转录组测序筛选牛卵泡发育相关基因及其表达差异分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

李鹏飞  孟金柱  景炅婕  毕锡麟  王锴  朱芷葳  吕丽华 《中国农业科学》2018,51(15):3000-3008

【目的】通过不同生理状态牛卵泡高通量测序筛选与卵泡发育相关的基因。【方法】母牛同期发情后,B超声波连续监测并适时采集第一卵泡波出现偏差前的最大卵泡(the largest follicle at predeviation,PDF1)和第二大卵泡(the second largest follicle at predeviation,PDF2),构建RNA文库后Illumina平台测序,经数据库比对,设定参数筛选高表达基因、差异表达基因并进行GO分析,Genecards基因功能查询进一步筛选与卵泡发育直接相关的调控基因,q RT-PCR对筛选的基因进行表达量验证分析。【结果】两个转录本中共获得263个差异表达基因;GO功能聚类分析共分为三大类90组:其中生物学过程占64.4%,细胞组分占17.8%,分子功能占17.8%;获得一些重要的功能富集通路,如调控信号转导和细胞因子应答的生物途径;基因表达量分析筛选出10个高表达的上调和下调基因,获得参与雌激素合成和胎儿性别发育的CYP17A1、参与类固醇激素合成的LOC785462、细胞发育过程中调节细胞凋亡的DACH1以及调节ERK和MEK1/2信号通路的MAP3K3。Genecards功能查询共获得6个基因与卵泡发育关系较为密切,其中上调基因分别为PRSS35,PTGRF,ARID4B,GPR116;下调基因为APOA1和CPXM1;q RT-PCR结果显示,PRSS35和ARID4B在DF中的表达量显著高于SF(P0.05),CPXM1在SF中的表达量极显著高于DF(P0.01),PTGRF,GPR116和APOA1在DF和SF中的表达量不存在显著差异(P0.05),但其表达变化趋势与高通量测序结果相一致。【结论】转录组测序结果真实可靠,PRSS35和ARID4B在卵泡发育过程中发挥正调控作用,CPXM1在卵泡发育过程中发挥负调控作用,获得的牛卵泡发育相关基因和重要调节途径,对后期深入探讨卵泡发育调控机理的研究具有重要意义。  相似文献   

Mollusk species composition and quantity distribution of intertidal zone in Nanji Islands Marine Nature Reserve     

BI Siyao  XU Yongjiu  YU Cungen  CAI Houcai  CHEN Wandong  XIA Lujun  XIE Xu 《水产学报》2018,42(6):902-911

根据2013年11月、2014年2月、5月、8月对南麂列岛岩相潮间带7个断面进行的生物资源定量和定性调查所获得的软体动物资料,研究了该区域软体动物的种类组成和数量分布特征。结果显示:(1)共鉴定出软体动物种类63种,隶属于3纲13目34科52属。春、夏、秋、冬季出现的种类数分别是48种、48种、45种、41种。(2)不同季节软体动物资源数量不同,在个体数上是春季>秋季>冬季>夏季;在重量上则是春季>秋季>夏季>冬季;软体动物平均个体数和生物量分别为506.5个/m2和801.54 g/m2,且以春季为最大,冬季为最小。(3)不同潮区的软体动物平均个体数不同,具体是中潮区>低潮区>高潮区;生物量差异也很明显,具体是低潮区>中潮区>高潮区。(4)不同季节的优势种差异较大,但条纹隔贻贝是一年四季共有的第一大优势种。研究表明,由于受海流、地形、风浪等环境因素的影响,南麂列岛潮间带软体动物在不同季节、不同断面的分布差异较大。同时,通过与历史资料的对比发现,近二十年来,南麂列岛软体动物的物种数及数量有一定程度的减少。  相似文献   

肉桂醛纳米乳的制备及其抑菌效果研究     

王庆奎  姚维林  陆颖  石洪玥  卢正义  孙学亮  毕相东 《水生态学杂志》2018,39(2):95-100

为评价肉桂醛纳米乳对水产动物致病菌的抑菌效果,以吐温-80为表面活性剂、乙醇为助表面活性剂、乙酸乙酯为油相,加蒸馏水按比例配制成空白纳米乳,加入肉桂醛制备得肉桂醛纳米乳,并评价了肉桂醛纳米乳的部分特性;探究肉桂醛纳米乳对迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)、温和气单胞菌(Aeromonas sobria)、鳗败血假单胞菌(Pseudomonas anguilliseptica)4种常见水产动物致病菌的抑菌效果。结果显示,肉桂醛纳米乳中吐温-80、乙醇、乙酸乙酯、蒸馏水和肉桂醛质量比为10∶5∶11∶73∶1,空白纳米乳对肉桂醛的最大载药量为20.11 mg/m L,肉桂醛纳米乳为水包油型淡黄色澄清透明液体,粒径5~20 nm,平均粒径10.74 nm;与同浓度肉桂醛溶液相比,肉桂醛纳米乳具有更强的抑菌活性,在最大载药量时,对嗜水气单胞菌、鳗败血假单胞菌、迟缓爱德华氏菌、温和气单胞菌的抑菌强度分别提高了65.56%、46.99%、41.94%、26.91%。肉桂醛纳米乳对嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、鳗败血假单胞菌、迟缓爱德华氏菌的最小抑菌浓度(MIC)分别0.31、0.51、0.72、1.00 mg/m L。研究表明,肉桂醛纳米乳在水产养殖中具有潜在的应用价值。  相似文献   

不同采收期咖啡果实物理性状比较     

李亚男  杨世贵  严炜  刘倩  毕晓菲  武瑞瑞  刘航秀  张晓芳  黄家雄 《热带农业科学》2017,(3):57-62

以潞江坝的Catimor系列品种咖啡鲜果为材料,研究不同采收期对咖啡果实物理性状的影响。结果表明,不同成熟期果实的物理性状差异为极显著,其中,早期和晚期成熟的咖啡鲜果和咖啡豆颗粒较小,物理性状较差,而中期成熟的咖啡鲜果和咖啡豆颗粒较大,物理性状较好。  相似文献   

晋西黄土区苹果花生间作系统光合有效辐射及其对花生生长的影响     

蔡智才  毕华兴  许华森 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》2017,45(4):51-58

【目的】研究果-农间作系统的种间关系,为果-农间作系统的可持续经营提供理论支持。【方法】以晋西黄土区7年生苹果(Malus pumila)+花生(Arachis hypogaea)间作系统为研究对象,以花生单作系统为对照,布设根障以阻断苹果树与花生根系之间的延伸交叉,采用定位观测和数学模拟相结合的试验手段,对林下光合有效辐射(PAR)分布及其对花生生长的影响进行研究。【结果】间作系统内树行北侧的作物行主要在上午受果树遮阴影响,南侧则主要在下午受影响,距树干基部越近的作物行PAR均值越小;采用直角双曲线修正模型对花生花期(7月)所测光合数据进行光响应曲线拟合,拟合效果良好,计算得花生光饱和点(LSP)为1 497.4μmol/(m2·s);间作系统内不同作物行表现为距树干基部越近,饱和PAR时长越小,生物量越小;花生生物量与PAR均值和饱和PAR时长均极显著相关,且与饱和PAR时长的相关性更高。【结论】间作系统内果树树荫不断移动变化,导致林下PAR出现时空异质性,且距树干基部越近的作物行受影响程度越深。  相似文献   

紫花苜蓿对Cd胁迫的响应及品种差异研究进展   总被引：1，自引：1，他引：0  

杨姝  李元  毕玉芬  祖艳群  何永美  贾乐 《农业环境科学学报》2017,36(8):1453-1461

为利用紫花苜蓿对Cd污染土壤进行修复和综合利用提供理论基础。综述了紫花苜蓿对Cd胁迫的响应,包括:紫花苜蓿的生长对Cd的响应存在"低促高抑"现象;紫花苜蓿对Cd吸收的可能途径包括根表皮质膜的H+交换、Ca~(2+)和Mg~(2+)阳离子通道,根际环境和Cd元素在土壤中的有效态等因素会影响紫花苜蓿对Cd的吸收;在Cd由根部向地上部转运的过程中,随着土壤Cd含量的增加,更多的Cd被累积在紫花苜蓿的根部;紫花苜蓿应对土壤Cd胁迫的调控机理包括信号分子调控、抗氧化系统调控、生物巯基化合物对Cd的螯合、调节Cd的亚细胞分布和耐Cd基因的表达等多个方面。总结了紫花苜蓿对Cd胁迫响应的品种差异,主要表现在:种子萌发和幼苗生长;根瘤生长、植株形态和生物量;生理指标;对Cd的吸收与累积等方面。今后的研究工作可重点关注品种差异评判标准的建立、差异显著品种的系统筛选、在分子水平上的响应机理及品种差异机理的分析等方面。  相似文献   

马尾松毛虫幼虫发生严重程度的预测研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

余燕  李尚  王振兴  毕守东  张国庆  周夏芝  方国飞  邹运鼎  张桢  宋玉双 《安徽农业大学学报》2017,44(5):882-893

为了提高马尾松毛虫幼虫发生严重程度的预测精度,寻求简便准确的预测方法,采用时间平稳序列法、回归预测法、马尔科夫链法、BP神经网络法和列联表多因子多级相关分析法对安徽省潜山县1983—2014年的马尾松毛虫越冬代、一代和二代幼虫发生的严重程度进行预测,研究历史符合率,并用2015年和2016年的实际发生情况验证。结果表明,平稳时间序列法,列联表多因子多级相关分析法计算简便,预测结果准确;BP神经网络法和马尔科夫链法预测结果非常准确。回归模型中以当代卵盛期卵量预测当代幼虫发生严重程度的一元回归模型的预测结果准确性高,其余一元回归模型预测结果稍差,多元回归模型和逐步回归模型优于一元回归模型。BP神经网络模型是一种理想的预测模型。  相似文献   

广西家蚕核型多角体病毒株gp64基因 克隆与序列分析          下载免费PDF全文

陈朝蓉  屈达才  朱方容  李俊  闭立辉  梁湘 《南方农业学报》2017,48(2):328-335

[目的]了解广西家蚕核型多角体病毒(Bombyxmori nucleopolyhedrovirus,BmNPV)毒株gp64基因的保守性,并掌握其具体的突变位点,为研究核型多角体病毒(NPV)种内的微进化模式提供参考依据.[方法]对广西不同桑蚕产区的19株BmNPV毒株进行gp64基因克隆与测序,分析完整开放阅读框(ORF)序列的同源性和单核苷酸多态性,并构建基于gp64基因的遗传进化树.[结果]广西BmNPV毒株的gp64基因ORF序列不一致,存在1590、1593和1599 nt三种类型,是由于第94~96位缺失GCG或第97~102位插入GCGCCG所致,且插入核苷酸突变仅在广西BmNPV毒株中出现.仅GXSL毒株与T3毒株的核苷酸及其推导氨基酸序列同源性均达100.0%,其余18株毒株与T3毒株的核苷酸序列同源性在98.5%~99.2%,其推导氨基酸序列同源性在98.7%~99.6%.19株广西BmNPV毒株被分为两个亚群(cladeⅠ和cladeⅡ),其中11株独立形成cladeⅡ,7株独立形成cladeⅠ中的一个亚群;广西毒株在多个位点出现同义核苷酸突变,呈一定的规律性.[结论]广西BmNPV毒株的gp64基因具有遗传多样性,在遗传进化上较独立,插入突变显示出地域特点.  相似文献   

Colles骨折手法整复后竹夹板固定与石膏固定的疗效比较          下载免费PDF全文

谢文鹏  王式鲁  张岳  陈彦华  张永奎  毕荣修 《勤云标准版测试》2017,37(5):536-539

目的 通过随访对Colles骨折手法整复后竹夹板固定与石膏固定的疗效进行比较,确定Colles骨折手法整复后的有效治疗方案。方法 将120例Colles 骨折患者按随机数字表法随机分为竹夹板外固定组60例及石膏外固定组60例,骨折手法整复成功后,按照组别分别给予竹夹板固定及石膏固定治疗,外固定拆除后均给予中药熏洗1个月,6个月后进行随访,并按照Gartland and Werley 腕关节评分比较两组骨折患者的腕关节评分,以评价疗效。结果 竹夹板固定组优良率为83.3%,优于石膏固定组的56.7%（P<0.01）。结论 Colles骨折手法整复后竹夹板固定的疗效优于石膏固定。  相似文献   

Study on the Key Techniques of Rapid Propagation in Purebred Wagyu     

BI Jiang-hua  FENG Chun-tao  LI Su-xia  LIN Hui-liang  SUN Gui-lai  FANG Jin-wu  LI Shu-jing 《中国畜牧兽医》2017,44(6):1784-1789

In order to rapid propagation of purebred Wagyu, the experiment were conducted to study the effects of high intensity superovulation, embryo sex identification and different breeds recipient cattle on calving, gestation period and calf birth weight. Wagyu were superovulated repeatedly for nine times with a 30 days interval. The results indicated that the average number of total embryos collected at the second time was 22.78, which was significantly higher than those of the fifth to ninth times (P< 0.05),and there was no significant difference between the other groups (P> 0.05).There was no significant difference between the number of transferable embryos in the first to third times (P> 0.05). The available embryos number of the second times superovulation were significantly higher than those of the fourth to ninth times (P< 0.05),and were remarkably significantly higher than those of the seventh and ninth times (P< 0.01). There were no observably differences of pregnant rate and calving rate between sex identified embryos, and regular embryos respectively (P> 0.05).The female calf percentage of sexed embryos was 95.56%. The calving rate of the Simmental-catalo receptors were higher than those of Wagyu-catalo and Holstein receptors (P> 0.05). The gestation period of Wagyu-catalo were remarkably significantly greater than those of Simmental-catalo and Holstein receptors (P< 0.01), however, there was no significant difference between Simmental-catalo and Holstein receptors (P> 0.05). The birth weight of female calves calved by Simmental-catalo receptors were higher than those of Wagyu-catalo (P< 0.05), which was extremely significantly higher than those of Holstein receptor (P< 0.01). The male calf birth weight was no significant difference in the three breeds receptors (P> 0.05). There were obvious differences between male and female calves in gestation and birth weight with in the same recipient breed.  相似文献