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1.
采用RT-PCR方法从鸭腿肌总RNA中扩增了鸭核心蛋白聚糖基因编码区序列,进行序列分析,并将编码鸭核心蛋白聚糖成熟蛋白的核酸片段连入原核表达载体pET-32a(+)中,加入IPTG诱导其表达后,亲和层析纯化表达的蛋白。采用SDS-PAGE检测,用质谱方法对表达的蛋白进行鉴定。研究成功克隆出鸭核心蛋白聚糖基因编码区序列,序列分析表明,鸭DCN编码区序列由1074个碱基组成,编码357个氨基酸,其中信号肽有16个氨基酸。将鸭DCN蛋白划分为9个结构域(LRR1-9),结合人DCN序列进行序列分析推测结构域中LRR4、5与TGF-β可能存在一定关系。SDS-PAGE检测和质谱鉴定结果表明获得了分子量为54.7ku的鸭DCN融合蛋白。 相似文献
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为研究Akirin2基因在鸭生物体中的功能,本试验通过RT-PCR扩增了鸭Akirin2基因,并采用荧光定量PCR方法检测了其在40日龄北京鸭不同组织中的表达差异.序列分析结果表明,鸭Akirin2基因CDS区全长594 bp,编码197个氨基酸,氨基酸水平上与鸡的相似性达99%,其氨基酸序列二级结构具有哺乳动物Akirinl和Akirin2氨基酸二级结构域的共同区域;荧光定量结果表明,鸭Akirin2在肌肉和免疫器官脾脏中都有表达.以上结果支持了鸟类Akirin2可能具有与哺乳动物中Akirin1和Akirin2共同功能的观点,为进一步研究Akirin2基因在鸟类肌肉发育中的作用奠定了基础. 相似文献
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脾源鸭γ-干扰素基因的RT-PCR扩增、序列分析及表达 总被引：1，自引：0，他引：1
从丝裂原刺激的鸭脾淋巴细胞中提取基因组RNA，采用RT—PCR扩增鸭干扰素γ基因并进行了序列分析。序列分析结果表明，鸭干扰素1基因序列全长477bp，开放阅读框架内401个核苷酸，共编码132个氨基酸。将鸭γ-IFN基因定向克隆到原核表达载体pBV220中，重组质粒经酶切鉴定后，转化到宿主DH5a中，温度诱导表达，SDS—PAGE分析，表达产物与标记抗鸡干扰素抗体出JLDot—ELISA阳性反应。 相似文献
4.
【目的】试验旨在分析阳原驴肌生长抑制素(myostatin,MSTN)基因CDS序列特征及其在不同生长发育时期和不同组织中的表达水平。【方法】采集6、12、18、24月龄阳原驴的血样及不同组织样,提取其基因组DNA及不同组织样总RNA。利用PCR技术扩增阳原驴MSTN基因CDS序列,并对其进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR技术检测MSTN基因在阳原驴不同生长发育时期背最长肌、腿肌和18月龄不同组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏)中的表达水平。【结果】阳原驴MSTN基因CDS序列长1 128 bp,编码375个氨基酸,与马的核苷酸序列相似性最高(99.9%),编码蛋白属于不稳定的亲水性蛋白,含有转化生长因子-β(TGF-β)超家族结构域,不含跨膜区,存在1个信号肽区域,包含6个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点和34个磷酸化位点,主要分布于细胞核中(39.1%),二级结构中无规则卷曲占比最高(50.93%)。MSTN基因在18月龄阳原驴背最长肌和腿肌中的表达水平显著高于6、12、24月龄(P＜0.05);MSTN基因在18月龄阳原驴不同组织中均有表达,其中背最长肌中的表达水平显著高于其他组织(P＜0.05),其次是腿肌、肺脏、脾脏、肾脏和肝脏,心脏中的表达水平最低。【结论】试验成功扩增出阳原驴MSTN基因CDS序列,MSTN基因在阳原驴不同生长发育时期背最长肌和腿肌中的表达水平均以18月龄最高,且在18月龄不同组织中以背最长肌和腿肌中表达水平较高。研究结果为进一步探讨MSTN基因在阳原驴骨骼肌生长发育中的作用机制提供参考。 相似文献
5.
为了克隆家兔过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferative activated receptor gamma, PPARγ)基因蛋白质编码区(CDS)序列,并研究其生物学功能、组织表达规律及与肌内脂肪(IMF)含量的关系,试验克隆了家兔PPARγ基因CDS序列,并对其进行生物信息学分析;采集70日龄新西兰白兔心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、子宫、胃、腿肌、腹肌、背最长肌,0,35日龄新西兰白兔背最长肌,70日龄豫丰黄兔腿肌、腹肌、背最长肌,通过qRT-PCR扩增检测了PPARγ基因在不同组织/器官中的相对表达量;测定了70日龄新西兰白兔和豫丰黄兔腿肌及背最长肌的IMF含量,并对PPARγ基因相对表达量与IMF含量进行相关性分析。结果表明：家兔PPARγ基因CDS序列长1 428 bp,共编码475个氨基酸,其核苷酸序列与GenBank上公布的人、鼠、猪、绵羊、牛、马、犬及鸡等物种的氨基酸序列相似性分别为91.0%、90.5%、90.5%、90.2%、90.1%、90.0%、89.9%和80.5%,与小鼠的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。PPARγ基因在70... 相似文献
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鸭脂联素基因全长cDNA的克隆和原核表达的研究 总被引：1，自引：0，他引：1
本研究旨在通过克隆鸭脂联素(Adiponectin)基因序列并进行序列分析,揭示该基因的序列特征、组织特异性表达规律,并对其进行原核表达。采用RT-PCR、5′-RACE和3′-RACE的方法从鸭脂肪组织总RNA中扩增脂联素基因cDNA片段;半定量RT-PCR检测组织表达特异性;构建原核表达载体,建立原核表达体系。从鸭脂肪组织中得到3个脂联素基因cDNA片段,克隆测序后,拼接获得了鸭脂联素基因1374bp全长cDNA序列,其包含一个长度为738bp完整的开放阅读框,编码245个氨基酸;编码区与鹅、鸡脂联素基因序列的同源性分别为94.9%和86.0%,与人、小鼠、狗等物种脂联素基因的同源性在64.2%～67.0%之间;氨基酸序列比较可知,鸭与鹅、鸡的脂联素氨基酸的同源性分别达95.5%和84.0%,与人、小鼠、狗等哺乳动物的同源性在65%左右。半定量RT-PCR研究结果表明脂联素基因在所测组织中均表达,且高度表达于脂肪组织、肌胃、小肠、心和骨骼肌,中度表达于肺、腺胃、卵巢和脾组织中,而在肝、肾和间脑中低度表达。构建得到在其C端含有8个组氨酸的鸭脂联素融合蛋白表达载体pET41a-duck-adp,重组表达质粒转入BL21(DE3)大肠杆菌中表达,经IPTG诱导后并SDS-PAGE检测获得了30ku的鸭脂联素原核表达蛋白。脂联素基因在动物进化中具有一定的保守性,该基因在不同组织中表达水平不同,通过原核表达可获得鸭脂联素的重组蛋白。 相似文献
7.
《中国畜牧杂志》2020,(6)
本研究旨在克隆长白猪诱导细胞凋亡DFF45样效应因子C(CIDEC)基因及其转录起始位点前约2000bp启动子区域,并检测其在长白猪不同组织中的表达水平,从而为研究CIDEC在猪中的作用及表达调控机制提供依据。选择8头6月龄去势长白猪,提取肝脏RNA,利用RT-PCR技术扩增CIDEC基因的CDS序列,使用生物信息学相关软件分析其结构和功能;屠宰后采集长白猪心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏、胃、皮下脂肪、腿肌、颈阔肌、肱二头肌、小肠、空肠等组织样品,分别提取各样品的总RNA,利用qRT-PCR检测CIDEC在各组织中的mRNA表达量;提取长白猪肝脏总DNA,采用降落PCR方法获得CIDEC启动子序列,利用Methprimer在线软件对CpG岛区域进行预测。结果表明:克隆得到的长白猪CIDEC基因CDS序列长度为747bp,编码238个氨基酸,进化关系分析发现猪与羊、牛的亲缘性较近。CIDEC基因在长白猪的各个组织均有表达,其中在皮下脂肪组织表达量最高,在肾脏中表达量最低。对CpG岛区域预测结果显示CIDEC基因CDS序列不存在典型的CpG岛。 相似文献
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根据GenBank发表的鸡刺鼠信号蛋白(ASIP)基因序列的同源保守区域,设计了1对特异性引物。以番鸭、高邮鸭和英系北京鸭(即樱桃谷鸭)毛囊RNA为模板,经扩增、测序及拼接得到的部分mRNA序列均为编码序列,共308bp,对应编码102个氨基酸。与已发表的原鸡和鹌鹑的ASIP对应的mRNA核苷酸序列进行比对,番鸭、高邮鸭和英系北京鸭的同源性均在92.53%以上,相应编码的氨基酸序列同源性均高于92.16%。高邮鸭与英系北京鸭核苷酸,氨基酸序列一致,同源性为100%。半定量PCR结果显示,番鸭ASIP基因表达具有较高的普遍性,在皮肤组织(毛囊和皮肤)和中枢神经系统(下丘脑)及其他非皮肤中均有表达。皮肤和毛囊的表达差异不显著(P>0.05),下丘脑中的ASIP基因相对表达量最高,极显著高于皮肤中ASIP基因的表达量(P<0.01),而与毛囊中的差异不显著(P>0.05)。 相似文献
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旨在获取水禽StAR基因的结构和组织表达规律，初步了解其对水禽睾丸发育的影响。本研究选取山麻鸭和狮头鹅的下丘脑和睾丸组织为材料，克隆StAR基因，并采用实时荧光定量PCR方法检测该基因在山麻鸭和狮头鹅不同组织中的表达规律，并进一步比较该基因在不同时期鹅睾丸组织中的表达差异。本试验克隆获得鸭StAR基因3个转录本（dSTAR-A、dSTAR-B和dSTAR-C），dSTAR-A和dSTAR-B编码序列相同，编码283个氨基酸，而dSTAR-C编码238个氨基酸；获得鹅STAR基因两个转录本（gSTAR-A和gSTAR-B），均编码283个氨基酸。比对分析发现，鸭和鹅StAR氨基酸序列与其他禽类的同源性较高，在物种间的保守性高。StAR基因在鸭和鹅的各个组织中均有表达，其中在睾丸中表达量最高，在腹脂、胸肌和腿肌也有较高的表达水平。比较不同时期公鹅的睾丸，发现该基因在3岁龄时表达水平极显著高于1和52日龄（P<0.01），且在成年公鹅繁殖期的表达水平极显著高于休产期（P<0.01）。结果表明，StAR基因可能是鹅睾丸发育所必需的关键基因，并参与成年公鹅繁殖性能的调控。 相似文献
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UBE2b基因编码的泛素结合酶参与的泛素-蛋白酶通路(UPP)在哺乳动物精子发生中起着重要作用。本研究根据相关ESTs拼接的序列采用PCR扩增鉴定的方法获得梅山猪UBE2b基因cDNA全序列,对其序列进行生物信息学分析,利用半定量RT-PCR的方法研究150日龄梅山公猪UBE2b基因的组织表达特征和不同日龄(2、30、60、90、150日龄)公猪睾丸的表达规律。结果表明:梅山猪UBE2b基因cDNA全长1 329 bp,编码153个氨基酸,具有UBCc家族的保守结构域。该基因编码氨基酸序列在不同物种间具有较高的保守性,根据编码氨基酸序列构建的分子进化树显示猪与牛的亲缘关系最近,与斑马鱼的关系最远。UBE2b基因在梅山公猪各组织中广泛表达,其中睾丸为高丰度表达。该基因在梅山猪睾丸中的表达随日龄增加呈显著上升趋势,与睾丸发育显著相关(r=0.82,P<0.01),推测UBE2b可能在梅山猪精子发育和性发育中起重要作用。 相似文献
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The study was aimed to research the structure and function of Mx gene in Beijing duck.Full-length sequence of Beijing duck Mx gene was amplified by RT-PCR from the total RNA extracted from duck embryo fibroblast(DEF) induced by Poly(I:C).Furthermore, the expression of Mx gene in DEF infected with DRV was described.Sequence analysis indicated that the duck Mx gene contained an open reading frame(ORF) of 2166 bp encoding a protein of 721 amino acids.A phylogenetic tree based on Mx gene sequence was constructed.The results showed that Beijing duck Mx gene had the lowest distance with the gene from wild duck available in GenBank.Homology analysis showed that Beijing duck Mx gene nucleotides and deduced amino acids shared 47.8% to 99.8% and 47.9% to 99.4% homologies with those from other animals available in GenBank, respectively.Fluctuation expression of Beijing duck Mx gene was found with DEF incubated with duck reovirus.Duck Mx gene was successfully cloned and predicted with characteristic of typical structure of Mx family.Gaining Beijing duck Mx gene laid a foundation for further researching Mx protein antiviral activity, molecular mechanism and interferon monitoring of poultry. 相似文献
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本试验旨在研究北京鸭Mx基因的结构及功能。利用干扰素诱导剂Poly(I:C)诱导鸭胚成纤维细胞(DEF),提取细胞总RNA,采用RT-PCR方法扩增北京鸭Mx基因全长编码区序列,并观察其在感染了鸭呼肠孤病毒(DRV)的DEF中的动态表达情况。北京鸭Mx基因序列分析结果显示,该基因编码区全长2166 bp,编码721个氨基酸残基。通过与GenBank中已登录的脊椎动物Mx基因进行核苷酸系统进化树分析,结果显示北京鸭Mx基因与野鸭Mx基因关系最近。北京鸭Mx序列与其他动物基因序列的比对结果显示,核苷酸同源性为47.8%~99.8%,氨基酸同源性为47.9%~99.4%。DRV孵育DEF后,Mx呈波动性表达。结果表明,本试验成功克隆了北京鸭Mx基因,预测分析证实其编码的蛋白具有脊椎动物Mx蛋白共有的结构特征,北京鸭Mx蛋白全基因的获得为下一步研究禽类Mx蛋白的抗病毒活性、作用机制及干扰素的监测奠定了基础。 相似文献
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1. The objective of the research was to investigate the molecular evolutionary relationships between the duck myogenic determination factors (MYOD) gene family members and their roles in muscle development. 2. The four members of the duck MYOD gene family were cloned using RT-PCR, and their relative mRNA expression during duck muscle development was measured using qRT-PCR. 3. The results showed that MyoD and Myf5 clustered together, as did MyoG and MRF4 based on their complete amino acid sequence and the basic helix-loop-helix domain. Results of the evolutionary level analysis were consistent with that of the differential expression patterns during duck breast muscle development. As determined by qRT-PCR, MyoD and Myf5 were highly expressed in 22-day embryos, while MyoG and MRF4 expression was high in 14-day embryos. 4. We conclude that the entire MYOD gene family in the duck originated from a common ancestral gene and evolved after two duplication events. The roles of the MYOD gene family members in duck muscle development are similar to those in mammals. 相似文献
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维甲酸诱导基因1(RIG-1)是细胞质中侦测病原相关分子模式的识别受体。论文旨在扩增北京鸭RIG-1编码基因,并对其进行序列分析。通过PCR方法,从北京鸭脾脏中扩增得到RIG-1基因cDNA,并使用LaserGene分子生物学分析软件进行序列分析。结果发现北京鸭的RIG-1基因cDNA开放阅读框全长2 802bp,编码933个氨基酸。结构预测发现鸭RIG-1结构与哺乳动物类似,N端有两个串联CARD区,中间为DExD/H解旋酶区,C端为抑制区,各功能区起重要作用的氨基酸较为保守。同源性及进化树分析发现鸭RIG-1与鹅和斑马鱼的同源性最高分别为93.7%、78.4%,与哺乳动物同源性高于50%,与其他鱼类的同源性低于50%。成功扩增出北京鸭RIG-1基因cDNA编码序列,为鸭RIG-1的深入研究奠定了基础。 相似文献
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Expression of myogenic regulating factors, Myogenin and MyoD, in two canine botryoid rhabdomyosarcomas 总被引：1，自引：0，他引：1
Kobayashi M Sakai H Hirata A Yonemaru K Yanai T Watanabe K Yamazoe K Kudo T Masegi T 《Veterinary pathology》2004,41(3):275-277
Myogenin and MyoD regulate the development of skeletal muscle, and their expressions are specific to the stages of myogenesis. Therefore, these myogenic regulatory proteins could be considered as sensitive and specific markers for rhabdomyosarcoma. In this report we investigated the immunohistochemical reactivities of myogenin and MyoD in two canine bladder botryoid rhabdomyosarcomas that were different in the degree of differentiation. MyoD was stained in the Ki-67 antigen-positive undifferentiated mesenchymal cells, which had proliferative activity similar to myoblasts differentiated from mesoblasts. In contrast, multinucleated neoplastic cells were positive for myogenin and alpha-sarcomeric actin but not for Ki-67 antigen, similar to the myotubes differentiated from myoblastic cells. The expressions of myogenin and MyoD were closely correlated to the histologic features of myogenic neoplastic cells. 相似文献
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鸭肥胖基因的分子克隆、序列分析及原核表达 总被引：5，自引：0，他引：5
根据人、小鼠、猪等动物的肥胖基因编码区序列的保守性设计1对引物，利用RT-PCR技术扩增出鸭肥胖基因的cDNA编码序列，将PCR产物插入pGEM-T载体，经：PCR和双酶切鉴定正确后进行序列测定，分析表明该cDNA序列由438个核苷酸组成，编码146个氨基酸组成的多肽，鸭与人、猪、小鼠、大鼠的核苷酸相似性分别为83％、84％、98％、94％；氨基酸的相似性分别为86％、83％、99％、96％。为了研究鸭肥胖基因体外表达的特点，构建了原核表达载体pET-28a-Ya，在大肠杆菌中进行了诱导表达。结果表明，鸭肥胖基因在大肠杆菌中进行了高效特异性融合表达，融合蛋白分子量约为20ku，其中16ku为鸭肥胖基因表达的蛋白质，经薄层扫描分析，目的蛋白约占菌体总蛋白的30％。鸭肥胖基因的克隆和表达研究，为进一步研究鸭leptin的功能与应用奠定了基础。 相似文献