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相似文献
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1.
应用套式PCR分段扩增犬瘟热病毒融合蛋白的全基因   总被引:2,自引:0,他引:2  
为研究犬瘟热病毒(CDV)融合蛋白各段功能,根据CDVOnderstepoort弱毒株的融合蛋白基因序列,设计合成了10条寡聚核苷酸引物。对此10条引物进行不同的配对,将1株犬瘟热疫苗弱毒株细胞培养物的总RNA进行RT-PCR扩增,利用1次PCR扩增得到了7个基因片段,最长的达1669bp,最短的为314bp;应用套式或半套式PCR,扩增得到了能覆盖整个融合蛋白基因的8个片段  相似文献   

2.
为研究犬瘟热病毒融合蛋白各段功能,根据CDV Onderstepoort弱毒株的融合蛋白基因序列,设计合成了10条寡聚核苷酸引物。对此10条引物进行不同的配对,将1株犬瘟热疫苗弱毒株细胞培养物的总RNA进行了RT-PCR扩增,利用1次PCR扩增得到了7个基因片段,最长的达1669bp,最短的为314bp,应用套式或半套工PCR,扩增得到了能覆盖整个融合蛋白基因的8个片段。  相似文献   

3.
减蛋综合征病毒套式PCR检测技术的研究   总被引:5,自引:1,他引:4  
从GeneBank的1段含六邻体蛋白基因、蛋白酶基因、DNA结合蛋白基因的序列中,应用Primer软件设计了2对引物。用这2对引物在分别对反应体系成分和聚合酶链反应(PCR)试验条件进行优化后,成功地建立了减蛋综合征病毒(EDSV)套式PCR检测技术。对鹌鹑源EDSVQAVc-94株、AV-xb西北分离株、AV-127国际标准株扩增结果,第一轮PCR得到约290bp的特异性片段,第二轮PCR得到约90bp的片段,与预期289bp、89bp的设计相符合。而传染性腔上囊病病毒(IBDV)疫苗株B87、鸡亲城疫病毒(NDV)Ⅳ系疫苗株(LaSota)和正常尿囊液等对照的扩增结果均未显示任何扩增条带,有很好的特异性。所建立的套式PCR检测方法具有特异、快速的优点,其灵敏度比常规PCR灵敏100倍,可检测出0.01fg的  相似文献   

4.
犬场蚊子与犬细小病毒   总被引:1,自引:2,他引:1  
2000年4月,应用套式PCR技术从犬场蚊子的血液样品检测出犬细小病毒。将分离到的犬细小病毒VP2-Y34基因片段克隆到PMD18-T载全,其病毒基因组CPV-PV2-Y34序列测定结果显示与作者在GENEBANK发表的肺病变犬细小病毒CPV-HN-1株有99%同源性。  相似文献   

5.
根据猪繁殖与呼吸综合征病毒美洲型标准毒株的ORF6及部分ORF7的序列,设计合成了一对引物26374 PS/26375PR,用反转录-聚合酶链反应技术对6株PRRSV北京分离株进行了检测。结果该引物对6株病毒均能扩增出与预期大小相符的RT-PCR产物,并与ATCC VR-2332株扩增产物的大小相当,而欧洲型标准毒株未获扩增片段。  相似文献   

6.
本试验建立了一种快速检测鸡传染性支气管炎病毒的通用性PCR方法。通过对纯化后IBV核蛋白基因进行直接PCR及套式PCR扩增表明,两次PCR产物的大小为0.7kb和0.5kb,与实际设计相符。而对照的NDV及IBDV的PCR扩增产物均为阴性。用 IBV HB株感染 SPF鸡后,应用我们所建立的 PCR方法去检测不同时期所采集的肾脏、气管、盲肠扁桃体、肺脏和肝脏中的 IBV,在 SPF鸡感染 IBV后的21天仍然能够检测到 IBV的基因组,Southern blotting杂交试验证明了我们获得的 PCR产物为IBV的核蛋白基因。该PCR检测方法比免疫荧光抗体(FA)法更具敏感、特异、快速等特点,完全适用于不同来源及不同血清型IBV的检测。  相似文献   

7.
牛传染性支气管炎病毒PCR诊断方法的研究   总被引:8,自引:1,他引:7  
根据已发表的牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)gB基因序列,应用oligo4.1程序设计一对引物PB1/PB2,分别对IBRVLA株、洛精、美精、BarthaNu/67株、B7株、云南-1和云南-2分离株进行PCR扩增。结果显示7株IBR病毒DNA均有399bp的特异性片段。用此引物对其同属的伪狂犬病毒(PRV)、马立克氏病毒(MDV)、鸡传染必喉气管炎病毒(ILTV)进行扩增。均未见特异性条带,证  相似文献   

8.
根据已发表的传染性喉气管炎病毒(ILTV)SA-2株的核酸序列,设计了1对引物,以ILTV-中国王岗株DNA为模板,PCR法扩增出1条1.39kb的基因片段,将扩增产物插入到真核表达质粒pCR^TM3-Uni,得到重组质粒pTA-gD,另将克隆到pBluescript SK质料中的gC基因酶毁后,插入到pCR^TM3-Uni载体,得到重组质粒pTA-gC,经电泳分析、酶分、PCR鉴定后,进行序列测  相似文献   

9.
本研究将最新的病毒核酸纯化技术和单管RT-PCR技术相结合,应用于IBDV的诊断研究,对40余个病毒样品进行扩增反应,均取得令人满意的效果。该技术灵敏快速,从核酸纯化到电脉检测PCR产物只需5~6h,反应灵敏度比传统方法至少提高100倍。所设计的引物对毒株的适用范围较广,对12个IBDV毒株和12个病变法氏囊样品均得到分子量一致并与设计相符的扩增产物  相似文献   

10.
猪瘟病毒石门株E2基因的RT-PCR克隆及鉴定   总被引:2,自引:0,他引:2  
本文采用RT-PCR技术从感染猪血中成功扩增了我国猪瘟病毒强毒石门株E2基因,大小为1184bp,与预期大小一致。经巢式PCR和酶切鉴定证实所扩增的片段为E2基因特异性片段。将扩增的E2基因克隆到P^GEM-T载体,采用限制性内切酶鉴定和PCR技术了阳性重组子。  相似文献   

11.
核酸水平检测犬副流感病毒方法的建立   总被引:1,自引:0,他引:1  
根据GenBank中与犬副流感(CPIV)同源性较近的SV5病毒N基因保守序列,利用DNAStar软件设计了一对特异性引物,能扩增265bp大小的片段,并以此建立了检测CPIV的RT-PCR方法,实验证明该对引物特异扩增CPIV;不扩增犬瘟热病毒、犬细小病毒、犬腺病毒和狂犬病病毒犬的四种病原的核酸。检测临床病料20份,其中2分为CPIV阳性。此法敏感性较高。是检测犬急性传染性呼吸道疾病(CIRD)中CPIV的有效的方法。  相似文献   

12.
用PCR法检测东北虎感染猫细小病毒的研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
根据GenBank中已发表的猫细小病毒基因组中的保守序列 ,利用Goldkey软件设计了一对能扩增 750bp片段大小的引物 ,对某动物园 1只病死东北虎的脾脏样品进行了PCR检测。结果得到了与设计大小完全相符且与标准猫细小病毒扩增产物大小一致的特异核酸带 ,同时对犬瘟热、犬腺病毒、轮状病毒的核酸扩增结果均为阴性。敏感性试验表明 ,此法可检出血凝价为 1 2 8×脾脏匀浆液上清 1 0 - 5倍稀释的模板 ,远高于血凝试验的敏感性 ,为虎、狮、熊猫等野生动物细小病毒病的快速诊断提供了一个有效的方法  相似文献   

13.
根据GenBank上登录的犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)基因组全序列,选择CDV强、弱毒株间有区别保守区设计了一对通用引物P1和P4,并在该对引物跨越区域的内部设计了CDV强毒株特异性引物P2及弱毒株特异性引物P3,用引物P1/P4进行RT—PCR,然后用引物P2/P3/P4进行复合套式PCR,建立了一种能区分CDV强、弱毒株的复合反转录-套式聚合酶链式反应(RT—nPCR)的鉴别诊断方法。应用该方法从CDV强、弱毒株的基因组中分别扩增出了大小为247bp和177bp的特异性片段,从两种病毒基因组混合物中扩增出了大小为247bp和177bp的两条特异性片段,与犬细小病毒、犬腺病毒、犬冠状病毒、狂犬病病毒、新城疫病毒的细胞培养物以及正常细胞对照组进行复合RT—nPCR扩增时均为阴性。对从黑龙江省和吉林省采集的20份疑似CDV病料进行的检测结果表明,有15份类似CDV强毒,5份类似CDV弱毒。本研究建立的复合RT—nPCR可以有效检测CDV感染,能够将强、弱毒株区分开,可用于临床快速检测、流行病学监测以及追踪疫苗免疫效果等。  相似文献   

14.
RT-PCR检测贵州犬瘟热病毒   总被引:5,自引:3,他引:5  
根据犬瘟热病毒H基因核苷酸序列 ,设计合成一对引物对贵州临床诊断为犬瘟热 (CD)病死犬的心、肝、脾、肾、粪便进行RT PCR检测。结果表明 :从心、脾、肾病料上清液中可扩增出 760bp的特异性带 ,与预期扩增片段长度相同 ;粪便和肝脏上清液RT PCR结果为阴性 ,但粪便上清液接种Vero细胞后连续传代 3代 ,每代细胞培养液RT PCR结果均为阳性 ;在检测的 2 2条病死犬中 ,有 1 9条病死犬检测到犬瘟热病毒H基因的特异性核酸片段 ,阳性率为 86 4% (1 9/ 2 2 )。  相似文献   

15.
根据发表的犬瘟热病毒(CDV)参考株Ondetstepoort的序列设计1对引物,以犬瘟热病毒疫苗株感染Vero细胞总RNA为模板,利用RT-PCR扩增出附着蛋白基因843 bp片段,将这个片段连接到pMD18-T载体上,经过PCR鉴定、酶切鉴定得到1个阳性克隆,将阳性质粒进行序列测定,结果表明,该片段与Onderstepoort株核苷酸同源性为95.9%。从基因角度为犬瘟热的预防、诊断和治疗提供理论依据。  相似文献   

16.
OBJECTIVE: To develop a rapid and sensitive method for the detection of canine distemper virus (CDV) by nested PCR using clinical specimens. DESIGN: A nested PCR was developed, compared to a one-step RT-PCR and validated. PROCEDURE: Two sets of specific primers for a one-step RT-PCR and a nested PCR, targeting a 640 bp fragment and a 297 bp fragment, respectively, were selected from the highly conserved region of the nucleocapsid protein (NP) gene of CDV. The nested PCR and the one-step RT-PCR were used to amplify a part of the CDV NP gene of a CDV vaccinal strain and samples of urine, blood, nasal discharge and saliva from 29 dogs suspected of suffering CD. RESULTS: Both the one-step RT-PCR and the nested PCR reacted with the CDV vaccinal strain, but not with canine parvovirus. The expected 640 bp fragment of the NP gene was detected in 11/22 (50.0%) blood, 10/20 (50.0%) urine, 5/25 (20.0%) saliva and 6/27 (22.2%) nasal swab samples by one-step RT-PCR, whereas the nested PCR amplified an expected 297 bp fragment of the NP gene in 18/22 (81.8%) blood, 15/20 (75.0%) urine, 14/25 (56%) saliva and 19/27 (70.3%) nasal swab samples. CONCLUSION: The nested PCR detected CDV in blood, urine, nasal swab and saliva more frequently than did the one-step RT-PCR. Therefore, this assay should be a useful aid to antemortem diagnosis of CDV infections in dogs.  相似文献   

17.
根据GenBank中犬瘟热病毒Onderstepoort株序列设计特异性引物,以犬瘟热病毒贵州分离株(CDV-GZ1)RNA为模板,应用RT-PCR对病毒H蛋白编码基因进行了扩增、克隆及序列分析.测序结果表明,CDV-GZ1 H基因ORF由1 824 bp组成,可编码607个氨基酸;与已发表23株其它CDV H基因核苷...  相似文献   

18.
对流行病学调查、临床症状检查和ELISA检测为犬瘟热阳性的自然发病犬,取肠内容物为病料,采用同步培养方法接种于犬肾细胞系(MDCK)进行病毒的分离,并对分离株进行了形态学特征、血凝特性、动物感染及RT-PCR鉴定。结果表明:病料接种MDCK细胞产生明显的细胞病变(CPE),电镜负染观察接毒细胞培养物见有典型的犬瘟热病毒粒子。分离株不凝集鸡及人“O”型红细胞,接种犬出现明显的临床症状和病理变化。用RT-PCR技术检测病毒细胞培养液,扩增出的片段长为760 bp,与预期设计的长度相同,由此确证分离株为犬瘟热病毒,命名为CDV-GZ2株。  相似文献   

19.
Two pairs of PCR primers were designed according to sequence of canine distemper virus (CDV) and canine coronavirus (CCV) from GenBank, respectively, which could amplify 550 bp fragment for CDV and 225 bp fragment for CCV. The products of PCR were cloned to pMD18-T for sequencing, which proved to be specific. Positive plasma were developed for standard DNA, and the sensitivity result of duplex PCR showed that the method could amplify 0.1 ng/μL nucleic acid for both of viruses. The result of rudimentary application showed that the method was specific, sensitive, efficient, and was a new detecting method for the mixed infection of CDV and CCV.  相似文献   

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