酶切图谱及序列分析虫体ITS2鉴别中国的片形吸虫   总被引：6，自引：0，他引：6  

黄维义  何波 《动物科学与动物医学》2002,19(10):2-6

提取我国广西、四川、黑龙江、甘肃等地及法国的片形吸虫的总DNA，用PCR扩增完整的ITS－2。对得到的PCR产物用限制性内切酶Hsp 92Ⅱ，RcaI进行酶切和RFLP技术分析。并对ITS－2PCR产物进行双向测序。以便确定国内片形吸虫种内及种间ITS－2的特点和序列变异的水平。结果显示：广西、四川、黑龙江、法国等地的样品通过PCR均扩增到约550bp的ITS－2目标片段。Hsp92 Ⅱ,Rcal可区别不同种的片形吸虫。对PCR产物的序列分析结果表明片形吸虫ITS－2全长均为362bp，同种内ITS－2序列无变异，不同种间ITS－2序列存在5－6个碱基差异，变异率约为2.8%。对各地区片形吸虫ITS－2的PCR－RFLP分析与对PCR产物的DNA序列分析一致证明，来自四川的样品和法国样品同属肝片形吸虫F.hepatica；广西样品属大片形吸虫F.gigantica；黑龙江的样品为中间型片形吸虫。本研究首次从分子水平上证实我国除有肝片形吸虫、大片形吸虫外，还存在中间型的片形吸虫。  相似文献   

片形吸虫第一内转录间隔区DNA多态性的研究   总被引：9，自引：0，他引：9  

林瑞庆董世娟  胥楚雄黄维义宋慧群  朱兴全 《中国兽医科技》2004,34(7):8-12

以不同地区的片形吸虫虫株为研究对象，经PCR扩增出了ITS-1部分基因片段，采用单链构象多态性(SSCP)方法，并结合序列分析研究了不同地区片形吸虫ITS-1 DNA的多态性。不同地区的样品经SSCP分析，显示3种带型，第1种为大片形吸虫的带型，第2种为肝片形吸虫的带型，第3种为2种带形的混合带型。广西区样品和大部分贵州省样品属于大片形吸虫带型；四川省、黑龙江省和部分贵州省样品为混合带型；南京市和甘肃省样品为肝片形吸虫带型或混合带型。测序结果表明，根据ITS-1基因的序列变异位点可区分2种片形吸虫；表现为混合带型的样品在变异位点具有多态性。本研究结果显示，ITS-1片段可作为遗传标记用以区分大片形吸虫和肝片形吸虫，同时也证实，在我国除了这2种片形吸虫外，还可能存在着“中间型”的片形吸虫。  相似文献   

片形吸虫Cold-SSCP鉴别方法的建立     

邓国祥  张汉云  陈蓓蓉  李秋燕  林瑞庆  马妮妮  朱兴全 《中国畜牧兽医》2007,34(2):86-88

以采自我国不同地区的片形吸虫虫体为研究对象，PCR扩增出核糖体DNA (rDNA)的第一内转录间隔区(ITS-1)序列，然后采用非同位素的单链构象多态性(Cold-SSCP)方法分析PCR产物，对不同地区片形吸虫进行分子鉴定。所有样品经Cold-SSCP分析显示2种带型。样品测序及序列分析结果表明，第1种为肝片形吸虫带型，另1种为大片形吸虫带型。本研究建立了区分大片形吸虫和肝片形吸虫的Cold SSCP方法，可用于这2种吸虫的分子流行病学调查，从而为片形吸虫分子生物学的进一步研究奠定了基础。  相似文献   

分子分类结合形态学观察鉴定重庆地区片形吸虫种类     

罗洪林  黄维义  许翠翠  李章民  聂奎 《中国兽医寄生虫病》2007,15(4):7-11

目的明确重庆地区片形吸虫的种类,并为重庆地区片形吸虫的分类研究提供科学的参考依据。方法在对重庆地区黄牛、水牛肝脏上寄生的片形吸虫形态结构进行观察后,根据片形吸虫第一内转录间隔区(ITS-1)和第二内转录间隔区(ITS-2)基因设计特异性引物,运用多聚酶链式反应(PCR)技术,以法国肝片吸虫gDNA为对照,对所采样品gDNA用大片吸虫和肝片吸虫的ITS-1和ITS-2特异性引物进行扩增。结果形态学鉴定均为“不规则”片形吸虫,电泳结果显示均分别扩增出特异性ITS-1和ITS-2条带。结论综合形态学和PCR鉴定结果,初步认为重庆地区存在着大片吸虫和肝片吸虫的“中间型”。  相似文献   

新疆南疆规模羊场片形吸虫的基因鉴定及分析     

《中国兽医杂志》2018,(12)

片形吸虫是严重影响新疆养羊业发展的主要寄生虫病之一。本研究从新疆南疆某规模化羊场感染片形吸虫分离获得3株虫体并提取总DNA,以片形吸虫ITS-1、ITS-2基因设计2对特异性引物,PCR扩增、电泳,获得预期目的片段约360 bp、250 bp。测序结果经核苷酸同源性比较、系统发育树分析,来自新疆南疆样品与肝片吸虫参考株ITS-1、ITS-2基因序列核苷酸同源性达100%、99.7%,证实新疆南疆某规模化羊场感染的片形吸虫为肝片形吸虫。  相似文献   

青海省藏羊片形吸虫18S rRNA基因的扩增及虫种鉴定     

《畜牧与兽医》2015,(11):97-98

为了进一步确定青海地区藏羊体内片形吸虫,并为青海省藏羊体内片形吸虫的分类研究提供科学的参考依据,取片形吸虫基因组DNA,利用保守引物,PCR扩增18S r RNA片段并测序。应用DNAMAN软件用对所测得的序列与Gen Bank中已经发布的大片吸虫(Fasciola gigantica)和肝片吸虫(Fasciola hepatica)的18S r RNA序列进行比对分析。结果发现测得目的片段长度为1 737 bp,测得序列与大片吸虫18S r RNA序列相似度为92.98%,与肝片吸虫的18S r RNA序列相似度为99.77%,从而进一步确定所采虫体为肝片吸虫。  相似文献   

我国片形吸虫(Fasciola)线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因(cox1)部分序列的多态性   总被引：4，自引：0，他引：4  

董世娟  黄维义  林瑞庆  钱德兴  吴绍强  宋慧群  朱兴全 《中国兽医学报》2005,25(4):378-381

用γ^33P对引物进行标记，对来自国内不同地区不同宿主的片形吸虫(Fasciola)的线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基I基因(pcox1)部分序列进行PCR扩增及DNA单链构象多态性(SSCP)分析，结果76个虫体均成功地扩增出约450bp的基因片段；SSCP分析显示，不同地区或同一地区的不同样品在pcox1的SSCP带型上存在多态性；代表性样品的测序结果表明，其碱基序列存在差异。试验结果显示，我国片形吸虫pcox1序列种内变异不明显，种间变异显著．表明cox1序列可以作为片形吸虫分类鉴定中一个可靠的遗传标记。  相似文献   

我国片形吸虫线粒体NADH脱氢酶亚单位1基因(nad1)多态性的研究     

黄维义  董世娟  杨晓野  林瑞庆  钱德兴  张为宇  宋慧群  朱兴全 《中国预防兽医学报》2005,27(4):273-276

用γ^33P对引物进行标记，首次对来自国内不同地区、不同宿主的片形吸虫线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位Ⅰ基因部分序列(pnad1)进行PCR扩增及DNA单链构象多态性(PCR-SSCP)分析，结果76个虫体均成功地扩增出约200bp的基因片段；76个样品经过PCR-SSCP分析后，筛选出11个代表性样品进行测序。测序结果显示我国片形吸虫pnad1序列种间差异大于种内变异，表明nad1序列可以作为片形吸虫种内和种间遗传多态性研究的标记。  相似文献   

广西片形吸虫中间宿主-小土窝螺线粒体rrnL基因遗传多态性研究     

王树艳  李鑫  李娟  沈前程  朱兴全  黄维义 《中国畜牧兽医》2011,38(1)

为研究广西小土窝螺不同地理株线粒体大亚基(large subunit ribosomal rRNA,rrnL)基因的遗传多态性,对广西大片吸虫6个流行地区96个小土窝螺样品的rrnL基因进行PCR扩增,通过单链构象多态性(single strand conformation poly-morphism,SSCP)技术筛选出具有代表性的样品进行克隆、测序,并用DNAStar 5.0及MEGA 4.0软件加以比对分析。结果显示,6个地区小土窝螺rrnL基因PCR扩增长度约500 bp,在长度为273 bp的序列中检测到15个变异位点,占核苷酸总数的5.49%。百色、南宁和桂林3个地区相同地理株间存在较大的遗传差异。种系发育分析表明,线粒体rrnL基因在一定程度上不是研究小土窝螺种群遗传变异的良好分子标记。本研究为阐明片形吸虫中间宿主—小土窝螺的种群遗传关系提供了基础数据。  相似文献   

RAPD与形态学对片形吸虫种类鉴别的比较研究     

沈永林  徐立新  顾有方  胥全彬  A Daugschies 《动物医学进展》2002,23(2):44-46

通过形态学特征观察与随机扩增多态DNA（RAPD）技术，对国内外8株片形吸虫（Fasciola)作比较鉴别。形态典型的6株肝片形吸虫（F.hepatica)和1株大片形吸虫（F.gigantica)两种方法结果。南京的1株不典型虫种（F.sp)，其形态特征类似日本中间种／印度片形吸虫（F.indica),RAPD检测则与大片形吸虫聚类，差异仅0．255，亲缘于大片形吸虫，是一株形态不典型的大片形吸虫。比较表明，形态学方法能简单易行正确地判定典型片形吸虫，但难以识别中间种或亲缘种；RAPD技术则从分子遗传变异水平上鉴别虫种，有利于对中间种或亲缘种的识别及新种的发现，两者具有相互不可替代的相辅相成作用。  相似文献