共查询到20条相似文献，搜索用时 218 毫秒
1.
2.
为建立犬细小病毒(CPV)环介导等温扩增(LAMP)检测方法,实现CPV的早期快速诊断,本研究根据GenBank登录的CPV VP2基因序列,在其序列保守区域设计LAMP引物,利用CPV基因组DNA为模板进行扩增。结果表明:LAMP方法检测灵敏度达到10-1TCID50/mL;并且与其它细小病毒等无特异性扩增,表现出良好的特异性。与PCR技术相比,LAMP法操作更加简单方便,更适合基层和实验室的快速检测。 相似文献
3.
为建立一种快速、灵敏的蜂房蜜蜂球菌(Me lissococcus p luton,MSP)的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)检测方法,针对蜂房蜜蜂球菌16S rRNA特异性序列设计6条特异性引物,分别对Mg2+、dNPTs、引物、甜菜碱浓度及条件进行优化,建立了欧洲蜜蜂幼虫腐臭病的LAMP检测方法,并对其特异性和灵敏性进行了检测.结果 显示,建立的LAMP检测方法具有很好的特异性,仅以蜂房蜜蜂球菌为模板可扩增出梯状条带,最低可检测到7.231×1 0拷贝/μL,是普通PCR的100倍,并且该方法快速简便、检测时间仅需0.5 h,肉眼即可观察检测结果.结果 表明,建立的LAMP检测方法可用于蜂房蜜蜂球菌的检疫,为基层快速诊断和预防该病提供了新的技术. 相似文献
4.
牛瑟氏泰勒虫环介导等温扩增检测方法的建立 总被引：1，自引：0，他引：1
为建立快捷、灵敏的牛瑟氏泰勒虫(T.sergenti)检测方法,本研究以感染牛T.sergenti的阳性血液为试验材料,建立了牛T.sergenti P33表面蛋白基因环介导等温扩增(LAMP)检测技术,并优化了LAMP的各反应条件,进行了敏感性和特异性试验。结果显示,扩增产物经显色、电泳、酶切鉴定后,LAMP方法扩增牛T.sergenti产物检测管显色后呈阳性反应,最低检测量为2.3fg/μL模板DNA,比普通PCR高10倍,牛T.sergenti LAMP产物电泳后呈特征性梯状条带,而弓形虫等对照组均无扩增条带。说明本研究建立的LAMP方法具有灵敏、特异、快速等优点,适合于牛T.sergenti的检测。 相似文献
5.
为实现沙门氏菌的快速检测,根据沙门氏菌特异性invE、hilA、invA、hut基因编码区序列,分别设计合成4套引物,通过对引物筛选和反应条件优化,建立了以invA特异性基因设计合成为引物的沙门氏菌环介导等温扩增检测方法。本方法对沙门氏菌定性检测灵敏度可达到101CFU/mL (细菌浓度),其灵敏度比普通PCR高10倍且反应结果易于观察。以6种沙门氏菌和8种非沙门氏菌细菌DNA为模板进行LAMP扩增检测,并无交叉反应。结果显示,设计的LAMP引物组和建立的沙门氏菌的LAMP检测方法具有特异性好、灵敏度高、快速、费用低廉等优点,可应用于动物和食品样品中肠道沙门氏菌6个亚种的快速检测。 相似文献
6.
《畜牧与兽医》2015,(10):75-78
为建立一种快速检测食源性沙门菌的环介导等温扩增(LAMP)方法,依据Gen Bank公布的沙门菌属hisJ基因序列,利用Primer Explorer软件设计LAMP扩增所需引物,通过LAMP反应条件的优化,建立沙门菌LAMP快速检测方法。选取鼠伤寒沙门菌、猪霍乱沙门菌、肠炎沙门菌、伤寒沙门菌、鸡白痢沙门菌及其他6种常见食源性细菌进行特异性试验,并对其灵敏性进行了评价。针对hisJ基因建立的LAMP方法,在63℃水浴1 h便可完成沙门菌的有效扩增,该方法的灵敏度达到102cfu/mL,高于PCR方法 100倍,特异性试验结果显示只有沙门菌LAMP扩增结果呈阳性。本研究建立的沙门菌hisJ基因LAMP检测方法具有较强的特异性及灵敏性,可用于食品中沙门菌的快速检测。 相似文献
7.
根据GenBank上公布的犬腺病毒I型（CAV-I）E3基因序列,设计了3对特异性环介导等温扩增（LAMP）引物,以CAV-I DNA为模板,通过条件优化建立了犬传染性肝炎LAMP快速检测方法,该方法能够在63℃恒温下30min内实现目的核酸的大量扩增,在可见光下即可直接观察扩增产物荧光颜色变化来判定结果。特异性和灵敏度试验表明,该LAMP检测方法只对CAV-I有特异性扩增,对其他无关核酸无扩增。与常规PCR检测相比,LAMP的检测灵敏度较好,最低检出限为10-7TCID50,是PCR检测方法的100倍。临床样品检测结果表明, LAMP阳性检出率为36%,与病毒分离鉴定的结果符合率达96.8%,与PCR检测的结果符合率达100%,且快速简便,成本低,适用于基层实验室的快速疾病诊断。 相似文献
8.
为了对羊衣原体病进行快速检测,试验通过模板制备、引物设计等建立了一种针对山羊衣原体的环介导等温扩增(LAMP)检测方法,同时验证了该方法的特异性,并对贵州省部分山羊场抽样采集的临床可疑病料进行了检测。结果表明:所建立的LAMP检测法特异性较好,用建立的LAMP法对当地采集的临床可疑病料进行检测,发现当地山羊群衣原体感染率为2.50%~8.00%,平均感染率为5.00%(10/200),说明贵州省内山羊普遍存在衣原体感染的情况,所建立的衣原体LAMP法适合兽医临床快速检测。 相似文献
9.
2种鸡免疫抑制性疾病LAMP检测方法的建立 总被引：1，自引：0，他引：1
本文借助环介导等温扩增技术(LAMP),建立了两种常见鸡免疫抑制病的(鸡传染性贫血病、J亚群白血病)的快速检测方法。采用简易法提取DNA模板,设计特异性LAMP引物,成功扩增出梯形条带,并且对反应体系进行优化,以及特异性试验和灵敏度试验。结果表明LAMP的灵敏度可达10个拷贝,比PCR灵敏度高10倍;且具有特异性,对其他相关鸡病病原检测结果均为阴性。用建立的LAMP方法对临床样品进行检测,同时与PCR方法比较,结果表明LAMP结果基本与PCR相符,但检测的阳性率要比PCR高。操作简便,无需昂贵设备,适用于临床快速诊断。 相似文献
10.
应用环介导等温扩增(LAMP)技术建立了快速特异的检测副鸡禽杆菌的方法。利用在线引物设计软件Primer Explorer Version 4.0,针对副鸡禽杆菌16SRNA基因序列设计两组LAMP引物,并对副鸡禽杆菌特异性DNA的扩增条件进行优化,评价所建立LAMP的特异性和灵敏性。结果显示,优化后的反应条件为65℃恒温反应60min,内引物1.60pmol/μL、外引物0.20pmol/μL。该LAMP对13株副鸡禽杆菌均发生了扩增反应,而对大肠埃希菌、禽多杀性巴氏杆菌、空肠弯曲杆菌等14株其他病原微生物没有扩增反应;该LAMP最低检出量为0.17pg/反应,敏感性远高于常规PCR的56pg/反应。结果表明,所建立的副鸡禽杆菌LAMP具有快速、高效、方便操作等特点,适用于基层兽医部门进行副鸡禽杆菌的快速检测。 相似文献
11.
H1N1猪流感病毒环介导等温扩增快速检测方法的建立 总被引：2，自引：0，他引：2
目的:建立H1N1猪流感病毒环介导等温扩增(LAMP)快速检测方法。方法:从GenBank中获得H1N1猪流感病毒血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)基因序列,应用DNAStar软件MegAlign程序分析其序列,利用Primer ExplorerV4软件在序列保守区域设计LAMP引物,即外引物和内引物,同时以H1N1猪流感病毒的cDNA作为阳性模板,对试验中的几个反应条件进行优化。结果:LAMP检测方法对H1N1猪流感病毒的灵敏度达到4～6个拷贝,其引物对于H9亚型禽流感病毒、猪瘟病毒和猪圆环病毒均无非特异性扩增,表现出良好的特异性。结论:建立的H1N1猪流感病毒环介导等温扩增快速检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好,为快速检测猪流感病毒提供了新方法和新思路。 相似文献
12.
Since the first isolation of Helicobacter pylori from humans in 1983, 18 Helicobacter species have been identified during the last decade in domestic and laboratory animals. Several Helicobacter species have been isolated from the gastrointestinal tracts of various mammalian species and birds. Helicobacter hepaticus, H. muridarum, H. bilis, H. rodentium and Flexispira rappini have been isolated from mice. Among these species, only H. hepaticos has been clearly recognized as a pathogen. Indeed, it displays the pathogenic potential to elicit hepatitis in several strains of mice; moreover in A/JCr mice, it is strongly associated with hepatic cancer. Among the five murine helicobacter species, apart from H. hepaticus, F. rappini has not been found associated with lesions, H. muridarum has been observed in gastric glands of mice with chronic gastritis, and H. bilis has been reported in the liver of mice with chronic hepatitis. When associated with H. rodentium, H. bilis is able to induce diarrhea in SCID mice. In no case has pathogenicity of a single species been clearly proven. In rats, H. trogontum and H. muridarum have been isolated from the intestine, without any information concerning their respective pathogenicity. H. cinaedi and H. cholecystus have been identified from the intestine and the gallbladders of hamsters, respectively. The diagnosis of Helicobacter species by polymerase chain reaction (PCR) is a rapid, specific and sensitive technique. One of the most promising diagnostic techniques of these infections seems to be the PCR detection of Helicobacter sp. from feces based on the 16S rRNA sequences, then a restriction enzyme analysis to identify the actual species. Several drug regimens have also been evaluated to eradicate H. hepaticus from mice. Helicobacter infections, particularly H. hepaticus and H. bilis, seem to be widespread in laboratory mouse colonies and have also been detected from commercial breeders. 相似文献
13.
Poynter S Phipps JD Naranjo-Pino A Sanchez-Morgado JM 《Veterinary microbiology》2009,134(3-4):272-278
Molecular diagnostic methods using the polymerase chain reaction (PCR) are the gold standard in Helicobacter diagnostics. Most rely on the amplification of parts of the 16S rRNA gene sequence. Therefore, the validity and accuracy of results depends heavily on the PCR design and the time of its publication because new sequences are continually being submitted to databases. Here we report the presence of helicobacter in commercially bred mice supposedly free of this infection. Furthermore, three out of six different commercial laboratories performing helicobacter testing on the same spiked faecal samples failed to detect and identify H. hepaticus. We designed a simple generic PCR assay that amplifies a 261bp amplicon spanning two of the seven variable regions in the 16S rRNA of helicobacter. Using this assay together with an established generic assay designed by Bohr [Bohr, U.R., Primus, A., Zagoura, A., Glasbrenner, B., Wex, T., Malfertheiner, P., 2002. A group-specific PCR assay for the detection of Helicobacteraceae in human gut. Helicobacter 7, 378-383] and then cloning and sequencing their products, we detected the H. hepaticus used in the study that three commercial laboratories failed to detect. We think these assays together could detect all the currently known species of helicobacter and hopefully the new ones as well. In addition, we have been able to identify different species of helicobacter and their relative proportions infecting a single animal. This information has also shown that some helicobacters may have a much broader host range than originally reported. 相似文献
14.
本试验针对猪流感病毒（swine influenza virus,SIV）NP基因保守区域设计并合成6条引物,建立了SIV的环介导等温扩增（LAMP）检测方法,并进行了特异性、敏感性和重复性试验。结果显示,该方法可特异性检测H1N1、H1N2、H3N2、类禽H1N1亚型SIV及甲型H1N1流感病毒,但不能检测猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪细小病毒、猪瘟病毒、猪伪狂犬病病毒、猪圆环病毒2型、日本乙型脑炎病毒;该方法的最低检测量为100拷贝/μL质粒DNA。结果表明建立的LAMP方法具有较高的敏感性和特异性,可用于SIV的快速检测。 相似文献
15.
本研究利用3种方法对新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)进行检测,并对这3种检测方法的灵敏度和特异性作出比较。根据新城疫病毒的融合蛋白基因(F基因)设计合成6条特异性引物,利用水浴LAMP法、PCR及LAMP实时浊度仪进行检测。通过对恒温水浴中的反应温度、反应时间及反应液中Mg2＋浓度进行优化获得最佳反应条件,结果用凝胶电泳分析;用优化的温度进行LAMP实时浊度仪检测,同时都与PCR方法进行比较。结果显示,获得了最佳反应条件,水浴LAMP方法最低检测限是1.58 pg,比PCR高100倍,而LAMP实时浊度仪检测灵敏度比水浴LAMP方法高10倍,最低检测限是0.158 pg。3种方法对其他非新城疫病毒均无检出。结果表明,新城疫病毒水浴LAMP检测方法速度快、不需要高精密的仪器,而且具有灵敏度高、特异性强、操作简单等特点,有望在核酸扩增领域取代PCR技术,LAMP浊度仪法检测灵敏度更高,但是所需仪器和试剂比较昂贵。 相似文献
16.
鸭圆环病毒LAMP可视化检测方法的建立 总被引：1，自引：0，他引：1
根据GenBank中DuCV基因序列,在保守区设计了6条特异性引物,并对反应条件进行优化,建立了一种适用于鸭圆环病毒（DuCV）的环介导等温扩增快速检测方法（LAMP）。该方法对H9亚型禽流感、小鹅瘟、鸭瘟、鸭肝炎、鸭副黏病毒均无扩增反应;且扩增反应只需在常规水浴锅中进行,1小时内即可完成反应;对DuCV模版DNA的最小检测限为10龟,灵敏度是一步法PCR的1000倍。本研究建立的LAMP方法简便、快速、灵敏、特异,适合在基层进行DuCV的快速检测。 相似文献
17.
弓形虫环介导等温扩增快速检测方法的建立 总被引：2，自引：0，他引：2
为了建立弓形虫的快速检测方法,本研究建立了一种灵敏、特异、快速的分子生物学检测方法——环介导等温扩增技术(LAMP)。用10倍系列稀释的DNA样品对该检测方法的灵敏度进行了测试,同时通过对扩增产物做内切酶验证;为证明LAMP技术的特异性,对新孢子虫、附红细胞体、瑟氏泰勒虫等病原体进行检测。结果显示:利用LAMP技术成功检测到弓形虫基因区,此方法的灵敏度可达到能检测5个拷贝DNA分子水平,酶切分析结果正确,并且特异性强,对新孢子虫、附红细胞体、瑟氏泰勒虫等病原体检测均为阴性。说明LAMP技术可应用于弓形虫的快速检测。 相似文献
18.
Luo Y Sahin O Dai L Sippy R Wu Z Zhang Q 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2012,74(5):591-596
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay is a simple, rapid and specific detection method and has been used for detection and identification of different Campylobacter species. In this study, we develop a LAMP assay specific for detection of a particular clone (clone SA) of Campylobacter jejuni, associated with the vast majority of recent sheep abortions in the U.S. Using a set of specific primers for C. jejuni IA3902 (a clone SA isolate) and genomic DNA or boiled cell extract as template, the target DNA was amplified at 63 °C for 50 min in a water bath. A positive reaction was identified visually as white precipitate or fluorescence under UV, and confirmed by gel electrophoresis. Detection limit of the assay was comparable to that of conventional PCR. The LAMP was shown to be specific for detection of clone SA when tested on a number of C. jejuni strains of different genetic backgrounds. Applicability of the LAMP assay for specific detection of clone SA was demonstrated in animal tissues experimentally infected with IA3902 or genetically diverse C. jejuni strains. Since clone SA is the predominant cause of sheep abortions in the U.S. and is a zoonotic pathogen, the LAMP assay may be a valuable detection tool in future epidemiological studies. 相似文献
19.