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【目的】 借助网络药理学手段探究乌梅散加减方治疗猪传染性胃肠炎（TGE）的作用机制。【方法】 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、Swiss TargetPrediction获取乌梅散加减方的活性成分与作用靶点，应用公共比较毒理基因组学数据库（CTD）获取TGE的相关靶点，使用STRING数据库绘制乌梅散加减方与TGE交集靶点的蛋白互作（PPI）网络图，利用DAVID对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析，探究乌梅散加减方治疗TGE的作用机制。【结果】 从乌梅散加减方中共筛选到槲皮素、山柰酚、芒柄花素等125种活性成分和JUN原癌基因（JUN）、肿瘤坏死因子（TNF）、信号传导与转录激活因子3（STAT3）等58个作用靶点。GO功能富集分析显示，共得到生物过程138个条目，涉及免疫反应、血管内皮因子生成、RNA聚合酶Ⅱ启动子对pri-miRNA转录的正调控等；细胞组分13个条目，涉及胞外区、细胞外空间、膜筏等；分子功能32个条目，涉及细胞因子活性、生长因子活性、白细胞介素2（IL2）受体活性等。KEGG通路富集分析显示，共得到135条信号通路，其中IL17信号通路、Th17细胞分化、TNF信号通路、HIF-1信号通路是乌梅散加减方治疗TGE的主要信号通路。【结论】 乌梅散加减方主要通过槲皮素、山柰酚、芒柄花素等多个活性成分调控JUN、TNF、STAT3等靶点，通过参与IL17信号通路、Th17细胞分化等治疗TGE。 相似文献
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利用网络药理学分析马针颗粒治疗仔猪腹泻的药效物质基础、靶点与调控通路。通过TCMSP、Drugbank数据库对马针颗粒组方药物的重要化合物与靶点进行筛选，再通过STRING、DAVID、BIOGPS数据库分析马针颗粒治疗腹泻的靶点、信号通路与归经。结果显示，马针颗粒通过甜菜甙、异甜菜素、花生四烯酸、β–胡萝卜素、槲皮素作用TP53、TNF、JUN、CASP3等靶点调节炎症、免疫来改善仔猪腹泻。 相似文献
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【目的】利用网络药理学和分子对接方法研究连参止痢颗粒治疗猪腹泻的作用机制。【方法】运用中药系统药理学分析平台（TCMSP）、中医药百科全书（ETCM）平台搜索连参止痢颗粒中黄连、白头翁、苦参、诃子、甘草的有效活性成分和作用靶点，利用Cytoscape 3.7.2软件绘制药物有效成分-靶点网络图；从NCBI、OMIM、GeneCards、MalaCards平台获取猪腹泻靶点，将疾病和药物交集蛋白靶点上传至STRING 11.5数据库，利用Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络图，并利用微生信平台对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过分子对接技术对关键有效活性成分和核心靶点进行对接验证。【结果】经筛选获得连参止痢颗粒药物的有效活性成分96个，药物作用靶点208个，疾病靶点1 785个。PPI结果显示，连参止痢颗粒作用于猪腹泻的关键靶点为Jun原癌基因（JUN）、丝裂原活化蛋白激酶14（MAPK14）、MYC原癌基因（MYC）、NFKB抑制剂α（NFKBIA）、原癌基因RELA（RELA）、胱天蛋白酶3（CASP3）、肿瘤坏死因子（TNF）、MAPK1、白细胞介素6（IL6）、雌激素受体1（ESR1）等。GO功能筛选得到生物过程6个条目，细胞组分和分子功能各2个条目。生物过程主要富集在RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控、正调控IL8的产生、正调控序列特异性DNA结合转录因子活性、细胞对脂多糖的反应、凋亡过程的负调控和RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控；细胞组分主要富集在细胞核和细胞质；分子功能主要富集在RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端区域序列特异性DNA结合和DNA结合。KEGG通路富集分析获得53条通路，其中2条信号通路与猪腹泻密切相关。分子对接结果显示，连参止痢颗粒的关键有效活性成分与猪腹泻靶点具有良好的结合活性。【结论】连参止痢颗粒可能主要通过芒柄花黄素、芳香膜菊素、3，3'-二甲基槲皮素、松香素、硫酸奎尼丁、高丽槐素、1-甲氧基菜豆素、异甘草素等有效成分靶向JUN、RELA、MYC、NFKBIA、MAPK14、CASP3、TNF、MAPK1、IL6等靶点分子，调控沙门氏菌感染和IL17等信号通路，从而达到治疗猪腹泻的目的。 相似文献
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试验利用网络药理学研究方法尝试揭示白头翁汤治疗猪腹泻的活性成分、作用靶点及其基因功能、信号通路的机制。首先在中药系统药理学分析数据库中检索白头翁汤的所有化学成分、作用靶点,进而利用STRING、DAVID、NCBI数据库,Cytoscape软件构建化合物-靶点网络、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络、靶点-通路网络,研究白头翁汤治疗猪腹泻的作用机制。通过化合物的口服利用度和类药性筛选得出白头翁汤11个活性化合物,化合物-靶点网络结果显示,11个活性化合物含有63个相应靶点;白头翁汤作用于猪腹泻的PPI网络图包含45个靶点,主要靶点是雌激素受体1（estrogen receptor,ESR1）、CREB结合蛋白（CREB binding protein,CREBBP）、丝裂原活化蛋白激酶1（mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1）、雄激素受体（androgen receptor,AR）等,与猪腹泻靶点基因直接相关的靶点是拓扑异构酶Ⅱβ（DNA topoisomerase Ⅱ,TOP2B）、ESR1、ESR2、糖皮质激素受体（glucocorticoid receptor,NR3C1）、AR和细胞核受体共激活剂2（nuclear receptor coactivator 2,NCOA2）;白头翁汤-猪腹泻PPI网络图关键靶点GO富集条目为5个,其中生物过程、分子功能、细胞组成相关的条目分别有3、1、1个;白头翁汤作用于猪腹泻PPI网络图KEGG信号通路有1条。白头翁汤可能主要通过金鱼草素、掌叶防己碱、8-异戊烯基二氢茆酚-7-葡糖苷、延胡索乙素、足叶草脂素、黄麻苷和8-羟基松脂醇等调控TOP2B、ESR1、ESR2、NR3C1、AR和NCOA2等靶点,基因功能富集于磷脂酶C激活G蛋白偶联受体信号通路、腺苷酸环化酶激活肾上腺素能受体信号通路、DNA模板转录、类固醇结合、细胞膜的组成部分,以及通过KEGG信号通路中神经活性的配体-受体相互作用信号通路来治疗猪腹泻。 相似文献
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为了基于网络药理学方法探究芪姜粉治疗猪脾胃虚寒型腹泻的效果和作用机制，本试验借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)对芪姜粉进行药效物质基础分析及作用靶点预测，通过GeneCards和OMIM数据库检索与腹泻相关的疾病靶点，并用Uniprot数据库进行校正；用Cytoscape 3.7.2软件构建“芪姜粉—活性成分—靶点网络图”“芪姜粉—活性成分—腹泻—靶点网络图”,利用String数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络；在DAVID数据库中进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，以预测其作用机制。结果显示，活性成分—靶点网络包含20个活性成分和相应靶点159个，关键靶点涉及PPARG、PTGS2、PTGS1、NOS2等；PPI核心网络包含101个蛋白，关键蛋白涉及TNF、TP53、IL-6、IL-8等；GO功能富集分析得到GO条目272个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目198个，分子功能(CC)条目23个，细胞组成(MF)条目51个；KEGG通路富集筛选得到119条信号通路(P<0.05),相关度较高的疾病依次为癌症、乙... 相似文献
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将葛根芩连汤加工成细粉（40-65目）和超微粉（300目）,高效液相色谱法（HPLC）测定葛根芩连汤细粉和超微粉中主要有效成分葛根素、黄芩苷的含量,研究超微粉碎技术对葛根芩连汤主要有效成分葛根素、黄芩苷溶出的影响。结果葛根芩连汤细粉和超微粉中葛根素的含量分别为2.05%、3.20%;葛根芩连汤细粉和超微粉中黄芩苷含量分别为2.78%、3.94%。葛根芩连汤超微粉中的葛根素、黄芩苷含量比细粉分别提高56.10%、41.73%。表明超微粉碎技术能显著提高葛根芩连汤中主要有效成分葛根素和黄芩苷的溶出度。 相似文献
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【目的】基于网络药理学及分子对接技术研究黄芪调控仔猪肠道菌群失调性腹泻的有效活性成分及其作用机制。【方法】从TCMSP数据库搜集黄芪中药化合物成分,并获取其潜在靶点。利用GeneCards和OMIM数据库搜集肠道菌群失调性腹泻(flora imbalance diarrhea)的作用靶点,将两者预测的潜在作用靶点进行映射,获得共同作用靶点。运用STRING数据库构建靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)关系,用Cytoscape_3.8.0软件对其网络进行拓扑分析,用DAVID数据库对共同作用靶点进行富集分析,用AutoDuck_4.2.6软件对其核心成分与核心靶点进行分子对接。【结果】黄芪含有11个调控仔猪肠道菌群失调性腹泻核心成分,其对应靶点基因65个,疾病靶点854个,交集靶点25个。PPI网络中显示肿瘤坏死因子(TNF)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、白细胞介素-6(IL6)、NF-κB抑制剂α(NFKBIA)、IL1B、IL10、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、C-C基序趋化因子2(CCL2)为关键靶点。GO功能和KEGG通路富集分析发现,黄芪有效成分主要通过美国锥虫病、炎症性肠病、阿米巴病、细胞因子-细胞因子受体相互作用、A型流感、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路参与转录调控、免疫反应、细胞对脂多糖的反应等生物过程。分子对接结果显示,槲皮素、山奈酚、芒柄花素等核心成分与TNF、IL1B等关键靶点结合紧密,亲和力较好。【结论】黄芪可能通过槲皮素、山奈酚、芒柄花素等主要活性成分作用于TNF、IL1B等靶点,通过参与美国锥虫病、炎症性肠病、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路进而治疗仔猪肠道菌群失调性腹泻。 相似文献
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【目的】 采用网络药理学技术与方法预测白龙散治疗鸡腹泻的物质基础、作用靶点和通路。【方法】 通过中药系统药理学分析数据库TCMSP筛选中药复方白龙散中的白头翁、黄连、龙胆的有效活性成分及其潜在作用靶点。通过GeneCards和OMIM数据库检索鸡腹泻的相关疾病靶点。利用Venny平台获得药物和疾病的交集靶点。将交集靶点上传至STRING数据库进行分析,构建蛋白互作（PPI）网络图并获得关键靶点,并进一步对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】 共筛选得到活性成分27个,药物靶点57个,疾病靶点4 207个;药物与疾病交集靶点45个。PPI网络发现原癌基因蛋白质C （MYC）、雌激素受体1（ESR1）、白细胞介素-6（IL-6）、G1/S-specific周期蛋白D1（CCND1）等45个蛋白可能是白龙散治疗鸡腹泻的关键靶点。GO功能富集分析确定了112个条目,KEGG通路富集分析确定了22条通路。【结论】 中药复方白龙散主要通过槲皮素、山奈酚、异鼠李素等多个化学成分调控转录因子AP-1（JUN）、MYC、ESR1、IL-6等靶点,作用于细胞因子-细胞因子受体相互作用、肿瘤抑制蛋白（p53）信号通路、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等信号通路来治疗鸡腹泻。 相似文献
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本研究基于网络药理学预测大黄发挥清热解毒作用的质量标志物。利用TCMSP数据库、Swiss Target Prediction服务器等筛选大黄的主要活性成分并预测其发挥清热解毒潜在作用靶点及其通路。结果表明：大黄主要通过泽兰黄醇、番泻苷、大黄酸、β-谷甾醇等14种化合物，作用于287个靶点，其中SRC、TP53、JUN、HSP90AA1、ESR1为核心靶点；主要通过钙离子、花生四烯酸代谢、TRP通道炎性介质调节等信号通路发挥清热解毒作用。由此预测到大黄发挥清热解毒作用的质量标志物为番泻苷、大黄酸，为其作用机制的进一步研究奠定了基础。 相似文献
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This experiment was conducted to explore the mechanism of Gegen Qinlian decoction in treating swine diarrhea. The chemical composition and targets of Gegen Qinlian decoction were searched by the analysis of the traditional Chinese medicine system pharmacology platform (TCMSP). The software of Cytoscape 3.7.1 was used to construct and analyze compound-targets networks, protein-protein interaction (PPI) network and key targets-signaling pathway network. The results showed that 60 active compounds including daidzein, puerarin, oroxindin and formononetin were obtained after screening. The compounds acted on 206 targets, among which TP53, TNF, IL-6, IL-8, Jun and STAT3 were the key targets. These key targets involve in PI3K-Akt signaling pathway, Viral carcinogenesis, and so on. Based on the results of network pharmacological analysis, Gegen Qinlian decoction may regulate diarrhea and fever through TP53, TNF, IL-6, IL-8, Jun, STAT3 and other targets. The paper provides theoretical basis and clues for the further study of Gegen Qinlian decoction in the treatment of swine diarrhea. 相似文献
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【目的】基于网络药理学预测芪翁黄柏散治疗仔猪腹泻的有效成分，并探究其作用机制。【方法】通过TCMSP数据库筛选芪翁黄柏散潜在的有效成分和靶标蛋白，利用Cytoscape 3.9.1软件构建药物成分-靶点网络；通过GeneCards和OMIM数据库检索腹泻靶点并去重，获得疾病与药物的共同靶点，导入STRING数据库并构建蛋白互作（PPI）网络，对共同靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】共获得芪翁黄柏散37个有效成分和74个靶点，其中与疾病相交的共同靶点有68个；GO功能注释得到生物过程147个条目，细胞组分15个条目，分子功能32个条目；KEGG通路富集分析获得98个通路。槲皮素、山奈酚、豆甾醇、四氢小檗碱、小檗碱等为其有效成分，肿瘤坏死因子（TNF）、肿瘤蛋白P53（TP53）、血管内皮生长因子A （VEGFA）、白细胞介素6（IL6）、IL10、C-C基序趋化因子配体2（CCL2）、上皮生长因子（EGF）、核因子κB抑制剂α（NFKBIA）等为药物关键靶点，癌症、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B （PI3K-Akt）、丝裂原激活的蛋白激酶（MAPK）、IL17、炎症性肠病等信号通路为关键通路，还涉及到免疫应答、转录、细胞凋亡、细胞因子活性、细胞外等方面。【结论】本研究预测了芪翁黄柏散治疗仔猪腹泻的有效成分及作用机制，体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点，并为后续研究提供方向和参考。 相似文献
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【目的】预测麻黄甘草汤治疗肺水肿的潜在作用靶点及作用机制,并通过动物体内试验加以验证,为深入研究麻黄甘草汤的药理作用提供参考依据。【方法】通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取麻黄、甘草的活性成分及其作用靶点,利用GeneCards数据库收集肺水肿疾病的作用靶点,将麻黄甘草汤的成分作用靶点和肺水肿疾病靶点取交集,基于STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),使用Cytoscape 3.6软件构建成分-靶点网络图。利用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。对获得的关键成分和核心靶点通过AutoDock Vina进行分子对接,用以佐证网络药理学预测结果。选用2%氯化铵构建小鼠肺水肿模型,分为空白对照组、氯化铵模型组及麻黄甘草汤治疗组;空白对照组每日上午腹腔注射200μL生理盐水,氯化铵模型组和麻黄甘草汤治疗组腹腔注射200μL 2%的氯化铵溶液;氯化铵模型组和空白对照组每晚灌胃200μL生理盐水,麻黄甘草汤治疗组灌胃200μL 1 g/mL麻黄甘草汤,连续处理5 d后采用实时荧光定量PCR检测白细胞介素-6(IL6)、诱导型一氧化氮合酶(NOS2)、丝裂原... 相似文献
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旨在基于网络药理学研究板蓝根的主要抑菌药效成分及其作用机理。利用中药系统药理学在线分析数据库（TCMSP）筛选出板蓝根药效成分及其潜在作用靶点,通过OMIM和GeneCards数据库以“抑菌”为关键词搜索相关靶点。通过Venny平台获取板蓝根和抑菌的交集靶点。通过STRING数据库结合Cytoscape软件构建PPI网络图并筛选关键靶点。通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。通过Autodock Tools 1.5.7软件将关键药效成分和抑菌靶点进行分子对接。通过菌落计数法和SDS-PAGE法验证关键药效成分抑菌作用和作用靶点。结果显示：共筛选到药效成分33个,药物靶点61个,抑菌靶点2 192个,药物与抑菌作用交集靶点32个。蛋白互作网络分析发现,TNF、TP53、CASP3、JUN、ESR1、PTGS2等30个蛋白可能是板蓝根抑菌作用的关键靶点。GO功能富集分析得到126个条目,包括生物过程条目86个（如对雌二醇的反应、凋亡信号通路、神经元凋亡过程的正调控）,细胞组分条目11个（如细胞质、核）,分子功能条目29个（如蛋白质同源二聚化活性、酶结合）。KEGG通路富集分析得到20条通路。分子对接结果显示,度值排名前3位的活性成分（β-谷甾醇、豆甾醇、金合欢素）与关键抑菌靶点编码蛋白的结合能均<0 kJ·mol-1。抑菌试验验证表明,豆甾醇是板蓝根的关键药效成分,其能够下调胞内CASP3和PTGS2蛋白的表达。板蓝根主要通过药效成分豆甾醇作用于PTGS2、CASP3靶点,通过TNF、癌症途径信号通路发挥抑菌作用。 相似文献
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近年来,中药复方抗炎机制的研究不断深入,白头翁汤复方（Pulsatilla decoction,PD）作为经典的清热解毒中药方剂常用于预防和治疗细菌性腹泻。然而其抗炎机制和靶细胞研究仍然不明确,本课题以大鼠肠黏膜微血管内皮细胞（RIMVECs）为模式细胞,旨在研究白头翁汤对LPS诱导的RIMVECs炎症反应的调控作用。利用LPS刺激RIMVECs,通过荧光定量PCR（RT-PCR）、蛋白免疫印迹（Western blot）的方法检测白头翁汤对LPS刺激后RIMVECs的炎性信号通路TLR4-ERK1/2信号通路关键蛋白TLR4、TRAF6、ERK的mRNA及蛋白表达。进一步采用酶联免疫吸附方法（ELISA）检测白头翁汤对LPS刺激后的炎性因子IL-6、IL-8、IL-1β、TNF-α的分泌情况。结果表明：白头翁汤可以显著降低LPS诱导的TLR4、TRAF6、ERK的mRNA水平及蛋白表达并降低了LPS诱导的细胞下游炎性因子的分泌。白头翁汤通过抑制TLR4-ERK1/2信号通路缓解LPS所诱导的RIMVECs炎性反应,发挥抗炎作用。 相似文献