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对濒临灭绝贵州地方猪种白洗猪线粒体DNA控制区进行分子遗传学研究,为其科学保种和合理开发利用提供科学依据。PCR扩增线粒体DNA控制区全序列,直接测序分析。结果表明:白洗猪线粒体DNA控制区全长1 254~1 314 bp,可以分为3个区;按中间重复区序列是否发生变异可以分为A、B 2种类型;聚类分析和单倍型遗传距离分析显示,各类型分布频率很不均衡,遗传多样性呈降低趋势。结果说明,贵州白洗猪可能有2个母系起源,该物种已经濒临灭绝,单倍型多样度较丰富,但是遗传多样性正在逐步丧失,亟需进行科学的保护。 相似文献
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《中国畜牧杂志》2020,(1)
为探究淮南猪的遗传多样性和母系起源,本实验对32头淮南猪线粒体DNA D-loop区序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank中国内外猪种及黄河流域古家猪D-loop序列,分析淮南猪线粒体多态性及其起源。结果显示:淮南猪1 170 bp的D-loop序列核苷酸多样性(Pi)及单倍型多样性(Hd)分别为0.004 25和0.968;32个测序结果共检测到27个多态位点,界定了20种单倍型;中性检验表明淮南猪在驯化进程中曾发生过种群扩张;邻接法(NJ)构建分子系统发育树明显将群体分为国内和国外2个类群,淮南猪20个单倍型都聚集在国内分支上;进一步Network分析显示,淮南猪单倍型在国内猪种中呈广泛分布,但与华中、华北型猪种基因交流较多,且与黄河流域古家猪遗传关系较近,表明淮南猪为多母系起源,主要来自于黄河流域古家猪。 相似文献
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核线粒体假基因(NUMT)是线粒体DNA插入到核基因组中的DNA片段。目前,已经发现越来越多的真核生物基因组存在线粒体假基因现象。猪线粒体假基因在核基因组中的分布尚未见报道。研究通过猪线粒体基因组全序列与核基因组全序列进行比对,由BLAST程序鉴别出132个NUMT。结果表明:这些NUMT的大小在37~4 453bp,其中90%的NUMT长度处于40~1 000 bp的范围内,NUMT与相应的线粒体DNA片段之间的同源性数值范围为66%~100%。此外,鉴定出的NUMT序列几乎涵盖了包括线粒体DNA控制区在内的全部线粒体基因组,包括30个完整的线粒体基因,分布于猪的1、4、5、7、11、13、14、15、17号染色体上,近50%的NUMT定位在14号染色体上。 相似文献
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D-loop环作为线粒体DNA重要的一个区域,已被广泛用于物种起源分化、系统进化等方面的研究。本文简要介绍了线粒体DNA D-loop环的结构特征及其研究方法,并综述了近年来猪线粒体DNA D-loop环的研究进展。 相似文献
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综述了国内外近20年来在DNA分子水平上对马遗传多样性的研究进展.集中从基因组DNA,线粒体DNA和Y染色体DNA的多态性上反映马遗传多样性.基因组DNA的研究证明了马具有丰富的多态现象;线粒体DNA的分析暗示马可能有多个母系祖先,并阐述了世界马种经历过多个驯化历史时期;Y染色体虽然被包含在基因组内,但它含有非重组的的单亲遗传区,能够反映父系的遗传多样性,使其在生物进化和群体遗传学研究中具有独特的意义.相对于线粒体突变率,马的Y染色体遗传变异较少. 相似文献
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马DNA遗传多样性研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
综述了国内外近20年来在DNA分子水平上对马遗传多样性的研究进展。集中从基因组DNA,线粒体DNA和Y染色体DNA的多态性上反映马遗传多样性。基因组DNA的研究证明了马具有丰富的多态现象;线粒体DNA的分析暗示马可能有多个母系祖先,并阐述了世界马种经历过多个驯化历史时期;Y染色体虽然被包含在基因组内,但它含有非重组的的单亲遗传区,能够反映父系的遗传多样性,使其在生物进化和群体遗传学研究中具有独特的意义。相对于线粒体突变率,马的Y染色体遗传变异较少。 相似文献
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猪品种遗传多样性的研究进展 总被引:3,自引:1,他引:2
从猪品种的体型外貌、染色体带型、血型和蛋白质以及DNA分子水平等几个方面对猪的遗传多样性进行论述 ,并对遗传多样性的度量参数作了分析。认为猪种遗传多样性的研究是保种和利用的理论基础 ,从形态到DNA分子水平对猪品种遗传多样性的研究在遗传资源大量流失的今天具有重要意义。 相似文献
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线粒体DNA在家畜遗传多样性研究中的应用 总被引:2,自引:2,他引:0
近年来动物线粒体DNA在遗传进化学方面的研究成为分子进化遗传学领域的研究热点,线粒体基因组已成为分子遗传学和系统进化的一个重要模式。作者就动物线粒体DNA的研究及其在家畜遗传多样性研究中的应用作一简要综述。 相似文献
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《畜牧与兽医》2015,(10):1-4
我国拥有丰富的地方猪资源,也是世界上家猪驯化较早的中心之一。但近40年,地方猪品种受到国外引进猪种的强烈冲击,在数量和规模上均显著降低,遗传资源受到威胁。本研究利用线粒体基因组序列,对我国21个地方猪品种共计86个个体的遗传多样性进行了分析,并构建了43个地方猪品种的分子进化树。结果表明:中国地方猪线粒体D-Loop区存在序列长度多态性。86个序列共检测到32种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.966±0.006,平均核苷酸多样性(Pi)为0.00592±0.00023,遗传多样性贫乏。32种单倍型可明显的聚为2大类,但是单倍型的聚类与地理分布没有显著相关性。分子进化树显示中国地方猪与国外猪种处于2个明显不同的分支上;由于受到人类迁徙活动以及不同猪种间基因交流的影响,猪种的聚类关系与地理分布同样不存在显著相关,很难利用线粒体基因组序列对中国地方猪品种进行准确分类。 相似文献
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为从分子水平上探究中国地方猪种遗传多样性和分类地位,本试验采用生物信息学方法比较了6个类型共22个中国地方猪种的线粒体基因组全序列,分析了其多态性,并构建了6个类型猪种线粒体D-loop区单倍型的网络中介图以及基于线粒体D-loop序列、Cytb基因、完整编码区序列的系统进化树。结果表明,6个类型22个猪种中共检测到了144个多态位点,22种单倍型,说明地方猪种具有丰富的遗传多样性;地方猪线粒体基因组序列中核苷酸变异以转换为主,且Ti/Tv大于转换/颠换比临界值(2.0),变异位点均符合中性突变。6个类型猪种间遗传距离均较小,且有共享单倍型。系统进化树结果表明,6种类型地方猪种主要聚为两个支系。表明线粒体D-loop序列及Cytb基因均可作为研究种内系统发育、起源进化的分子标记。 相似文献
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<正>自1962年线粒体DNA(mitochondria DNA,mt DNA)首次通过电子显微镜直接被观察到以来,便成为核外遗传物质的研究热点。随着PCR、DNA测序、生物信息学等领域的快速发展,有关猪mt DNA的结构、遗传特点、应用等各方面都已经积累了相当丰富的资料。猪线粒体DNA的长度约为16.7kbp,由1个非编码D-Loop区和37个编码基因组成,其结构排列十分紧凑,碱基使用节约、高效。mt DNA具有母系遗传、自主遗传、无组织特异性、进化速率快 相似文献