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1.
以日本进境的冻太平洋鳕鱼体内分离出的异尖科线虫为研究对象,采用寄生虫通用引物NC5和NC2扩增其核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)序列,进行克隆、转化、测序和序列分析,并对样品进行分子鉴定。结果表明,扩增的异尖科线虫样品的ITS序列片段大小为906 bp,包含部分的18S、28S及全部的ITS1(353 bp)、5.8S(157 bp)和ITS2(299 bp)序列,ITS1和ITS2序列与GenBank登录的伪新地蛔线虫(Pseudoterranova decipiens)同源性均为在99.7%以上,与其他线虫的相似性较低。由ITS1和ITS2序列构建的系统进化树可知,从鳕鱼中分离到的线虫ITS1和ITS2均与伪新地蛔线虫处于同一分支。本研究结果为异尖科线虫种属的确定及进一步的分子生物学研究奠定基础。 相似文献
2.
斯氏副柔线虫rDNA-ITS片段的克隆及序列分析 总被引：3，自引：1，他引：2
运用PCR方法以保守引物NC5、NC13、NC13r和NC2扩增从内蒙古地区骆驼皱胃分离的3条斯氏副柔线虫（Parabronema skrjabini）rDNA的内转录间隔区1（ITS1）、5.8S序列和内转录间隔区2（ITS2）。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGM-T载体,用PCR技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒DNA进行测序。结果表明线虫1（P.sk1）扩增的ITS片段大小为837 bp,包含部分的18S、28S及全部的ITS1（298 bp）、5.8S（157 bp）及ITS2（281 bp）序列;线虫2（P.sk2）扩增的ITS1片段大小为372 bp,包含部分的18S、5.8S及全部的ITS1（296 bp）;线虫3（P.sk3）扩增的ITS2片段大小为484 bp,包含部分的5.8S、28S及全部的ITS2（284 bp）序列。同其它属线虫同源性比较ITS2序列同源性在30.2%-60.1%。本研究系首次报道骆驼斯氏副柔线虫的ITS序列,为斯氏副柔线虫分子生物学的进一步研究奠定基础。 相似文献
3.
3种冠环线虫rDNA-ITS的PCR扩增及序列分析 总被引：1，自引：1，他引：0
本试验利用PCR扩增3种冠环线虫5个样品的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)及5.8S片段,将PCR扩增产物纯化后直接进行序列测定和分析。序列比对和分析结果显示,所测样品ITS1-5.8S-ITS2的长度范围为748~843 bp,总变异位点(包括gaps)119个,简约信息位点18个;其中ITS1和ITS2的长度范围分别为367~370 bp和228~320 bp,变异位点分别为14个和105个,简约信息位点均为9个。所有测试样品的5.8S片段完全相同,长度为153 bp。5条序列ITS1区的G+C含量(48.0%~48.5%)明显高于ITS2区(37.7%~40.3%)。通过序列两两比对,3种冠环线虫ITS1和ITS2的种间差异性分别为1.9%~3.5%和5.6%~31.8%;而种内差异性分别为0~0.5%和0~0.9%。并且所测序列与GenBank中已知序列的同源性为99.07%~99.41%。本研究认为,ITS序列可以作为冠环线虫种类鉴定的分子标记。 相似文献
4.
为了摸清西北部分地区猪蛔虫内转录间隔区(ITS)的遗传变异特点,扩增了猪蛔虫ITS基因,进行测序,依据GenBank公布的ITS序列将测序结果截为ITS1、5.8S及ITS2三段,分析比对各段序列的差异性。结果显示,所有样品ITS序列长约1 000bp,其中ITS1、5.8S和ITS2的长度分别为450bp~453bp、159bp、272bp,种内差异分别为0~0.2%、0、0。基于ITS1的种系发育分析表明,23个猪蛔虫样品均位于同一分支,而与贝蛔属蛔虫分属两个不同分支。ITS1序列不能作为区分西北不同地区猪蛔虫的种内分子标记,但可以作为区分蛔属蛔虫与贝蛔属蛔虫的种间分子标记,研究结果为猪蛔虫的鉴定和分子流行病学调查提供了基础资料。 相似文献
5.
6.
通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18SrRNA和28SrRNA进行序列比对分析,在18SrRNA 3′端和28SrRNA 5′端保守区设计艾美耳属通用引物,以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS1-5.8SrRNA-ITS2序列,其大小为1 178bp,其中ITS1序列长度为423bp,5.8SrRNA为155bp,ITS2为600bp,斯氏艾美耳球虫LY株ITS1/2序列高度变异,与鸡球虫、啮齿动物球虫的序列相似性低于60%。然后在斯氏艾美耳球虫ITS1/2序列超变区设计种特异引物,建立了灵敏、特异的PCR检测方法。本研究结果将为兔球虫强致病种的临床诊断和揭示兔球虫种群遗传特征提供有效的分子工具。 相似文献
7.
以神木山羊体内分离出的美丽筒线虫为研究对象,用保守引物进行PCR扩增其核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)和5.8S序列,并进行克隆、转化、测序和序列分析,对样品进行分子鉴定.结果获得一个美丽筒线虫样品的ITS及5.8 S rDNA序列,总长均为1 035 bp.将序列与GenBankTM公布的相关序列进行比较分析,结果显示美丽筒线虫分离株ITS1与参考株的相似性为98.1％～99.7％,ITS2、5.8S序列与参考株相似性均达到100％.本研究是第一次从山羊体内获得美丽筒线虫ITS序列,为其分子学的进一步研究提供了基础资料. 相似文献
8.
以日本进境的冻鳕鱼体内分离出的异尖科线虫为研究对象,用保守引物PCR扩增其核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)和5.8S序列,并进行克隆、转化和序列分析,对样品进行分子鉴定。结果获得2个异尖科线虫样品的ITS及5.8 S rDNA序列,总长为991 bp,样品间序列相似性为99.0%。将序列与GenBank公布灰海鳗对盲囊线虫(Contracaecum muraenesoxi)的相关序列进行比较分析,结果显示与C.muraenesoxi的ITS1、5.8S和ITS2序列相似性高,分别98.0%～98.4%、100%和97.0%～98.0%,表明冻鳕鱼中分离的异尖科线虫属于C.muraenesoxi。 相似文献
9.
采集关中某羊场奶山羊的血液样品,以提取的血液基因组DNA为模板对弓形虫ITS1及529bp基因进行PCR扩增、测序,并对测序结果进行比对,基于529bp重复序列构建系统进化树。序列分析结果表明,待测样品与GenBank中弓形虫RH虫株的ITS1序列(AY259044)完全一致,与529bp重复序列(FJ656209.1)存在差异;基于529bp重复序列构建的系统进化树分析结果显示,待测样品弓形虫与RH虫株遗传距离最近。该结果为奶山羊弓形虫病的分子流行病学、诊断方法的建立等方面的研究奠定了基础。 相似文献
10.
通过对多种鸡球虫和松鼠球虫18S rRNA和28S rRNA进行序列比对分析,在18S rRNA 3’端和28S rRNA 5’端保守区设计艾美耳属通用引物,以斯氏艾美耳球虫洛阳分离株LY卵囊基因组DNA为模板首次成功克隆到斯氏艾美耳球虫完整的ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列,其大小为1178bp,其中ITS1序列长度为423bp,5.8S rRNA为155 bp,ITS2为600 bp,斯氏艾美耳球虫LY株ITS1/2序列高度变异,与鸡球虫、啮齿动物球虫的序列同源性低于60%。然后在斯氏艾美耳球虫ITS1/2序列超变区设计种特异引物,建立了灵敏、特异的PCR检测方法。本研究结果将为兔球虫强致病种的临床诊断和揭示兔球虫种群遗传特征提供有效的分子工具。 相似文献
11.
不同生长期金荞麦营养成分含量及消化率测定研究 总被引：2，自引：0，他引：2
为系统地测定分析不同生长期金荞麦的常规营养成分、氨基酸、微量元素含量及其回肠末端消化率, 本研究用3头安装“T”型瘘管, 并做回-直肠吻合切除盲肠的巴克夏-驯养野猪-高坡黑猪(巴-野-高)三元杂交生长猪作为试验动物, 采用3×3拉丁方试验设计开展消化试验。结果表明, 分枝期、孕蕾期和初花期金荞麦OM、CP、EE、Ca、P、CF含量分别为88.59%、22.72%、2.34%、1.05%、0.39%、13.51%, 89.10%、20.57%、1.69%、1.25%、0.42%、15.50%和89.63%、17.54%、1.37%、1.29%、0.46%、19.75%;EAA、NEAA和TAA含量分别为9285、7982、6244 mg/100 g, 14334、10810、9320 mg/100 g和23619、18792、15564 mg/100 g。随着生长期的后延, 营养成分含量显著降低, 在体和离体消化率也随着生长期的后延而显著降低。分枝期与孕蕾期间营养成分含量差异显著(P<0.05), 分枝期与初花期间营养成分含量差异极显著(P<0.01), 孕蕾期与初花期间营养成分含量差异显著(P<0.05)。从分枝期到孕蕾期, 金荞麦CP、EE、EAA及TAA下降较慢, CF含量升高较慢, 营养成分消化率下降也较慢;从孕蕾期到初花期, 金荞麦CP、EE、EAA及TAA下降较快, CF含量升高也较快, 营养成分消化率下降也较快。以分枝期、孕蕾期和初花期体外法测定常规营养成分及微量元素消化率值为自变量, 以对应的动物饲养试验回肠末端表观消化率值为因变量建立的回归方程拟合度好,可用于推算对应的回肠末端表观消化率。本实验证明, 金荞麦营养丰富、消化率高, 必需氨基酸比例高、适合动物消化吸收。孕蕾期为金荞麦适宜收割期, 在适宜收割期内, 收割时间点应选择孕蕾后期。 相似文献
12.
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Diniz PP Maggi RG Schwartz DS Cadenas MB Bradley JM Hegarty B Breitschwerdt EB 《Veterinary research》2007,38(5):697-710
The purpose of this study was to determine the serological and molecular prevalence of Bartonella spp. infection in a sick dog population from Brazil. At the S?o Paulo State University Veterinary Teaching Hospital in Botucatu, 198 consecutive dogs with clinicopathological abnormalities consistent with tick-borne infections were sampled. Antibodies to Bartonella henselae and Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii were detected in 2.0% (4/197) and 1.5% (3/197) of the dogs, respectively. Using 16S-23S rRNA intergenic transcribed spacer (ITS) primers, Bartonella DNA was amplified from only 1/198 blood samples. Bartonella seroreactive and/or PCR positive blood samples (n=8) were inoculated into a liquid pre-enrichment growth medium (BAPGM) and subsequently sub-inoculated onto BAPGM/blood-agar plates. PCR targeting the ITS region, pap31 and rpoB genes amplified B. henselae from the blood and/or isolates of the PCR positive dog (ITS: DQ346666; pap31 gene: DQ351240; rpoB: EF196806). B. henselae and B. vinsonii subsp. berkhoffii (pap31: DQ906160; rpoB: EF196805) co-infection was found in one of the B. vinsonii subsp. berkhoffii seroreactive dogs. We conclude that dogs in this study population were infrequently exposed to or infected with a Bartonella species. The B. henselae and B. vinsonii subsp. berkhoffii strains identified in this study are genetically similar to strains isolated from septicemic cats, dogs, coyotes and human beings from other parts of the world. To our knowledge, these isolates provide the first Brazilian DNA sequences from these Bartonella species and the first evidence of Bartonella co-infection in dogs. 相似文献
14.
Itagaki T Kikawa M Terasaki K Shibahara T Fukuda K 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2005,67(11):1115-1118
Nucleotide sequences of ribosomal internal transcribed spacer (ITS1) and mitochondrial NADH dehydrogenase I (NDI) gene were analyzed to genetically characterize aspermic Fasciola forms in Korea. From the difference in ITS1 sequences, Korean flukes were divided into 3 haplotypes represented by Kor1, Kor2 and Kor1/2, which had nucleotides identical to F. hepatica, F. gigantica and those overlapped between the two species, respectively. NDI sequences also showed that Korean flukes could be classified into 3 distinct haplotypes (Kor1: F. hepatica-type, Kor2a and Kor2b: F. gigantica-type). The sequences of Kor1 and Kor2a were 100% identical to those of the haplotypes Fsp1and Fsp2, respectively, which are major Fasciola forms in Japan. These findings strongly suggest that aspermic Fasciola forms in Korea and Japan originated from same ancestors and have recently spread throughout both countries. 相似文献
15.
以盆栽法对中国结缕草属4个种的64份野生种源的匍匐茎生长速度进行了研究.结果表明,结缕草属植物不同种源利用匍匐茎进行营养繁殖时,变异很大,匍匐茎总长度和地上部生物量的变异系数分别为78.97%和33.00%;不同种间的匍匐茎总长度存在显著的差异,而地上部生物量无显著差异;结缕草Zoysia japonica的种内变异最大,细叶结缕草Z.tenuifolia的种内变异最小. 相似文献
16.
本试验旨在研究鲜饲金荞麦对热应激条件下的长顺绿壳蛋鸡生产性能、蛋品质和血清指标的影响。采用完全随机试验设计,将300只鸡分为5个处理组:C组(基础饲粮)、T1组(基础饲粮+5%金荞麦)、T2组(基础饲粮+10%金荞麦)、T3组(基础饲粮+15%金荞麦)和T4组(基础饲粮+20%金荞麦),每个处理5个重复,每个重复12只鸡。将所有用于试验的鸡只暴露于(31.4±1.5) ℃的高温环境下发生自然热应激。记录和统计每月平均采食量、蛋重和产蛋数,并测定试验末各处理鸡蛋的表观品质、全蛋氨基酸和蛋黄脂肪酸含量,以及蛋鸡的血清激素水平、炎症因子和内毒素浓度。结果表明,T1组在试验第2个月的产蛋率显著高于其余处理组(P<0.05),C、T1和T2的产蛋率在第3个月和全期差异不显著(P>0.05);C和T1的蛋黄颜色等级显著低于其余处理组(P<0.05);T3组全蛋中的异亮氨酸含量最高,T3和T4组的蛋氨酸含量较高(P<0.05),而C组的多不饱和脂肪酸显著高于其他处理组(P<0.05);C组蛋鸡的肾上腺皮质激素和皮质酮浓度显著高于试验组(P<0.05),相反,C组的皮质酮和黄体生成素显著低于试验组(P<0.05),试验组白细胞介素-6、肿瘤坏死因子α和血清内毒素均显著低于对照组(P<0.05)。因此,饲粮中添加10%的鲜饲金荞麦对热应激条件下长顺绿壳蛋鸡的平均产蛋率无负面影响,加深了蛋黄颜色;改善了全蛋氨基酸组成和含量,但对蛋黄脂肪酸组成有负面影响;提高了血清促卵泡素和黄体生成素含量;降低了血清炎症因子和内毒素水平。 相似文献
17.
为阐明金荞麦(Fagopyrum dibotrys Hara)耐热生理生化机制,以8个金荞麦种质为试验材料,研究高温对其生理生化指标的影响。结果表明:高温处理后,各金荞麦种质的相对电导率、丙二醛(MDA)和脯氨酸(Pro)含量增加;可溶性蛋白(SP)含量先升高后降低;超氧化物岐化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)和过氧化物酶(POD)活性增加。综合分析,评价出供试材料耐热顺序为:JQ6> JQ2> JQ3> JQ1> JQ8> JQ4> JQ5> JQ7。 相似文献
18.
金荞麦查尔酮合成酶基因CHS的克隆及序列分析 总被引：2，自引：0，他引：2
采用同源克隆的方法获得金荞麦查尔酮合成酶基因(CHS)的保守片段554 bp,进一步采用染色体步移法(genome-walking)和RT-PCR技术克隆到CHS基因的全长DNA序列和cDNA开放阅读框(ORF)序列.序列分析结果表明,金荞麦CHS基因DNA全长1 650 bp,含一个462 bp的内含子;其cDNA编码区全长1 188 bp,编码395个氨基酸,命名为FdCHS,NCBI登录号为GU169470.该氨基酸序列与同为蓼科的掌叶大黄、虎杖CHS的氨基酸序列同源率分别达到94%和93%,且含有CHS活性位点和底物结合口袋位点等保守位点. 相似文献
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山羊ADD1基因 exon13～18、intron 13～17序列的克隆分析 总被引：1，自引：0，他引：1
提取湘东黑山羊基因组总DNA,用所设计的引物以聚合酶链式反应扩增山羊ADD1基因,并进行克隆测序。通过对克隆所得片段的测序结果分析,得到了山羊ADD1基因外显子(exon)13~18、内含子(intron)13~17序列,并将序列提交GenBank,获两个序列号:DQ483057、DQ455606;对编码序列(exon 13~18)与牛、人同区域进行Blast对比,同源性分别达到了97.43%和86.12%。聚类分析结果表明,在6个物种中,牛与山羊ADD1基因的同源性最高,其它几个物种间同源系数相差不大,在83%至89%之间。 相似文献
20.
Rubio-Godoy M Paladini G Freeman MA García-Vásquez A Shinn AP 《Veterinary parasitology》2012,186(3-4):289-300
Gyrodactylus salmonis (Yin et Sproston, 1948) isolates collected from feral rainbow trout, Oncorhynchus mykiss (Walbaum) in Veracruz, southeastern Mexico are described. Morphological and molecular variation of these isolates to G. salmonis collected in Canada and the U.S.A. is characterised. Morphologically, the marginal hook sickles of Mexican isolates of G. salmonis closely resemble those of Canadian specimens - their shaft and hook regions align closely with one another; only features of the sickle base and a prominent bridge to the toe permit their separation. The 18S sequence determined from the Mexican specimens was identical to two variable regions of SSU rDNA obtained from a Canadian population of G. salmonis. Internal transcribed spacer (ITS) regions (spanning ITS1, 5.8S and ITS2) of Mexican isolates of G. salmonis are identical to ITS sequences of an American population of G. salmonis and to Gyrodactylus salvelini Kuusela, Zi?tara et Lumme, 2008 from Finland. Analyses of the ribosomal RNA gene of Mexican isolates of G. salmonis show 98-99% similarity to those of Gyrodactylus gobiensis Gl?ser, 1974, Gyrodactylus salaris Malmberg, 1957, and Gyrodactylus rutilensis Gl?ser, 1974. Mexican and American isolates of G. salmonis are 98% identical, as assessed by sequencing the mitochondrial cox1 gene. Oncorhynchus mykiss is one of the most widely-dispersed fish species in the world and has been shown to be an important vector for parasite/disease transmission. Considering that Mexican isolates of G. salmonis were collected well outside the native distribution range of all salmonid fish, we discuss the possibility that the parasites were translocated with their host through the aquacultural trade. In addition, this study includes a morphological review of Gyrodactylus species collected from rainbow trout and from other salmonid fish of the genus Oncorhynchus which occur throughout North America. 相似文献