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猪肺炎支原体表面蛋白P46基因的克隆与序列比较 总被引：1，自引：0，他引：1
猪肺炎支原体(Mycoplasma Hyopneumoniae,Mhp)兔化弱毒株R659株、济南强毒株、强毒Z株、国际标准株232,通过A26培养基培养,提取DNA;利用PCR技术从四株猪肺炎支原体中均能扩增出目的条带.将该序列克隆到pGEM-T-Easy载体上测序.结果表明,克隆序列全长1 152 bp,编码383个氨基酸和一个终止子(TAA);该序列中含有3个TGA编码Trp,而不是终止密码子.比较兔化弱毒株与济南强毒株、国际标准株232及NCBI上发布的J株的P46基因序列,发现它们的同源性分别为98.6%、99.2%、99.2%;比较它们编码的氨基酸发现它们的同源性分别为98.7%、99.2%、99.2%.结果表明猪肺炎支原体的P46基因在猪肺炎支原体种内是很保守的,因此建立以P46蛋白为诊断抗原的ELISA具有潜在的意义. 相似文献
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根据GenBank登陆的新城疫病毒P基因序列,设计了一对引物,用RT-PCR技术对新城疫病毒内蒙古分离株TL1的P基因进行了扩增。将扩增产物提纯后克隆入pGEM-Teasy载体,通过酶切、PCR和测序验证克隆正确。测序拼接得出P基因的序列长度为1248bp,该基因的ORF总长为1188bp,编码395个氨基酸。与GenBank下载的12株参考毒株比较P基因编码区全核苷酸序列和氨基酸序列,发现TL1株与鹅源新城疫NA-1株核苷酸的同源性为99.8%,氨基酸的同源性为99.2%;与鹅源新城疫ZJ1株核苷酸的同源性为96.1%,氨基酸的同源性为95.5%,说明TL1株和与鹅源新城疫NA-1株、ZJ1株的同源性极高,它们三者亲缘关系较近,同属于基因VII型新城疫病毒。而与传统疫苗株LaSota核苷酸的同源性为83.4%,氨基酸的同源性81.8%,说明该毒株相对于经典的NDV在P基因上已发生了较大的变异。 相似文献
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采用RT-PCR方法扩增了新城疫病毒(NDV)TL1株M基因,将扩增产物提纯后克隆入pGEM-T easy载体,通过酶切、PCR和测序验证克隆正确。测序拼接得出M基因的序列长度为1232 bp,该基因的ORF总长为1095 bp,编码364个氨基酸。与GenBank下载的15株参考毒株M基因比较,核苷酸同源性为85.2%~98.1%,编码的氨基酸同源性为85.8%~98.9%。NDV TL1产生M蛋白分子中有7对碱性氨基酸,5个保守的Cys残基,与鹅源新城疫SF02株、ZJ1株具有类似的特征。这些结果为揭示NDV TL1株的分子生物学背景,阐明NDV种间传播机制奠定了基础。 相似文献
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用RT-PCR法,以1株h5N1亚型禽流感病毒RNA为模板,扩增了NP全基因cDNA.将cDNA克隆于pMD18-T载体,并对其进行测序.测序结果表明所克隆的1542个核苷酸的片段包含了核蛋白完整阅读框架,其中编码区为1497个核苷酸,编码498个氨基酸.将其序列与6株A型流感病毒NP基因序列进行比较,各毒株之间NP基因核苷酸序列同源性为92.5%～95.9%,编码的氨基酸同源性为97.0%～98.4%.本研究通过分子进化分析揭示了各毒株间的亲源关系. 相似文献
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牛病毒性腹泻病毒P20和P14基因的克隆及序列分析 总被引：5，自引：0，他引：5
参考GenBank中BVDV Oregon C24V株的基因组序列设计两对引物,利用套式PCR方法扩增P20基因,扩增出预期525 bp的目的片段.扩增产物克隆至pMD18-T载体,经酶切鉴定获得阳性重组质粒并对其进行测序.测序结果与参考序列Oregon C24V比较,二者的核苷酸同源性仅为80.95%,推导氨基酸同源性为87.50%.测序结果经NCBI上的Blast(Http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)同源性比较,克隆得到的基因与Osloss株同源性最高,核苷酸同源性为93.65%,推导氨基酸同源性为95.83%.根据P20的测序结果,参照GenBank中BVDV Osloss株设计一对引物,扩增P14基因,经同源性比较,扩增的P14基因与Osloss株核苷酸同源性为94.77%,推导氨基酸同源性为95.10%,通过系统发生分析,推测P20基因和P14基因与Osloss株在进化上比较接近. 相似文献
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为分析猪瘟病毒湖北流行株(CSFV-HBWH-2017株)E2基因遗传变化规律,参照Gen Bank公布的CSFV-E2基因序列设计特异性引物,对CSFV-HBWH-2017株E2基因进行PCR扩增、克隆、测序以及遗传进化分析。结果显示,E2基因PCR扩增产物大小为1 489 bp,编码496个氨基酸,系统进化树显示HBWH-2017株与Gen Bank参考毒株的核苷酸序列同源性为86.0%~96.0%,与湖南HNLY-2011株同源性高达96%亲缘关系最近,属于同一分支2.1c亚型,表明2.1c毒株已经成为湖北地区流行毒株。 相似文献
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为了解牛支原体广西分离株的P81基因和vspY1基因的变异特点,为牛支原体病的诊断和防控提供依据,本研究对7株牛支原体广西分离株P81和vspY1基因进行PCR扩增、克隆、测序和序列分析。序列分析结果显示,7株牛支原体的P81基因全长为2 100bp,编码700个氨基酸残基;vspY1全长为948bp^1 029bp,编码316~343个氨基酸残基。核苷酸相似性结果显示,7株分离株与参考株之间的P81基因相似性为94.7%~99.9%,而vspY1基因的相似性为78.4%~100%。核苷酸进化树结果表明,7株牛支原体P81基因和vspY1基因均与标准株PG45分属于不同的分支。抗原表位预测结果显示,7株分离株P81含有26~28个潜在的抗原表位,vspY1基因含有6~7个潜在的抗原表位。试验结果表明P81较保守,变异小,而vspY1基因变异较大,且P81和vspY1蛋白均存在抗原表位。 相似文献
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从典型猪肺炎支原体病变肺组织传代分离到一株支原体,经培养特性、血清学鉴定、生化鉴定、PCR检测及测序分析证明其为猪肺炎支原体,纯化后命名为S株。将S株P46基因和P97基因R1区的氨基酸序列与其他菌种的相应序列进行同源性分析,该菌株P46基因氨基酸序列与其他菌种同源高达99%以上,P97基因R1区的氨基酸重复数为11个,不同于其他菌株;免疫原性试验结果表明该菌株具有良好的免疫原性。 相似文献
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In order to understand the sequence characteristics, basic structure and genetic variation of P46 gene which was the main immunogenic surface membrane protein gene of local prevalent Mycoplasma hyopneumoniae (Mhp) strains in Guangxi Luchuan pig.The Mhp P46 gene in positive diseased swine samples which were collected from the purebred Luchuan pig farms in Guangxi from 2011 to 2013 was amplified using PCR,and then cloned into pMD18-T vector and transformed into E.coli DH5α.We chose the positive clones and sequenced.We amplified P46 genes of four positive strains (GXLC1,GXLC2,GXLC3 and GXLC4).Use the DNAStar software to analyse the cloned sequence.The results showed that P46 gene sequence was 1104 bp coding 368 amino acids.The sequence included three Trps coded by TGA codons which weren’t termination codons and one Arg coded by CGG codons which weren’t nonsense code.The homologies of nucleotide sequences of 4 strains were 98.4% to 99.4%,and the homologies of deduced amino acid sequences were 98.6% to 99.5% with these sequences of standard J strain,232 strain,7448 strain and 168 strain.The P46 genes of these strains had highly conservation because of the high-level homologies. 相似文献
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绵羊肺炎支原体Y98 P30基因的克隆、表达及免疫试验 总被引：1，自引：0，他引：1
根据猪肺炎支原体（Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp）跨膜蛋白P30基因序列设计引物,通过PCR克隆出绵羊肺炎支原体（Mycoplasma ovipneumoniae,MO）膜蛋白P30基因片段。通过对该序列的同源性分析表明MOP30基因与Mhp P30基因核苷酸序列同源性为79%。抗原表位及跨膜结构预测的结果表明,MO P30基因与Mhp P30基因的抗原表位及跨膜结构均具有高度的一致性。该片段中含1个TGA编码Trp,而不是终止密码子。将P30基因与原核表达载体pET-28a连接构建pET-28a-P30表达质粒,转化受体菌Rossta得到重组菌株Rossta（pET-28a-P30）。经诱导后SDS-PAGE表明有30 000左右的目的条带出现;Western blot表明Rossta（pET-28a-P30）表达的30 000蛋白主要以包涵体的形式存在;小鼠免疫试验表明Rossta（pET-28a-P30）原核表达的蛋白对小鼠具有一定的保护作用。 相似文献
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猪肺炎支原体P216基因片段的表达及黏附活性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究旨在研究猪肺炎支原体P216蛋白的黏附活性并初步建立猪肺炎支原体蛋白黏附模型。根据软件分析和文献报道从P216全基因中选取亲水性、抗原性、黏附性较好的目的片段,利用PCR从Mhp NJ株扩增P216基因片段,克隆到表达载体pET-32a(+)中,获得重组质粒pET-32a(+)/P216,经IPTG诱导获得重组蛋白,通过Western blot和间接免疫荧光试验检测重组蛋白的免疫原性及黏附活性。结果表明,PCR扩增的目的基因大小为l 636bp;SDS-PAGE检测重组蛋白相对分子质量为80.1ku;Western blot检测表明重组蛋白能与Mhp阳性血清发生特异性反应;间接免疫荧光试验表明该蛋白对猪肺炎支原体黏附SJPL细胞产生占位抑制作用。结果提示,P216蛋白具有良好的黏附活性,能黏附SJPL细胞,从而为猪肺炎支原体其他黏附因子的研究奠定基础。 相似文献
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根据猪肺炎支原体(Mhp)和猪鼻支原体(Mhr)的16S rRNA基因设计3条引物, 建立Mhp和Mhr的双重PCR检测方法,并对该方法进行了特异性和敏感性试验,并使用建立的方法检测了临床样品和疫苗样品。结果显示该方法具有良好的特异性,最低可检测到0.66ng 的Mhp基因组DNA和0.58 ng Mhr基因组DNA,临床样品和疫苗样品检测结果与普通PCR检测结果一致。该双重PCR方法,可用于Mhp与Mhr的鉴别、诊断以及疫苗纯粹性检查,快速而准确。 相似文献
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猪肺炎支原体P46基因的原核表达与间接ELISA方法的建立 总被引：3，自引：1，他引：2
猪肺炎支原体是猪喘气病的病原体,本研究选择猪肺炎支原体P46膜蛋白基因亲水区序列进行克隆,并将其内3个编码Trp的TGA突变成TGG,然后再克隆到pET28a(+)载体中,在大肠杆菌BL21 (DE3)细胞内实现了高效表达,表达产物相对分子质量约为31 ku,约占菌体总蛋白35％,表达形式为包涵体,通过Western blotting 证明表达产物与猪肺炎支原体高免血清具有很好的反应原性和特异性.将大肠杆菌表达的猪肺炎支原体P46重组蛋白经过洗涤、过柱纯化后,作为间接ELISA包被抗原用于检测猪血清中猪肺炎支原体抗体,通过对各参数和试剂的优化建立了rP46-ELISA方法,获得了较好的效果,通过与现有ELISA检测方法的比较,结果表明二者间具有较高的符合率. 相似文献
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LI Ke-yu ZHAO Wu LI Bin QIN Yi-bin LU Bing-xia LIANG Jia-xing HE Ying ZHOU Ying-ning WEI Ying-yi 《中国畜牧兽医》2015,42(9):2270-2277
Through in-depth understanding of sequence characteristics, structure and genetic variation of adhesion factor P97 gene R1 region of Mycoplasma hyopneumoniae (Mhp) epidemic strains in Guangxi Luchuan pig, the assay was aimed to provide theoretical basis for mycoplasmal pneumonia of swine (MPS) integrated effective prevention and control measures of Guangxi local variety Luchuan pig, and lay a solid foundation for further study the characteristics of Mhp epidemic strains in Guangxi Luchuan pig.A pair of primers was designed to amplify P97 gene R1 region according to Mhp genome sequence, the MPS positive disease materials of Guangxi Luchuan pig from 2011 to 2014 as the object of study, after genomic DNA extraction and PCR amplification of P97 gene R1 region, the PCR products were sequenced.The base composition and deduced amino acid sequence of P97 gene R1 region of Mhp epidemic strains of Guangxi Luchuan pig were compared.The analysis of DNAStar showed that there were multiple base mutations in P97 gene R1 region of 15 strains of Guangxi Luchuan pig Mhp strains (GXLC-1, GXLC-2, GXLC-3, GXLC-4, GXLC-5, GXLC-6, GXLC-7, GXLC-8, GXLC-9, GXLC-10, GXLC-11, GXLC-12, GXLC-13, GXLC-14 and GXLC-15) and 3 strains of Guangxi other breeds of pigs Mhp strains (GX227, GX595 and GX674).The statistical repeat number of five amino acid (AAKPV/E) of P97 R1 region were 9 to 18, the average value was 12, TN repeats were 1 to 4.We found that Guangxi Luchuan pig Mhp strains mutation made its virulence and adhesion ability enhancement, and respiratory of Luchuan pig with the special structure of short and narrow, which could more easily lead to the occurrence of Guangxi Luchuan pig MPS. 相似文献
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本试验通过深入了解广西陆川猪猪肺炎支原体(Mhp)地方流行毒株的黏附因子P97基因R1区的序列特征、基本结构及遗传变异等特点,为广西地方品种陆川猪猪支原体肺炎(MPS)有效的综合防控措施提供理论依据,并为进一步研究广西陆川猪Mhp地方流行毒株特性打下坚实的基础。参考Mhp基因组序列设计扩增P97基因R1区的1对引物,以 2011年-2014年广西陆川猪MPS阳性病料为研究对象,提取基因组DNA,PCR扩增P97基因R1区,对PCR产物进行测序,将广西陆川猪Mhp不同地方流行毒株的P97基因R1区序列的碱基组成和推导的氨基酸序列进行比对。DNAStar软件分析结果表明,所获得的15株广西陆川猪Mhp毒株(GXLC-1、GXLC-2、GXLC-3、GXLC-4、GXLC-5、GXLC-6、GXLC-7、GXLC-8、GXLC-9、GXLC-10、GXLC-11、GXLC-12、GXLC-13、GXLC-14、GXLC-15)和3株广西其他品种猪Mhp毒株(GX227、GX595、GX674)的P97基因R1区的多处碱基发生变异。通过推导氨基酸序列统计P97 R1区五氨基酸(AAKPV/E)重复数为9~18,平均值为12,TN重复数为1~4,结果发现广西陆川猪Mhp流行毒株变异使其毒力和黏附能力增强,再加上陆川猪呼吸道短小狭窄的特殊结构,更易导致广西陆川猪MPS的发生。 相似文献