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犬慢性肾衰竭进程中肠道菌群代谢物短链脂肪酸水平的变化及其对肾功能的影响 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究旨在评估短链脂肪酸在慢性肾衰竭患犬和健康犬中的水平,探究短链脂肪酸变化的原因及其对肾功能的影响。选取22例轻度慢性肾衰患犬（M-CRF组）、29例重度慢性肾衰患犬（S-CRF组）和26例健康对照犬（HC组）,用16S rDNA测序技术分析肠道菌群多样性,气相色谱法检测粪中短链脂肪酸浓度。通过粪菌移植和补充丁酸钠给5/6肾摘除犬,观察肠道菌群及丁酸钠对肾功能影响。结果显示：1）S-CRF组肠道菌群多样性指标观察物种数及Simpson指数低于HC组（P<0.05）,PCoA分析显示,S-CRF组肠道菌群与M-CRF、HC组有差异。2）LEfSe分析显示,S-CRF组和HC组间大量差异菌群,拟杆菌科、拟杆菌属及假单胞菌科等7个菌种富集于S-CRF组,普氏杆菌科、梭菌科、普氏杆菌属及普拉梭菌属等11个菌种富集于HC组。CCA分析发现富集于S-CRF组菌种丰度与肾功能指标呈正相关。3）S-CRF组粪中乙酸、丙酸及丁酸浓度均显著低于HC组和M-CRF组,M-CRF组丁酸浓度显著低于HC组（P<0.05）,且丁酸浓度与血中胱抑素C（Cys-c）、肌酐（Cr）及尿素氮（BUN）等肾功能指标呈负相关（r值分别为-0.451、-0.583和-0.514,P<0.01）。4）与慢性肾衰模型组（5/6 Nx组）比较,慢性肾衰犬给与丁酸钠8周后,血清Cr和BUN显著降低（P<0.05）;粪菌移植8周后,血清Cr和BUN显著升高（P<0.05）,丁酸钠可回调血清Cr和BUN水平。综上表明,慢性肾衰竭患犬肠道菌群多样性降低,菌群结构及丰度改变,粪中短链脂肪酸浓度降低,这些变化可加剧肾功能障碍。为犬慢性肾衰竭的防治提供新的理论依据。 相似文献
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不同饲养模式对哈萨克马肠道菌群有何影响鲜有报道,本文通过对比自由放牧和圈养状态下哈萨克马粪便菌群组成和标志物种,揭示哈萨克马肠道菌群在不同饲养模式下的波动性变化。采集自由放牧和圈养条件下各5匹哈萨克马的新鲜粪便,利用高通量测序技术分析哈萨克马肠道菌群组成、功能途径等。结果显示,放牧组肠道菌群多样性显著高于圈养组（Shannon指数,P<0.05;Simpson指数,P<0.01）;放牧组标志物种显著多于圈养组。在门水平上,放牧组和圈养组的厚壁菌门（76.10%;78.08%）和拟杆菌门（17.16%;15.72%）丰度较高,均占总菌群的93%以上。在科水平上,放牧组以分解/发酵纤维素的菌群（瘤胃球菌科,30.44%;毛螺菌科,21.96%;艰难杆菌科,4.86%）为主;圈养组中分解/发酵纤维素的瘤胃球菌科（28.73%）和毛螺菌科（14.51%）以及消化淀粉类碳水化合物的链球菌科（15.08%）为优势菌科,且链球菌科的丰度显著高于放牧组（P<0.05）。对功能基因序列进行功能注释时,77.44%的序列被注释为“代谢”。结果表明,由不同饲养模式介导的两组中,自由放牧组菌群多样性高于圈养组,且菌群消化类型更为统一,两组肠道菌群组成存在整体性差异,这些为进一步研究哈萨克马肠道菌群奠定了理论基础。 相似文献
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本研究旨在通过网络药理学联合16S rDNA高通量测序技术分析丹参对感染大肠杆菌小鼠肠道菌群的影响。利用传统中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选丹参有效成分及靶点基因。使用基因数据库（Genecards）获得E.coli靶点基因。两者靶点基因取交集,通过STRING平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络,并运用Cytoscape 3.8.2软件构建“丹参活性成分-潜在作用靶点”网络。利用DAVID在线工具进行基因本体论（GO）功能富集分析,Metascape数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。试验选用110只雄性昆明小鼠,随机分为对照组、大肠杆菌组和低、中、高剂量丹参大肠杆菌感染组,每组22只。连续灌胃丹参液28 d后,用E.coli O101进行腹腔注射,对照组注射无菌生理盐水,观察24 h后,收集各组粪便。应用16S rDNA高通量测序技术对各组小鼠肠道菌群进行分析。结果显示：1）网络药理学丹参有效成分36个,作用靶点669个,Genecards数据库搜索E.coli靶点8 902个,对两者取交集去除孤立点获得丹参治疗E.coli潜在靶点51个;GO、KEGG分析,获得关键靶点18个、关键通路47条,其中生物过程（BP）、分子功能（MF）和细胞成分（CC）各为174、76、45条;2）通过Illumina Miseq测序共获得950 855条有效序列,2 537个操作分类单元（OTUs）;3） Alpha多样性分析结果表明,不同剂量丹参组肠道菌群多样性与对照组具有显著差异,大肠杆菌组肠道菌群多样性显著低于对照组（P<0.05）;4）相比于大肠杆菌感染组,在门水平上,低、中、高剂量丹参大肠杆菌感染组Bacteroidetes （拟杆菌门）丰度极显著增高（P<0.01）,Firmicutes （厚壁菌门）丰度显著增高（P<0.05）,Proteobacteria （变形菌门）极显著降低（P<0.01）,在属水平上Bacteroides（拟杆菌属）丰度极显著增高（P<0.01）;5）基于LEfSe分析,对照组、大肠杆菌感染组、丹参高剂量大肠杆菌感染组共发现14种显著差异菌群;6） PICRUSt功能预测分析发现,丹参对大肠杆菌感染小鼠肠道菌群调节功能主要富集的途径是氨基酸、碳水化合物运输与代谢,翻译、核糖体结构和生物转化,细胞壁/膜/生物合成等方面。综上,基于网络药理学联合16S rDNA高通量测序技术全面揭示了丹参多成分、多靶点、多途径调节相关菌群生物丰富度,对大肠杆菌感染小鼠的肠道菌群紊乱有缓解作用,为临床应用丹参治疗大肠杆菌感染提供理论依据。 相似文献
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试验旨在分析鸭疫里默氏菌（RA）感染不同时期鸭肠道菌群结构变化规律，探讨鸭疫里默氏菌对鸭肠道微生物的影响及引起鸭致病的可能机制。采用细菌16S V4-V5区扩增通用引物，扩增鸭疫里默氏菌未感染组（鸭疫里默氏菌感染0 d组），鸭疫里默氏菌感染后1、2、3、5、9和14 d的鸭直肠内容物样本DNA，将扩增得到的产物进行DNA建库后基于Ion S5TMXL测序平台测序。测序得到的Raw Reads数据总量为4 710 688条序列，平均每个样本84 119条序列。共注释到数据库的操作分类单元（OTUs）数目为4 528。Alpha多样性分析结果表明，菌群多样性指数Shannon和Simpson在鸭疫里默氏菌感染组和未感染组间差异不显著（P>0.05），菌群丰富度指数Chao1、Ace、Observed-species和PD-whole-tree在鸭疫里默氏菌感染后0~5 d逐渐降低，从5~14 d又逐渐增加，尤其在鸭疫里默氏菌感染后3和5 d均显著低于未感染组（P<0.05）。Beta多样性分析表明，未感染组与6个时间点的感染组间菌群差异均显著（P<0.05），其中，未感染组与感染后3 d的物种差异最大，之后依次为感染后2、5、9、1和14 d。物种丰度聚类热图显示，在未感染组和不同时间感染组，物种丰度相对较高的微生物菌属均不同。在门水平，鸭疫里默氏菌感染组主要以厚壁菌门（Firmicutes）、unidentified-Bacteria、拟杆菌门（Bacteroidetes）、梭杆菌门（Fusobacteria）及变形菌门（Proteobacteria）为主；在属水平，Bacteroides在感染组和未感染组均为优势菌属，感染组中弯曲杆菌属（Campylobacter）和梭杆菌属（Fusobacterium）明显增加。本试验分析了鸭疫里默氏菌未感染组和感染不同时间组肠道菌群的差异，寻找到一些特征菌属，可为鸭疫里默氏菌的致病性研究提供理论依据。 相似文献
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为了解不同浓度赤芍黄柏制剂对致病性大肠杆菌（Escherichia coli）感染的雏鸡肠道菌群多样性的影响,本研究对240只15日龄健康雏鸡随机编号后分为空白对照组（CON）、感染组（BC）、低剂量治疗组（TL）和高剂量治疗组（TH）4个组,除对照组外,其余各组（BC、TL、TH）均使用致病性大肠杆菌进行感染,感染0.5 d后,分别用不同浓度的赤芍黄柏制剂对TL组（4 mL·L-1灭菌水）和TH组（12 mL·L-1灭菌水）进行饮水治疗,治疗5 d后统计各组发病率及死亡率,采用高通量测序技术检测雏鸡十二指肠肠道菌群多样性。结果显示,与感染组相比,TH组显著降低了雏鸡的发病率和死亡率（P<0.05）。菌群分析显示,赤芍黄柏制剂处理改变了雏鸡肠道菌群多样性组成,提高了乳杆菌属的丰度。CON组优势菌群以厚壁菌门、肠球菌属为主;BC组肠道优势菌群主要为厚壁菌门、变形菌门、肠球菌属、大肠杆菌属及葡萄球菌属;TL组优势菌群以厚壁菌门、乳杆菌属、肠球菌属及葡萄球菌属为主;TH组优势菌群以厚壁菌门、乳杆菌属为主。热图分析显示,乳杆菌属与发病率和死亡率呈负相关,大肠杆菌属与发病率和死亡率呈正相关（P<0.05）。综上,大肠杆菌感染及赤芍黄柏制剂治疗改变了雏鸡肠道菌群多样性及组成,而这种肠道菌群的变化可能对雏鸡腹泻发病及抗病力产生重要影响。 相似文献
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为了解中草药泰山磐石散加减方对小鼠肠道微生物菌群的影响，本试验选取45只SPF级昆明小鼠，分为对照A组、试验B组和试验C组。试验B组和C组小鼠分别用0.86 g/mL的中草药泰山磐石散方灌胃0.3和0.4 mL，对照A组灌胃蒸馏水0.4 mL，每天灌胃2次，间隔8 h，连续7 d。第8天采集对照组和试验组小鼠直肠部位粪便样品，从每份样品中提取微生物基因组总DNA，采用Illumina HiSeq测序技术检测样品微生物群落多样性。结果显示，中草药泰山磐石散对小鼠粪便中微生物α多样性指数（Chao1和Shannon）呈波动性变化，试验B和C组与对照A组的Chao1指数差异极显著（P<0.01）；通过检测小鼠对照组与试验组粪便中的微生物，在门水平上，有9大优势菌门，其中与对照A组相比，试验组肠道微生物Proteobacteria、Verrucomicrobia丰度显著降低（P<0.05）；而Saccharibacteria、Tenericutes丰度显著或极显著增加（P<0.05；P<0.01）；在科水平上，有19大优势菌科，其中与对照组相比，试验组肠道微生物Lactobacillaceae、Desulfovibrionaceae、Coriobacteriaceae、Porphyromonadaceae、Family_XIII和Bifidobacteriaceae丰度显著降低（P<0.05）；在属水平上，有18大优势菌属，其中与对照A组相比，试验B、C组肠道微生物Lactobacillus、Desulfovibrio和Enterorhabdus丰度显著降低（P<0.05），而试验C组的肠道微生物Alloprevotella、Bacteroides、Lachnospiraceae_UCG-006和Faecalibaculum丰度显著增加（P<0.05）。本试验中草药泰山磐石散加减方能够有选择性的促进小鼠肠道内Bacteroidetes的生长，从而抑制Proteobacteria有害菌的生长，增强糖和脂肪代谢，最终通过改善肠道微生物多样性的结构，使整个肠道微生物多样性达到一个新的平衡。 相似文献
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【目的】 探究丁酸梭菌在肉鸡消化道内的定植能力以及丁酸梭菌对肉鸡肠道短链脂肪酸含量和菌群多样性的影响。【方法】 选择90只健康状况良好的1日龄爱拔益加肉鸡,随机均分为空白组和丁酸梭菌组,每组3个重复,每个重复15只鸡。空白组灌喂生理盐水,丁酸梭菌组灌服荧光标记的丁酸梭菌,3 h及16日龄进行解剖并采集回肠上皮细胞观察荧光情况。随后另外选择30只健康状况良好的1日龄雏鸡,随机分为对照组和试验组,试验组1~6 d饲喂含丁酸梭菌的饲粮,之后饲喂基础饲粮,对照组全程饲喂基础饲粮,试验期21 d。在16和21日龄时,分别采集回肠和盲肠中段内容物,测定乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸、戊酸、己酸和总短链脂肪酸含量,并进行微生物种类、物种丰度比例、菌属以及蛋白功能丰度等差异分析。【结果】 3 h及16日龄丁酸梭菌组回肠上皮细胞周围均呈现出荧光现象,表明丁酸梭菌能够定植于消化道上皮细胞。短链脂肪酸含量测定结果显示,与对照组相比,在肉鸡回肠内容物中,试验组16日龄乙酸、丙酸、异丁酸、异戊酸和戊酸含量均极显著增加（P<0.01）;21日龄丙酸、异戊酸和戊酸含量均极显著增加（P<0.01）,乙酸、异丁酸和总短链脂肪酸含量均显著增加（P<0.05）;在盲肠内容物中,试验组16日龄肉鸡丁酸和戊酸含量均极显著增加（P<0.01）,异戊酸和己酸含量显著增加（P<0.05）;21日龄丁酸和异戊酸均极显著增加（P<0.01）,乙酸、异丁酸、己酸和总短链脂肪酸均显著增加（P<0.05）。门水平上微生物种类分析发现,16日龄样本中厚壁菌门为优势菌群,丰度最高;21日龄样本中微生物种类增多,其中变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌群,丰度较高,16和21日龄试验组的优势菌群均高于对照组。物种丰度比例分析结果显示,与对照组相比,16日龄试验组厌氧菌属的物种丰度比例显著增加（P<0.05）,而去氟球菌属、丛毛单胞菌属、肠杆菌属等7种菌属的物种丰度比例显著降低（P<0.05）;21日龄试验组铁杆菌属、毛球菌属等6种菌属的物种丰度比例显著增加（P<0.05）,变形菌属、浮霉菌属、装甲菌门GP5的物种丰度属显著降低（P<0.05）。菌属差异分析结果显示,16日龄试验组起重要作用的微生物是布劳特氏菌属,对照组起重要作用的微生物是梭状芽孢杆菌属和未分类毛螺旋菌属;21日龄试验组起重要作用的微生物是未分类拟杆菌、毛球菌属、乳酸杆菌目、乳球菌属等,对照组起重要作用的微生物是诺兰克酸杆菌GP4、丛毛单胞菌科等。菌群蛋白功能丰度分析结果显示,16日龄试验组甲基受体趋化性蛋白、谷胱甘肽S-转移酶、氨基酸转移酶亚基A的丰度均高于对照组,21日龄试验组ECF亚家族RNA聚合酶δ-70因子、丙氨酸的丰度均高于对照组。【结论】 丁酸梭菌可以在肉鸡回肠上皮细胞中定植;丁酸梭菌可增加肠道内容物中短链脂肪酸含量、微生物种类及有益菌属,提高物种丰度及功能蛋白丰度,从而促进肠道功能发挥。 相似文献
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旨在研究痛风雏鹅的肠道菌群对肾损伤的影响及作用机制。本研究选取具有典型痛风特征的雏鹅15只,相同日龄及生长环境下的健康雏鹅15只,利用16S rDNA测序技术分析盲肠内容物中菌群的差异;用改良苦味酸法测定血清肌酐（Cr）,用酶比色法测定血清尿酸（UA）,用脲酶-谷氨酸脱氢酶法测定血清尿素氮（BUN）;用RT-qPCR和Western blot法测定肾组织Toll样受体4（TLR4）、髓样分化因子（MyD88）、核转录因子-κB （NF-κB）、白细胞介素1β（IL-1β）、肿瘤坏死因子ɑ（TNF-ɑ）及白细胞介素6（IL-6）的mRNA和蛋白表达量。并将肠道菌群移植给无菌小鼠进行验证。结果显示：1）与健康雏鹅比较,痛风雏鹅肠道菌群16S rDNA测序所得操作分类单元（OTUs）数量、Chao 1指数及Shannon指数均显著降低（P<0.01）,变形菌门、埃希菌属、变形菌属及肠球菌属等细菌丰度显著增加,痛风雏鹅肠道菌群在免疫系统、细菌感染、膜传输及核苷酸代谢等代谢途径参与度较高;2）与健康雏鹅比较,痛风雏鹅肾组织中TLR4、MyD88、NF-κB、IL-1β、TNF-ɑ及IL-6的mRNA表达及蛋白表达均显著升高（P<0.05或P<0.01）,且这些分子表达量与Cr、BUN及UA呈正相关,与埃希菌属、变形菌属及肠球菌属等菌属丰度呈强正相关关系;3）移植痛风雏鹅肠道菌群小鼠的肾小管发生变性,肾组织TLR4、MyD88、NF-κB的mRNA表达量及血中Cr、BUN、肾损伤因子-1（KIM-1）等水平显著高于移植健康雏鹅菌群的小鼠;给予移植痛风雏鹅菌群小鼠TAK-242后,可回调这些变化。综上表明,痛风雏鹅肠道菌群发生了变化,并可激活LTR4/MyD88/NF-κB通路,诱发炎症反应,促进肾损伤的发生。 相似文献
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旨在分析健康鸭十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物菌群组成、多样性特征以及拟杆菌分布。本研究选择健康高邮鸭20只,公母各半,70日龄时无菌采集十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物,提取肠道内容物细菌基因组,利用IonS5TMXL平台进行高通量测序,分析肠道内容物菌群结构与丰度特征以及拟杆菌的分布。结果表明,十二指肠、空肠内容物菌群丰度显著高于回肠和盲肠内容物（P<0.05）,回肠内容物菌群多样性最低;十二指肠和空肠内菌群群落结构较为相似,与回肠,特别是盲肠的相似度较小。健康鸭肠内优势菌门为拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和梭杆菌门（Fusobacteria）,上述菌门在各肠段内容物中相对丰度不同;不同肠段内容物中定植了不同差异微生物物种,十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物中差异菌门分别是变形菌门、放线菌门（Actinobacteria）、厚壁菌门和拟杆菌门。鸭肠道中共分析到28种拟杆菌种,其中B.acidifaciens、B.barnesiae、B.caccae、B.caecicola、B.coprocola、B.sp和B.luti在盲肠内容物中显著聚类,且B.caecigallinarum、B.plebeius和B.barnesiae在鸭盲肠中优势定植。结果显示,鸭肠段空间显著影响了其内容物中菌群丰度与多样性,不同肠段内定植了差异的优势微生物物种,这可能与肠段小环境以及功能一致,在盲肠内容物中优势定植拟杆菌,推测可能与鸭盲肠生理生化功能相关。 相似文献
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不同生长速度阿勒泰羊肠道菌群差异性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
本文通过研究同一饲喂条件下，不同生长速度的阿勒泰羊肠道菌群差异，以及通过日粮影响生长速度后，肠道菌群物种组成的变化，旨在探讨肠道菌群与绵羊生长发育之间的关系。在300只6月龄羔羊中，按照日增重前10%和后10%筛选生长快和生长慢的雄性阿勒泰羊，分为高体重组和低体重组，高体重组随机选12只分为高体重能量日粮限饲组（HR）和高体重标准日粮对照组（HC），低体重组随机选12只分为低体重能量日粮增加组（LA）和低体重标准日粮对照组（LC），每组各6只。HR、HC、LC和LA组分别饲喂能量摄入为营养需要量75%、100%、100%和125%的日粮。预试期7 d，正试期30 d，记录体重，屠宰并采集相同部位的肠内容物，提取DNA，使用Illumina Miseq测序平台进行检测。研究结果显示，同一饲喂标准下，不同生长速度阿勒泰羊肠道菌群组成有差异，HC组厚壁菌门、放线菌门、Saccharibacteria门、疣微菌门和双歧杆菌属菌群丰度高于LC组，LC组变形菌门和拟乳菌属丰度高于HC组；在日粮调控生长速度的试验中，低能量水平日粮显著降低了高体重组体增重（P<0.05）；高能量水平日粮增加了低体重组的体增重（P<0.05）；不论促进或是抑制生长速度，肠道中厚壁菌门和拟杆菌门的物种丰度均升高，高丰度的Saccharibacteria门始终存在生长速度较快的组中，高丰度的拟乳菌属始终存在于生长速度较慢的组中。综合分析两部分试验结果可知，阿勒泰羊肠道中厚壁菌门和拟杆菌门的物种丰度变化可能与日粮和生长速度均有相关性，Saccharibacteria门的物种丰度变化与生长速度呈正相关，拟乳菌属的物种丰度变化与生长速度呈负相关。 相似文献
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This study aimed to investigate the effect of chronic renal failure(CRF) on the gut microbiota diversity and predict the gene function of the flora. A total of 30 2-year-old dogs were selected and randomly divided into the chronic renal failure model group (CRF, established by renal artery ligation), sham operation control group (Sham) and healthy control group (HCG). All animals were fed normally during the 56 days of test period. The serum creatinine (Scr), blood urea nitrogen (BUN) and urine protein / creatinine ratio (UP/C) were detected regularly during the experiment. The effects of chronic renal failure on the structure, diversity and function of gut microbiota were analyzed according to the result of bacterial 16S rDNA sequencing from fresh feces collected without contamination. The flora markers index (FMI) was constructed based on the principal component Logistic regression analysis of different microbiota in CRF group to predict the development of chronic renal failure. The results showed that: 1) The levels of Scr, BUN and UP/C in CRF group from the start of the 28th day of the experiment were significantly higher than those of HCG group and Sham group (P<0.05), and significantly higher than that of the first day of CRF group (P<0.05). 2) Compared with those before chronic renal failure (CRF group at day 0 and 28), HCG group and Sham group, the Chao 1 diversity and Shannon diversity of gut microbiota in CRF group at day 56 were significantly lower (P<0.05), while the relative abundance of Bacteroidetes, Proteobacteria and Actinobacteria significantly increased and the number of Firmicutes significantly decreased (P<0.05). 3) LEfSe analysis showed that 20 species were enriched in CRF group, mainly including Pseudomonas, Escherichia, Proteus and so on, and most of them had negative correlation with other intestinal bacteria. Functional prediction revealed that genes of those different species were mainly enriched in amino acid metabolism, sugar biosynthesis and metabolism and carbohydrate metabolism in CRF group. The area under ROC curve (AUC) of the FMI constructed with those species enriched was 0.788, which could be used as the intestinal microbial marker for CRF in dogs. In summary, chronic renal failure can reduce the diversity of intestinal microbiota, lead to the imbalance of bacterial structure and change of bacterial function. Moreover, the enriched gut microbiota in CRF group can be used as the intestinal microbial marker of CRF in dogs, and the best prediction effect can be obtained by FMI. 相似文献
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试验旨在探究妊娠后期饲粮中添加β-胡萝卜素对母猪初乳、常乳成分及肠道菌群的影响,并揭示肠道菌群与乳成分之间的相关性。选取胎次相近的妊娠后期二元杂交母猪48头,随机分为3组,每组16个重复,分别饲喂添加0、30和90 mg/kg β-胡萝卜素的饲粮,试验从妊娠第90天开始到分娩后第14天结束。分娩当天采集母猪初乳和粪便样品,哺乳第14天采集母猪常乳样品。对初乳中免疫球蛋白（Ig）水平以及常乳中乳成分进行测定,粪便样品通过16S rRNA测序技术进行分析。结果显示：与对照组相比,饲粮添加β-胡萝卜素有提高母猪初乳中IgM的趋势（P=0.173）,降低IgG的趋势（P=0.155）;添加30 mg/kg β-胡萝卜素显著提高了常乳中乳蛋白和尿素氮含量（P<0.05）,同时降低了乳糖含量（P<0.05）,而添加90 mg/kg β-胡萝卜素降低了常乳中总固体含量（P<0.05）。对粪便菌群进行分析发现,β-胡萝卜素上调了Eubacterium brachy group、Ruminococcaceae UCG009、Ruminococcaceae UCG014等菌群的丰度,下调了Candidatus Soleaferrea、Coprococcus 3、Lachnospiraceae NK4B4 group等菌群的丰度。相关性分析表明,Coprococcus 3与初乳中IgM水平呈显著负相关（P<0.05）,Fibrobacter与初乳中IgG、IgM水平呈显著正相关（P<0.05）;Lachnospiraceae NK4B4与常乳中乳蛋白和总固体含量呈显著正相关（P<0.05）;Ruminococcaceae UCG009与初乳中IgG水平呈显著负相关（P<0.05）。以上结果表明,β-胡萝卜素可通过调节肠道菌群影响母猪初乳及常乳的成分组成。 相似文献
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动物主要通过采食来获取能量和所需营养物质,探索肠道菌群对猪采食行为的影响并研究其潜在的作用机制,可以为后续通过调控肠道菌群来改善猪采食提供理论基础。以210头商业杜洛克猪为研究对象,使用自动喂料器记录包括平均日采食时间(ADET)、平均日采食次数(ADEV)、平均日采食量(ADFI)等采食行为指标。140日龄时于肛门处收集粪便样品,通过16S rRNA基因V3-V4区测序获得试验猪肠道微生物结构与组成概况,采用Two-part模型以及共丰度组(CAGs)鉴别与猪采食行为相关的肠道微生物种类。结果显示：1)表型间相关性分析结果表明,ADET分别与ADEV(r=0.41,P<0.05)、RFI(r=0.32,P<0.05)呈显著正相关,ADFI分别与RFI(r=0.56,P<0.05)、平均日增重(ADG)(r=0.63,P<0.05)呈显著正相关,另外,RFI与背膘厚呈显著正相关(r=0.16,P<0.05)。2)CAGs分析中,主要包括瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)、拟杆菌目(Bacteroidales)以及颤螺菌属(Oscillospira... 相似文献
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旨在探究参苓白术散调节哺乳期母鼠肠道菌群紊乱导致的仔鼠肠道稳态失衡以及减轻仔鼠断奶应激的机制。选取9只妊娠SD大鼠,随机分成空白组(CON组)、抗生素组(ABX组)、参苓白术散组(SLBZS组)。母鼠分娩后,在ABX组和SLBZS组母鼠饮水中添加抗生素,CON组母鼠正常饮食,第14天开始连续一周给SLBZS组仔鼠灌胃参苓白术散水煎液,CON组与ABX组的仔鼠灌胃等量生理盐水。分娩后第14、21天采集仔鼠的粪便进行微生物16S rRNA基因测序,采用Western blot法检测结肠组织中紧密连接蛋白ZO-1和Occludin的表达量,采用苏木精-伊红(HE)染色法对仔鼠结肠组织进行组织病理学观察。结果显示,母鼠抗生素处理导致仔鼠肠道菌群的多样性显著低于CON组(P<0.05),而参苓白术散处理有效缓解仔鼠菌群紊乱,降低了Enterococcus、Sutterella、Shigella等病原菌的相对丰度,并升高了Lactobacillus、Blautia及Akkermansia等菌属的相对丰度;ABX组仔鼠结肠中紧密连接蛋白ZO-1和Occludin的表达量显著低于CON组(P&l... 相似文献
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SI Jinglei HUANG Ye CHEN Kuirong LYU Dongling CHENG Feng TIAN Weilong LIU Xiaoxiao LIANG Liang LI Yueyue FENG Lingli GAO Jiuyu MO Jiayuan LIANG Jing LAN Ganqiu 《中国畜牧兽医》2021,48(1):190-199
The purpose of this study was to explore the possible association of the intestinal microbiome with early-stage weight in Duroc pigs.80 days old weaned piglets with Lighter body weight (LBW,n=9) and heavier body weight (HBW,n=9) were selected from 91 individuals based on their body weights ranked.Fecal samples from piglets in the early grower phase were performed for microbial diversity,composition and predicted functionality by sequencing the V3-V4 region of 16S rRNA gene.The results showed that there was no significant differences in microbial Alpha diversity between HBW and LBW groups(P>0.05).The two dominant phyla detected in both groups were Firmicutes (65.62% and 66.57% in HBW and LBW groups) and Bacteroidetes (30.87% and 29.80% in HBW and LBW groups).Four dominant genera were Prevotella (23.82% and 20.84% in HBW and LBW groups),Lactobacillus (9.11% and 16.55% in HBW and LBW groups),norank_f_Ruminococcaceae (10.32% and 9.98% in HBW and LBW groups),and norank_f_Lachnospiraceae (6.33% and 4.53% in HBW and LBW groups).PCoA analysis showed that there were small differences in gut microbes among Duroc piglets,whereas,some weight-associated microbial compositional differences were revealed between HBW and LBW groups.At the genus level,the abundance of several genera,such as g_Kitasatospora,g_norank_o_Tremblayales,g_norank_f_Erysipelotrichaceae,g_unclassified_f_[Paraprevotellaceae] and g_Coprobacillus,were significantly higher in HBW group than in LBW group (P<0.05).The abundance of Corynebacterium in LBW group was significantly higher than that in HBW group (P<0.05).Moreover,the KEGG pathways analysis showed that the sesquiterpenoid biosynthesis,insulin signaling pathway,ascorbate and aldarate metabolism,and biosynthesis of ansamycins were significantly enriched in HBW group (P<0.05),however,the secretion system pathway was significantly enriched in LBW group (P<0.05).These results might provide insights into host-microbe interactions occurring in the early stage piglets and would be useful in contributing to healthy pig breeding. 相似文献
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【目的】研究植物精油（13.5%百里酚和4.5%肉桂醛）对笼养山麻鸭机体免疫、抗氧化力和肠道微生物的影响。【方法】选取200只健康的40周龄山麻鸭（产蛋性能及体重相近）,随机分为4组,每组5个重复,每个重复10只山麻鸭。4个处理组分别在基础饲粮的基础上添加0（对照组）、50、150和200 mg/kg植物精油,试验期30 d。于试验第28~30天,每组随机选取10枚鸭蛋（接近平均蛋重）,用于分析鸭蛋品质;于试验结束时,每个重复选取1只鸭,采集血清,检测血清免疫球蛋白（Ig）、补体蛋白及抗氧化指标,剖杀后采集山麻鸭盲肠内容物用于检测肠道菌群结构。【结果】与对照组相比,植物精油组蛋重、蛋壳重、蛋白重、蛋黄重和横径均显著提高（P＜0.05）,血清丙二醛含量均显著降低（P＜0.05）,但各组之间蛋成分所占比例差异不显著（P＞0.05）;150和200 mg/kg植物精油组山麻鸭血清免疫球蛋白A、免疫球蛋白G、免疫球蛋白M含量和谷胱甘肽过氧化酶含量均显著提高（P＜0.05）,山麻鸭盲肠拟杆菌门、Parabacteroides菌属和Prevotellaceae NK3B31 group菌属丰度提高,Ralstonia菌属丰度降低。【结论】饲粮中添加植物精油可提高鸭蛋重量,改善山麻鸭免疫机能,提高笼养山麻鸭血清抗氧化性能,并能一定程度上改善山麻鸭盲肠菌群结构。综合考虑,添加150 mg/kg植物精油效果较好。 相似文献
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【目的】本试验旨在探讨发酵豆粕(FSBM)对断奶仔猪生长性能、消化酶活性及肠道菌群结构的影响。【方法】试验选取48头21日龄断奶仔猪(杜×长×大,6.88 kg±0.13 kg),随机分为对照组和试验组,每组4个重复,每个重复6头猪。对照组饲粮为基础饲粮,试验饲粮用6%FSBM等量替代基础饲粮中的豆粕。试验期为20 d。试验期间记录采食量和体重。试验第21天,每个重复选取2头猪屠宰,收集回肠食糜测定消化酶活性和肠道菌群结构,并对两者进行相关性分析。【结果】(1)饲喂FSBM可显著提高断奶仔猪的终末体重和平均日增重(average daily gain, ADG),并显著降低了料重比(feed/gain, F/G)(P<0.05);(2)FSBM组断奶仔猪回肠中的胰蛋白酶和淀粉酶活性显著提高(P<0.05);(3)饲喂FSBM显著提高了断奶仔猪回肠食糜中拟杆菌门、普雷沃氏菌科NK3B31类群、厌氧弧菌属、瘤胃菌科UCG-005、普氏菌属2、巨型球菌属、副杆菌属、Solobacterium及毛螺菌科UCG-004的相对丰度,显著降低了链球菌属的相对丰度(P<0.05);(... 相似文献
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为研究发酵香菇渣（fermented shiitake residues,FSR）对断奶仔猪生产性能、十二指肠消化酶活性、空肠紧密连接蛋白相关基因表达、结肠挥发性脂肪酸及结肠微生物区系的影响,本研究选用100头健康的壹号土猪断奶仔猪（小耳花猪×杜洛克猪,公母各50头）,随机分为2组,每组5个重复,每个重复10头猪,进行饲养试验。对照组饲喂基础饲粮（NC组）,试验组饲喂基础饲粮+5%发酵香菇渣。试验期33 d。饲养试验结束时,从每个组中选择6头仔猪（公母各半）进行屠宰取样。检测指标包括生长性能、十二指肠黏膜消化酶活性、空肠紧密连接蛋白mRNA相对表达量、结肠挥发性脂肪酸含量和肠道微生物结构。结果显示,与对照组相比,试验组显著提高了断奶仔猪的末重和平均日增重（P<0.05）,显著降低了料重比（P<0.05）;显著提高了十二指肠黏膜胰蛋白酶和β-淀粉酶活性（P<0.05）;显著提高了结肠挥发性脂肪酸丙酸、丁酸、异丁酸和异戊酸水平（P<0.05）;显著增加了结肠纤维杆菌门（Fibrobacteres）和链球菌属（Streptococcus）的相对丰度（P<0.01;P<0.05）,对空肠紧密连接蛋白1（TJP1）和紧密连接蛋白2（TJP2）基因mRNA的表达无显著影响（P>0.05）。综上所述,饲粮中添加5%发酵香菇渣可提高断奶仔猪肠道消化酶活性,增加结肠挥发性脂肪酸含量,调节肠道微生物区系组成,有利于提高断奶仔猪的生长性能。 相似文献