布鲁菌Cycling探针荧光定量PCR检测方法的建立   总被引：1，自引：1，他引：0  

许邹亮  南文龙  陆明哲  周洁  谭鹏飞  陈义平  毛开荣 《中国兽医杂志》2012,48(2):13-16

根据布鲁菌BCSP31基因序列设计布鲁菌通用检测引物和探针,建立了布鲁菌Cycling探针荧光定量PCR检测方法。以构建的含BCSP31基因的质粒标准品10倍递进稀释为模板检测其敏感性,结果显示,本方法能检测约10个拷贝的阳性质粒,且标准曲线的线性关系良好。用本方法检测5株不同种的布鲁菌以及猪大肠杆菌K99、巴氏杆菌C48-1、猪链球菌ST171、绿脓杆菌等4株对照菌。结果显示,5株不同种的布鲁菌均出现典型的"S"型扩增曲线,4株对照菌40个循环内均无CT值出现。用本方法和B4/B5-PCR方法对来自布鲁菌病流行地区3个不同牛场的40份血样、奶样和血清样进行平行检测。结果显示,本方法和B4/B5-PCR方法的结果符合率为80.0%。B4/B5-PCR检测为阳性的27份样品经本方法检测均为阳性;B4/B5-PCR检测为阴性的13份样本,经本方法检测,其中8份呈阳性,5份为阴性。本方法的敏感性明显高于B4/B5-PCR方法。试验表明,所建立的Cycling探针荧光定量PCR方法具有敏感、特异、稳定等特点,可用于布鲁菌感染的快速检测。  相似文献   

绵羊肺炎支原体LAMP检测方法的建立及初步应用     

张双翔  周碧君  程振涛  文明  王开功  李泽民  王慧  崔亚兰  覃岚 《中国兽医学报》2013,33(3):362-366

针对绵羊肺炎支原体(Mo) 16S rRNA基因设计4条环介导等温扩增(LAMP)引物,通过优化反应条件与体系,建立了Mo检测LAMP方法,并对其进行特异性、敏感性及临床应用性检测.结果显示,于60℃保温60 min即可最优化检测Mo,且所建方法仅能特异扩增Mo,最低检出分子拷贝数为1.0×102copies/μL,具有良好的特异性和敏感性.对4份已知阳性病料进行LAMP检测均为阳性,表明所建LAMP可初步应用于临床检测,为羊Mo感染病例诊断提供了新方法.  相似文献   

羊丝状支原体簇环介导等温扩增检测方法的建立     

谢秀兰  康晓冬  储岳峰  马小明  岳彩娟 《中国畜牧兽医》2012,39(12):24-26

本试验利用环介导等温扩增技术(LAMP)建立了羊丝状支原体簇的快速检测方法,该方法以羊丝状支原体簇成员的保守性基因16S rRNA为靶序列,设计了4条特异性引物,在65 ℃等温条件下,60 min一步完成反应。在反应管中预先添加羟基萘酚蓝(HNB),阳性呈蓝色,阴性呈紫色。丝状支原体簇成员——丝状支原体山羊亚种(Mmc)、丝状支原体丝状亚种LC型(Mmm LC)、山羊支原体山羊肺炎亚种(Mccp)的LAMP检测为阳性;对其他病原菌没有交叉反应。以Mmc的核酸为模板进行灵敏度检测,LAMP的最低检出限为10 pg/μL。结果表明,本试验建立了一种特异、敏感、快速、简便的羊丝状支原体簇的LAMP方法。  相似文献   

布鲁杆菌环介导等温扩增快速检测方法的建立     

李秀梅  郭恋  郭立力  李颖  石瑜  杨爱华  王健春  王红军 《中国兽医学报》2013,33(4)

研究针对布鲁杆菌保守的OMP25基因设计了4条LAMP的特异性引物,通过优化反应条件,建立了布鲁杆菌的LAMP快速检测方法.特异性和敏感性试验结果显示,该方法能够特异地检测布鲁杆菌,其最低检测限为5 copies/μL.扩增产物可通过琼脂糖凝胶电泳、显色反应进行判定.LAMP可以快速、直观、准确地检测布鲁杆菌,是一种适合基层现场应用的检测方法.  相似文献   

环介导等温扩增技术快速检测猪细小病毒的试验     

黄书林  付萍  李佳禾  张跃伟  蒋菲  张侃  陈会玲  吴文学 《中国兽医杂志》2011,47(10)

利用环介导等温核酸扩增技术(LAMP),建立了一种灵敏、特异、快速的猪细小病毒(PPV)检测方法.该方法针对猪细小病毒非结构蛋白(NS-1)基因保守区域设计6条特异引物,在63℃的等温条件下45 min即可完成反应.最低检测限量为10拷贝的PPV目的基因,比常规聚合酶链式反应(PCR)方法敏感100倍,并具有良好的特异性.以钙黄绿素和Mn2+作为荧光指示剂,可快速、直观判定反应结果.通过对149份临床样品进行检测比较,LAMP与PCR检出阳性样本数分别为33份和27份,表明LAMP方法阳性检出率高于PCR.  相似文献   

鸭瘟病毒环介导等温扩增(LAMP)快速检测方法的建立与应用     

张坤  刁有祥  鞠小军 《中国兽医学报》2013,33(4)

为建立一种简便、快速、灵敏、特异的鸭瘟病毒(DPV)检测方法,本研究根据GenBank中登录的DPV基因组序列,设计3对特异性的环介导等温扩增(LAMP)引物,经优化反应体系,建立了LAMP快速检测方法.结果表明,LAMP方法能够在63℃恒温下,1h内实现目的核酸的大量扩增.结果判定时只需要在扩增产物中加入SYBRGreen Ⅰ染料,就可以直接在可见光或紫外光下观察颜色变化.该方法敏感性可达0.245 μg/L,比普通PCR灵敏性高10倍;对鸭病毒性肝炎病毒、H9N2亚型禽流感病毒、鸭副黏病毒、鸭源偏肺病毒等的核酸无交叉反应;利用建立的LAMP检测方法对40份临床样品的阳性检出率为30％.该方法简便快捷,省时省力,是一种适用于基层实验室快速、准确检测DPV的方法.  相似文献   

牛传染性鼻气管炎病毒LAMP检测方法的建立     

高峰  王建峰  于伯华  张丹  刘向阳  张琳  秦志军  唐泰山 《中国动物检疫》2018,35(5):87-90

为建立一种利用颜色判定的快速、简单、灵敏度高的检测方法,即可视化环介导等温扩增(LAMP)方法,采用针对牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)基因保守序列设计的特异引物,优化反应条件,建立了IBRV LAMP检测方法,并进行了特异性和灵敏性试验。结果显示,所建立的LAMP方法具有良好的特异性,其检出灵敏度为10~3 copies/μL,仅需1 h即可肉眼观察检测结果。结果表明,本试验建立的LAMP方法可用于IBRV的进出口检疫。  相似文献   

细菌β-内酰胺酶和氨基糖苷磷酸转移酶耐药基因可视化LAMP检测方法的建立和初步应用     

《动物医学进展》2021,42(2)

为了建立快速准确检测微生物携带氨苄青霉素和卡那霉素抗性基因的环介导等温扩增(LAMP)方法,根据抗性基因β-内酰胺酶(bla)和氨基糖苷磷酸转移酶(Aph)基因序列,利用Primer Explo-rer V4在线工具设计特异LAMP引物,成功建立了检测上述2个基因的可视化LAMP方法。该LAMP体系在65℃条件下反应1 h,以100μmol/L HNB为最佳浓度,可实现阳性结果的准确判读,bla基因的检测灵敏度达到1 pg/μL。应用该LAMP方法成功检测到污水环境的微生物携带bla抗性基因。建立的LAMP方法在快速、可视化检测环境中抗性基因方面具有潜在应用价值。  相似文献   

牛布鲁氏菌四种血清学检测方法的比较     

任璐  周晓翠  范伟兴  武瑞 《中国动物检疫》2016,33(3):74-76

[目的 ]为在布鲁氏菌病临床检疫中选择可靠的血清学检测方法提供参考。[方法 ]对采集的294份牛血清样品用虎红平板凝集试验(RBT)、试管凝集试验(SAT)、酶联免疫吸附试验(ELISA)和补体结合试验(CFT)进行布鲁氏菌病抗体检测,比较RBT与ELISA,SAT与CFT的符合率及Kappa值,以CFT作为判定标准,比较四种检测方法的敏感性和特异性。[结果 ]RBT与ELISA、SAT与CFT检测方法的符合率高达到95%以上,且Kappa值均大于0.75。以CFT作为判定标准,RBT和ELISA的敏感性较好,但有假阳性;SAT的特异性较好,但有假阴性。综合比较认为ELISA的敏感性和特异性都比较理想。[结论 ]临床工作中使用RBT或ELISA对布鲁氏菌病进行初筛,用CFT进行复核确诊,通过两种或两种以上的血清学检测方法联合诊断,结果较为理想。  相似文献   

马疱疹病毒1型LAMP检测方法的建立     

杨夷平  刘建华  冉多良  许全圆  李娜  加尔肯 《中国畜牧兽医》2014,41(9):35-40

本试验旨在建立一种检测马疱疹病毒1型（EHV-1）的快速、灵敏、特异的环介导等温扩增技术（LAMP）,同时评价该方法的可靠性。根据马鼻肺炎糖蛋白B（gB）基因特异保守序列设计多对LAMP引物,利用LAMP Real Time Turbidimeter LA-320仪监测反应进程,进行引物筛选和反应条件的优化,建立能特异性扩增EHV-1 DNA的LAMP检测方法,并加入SYBR GreenⅠ通过肉眼判断结果。该方法在65 ℃恒温下作用50 min,使EHV-1 DNA获得了高效率的特异性扩增,与其他马易感病毒如马疱疹病毒4型（EHV-4）等无交叉反应;且具有极高的灵敏性,可检测到10^-4稀释的目标病毒,比普通PCR的灵敏度高10倍;反应结束后加入SYBR GreenⅠ肉眼观察的结果与LAMP Real Time Turbidimeter LA-320仪监测结果一致。通过将4份临床样品的LAMP检测结果与已得到验证的PCR结果进行比对,结果显示符合率为100%。本研究建立的LAMP检测方法具有快速、特异、灵敏、简单易操作且设备要求低等特点,具有实地检测EHV-1的前景。  相似文献   

鸡传染性贫血病毒病LAMP快速可视化检测方法的建立     

邓显文  谢芝勋  谢志勤  刘加波  庞耀珊  谢丽基  彭宜  范晴 《家畜生态》2011,(6):57-60

为建立一种能快速检测鸡传染性贫血病毒病（CIAV）的检测方法,根据基因库中鸡传染性贫血病毒病的保守序列,设计一套特异性环介导等温扩增（LAMP）引物,建立了CIAV的LAMP可视化检测方法。该法敏感性可迭10fg,高于常规PCR方法10倍;全部反应可在1h内完成;可通过肉眼观察颜色直接判定结果;对其它鸡常见病原体的检测结果均为阴性。结果表明建立的LAMP方法简便、快速、灵敏、特异,可用于CIAV感染的快速检测。  相似文献   

鸭圆环病毒LAMP可视化检测方法的建立   总被引：1，自引：0，他引：1  

赵光远  谢芝勋  谢丽基  庞耀珊  邓显文  刘加波  范晴 《动物检疫》2012,(3):24-26

根据GenBank中DuCV基因序列,在保守区设计了6条特异性引物,并对反应条件进行优化,建立了一种适用于鸭圆环病毒（DuCV）的环介导等温扩增快速检测方法（LAMP）。该方法对H9亚型禽流感、小鹅瘟、鸭瘟、鸭肝炎、鸭副黏病毒均无扩增反应;且扩增反应只需在常规水浴锅中进行,1小时内即可完成反应;对DuCV模版DNA的最小检测限为10龟,灵敏度是一步法PCR的1000倍。本研究建立的LAMP方法简便、快速、灵敏、特异,适合在基层进行DuCV的快速检测。  相似文献   

Rapid detection of group I avian adenoviruses by a loop-mediated isothermal amplification     

Xie Z  Tang Y  Fan Q  Liu J  Pang Y  Deng X  Xie Z  Peng Y  Xie L  Khan MI 《Avian diseases》2011,55(4):575-579

A loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay was optimized for the rapid detection of Group I avian adenoviruses. A set of six primers was designed from the DNA sequences of hexon genes from Group I avian adenovirus. The assay was performed in a water bath for 60 min at 63 C, and the amplification result was visualized by adding a fluorescence dye reagent or by inspecting the white sediment. The results showed that the LAMP assay could detect all 12 serotypes of Group I avian adenovirus and nine Guangxi Group I avian adenovirus isolates. This avian adenovirus Group I-specific LAMP assay could detect 238 copies of avian adenovirus. No cross-reactions were detected using the LAMP assay with avian adenoviruses type II and III or with other avian viruses. The ability of LAMP to detect Group I avian adenovirus isolates was further evaluated with 184 cloacal swab samples from poultry. In total, 72 out of 184 cloacal swab samples from poultry were identified as positive by LAMP, whereas 45 out of 184 were identified as positive by conventional PCR test. The Group I avian adenovirus specific LAMP results were further confirmed by real-time PCR. This specific LAMP method holds promise as a rapid and specific diagnostic assay for detection of samples from birds suspected of adenovirus infection.  相似文献   

贝类折光马尔太虫LAMP可视化检测方法的建立     

谢丽基  谢芝勋  庞耀珊  邓显文  谢志勤  刘加波 《兽医大学学报》2012,(7):993-996

根据折光马尔太虫的基因保守序列设计了1套特异性环介导等温扩增（LAMP）引物,建立了折光马尔太虫LAMP可视化检测方法。该方法全部反应可在1h内完成;可通过肉眼观察颜色直接判定结果;检测的灵感性可达20fg,高于常规PCR方法100倍;对其他贝类常见病原体的检测结果均为阴性。结果表明,所建立的折光马尔太虫LAMP检测方法简便、快速、灵敏、特异,可用于贝类折光马尔太虫感染的快速检测。  相似文献   

实验猴粪便样品中沙门氏菌LAMP检测方法的建立及应用简     

邱索平  林志雄  游勇来 《中国畜牧兽医》2014,41(1):51-56

A loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay was developed for detection of Salmonlla in fecal samples of experimental monkeys. According to the specific sequences (fimY) of Salmonlla in GenBank, one set of primers was selected and the reaction condition was optimized. The results showed that the detection limit of LAMP method was 1.35×10¹ and 1.35×10³ CFU/mL in Salmonella pure culture and clinical samples,respectively,which was the same as routine PCR. The amplification could complete in one hour, and the result could be distinguished by naked eyes. There was non-specific amplification of other pathogens. These results suggested that this LAMP assay was a simple and specific method for rapid detection of Salmonlla in fecal samples.  相似文献   

肠炎沙门菌LAMP检测方法的建立     

邓显文  谢芝勋  谢丽基  谢志勤  刘加波  庞耀珊  彭宜  范晴 《动物医学进展》2012,33(5):27-30

为建立一种能快速检测肠炎沙门菌(SE)的方法,本研究根据基因库中SE种特异性基因(sdfⅠ)的保守序列,设计一套特异性环介导等温扩增(LAMP)引物,建立了SE的LAMP可视化检测方法。该方法的敏感性可达100fg DNA,高于常规PCR方法100倍;全部反应可在1h内完成;可通过肉眼观察颜色直接判定结果;对其他常见病原体的检测结果均为阴性。结果表明建立的LAMP方法简便、快速、灵敏、特异,可用于SE感染的快速检测。  相似文献   

肝螺杆菌LAMP快速检测方法的建立及初步应用     

冯洁  张泉  钱淼  谢建云  胡建华  高诚  高崧 《中国动物传染病学报》2019,(4):50-55

根据肝螺杆菌fla B基因保守区域设计一组特异性引物,经过条件优化、特异性和敏感性分析,成功建立了肝螺杆菌LAMP快速检测方法。结果显示,建立的LAMP扩增方法仅能检测出肝螺杆菌,其他常见细菌未见特异性扩增。检出肝螺杆菌最低模板量为86.9fg/L,是普通PCR所需模板量的1/10。本研究建立的LAMP快速检测方法具备操作简单、特异性好、灵敏度高的优点,结果易于观察,对仪器设备要求低,适宜推广应用。  相似文献   

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) test for specific and rapid detection of Brucella abortus in cattle     

K. Karthik  Rajesh Rathore  Prasad Thomas  T.R. Arun  K.N. Viswas  R.K. Agarwal 《The Veterinary quarterly》2013,33(4):174-179

Background: Brucella abortus, the major causative agent of abortion in cattle and a zoonotic pathogen, needs to be diagnosed at an early stage. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) test is easy to perform and also promising to be adapted at field level.

Objective: To develop a LAMP assay for specific and rapid detection of B. abortus from clinical samples of cattle.

Methods: LAMP primers were designed targeting BruAb2_0168 region using specific software tool and LAMP was optimized. The developed LAMP was tested for its specificity with 3 Brucella spp. and 11 other non-Brucella spp. Sensitivity of the developed LAMP was also carried out with known quantity of DNA. Cattle whole blood samples and aborted fetal stomach contents were collected and used for testing with developed LAMP assay and results were compared with polymerase chain reaction (PCR).

Results: The developed LAMP assay works at 61 °C for 60 min and the detection limit was observed to be 100-fold more than the conventional PCR that is commonly used for diagnosis of B. abortus. Clinical sensitivity and specificity of the developed LAMP assay was 100% when compared with Rose Bengal plate test and standard tube agglutination test. SYB® green dye I was used to visualize the result with naked eye.

Conclusion: The novelty of the developed LAMP assay for specifically detecting B. abortus infection in cattle along with its inherent rapidness and high sensitivity can be employed for detecting this economically important pathogen of cattle at field level as well be exploited for screening of human infections.  相似文献   

猪支原体肺炎LAMP-LFD快速检测方法的建立及初步应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

孙盼盼  时建立  彭喆  王硕  王妍  吴晓燕  徐绍建  李俊 《畜牧兽医学报》2020,51(6):1419-1428

旨在采用环介导等温扩增（LAMP）和横向流动试纸条（LFD）相结合的方法，建立一种快速、特异，过程可视化的猪肺炎支原体（Mycoplasma hyopneumoniae，Mhp）检测方法。针对猪肺炎支原体（Mhp）P36基因设计5套特异性引物和1条异硫氰酸荧光素（FITC）标记的探针，进行LAMP扩增反应。将生物素标记的LAMP产物与FITC标记的探针进行特异性杂交，并使用横向流动试纸条完成扩增产物的检测。经优化，LAMP最佳反应条件为65℃，反应15 min，从基因组DNA提取到LFD结果判断只需40 min左右，比常规PCR技术缩短近2 h。LAMP-LFD可特异性地检出猪肺炎支原体（Mhp），对猪鼻支原体（Mhr）及猪圆环病毒（PCV）等常见猪病病原的检测结果为阴性。灵敏性试验表明，LAMP-LFD对Mhp的检测灵敏度为1×10⁰个拷贝DNA，是普通PCR的1 000倍。利用本方法可从采集的88份临床疑似病料样品中检测到64份阳性，国标PCR方法可检测到56份阳性，符合率可达90.9%。综上，本研究建立的LAMP-LFD方法可特异、准确地应用于Mhp的检测，而且灵敏度高、操作简单、仪器设备依赖性低、检测成本低、耗时短，适合基层实验室、应急检测或现场监测等使用，具有较高的推广价值，有望发展成为Mhp快速检测的有效手段。  相似文献