里地区改则县的16头本地牦牛和18头半野血牦牛进行遗传多样性评估。结果显示,18对微卫星的平均等位基因数为7.44,其中TGLA73, BM2113和BGR3012,三个位点的观测杂合度最高为1.0000,AGLA293位点的观测杂合度最小为0.2049。改则县本地牦牛的期望杂合度(HE±SD=0.7000±0.0422)、观测杂合度(HO±SD =0.7243±0.0270)、平均等位基因数(NA=6.22±2.86)以及多态信息含量(PIC=0.636)均要高于改则县半野血牦牛(HE±SD=0.6864±0.0394,HO±SD=0.6940±0.0265,NA=6.06±2.44,PIC=0.622)。另外两个群体之间的遗传分化指数FST=-0.00542,同时结合主成分分析,发现两个群体遗传分化不明显。  相似文献