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1.
山东省猪种mtDNA CytB基因遗传多样性及系统进化研究 总被引：3，自引：0，他引：3
【目的】利用mtDNA CytB基因为标记,从分子水平探讨12个猪种166个样本（8个山东省猪种,3个引进猪种和梅山猪种）的遗传多样性和各猪种间的亲缘关系,为山东省猪种合理利用以及生物多样性保护提供基础资料。【方法】对各猪种样本mtDNA CytB基因进行PCR扩增和测序,采用现代生物信息学方法进行数据处理分析。【结果】山东8个猪种种内遗传变异和种间遗传距离均较小,有共享单倍型。山东各猪种和梅山猪与大约克的遗传距离也较小,但与引进猪种杜洛克和长白的遗传距离较大。利用分子系统进化树和CytB基因4个SNP位点的分类方法将上述样本分为2个独立的支系,第一支以中国猪种为主,将除鲁烟白猪的一种单倍型在内的所有山东猪种、梅山猪和大约克的两种单倍型聚为一类,第二支以引进猪种为主,将长白、杜洛克、大约克的一种单倍型和鲁烟白猪的一种单倍型聚为一类。【结论】山东猪种有共同的母系祖先,品种内母系遗传多样性较贫乏;外来猪种引入山东后主要是用作父本以提高生产速度和瘦肉率等,对本地猪种未有母系贡献;利用CytB基因4个SNP位点对欧洲单倍型和亚洲单倍型的分类方法,可以方便地估测利用中外猪种结合培育的猪新品种（配套系）的母系血统情况。 相似文献
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利用5个多态蛋白（酶）位点分析6个地方猪品种的遗传结构 总被引：3，自引：0，他引：3
利用5个多态蛋白（酶）位点碱性磷酸酶（Akp）、蛋白酶抑制物1（PI－1)、后白蛋白1（Po-1）、后白蛋白2（Po-2）和铜蓝蛋白（Cp）分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。6个品种的平均杂合度大小依次为：南阳黑猪（0.4142）、南城黑猪（0.3057）、阳新猪（0.3032）、东乡花猪（0.2606）、杭猪（0.2478）、清平猪（0.2416），通过计算Nei（1978）标准遗传距离，用UPGMA进行聚类分析，6个品种聚成2大类：清平猪、南城黑猪、阳新猪、南阳黑猪聚成一大类；东乡花猪与杭猪聚成另一类。 相似文献
3.
利用29个微卫星标记,通过计算亚群体杂合度（Hs）、总群体杂合度（Ht）、遗传分化系数（Gst）和基因流（Nm）,并基于Reynolds遗传距离、Nei遗传距离运用NJ和UPGMA聚类法构建4类聚类图,比较分析国家地方禽种遗传资源基因库保存的7个地方鸡品种（仙居鸡、鹿苑鸡、固始鸡、大骨鸡、河南斗鸡、狼山鸡和萧山鸡）间的遗传分化和亲缘关系。结果表明,7个地方鸡种29个微卫星标记的总群体杂合度和亚群体杂合度的平均值分别为0.642和0.551,平均遗传分化系数为0.142;7个地方鸡品种间,萧山鸡与鹿苑鸡的基因流动最大,为 5.832 7 ;狼山鸡与固始鸡的基因流动最小,为 0.805 3 ;基于Reyonalds遗传距离运用 NJ 聚类法获得的7个鸡种间的聚类图较为准确地反映了7个地方鸡种间的遗传分化和亲缘关系。 相似文献
4.
对八眉猪、内江猪、荣昌猪、汉江黑猪等西部地区地方品种和汉中白猪、长白猪、大白猪、杜洛克猪等8个猪品种以及野猪基因组DNA、混合DNA样进行了RAPD分析。根据8个多态引物的扩增结果计算了遗传距离指数并进行了UPMGA聚类分析。结果表明：长白猪与大白猪亲缘关系最近，八眉猪和汉江黑猪次之，而野猪与长白猪的遗传距离最远。综合考虑现行的分类结果及前人研究结果，认为内江猪、八眉猪和汉江黑猪为一类型，荣昌猪和汉中白猪可划分为同一类型，但对野猪与其他品种的亲缘关系应作进一步分析。 相似文献
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6个中国重点保护地方鹅品种的遗传多样性 总被引：18，自引：0，他引：18
对我国6个受重点保护的地方鹅品种资源(四川白鹅、狮头鹅、豁眼鹅、雁鹅、伊犁鹅和皖西白鹅)的遗传多样性进行了微卫星标记的研究。结果表明:6个品种的平均杂合度都较高,最高的是四川白鹅(0.6415),最低的是雁鹅(0.5010),表明了各鹅种的杂合度和遗传多样性水平都较高,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性;通过计算DS遗传距离发现6个品种的遗传距离较远,分化时间较长;UPGMA聚类结果将6个重点保护鹅品种聚为五类,安徽省的雁鹅和皖西白鹅聚为一类,豁眼鹅、伊犁鹅、狮头鹅、四川白鹅分别独自聚类。UPGMA的聚类结果分析与几个鹅品种的选育历史及地理分布是一致的。本研究结果为加强对我国现有鹅品种资源的保护和有效、合理、持续利用具有重大意义。 相似文献
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采用8个微卫星座位对福建省5个地方品种猪(槐猪、官庄花猪、莆田黑猪、闽北花猪、武夷黑猪)的遗传结构进行了分析,计算了遗传杂合度(H)、有效等位基因数、多态信息含量(PIC)、Nei氏标准遗传距离.结果表明:8个微卫星位点均为高度多态位点;5个品种间的遗传多样性比较高;8个微卫星位点H平均为0.7006-0.7760;PIC为0.6917-0.7609;莆田黑猪与闽北花猪的遗传距离最小(0.5531),官庄花猪与闽北花猪的遗传距离最大(0.8618). 相似文献
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利用微卫星标记分析4个猪品种的遗传结构 总被引：3，自引：0，他引：3
利用5个微卫星标记对4个猪品种(山西马身猪、大白猪、长白猪和太原花猪)的遗传结构进行了分析,计算了遗传杂合度、有效等位基因数,得到了由Nei氏标准遗传距离为基础的NJ聚类图。结果表明:大白猪与马身猪以及大白猪与太原花猪的遗传关系较远,而山西马身猪与太原花猪的遗传关系较近;山西马身猪与太原花猪的进化历史相近,大白猪与山西马身猪组合及大白猪与太原花猪的组合,可能产生较大的杂种优势。 相似文献
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中国地方猪品种登记网络平台的构建 总被引：1，自引：0，他引：1
中国地方猪种具有耐粗饲、繁殖力高、肉质鲜美、适应性强等优良特性,但由于外国猪种的引进,地方猪种的养殖、生存空间被严重压缩,加之保护意识不强,目前状态不容乐观,个别品种甚至已经灭绝。为有效保存和开发地方猪种资源,本研究应用先进网络技术,先行开发了中国地方猪品种登记网络平台。该平台具有地方猪种动态监测、数据登记、数据审核、遗传分析、统计分析、选种选配等多种核心管理和育种功能,可为国家级、省级主管部门提供监管手段,为保种场、保护区提供技术支持,为科研工作者提供精准的数据资料。 相似文献
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应用40条随机引物对四个品种猪,大白猪、长白猪、三江白猪及东北民猪的基因组进行亲缘关系的DNA多态性分析,结果筛选出12条效果良好的随机引物,并且通过RAPD技术方法和聚类统计分析得出结论;三江白猪、长白猪及东北民猪的亲缘关系较近,而大白猪与其它三种猪之间亲缘关系则相应的较远。 相似文献
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[目的]为分析我国大、中型驴品种遗传多样性。[方法]利用24个微卫星标记,对我国8个大、中型驴品种遗传多样性进行了检测。[结果]24个微卫星位点在8个驴品种中的多态信息含量除NVHEQ18为中度多态外,其余23个微卫星均为高度多态,8个驴种的平均PIC（0.6940）、H（0.7119）和E（3.94）,表明基因多态性和遗传多样性相对较高。[结论]这24个微卫星可作为有效的遗传标记用于各驴品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。我国大、中型驴品种的分子系统发生关系与其育成史和地理分布基本一致。 相似文献
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利用微卫星DNA标记分析贵州3个地方猪种的遗传多样性(英文) 总被引：1，自引：0，他引：1
[Objective] The research aimed to provide the genetic basis for the protection, development and utilization of Guizhou local pig breeds. [Method] From 27 pairs of porcine microsatellite primers recommended by Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) and International Society for Animal Genetics (ISAG), six pairs (S0155, SW240, IGF1, SW951, SW857, SW24) were selected for microsatellite DNA detection of three Guizhou local pig breeds, including Nuogu Pig, Kele Pig and Guanling Pig. Subsequently, their genetic diversities were analyzed. [Result] The three pig breeds were high polymorphic at the six microsatellite loci (PIC>0.5). The Nei's standard genetic distance of them was 0.206 3-0.481 5. The genetic distance between Nuogu Pig and Kele Pig was the closest, and that between Nuogu Pig and Guanling Pig was the furthest. [Conclusion] The three Guizhou local pig breeds are in high genetic diversities. Nuogu Pig is a special type of Kele Pig, an excellent Chinese local pig breed. 相似文献
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利用微卫星DNA标记分析贵州3个地方猪种的遗传多样性 总被引：1，自引：0，他引：1
[目的]为贵州地方猪种的琛护开发与利用提供遗传学依据。[方法]根据联合国粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的27对猪微卫星引物,从中筛选出6对（S0155,SW240,IGF1,SW951,SW857,SW24）,用于对糯谷猪、柯乐猪、关岭猪3个贵州地方猪群体进行微卫星DNA检测,进而分析其遗传多样性。[结果]3个品种（类型）猪呈高度多态（PIC〉0．5）,Nei氏标准遗传距离为0．2063～0．4815。群体间遗传距离最远的是关岭猪与糯谷猪,最近的是柯乐猪与糯谷猪。[结论]3个贵州地方猪种的遗传多样性较好;糯谷猪是中国优良地方猪种柯乐猪中的一个特殊类型。 相似文献
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地方鸡种微卫星DNA指纹图谱建立与遗传多样性研究* 总被引：6，自引：1，他引：6
利用20个微卫星标记对我国19个地方鸡种保种群进行了遗传检测，构建了各个品种的微卫星DNA指纹图谱，通过计算各群体的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量及各群体间的遗传距离，并用类平均法进行聚类分析，分析了所研究鸡种的遗传关系。研究结果表明：20个微卫星标记在19个地方鸡种保种群共检测到184个等位基因，平均为9.2个,基因频率分布在0.013～0.838之间。19个地方鸡种平均杂合度在0.5824～0.7432之间。其中藏鸡最高，白耳鸡最低。20个微卫星座位的平均多态信息含量在0.5238～0.7023之间，均大于0.5，表现为高度多态性；19个鸡种聚为6类。各鸡种的遗传距离及聚类结果与所保存的地方鸡种的地理分布、现实状况是相吻合的，从而表明用该方法分析品种间的亲缘关系是可行的。 相似文献
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应用微卫星标记对中国10个品种猪遗传变异的研究 总被引：15，自引：0，他引：15
对我国7个地方猪品种(二花脸、通城、清平、阳新、皖南花、赣东黑、万安)和3个引进品种(长白、大白、杜洛克)的4个微卫星位点的多态性进行了检测,并对品种内和品种间的遗传变异进行了群体遗传学分析。结果初步表明,地方品种中二花脸、赣东黑、通城的品种内遗传变异较高,万安的品种内遗传变异最低。除万安猪外,其它地方品种的品种内变异均大于引进品种。品种间的聚类结果基本符合品种的地缘分布。 相似文献
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以可乐猪、萝卜猪和香猪3个贵州地方猪种和欧洲猪种为材料,采用PCR-SSCP技术对脂蛋白脂酶（Lip-oprotein lipase,LPL）基因第8内含子的多态性进行了研究。以特异性PCR从样品基因组中扩增出163bp的DNA片段,经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,从两个猪群体的LPL基因第8内含子中都检测到了AA基因型和AB基因型,未检测到BB基因型;欧洲猪品种和贵州地方猪品种均以AB基因型占优势;与欧洲猪品种相比,贵州地方猪品种的B等位基因频率明显较高,A等位基因频率则较低。 相似文献
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湖北省3个地方鸭品种遗传多样性研究* 总被引：2，自引：0，他引：2
通过选用28个多态性较好的微卫星标记，检测了湖北3个地方鸭品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和群体间的标准遗传距离（Ds）。结果表明：28个微卫星位点中有26个微卫星位点在3个鸭群体中的多态信息含量均为高度多态，可作为有效的遗传标记用于各鸭品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。3个鸭品种中，平均杂合度范围是0.596~0.603，各鸭种的杂合度都较高，最高的是荆江麻鸭（0.603），最低的是沔阳麻鸭，而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性。对Ds遗传距离的计算表明：用UPGMA法进行聚类分析，结果3个鸭品种被聚为2类：荆江麻鸭和沔阳麻鸭为第1类；恩施麻鸭为第2类。这与各鸭品种的起源、分化、选育历史及地理分布基本一致。本研究结果为中国地方鸭品种种质特性研究提供了基础，也为中国地方鸭品种资源的合理保护和开发利用提供了科学依据。 相似文献
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ZHANG Yang CHEN Yang ZHEN Ting HUANG Zheng-yang CHEN Chang-yi LI Xin-yu DUAN Xiu-jun DONG Biao XU Qi CHEN Guo-hong 《农业科学学报》2014,13(4):849-857
Twelve fluorescence-labeled microsatellite markers were used to analyze the genetic diversity of 12 domestic duck breeds and 2 wild duck breeds to determine the relationship and origin of Chinese domestic duck breeds. Gene frequency, effective number of alleles （Ne）, expected heterozygosity （He）, polymorphism information contents （PIC）, inbreeding coefficient in population （Fis）, standard genetic distance （Ds）, and genetic distance （DA） were calculated by FSTAT and distance and phylogenetic analysis after the dates which were output from the Microsatellite-Toolkit software. Genetic distances between 12 domestic duck breeds and 2 wild duck breeds were analyzed by variance analysis. Unweighted pair group method with arithmetic mean （UPGMA） and phylogenetic trees used for cluster analysis were structured. The results indicated that 11 loci had medium- or high-level genetic diversity among the 12 loci, which could be efficiently used in the detection of the genetic parameters of each population. The values of He were 0.5414 to 0.7343, those of PIC proved similar, and those of Fis were 0.1101 to 0.3381 among all populations. All breeds were clustered into three groups by UPGMA phylogenetic trees. Banzui duck was clustered into a separate group. Differences of the DA were analysed by t-test. The results showed that difference in DA between the 12 domestic duck breeds and Lvtou duck and the Banzui duck were very significant （P〈0.01）, indicating that these 12 domestic duck breeds originated from Lvtou wild duck, but not Banzui duck. 相似文献