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用磁珠富集法从AFLP片段中分离鹅微卫星DNA标记 总被引:2,自引:0,他引:2
用磁珠富集法从AFLP片段中分离微卫星DNA标记,可以避免基因组文库的构建和筛选这一繁重的工作,既节省时间又节约费用。利用少量的内切酶组合建立一系列AFLP DNA,然后用生物素标记的简单重复序列(SSR)作探针与其杂交,杂交复合物固定到包被有链亲和素的磁珠上,经过一系列洗涤过程,含有SSR的AFLP片段被吸附到磁珠表面。这些片段经洗脱下来后,先用对应的AFLP引物扩增,再进行克隆和测序,根据SSR两端的保守序列设计引物,经过多态性分析后,便可得到微卫星DNA标记。用这种方法已成功地从6个中国地方品种鹅中分离到30个微卫星DNA标记。其中有11个引物表现为多态性好,特异性强且相互之间并不连锁。各品种平均多态信息含量(PIC)在0.513~0.546之间。说明这11个微卫星均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于鹅品种间遗传多样性和系统发生关系的分析,并为建立鹅遗传图谱、重要经济性状的基因定位及标记辅助选择奠定基础。 相似文献
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[目的]探讨IGFs系统对鹅骨骼肌生长的影响。[方法]以太湖鹅和皖西白鹅为研究材料,采用荧光定量PCR方法研究鹅70日龄腿肌中GHR、IGF-I、IGF-IR和IGFBP-3 mRNA表达的品种、性别特异性,并与屠宰性能做相关性分析。[结果]结果表明,鹅腿肌GHR、IGF-I、IGFIR和IGFBP-3 mRNA表达没有品种差异性,而体重和腿肌重品种差异显著。体重、腿肌重和腿肌率均无性别差异,除了太湖鹅腿肌IGF-I mRNA表达公鹅显著大于母鹅(P=0.032),其他3个基因均无性别差异。检测的4个基因中仅IGFBP-3 mRNA表达和腿肌率呈极显著正相关,提示70日龄时IGFs系统可能通过IGFBP-3发挥对鹅腿肌生长的调节作用。[结论]为鹅骨骼肌生长发育研究工作提供理论依据。 相似文献
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为探讨鸭疫里默氏菌的可能致病机制,本试验采用显微镜观察鸭疫里默氏菌感染后鸭盲肠组织的形态结构变化,并对肠黏膜厚度、肠绒毛高度及隐窝深度进行测量和统计,采用实时荧光定量PCR法检测鸭疫里默氏菌感染后盲肠组织中TLR4信号通路相关基因的表达变化。病理学观察结果显示,鸭疫里默氏菌感染后肠道结构有明显的损伤,表现为肠绒毛脱落、淤血、出血、淋巴细胞浸润和淋巴细胞增生;统计结果表明,2 d时,鸭疫里默氏菌感染组的肠黏膜厚度(383.58 μm)显著低于对照组(643.39 μm)(P<0.05);2和5 d时,感染组的肠绒毛高度(173.04和168.68 μm)均显著低于对照组(355.79和276.54 μm)(P<0.05);9 d时,鸭疫里默氏菌感染组的绒毛高度/隐窝深度的比值(3.42)显著低于对照组(5.34)(P<0.05)。实时荧光定量PCR结果显示,鸭疫里默氏菌感染后2和5 d,TLR4信号通路相关基因TLR4、MD2、MyD88、TRAF6、NF-κB、IL-4和IL-8 mRNA的表达量上调。说明鸭疫里默氏菌感染可导致盲肠的肠黏膜组织物理损伤和炎性病变,且TLR4信号通路参与了该炎性反应过程。 相似文献
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中国受威胁地方鸡品种的遗传多样性 总被引:8,自引:0,他引:8
对我国8个受威胁地方鸡品种(西双版纳斗鸡、高脚鸡、漳州斗鸡、浦东鸡、北京油鸡、静宁鸡、灵昆鸡、吐鲁番鸡)的遗传变异进行了微卫星多态性研究。结果表明:8个受威胁地方鸡品种的杂合度都较高,最高的是吐鲁番鸡(0.6849),最低的是灵昆鸡(0.6168),而且杂合度的高低与多态信息含量(PIC)的大小体现了较高的一致性;通过计算遗传距离珐发现8个品种的遗传距离较远;UPGMA的聚类分析结果与几个鸡品种的来源、分化、选育历史及地理分布是一致的。这些地方品种的遗传多样性极其丰富,各具特色,应根据各品种受威胁程度进行必要的紧急保护,将其转变为安全遗传资源。 相似文献
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研究旨在分析我国地方鹅品种资源遗传多样性保护等级,为更好地制定我国地方鹅品种资源保护方案提供理论依据。采用25个微卫星标记计算我国14个地方鹅品种(太湖鹅TH、永康灰鹅YK、百子鹅BZ、酃县白鹅LX、闽北白鹅MB、长乐鹅CL、兴国灰鹅XG、豁眼鹅HY、雁鹅YE、浙东白鹅ZD、广丰白翎鹅GF、丰城灰鹅FC、莲花白鹅LH、皖西白鹅WX)间DA遗传距离、基因流(Nm)、有效等位基因数(Ne)、杂合度(Ho)和多态信息含量(PIC),并采用Weitzman和Caballero两种遗传多样性保护理论,分析了各品种在遗传多样性最大化保护中的相对重要性。25个微卫星座位平均有效等位基因数为8.12,平均多态信息含量为0.581。14个地方鹅种的平均观察杂合度为0.6808,雁鹅观察杂合度最低(0.5662),百子鹅观察杂合度最高(0.7748);丰城灰鹅与浙东白鹅之间的遗传距离最小(0.2188),太湖鹅与永康灰鹅之间的遗传距离最大(0.7388)。Weitzman保护理论分析结果表明永康灰鹅、酃县白鹅、太湖鹅、百子鹅和雁鹅的品种贡献率较高(10.0%),Caballero保护理论分析认为太湖鹅、永康灰鹅、百子鹅、酃县白鹅和闽北白鹅具有较高的贡献率(0.5%),与Weitzman保护理论确定的等级顺序存在一定差异,主要原因是Weitzman保护理论没有考虑到品种内遗传多样性。我国地方鹅品种资源不仅具有丰富的品种间遗传多样性,品种内遗传多样性也较为丰富,在分析保护等级时,应两者兼顾。 相似文献
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中国10个地方蛋鸭品种遗传多样性及动态保种的研究 总被引:3,自引:2,他引:3
通过资源调查,查明了我国11个地方蛋鸭品种的保存现状,发现文登鸭已濒临灭绝,其他10个蛋鸭品种均处于正常保种状态。利用筛选出的28个多态性较好的微卫星标记,对我国10个地方蛋鸭品种的遗传多样性进行检测。根据等位基因频率计算各群体的平均基因杂合度、多态信息含量和群体间的Ds遗传距离。结果表明:28个微卫星位点中有26个微卫星位点在10个鸭群体中的多态信息含量均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于各品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。10个鸭品种中,平均基因杂合度为0.514~0.617,各品种的杂合度均较高,最高的为三穗鸭,最低的是金定鸭;用UPGMA法对Ds遗传距离进行聚类分析,结果10个蛋鸭品种被聚为3类,福建省的山麻鸭、莆田黑鸭、连城白鸭聚为一类;湖北省的荆江麻鸭、恩施麻鸭和贵州省的三穗鸭聚为一类;山东省的微山麻鸭、湖南省的攸县麻鸭和浙江省的绍兴鸭聚为一类。根据调查结果及遗传多样性检测数据,分析了10个地方蛋鸭品种的保存状态,并提出了保护建议。 相似文献
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影响微卫星分析家禽遗传多样性有关因素的探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
微卫星现为我国家禽分子生物学研究领域中的一大热点,在利用微卫星分析家禽遗传多样性时,其试验结果会受到采样、引物选择及数据分析等因素的影响。本文结合自身用30个微卫星对我国76个地方鸡种进行遗传多样性分析时的具体情况分别进行阐述。并指出要克服这些因素的影响,采样时尽量选择有品种代表性的群体,采样数达60羽,公母比1:4;选择的引物应分散在不同的染色体上,引物的个数应不低于25对;在凝胶条带判型时最大限度的减少认为因素;数据分析应用规范、大家广泛使用认可的生物学软件。 相似文献
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高温条件下涂膜贮存对鸡蛋保鲜效果的影响 总被引:2,自引:1,他引:2
选择具抑菌作用的壳聚糖为保鲜剂,对产后24h内褐壳鸡蛋进行涂膜处理,研究高温条件下鸡蛋的保鲜效果。结果表明:保存25d,对照组蛋壳表面菌落总数为6.9×10^44 cfu/g,大肠菌群为132MPN/100g;蛋清、蛋黄混合物菌落总数为5.6×10^44cfu/g,大肠菌群为112MPN/100g,超过鲜蛋卫生标准和绿色鸡蛋标准,但壳聚糖组蛋壳表面和蛋清蛋黄混合物菌落总数、大肠菌群均未超过鲜蛋卫生标准和绿色鸡蛋标准;保存25d时,对照组出现散黄蛋,哈氏单位仪检测均为阴性,壳聚糖处理组降为次鲜蛋;壳聚糖组鸡蛋失重率、蛋黄指数均优于对照组。壳聚糖能有效抑制细菌繁殖,具有延长鸡蛋保质期的作用。 相似文献
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本研究根据金定鸭个体蛋质量情况,选择2种极端表型,分为高蛋质量组(WH)和低蛋质量组(WL)。基于混池全基因组重测序和选择清除分析技术筛选组间差异显著基因组区域内的单核苷酸多态性(SNP)位点及相关功能基因,并通过单个样本重测序对筛选的蛋质量相关SNP进行验证,分析各SNP位点不同基因型之间的蛋质量大小差异。研究发现,在低蛋质量组和高蛋质量组获得的高质量reads数量分别为194 115 424和228 089 084,共定位到SNP差异显著区间178个,共富集到受选择候选基因40个,而且这些区间和基因均位于Z号染色体。鉴定出候选基因ARSB上Z-22908831、Z-22966695突变位点显著影响300 d、450 d蛋质量,RORB上Z-35251072、Z-35256947突变位点显著影响450 d蛋质量,RORB上Z-35278196突变位点显著影响300 d、450 d蛋质量,RASEF上Z-39588570突变位点显著影响450 d蛋质量。本研究结果为通过分子育种技术提高蛋鸭产蛋性能选育提供了依据,加快了选育进程。 相似文献