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1.
《中国畜牧杂志》2016,(15)
miR-143是一种广泛表达的miRNA,本研究采用RT-qPCR方法检测miR-143在尼罗罗非鱼雌雄性腺中的表达差异,同时对它的靶基因进行预测,并对靶基因进行GO富集和KEGGpathway分析。结果表明:miR-143在尼罗罗非鱼雌雄性腺均有表达,在卵巢中表达量显著高于精巢(P0.05);GO富集分析表明,miR-143参与细胞增生、营养积累和代谢等多个生物学过程;KEGGpathway分析表明,IGF1R、CAMKⅡ和PLA2等靶基因富集于与性腺发育、繁殖相关的卵母细胞减数分裂通路、Wnt信号通路和GnRH通路。本研究为探究miR-143在鱼类性腺发育过程的功能和分子机理提供了基础资料。 相似文献
2.
研究旨在从香猪卵巢small RNA测序数据中挖掘调控香猪繁殖的microRNA （miRNA）,解析miRNA调控香猪卵巢功能及繁殖性状的分子机制,对于猪的遗传选育具有重要意义。研究选取发情期和间情期的香猪各4头,屠宰后取其卵巢组织,提取总RNA进行small RNA测序,利用生物信息学方法检测miRNA表达谱,筛选差异表达的miRNA,预测差异表达miRNA靶基因,并对靶基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果显示,香猪卵巢组织中miRNA在染色体上呈不均匀分布,主要分布于1号染色体和X染色体上。香猪卵巢中共有627个已知猪miRNAs表达,其中有34个差异表达miRNAs,表达量前五的分别是miR-23、let-7i-5p、miR-103、miR-30e-5p和miR-1271-5p。GO功能分析结果显示,靶基因主要参与的生物学过程是细胞过程（cellular process）,主要分布于细胞（cell）,主要分子功能是结合（binding）;KEGG显著富集通路中,促性腺激素释放激素受体通路（gonadotropin-releasing hormone receptor pathway）、胰岛素样生长因子通路（IGF pathway）和表皮生长因子受体信号通路（EGF receptor signaling pathway）与卵母细胞的发育成熟相关,因此推测miR-23b、let-7i-5p、miR-103、miR-30e-5p和miR-1271-5p可能参与了香猪繁殖调控。本研究初步筛选出5个可能调控香猪繁殖性能的miRNAs,可为从分子水平提高香猪产仔数提供理论基础。 相似文献
3.
MicroRNAs（miRNAs）是一种长11~22 nt,具有调节作用的小分子RNA,可通过抑制蛋白质的合成和降解mRNAs来沉默靶基因。猪因具有产肉特性,成为了农业生产中一种重要的动物,此外,由于其与人类的亲缘关系较近,与小鼠模型相比,猪更具有作为模型组织的巨大的生物医学重要性。到目前为止,在哺乳动物中（如人、老鼠等）已鉴定出数百个miRNAs,但猪基因组中的miRNAs研究却较少。因此,本试验对猪不同组织中的保守miRNAs进行了鉴定,并对其表达模式进行了分析。通过对猪心脏、肝脏和胸腺中提取的混合RNA进行测序,构建了一个小RNA基因库,在该基因库中共鉴定出了120个保守的miRNA。对14个不同组织中的保守miRNAs进行表达分析。结果表明,miR-499和miR-208在心脏中特定表达,miR-122在肝脏中特定表达。除此之外,miR-1和miR-133、miR-181a和miR-142-3p、miR-194、miR-143在心脏、胸腺、肝脏和胃中均有较高的表达水平;miR-22、miR-26b、miR-29c和miR-30c在不同的猪组织中均有表达。猪不同组织中特定的miRNAs表达模式并不相同。 因此,本研究鉴定出了120个miRNAs,并对其在猪不同组织中的特定表达进行了检测,为对猪和一些相关的哺乳动物（包括人）转录后的基因调控感兴趣的分子生物学家、育种工作者、生物医学研究者提供了宝贵的资料。 相似文献
4.
miRNAs是长度为18~25个核苷酸的单链小RNA,转录后水平调节基因表达。在心肌和骨骼肌组织中高表达的miRNAs被称为myomiRs,它们在脊椎动物肌肉生长发育及功能维持过程中起重要作用。本研究采用表型特征分析、实时定量荧光PCR检测和SPSS数据处理分析,研究了德国镜鲤、黑龙江野鲤和荷包红鲤肌肉中5个myomiRs(miR-1、miR-21、miR-23a、miR-133和miR-206)的表达差异,及其与鲤鱼的生长性状的相关性。结果表明:不同品系鲤鱼体重、体高和体厚与myomiR表达有相关性,其中鲤鱼的体高/体长与miR-21和miR-23a表达量呈显著负相关;体厚/体长与miR-1表达量呈显著正相关,而与miR-21和miR-23a表达量呈显著负相关;肉重/体重与miR-206表达量呈显著正相关,表明miR-1等myomiRs可以作为检测分子用于鲤鱼的分子育种。 相似文献
5.
《中国兽医学报》2014,(10):1622-1626
从miRNA这类新的调控水平出发,在Solexa高通量测序的基础上,以毛囊发育不同阶段的绒山羊皮肤组织为研究对象,针对绒山羊不同发育阶段皮肤组织差异表达的miR-let7a进行分析,同时利用生物信息学软件预测和筛选与毛囊发育相关靶基因IGF-1R,并通过实时荧光定量PCR技术检测miR-let7a、IGF-1R在绒山羊毛囊不同发育时期中的表达规律。结果显示,miR-let7a与其靶基因IGF-1R在绒山羊毛囊不同发育阶段均有表达,但存在表达差异;miR-let7a在绒山羊生长期中的表达较退行期的弱,而其靶基因IGF-1R在绒山羊生长期中的表达较退行期的强,其表达量正好相反,从而进一步证实了IGF-1R为miR-let7a的靶基因,同时也为后期人工调控绒山羊的毛囊发育及提高绒山羊毛发产量提供新的思路和研究平台。 相似文献
6.
MicroRNA(miRNA)是一类重要的非编码小RNA分子,其通过对靶基因的转录后调控广泛参与真核生物生殖、发育、病毒防御、细胞增殖和凋亡、脂肪代谢等多种生命活动。采取比较基因组学方法,在对其他7种哺乳动物直向同源基因序列分析的基础上,设计特异性引物,应用实时定量PCR技术测定安徽白山羊心、肝、脾、肺、肾、卵巢、子宫、输卵管、肌肉等9种组织中miR-143的表达情况。结果表明,依据同源基因设计的引物,可以进行山羊miR-143基因特异性检测。安徽白山羊miR-143表达丰度以肺脏最高,肝脏最低;7种组织相对表达量由高到低依次为:肺、子宫、心、脾和卵巢、输卵管和肌肉、肾、肝。研究结果为进一步研究miR-143在山羊组织分化及生长发育过程中的作用提供了借鉴。 相似文献
7.
《畜牧兽医学报》2015,(11)
旨在研究miR-133及其靶基因SRF在山羊骨骼肌组织和细胞中的表达情况,并探讨miR-133对SRF基因的靶向调控作用。首先利用qRT-PCR分别检测miR-133及其靶基因在初生、7月龄、18月龄的安徽白山羊和波尔山羊8个组织(心、肝、脾、肺、肾、小肠、脂肪、背最长肌)以及不同代数的山羊骨骼肌卫星细胞(F6、F9、F12)中的表达变化;采用qRT-PCR及Western印迹法检测miR-133对靶基因mRNA及蛋白质表达水平的影响。qRT-PCR检测表明,miR-133在心肌和背最长肌中的表达水平明显高于其它组织,其靶基因SRF的表达水平与其相反;miR-133在山羊骨骼肌卫星细胞中的表达水平随着细胞代数的增多而表达量增加;qRT-PCR及Western印迹法证实,miR-133对SRF蛋白表达的调控发生在转录后水平。综上表明,miR-133有望成为研究山羊骨骼肌生长发育的新型标志物;miR-133通过在转录后水平抑制SRF蛋白的表达参与调控山羊骨骼肌细胞增殖和分化,进而影响山羊骨骼肌的发育。 相似文献
8.
本试验旨在研究microRNA-143(miR-143)对小鼠肌细胞增殖和分化的影响。利用Real-time PCR方法对细胞不同分化时期进行检测,并且在小鼠肌细胞C2C12中通过转染miR-143 mimics和Inhibitor对标志基因myogenin(MyoG)进行检测,然后利用免疫荧光和Western blotting方法对组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)基因表达水平进行检测。结果表明,miR-143与肌细胞的增殖和分化密切相关,过表达miR-143后,肌细胞标志基因MyoG出现下调,敲低后结果相反,且在分化细胞中过表达miR-143,免疫荧光和Western blotting结果显示,标志基因MHC的表达水平下降。因此,miR-143是一个潜在的影响肌肉生长发育的microRNA,为以后肌肉发育和功能的研究提供了一个新的资料。 相似文献
9.
为验证miR-7和miR-30-5p对贵州黑山羊CTSK基因的调控效率及其对产羔基因的影响,通过生物软件筛选出调控CTSK效率最高的2条miRNAs:miR-7和miR-30-5p;将2条miRNAs转染至卵巢颗粒细胞,并于转染后24 h和48 h分别提取细胞总RNA,采用qRT-PCR法分别检测2条miRNAs在转染24 h和48 h的表达效率;同时检测miR-7和miR-30-5p过表达对CTSK基因及产羔相关基因FSHβ、GDF9、BMP15和BMPR-1B表达水平的影响。实验结果表明：转染miR-7和miR-30-5p至卵巢颗粒细胞24 h后,2条miRNAs的表达水平均极显著高于对照组（NC组）;转染48 h后,miR-30-5p表达水平极显著低于NC组,而miR-7与NC组相比无显著性差异。此外,过表达2条miRNAs对CTSK基因和繁殖相关基因的影响发现,与NC组相比,转染miR-7 24 h后能极显著抑制CTSK的表达,且上调产羔基因FSHβ、GDF9、BMP15的表达;而转染miR-30-5p对CTSK的表达无明显抑制作用,但极显著上调了产羔基因FSHβ、GDF9、B... 相似文献
10.
《中国畜牧杂志》2021,(5)
为探究miR-143-3P对从江香猪的表达调控作用,本研究通过SWChen 2.3程序筛选出PRKAA1基因3'-UTR相关的miRNAs,利用生物信息学软件分析其保守性,采用茎环法设计引物克隆miR-143-3P序列,运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测该miRNA在从江香猪各组织中的表达水平。结果表明:通过SWChen2.3软件与高通量测序筛选出共同miRNAs有8个,以其中的miR-143-3P为研究对象;成功克隆出miR-143-3P成熟序列;生物信息学分析发现miR-143-3P在各物种中具有较高的保守性;miR-143-3P在从江香猪各组织均有表达,其中在肝、脾、胃组织中的表达量极显著高于其他组织。 相似文献