葡萄Fe-S簇装配基因的鉴定、克隆和表达特征分析     

张璐  宗亚奇  徐维华  韩蕾  孙浈育  陈朝晖  陈松利  张凯  程杰山  唐美玲  张洪霞  宋志忠 《中国农业科学》2021,54(23):5068-5082

【目的】从葡萄中克隆并鉴定Fe-S簇装配基因,在转录水平探索其组织特异性表达特征及其对缺铁胁迫的差异响应,明确主效基因。【方法】通过同源克隆法,在葡萄基因组中筛选并鉴定参与Fe-S簇装配的基因;借助生物信息学软件分析葡萄Fe-S簇装配相关基因及其编码蛋白的详细特征;利用实时荧光定量PCR分析Fe-S簇装配相关基因在葡萄不同组织部位的表达模式及其对缺铁胁迫的响应情况;利用MEGE 7.0软件建立不同植物ISU1同源蛋白的系统进化树。【结果】在葡萄基因组中检索并克隆获得46个Fe-S簇装配基因,分布于16条染色体上,含有1—21个长度不一的内含子,且主要分布于质体、线粒体和细胞质,分别含有14、21和11个基因成员;葡萄Fe-S簇装配蛋白在多种亚细胞结构中均有定位,且不同装配机制中蛋白的亚细胞定位情况差异很大;所选10种植物ISU1蛋白序列的一致性高达77%,系统发育树分析表明同一属的ISU1同源蛋白如十字花科的拟南芥和盐芥、禾本科的水稻和短柄草、蔷薇科的桃和苹果,倾向于紧密聚在一起,但葡萄ISU1和番茄ISU1紧密聚集在一起;葡萄Fe-S簇装配基因在3年生‘马瑟兰’成年树体和组培幼苗不同组织中的表达水平差异较大,其中,ISU1整体水平的表达量最为丰富（尤其是成熟期果实中的表达量最高）,其次是HSCA1、ISA2、NFU2、SUFA和SUFB等基因,而SUFE2、NFS1、HSCA2、HSCA6、TAH18和CIA2在本研究所有葡萄组织中均未检测到表达量;在‘马瑟兰’幼苗中,葡萄Fe-S簇装配基因对缺铁处理较为敏感,所有基因至少在1个检测的组织部位对缺铁处理有响应,其中,22个基因的表达水平在所有检测组织中均受缺铁处理调控：根部Fe-S簇装配基因的表达水平易受缺铁胁迫诱导而上调,但地上部（茎和叶）Fe-S簇装配基因的表达水平易受缺铁胁迫抑制而下调。【结论】从葡萄中克隆并鉴定了46个Fe-S簇装配基因,分别定位于质体、线粒体和细胞质;葡萄Fe-S簇装配基因在三年生成年树体和组培幼苗不同组织中的表达水平差异较大,且在葡萄幼苗不同组织中的转录水平对缺铁胁迫的响应具有显著差异;ISU1在葡萄所有组织中的整体表达量较高;葡萄ISU1和番茄ISU1同源蛋白遗传进化距离最接近。  相似文献   

五种西方蜜蜂品种形态指标差异性比较     

宗德琴  罗凌娟  张祖芸  张学文  梁铖  宋文菲 《蜜蜂杂志》2014,(3):6-9

采集吉林的东北黑蜂×意蜂、云南景洪的浙大蜜浆蜜胶、云南景洪的白山6号、云南个旧蛮耗的本地王和云南蒙自草坝的浙大蜜浆高产5种西方蜜蜂子代工蜂共8群样本,每群测定分析15只,测定每只工蜂38个形态指标。结果表明不同生产性能的西方蜜蜂在形态特征上都表现出差异性(P≤0.01,或0.01P≤0.05,或P0.05),通过实验,为蜜蜂生产上培育杂种优势西方蜜蜂品种提供有力的理论依据。  相似文献   

酵母硒和亚硒酸钠对蛋鸡蛋硒含量动态变化的影响     

卢建  王克华  曲亮  童海兵  沈曼曼  李尚民  窦套存  胡玉萍 《动物营养学报》2014,(12):3740-3746

本试验旨在研究酵母硒和亚硒酸钠对蛋鸡蛋硒含量动态变化的影响。试验选用30周龄体况良好、产蛋率接近健康的海兰褐蛋鸡216只,随机分成3个组,每组6个重复,每个重复12只。对照组饲喂基础饲粮(不额外添加硒源),试验组在基础饲粮中分别添加0.30 mg/kg硒的亚硒酸钠和酵母硒。预试期14 d,正试期56 d。结果表明:1)各试验组产蛋率、平均蛋重、平均日产蛋重、平均日采食量、死亡率和料蛋比与对照组相比较差异均不显著(P>0.05)。2)正试期第56天,试验组常规蛋品质与对照组相比较差异不显著(P>0.05)。3)正试期第3天,酵母硒组蛋硒含量显著高于对照组和亚硒酸钠组(P<0.05);14 d后,亚硒酸钠组蛋硒含量显著高于对照组(P<0.05);正试期第3、5、7、14、21、28和56天,酵母硒组蛋硒含量比亚硒酸钠组分别显著高出了28.18%、34.98%、45.35%、47.39%、67.53%、63.35%和65.71%(P<0.05)。4)随着试验天数的增加,对照组蛋鸡蛋硒含量显著降低(P<0.05),亚硒酸钠组蛋鸡蛋硒含量呈现先降低后增加的趋势(P<0.05),酵母硒组蛋鸡蛋硒含量显著增加(P<0.05)。由此可见,33~40周龄,蛋鸡饲粮中不额外添加硒以及添加0.30 mg/kg硒的酵母硒和亚硒酸钠对生产性能和蛋品质无不良影响;相对于亚硒酸钠,酵母硒中硒向鸡蛋中的转移速度更快,效率更高;饲粮添加硒能显著提高蛋硒含量,且饲粮添加酵母硒时蛋硒含量随着饲喂天数的增加而增加。  相似文献   

酵母硒和亚硒酸钠对蛋鸡生产性能、蛋品质和蛋硒含量的影响     

蔡娟  卢建  施寿荣  童海兵  王强  常玲玲  沈曼曼  陈大伟 《动物营养学报》2014,(12):3793-3798

本试验旨在比较酵母硒和亚硒酸钠对蛋鸡生产性能、蛋品质和蛋硒含量的影响,以确定能够替代亚硒酸钠的酵母硒适宜使用量。试验选用30周龄体况良好、产蛋率接近的健康海兰褐蛋鸡360只,随机分成5个组,每组6个重复,每个重复12只。对照组饲喂基础饲粮(不额外添加硒源),试验组饲喂在基础饲粮中分别添加0.30 mg/kg硒的亚硒酸钠以及0.10、0.20和0.30 mg/kg硒的酵母硒(试验饲粮中实测硒含量分别为0.176、0.342、0.278、0.302、0.359 mg/kg)。预试期14 d,正试期28 d。结果表明:1)各试验组产蛋率、平均蛋重、平均日产蛋重、平均日采食量、料蛋比和蛋品质与对照组相比较差异均不显著(P>0.05)。2)亚硒酸钠组和酵母硒组蛋硒含量均显著高于对照组(P<0.05);酵母硒组蛋硒含量均显著高于亚硒酸钠组(P<0.05),并随酵母硒添加量的增加显著增加(P<0.05)。由此可见,相对于亚硒酸钠,蛋鸡对酵母硒吸收和向鸡蛋中的转移效率更高;饲粮添加硒能显著提高蛋硒含量,且蛋硒含量随着酵母硒添加量的增加而增加;饲粮中添加0.10~0.30 mg/kg硒的酵母硒对蛋鸡生产性能和蛋品质无不良影响。  相似文献   

浅议我国对流浪动物的管理     

班曼曼  郑海红  贾广敏 《中国动物检疫》2014,31(10):38-40

我国宠物数量的快速增长,带来庞大了的流浪动物群。流浪动物群体的不断增长不仅影响着城市面貌,也给社会公共卫生安全埋下了隐患,引起了广泛的社会关注。通过研究我国流浪动物现状及不同国家和地区对流浪动物的立法及管理措施,针对我国流浪动物存在的隐患和管理问题,探讨我国流浪动物的管理措施和对策,以提高我国流浪动物管理水平,维护公共卫生安全。  相似文献   

缓释肥处理下麦田土壤细菌和真菌群落对气候变化的响应          下载免费PDF全文

任宏芳  王璐  郝兴宇  张东升  宗毓铮  李萍 《中国土壤与肥料》2022,(10):50-63

采用控制系统来模拟未来大气CO₂浓度和气温升高的气候变化情景,借助基于半导体芯片技术的IonS5TMXL测序平台并结合相关生物信息学方法对气候变化背景下缓释肥处理的麦田土壤进行16S rRNA细菌V4区和18S rRNA真菌ITS区测序分析,探究了缓释肥处理下麦田土壤细菌和真菌对气候变化的响应。结果显示,所有样品测序后获得细菌和真菌平均有效序列数分别是80543和64303个,平均OTUs分别是3149和1161个。Alpha多样性分析显示,大气CO₂浓度升高小麦土壤细菌的Shannon和Chao1指数均降低,而土壤真菌在各气候环境下均无显著差异。主成分分析显示,各处理下土壤细菌群落结构差异不明显,真菌群落结构在气温升高时差异明显。缓释肥处理与普通肥相比,土壤细菌和真菌的Alpha多样性及群落结构在不同气候条件下均没有差异。菌群分类学表明,小麦土壤的优势细菌门为变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和酸杆菌门,主要的优势细菌属有9种;优势真菌门为子囊菌门、被孢菌门和担子菌门,主要的优势真菌属有7种。大气CO₂浓度升高条件下,施用普通尿素使变形菌门和鞘氨醇单胞菌属的相对丰度分别增加10.34%和46.27%。在对照温度对照CO₂浓度条件下,缓释肥处理比普通肥处理使子囊菌门和毛壳菌属相对丰度分别显著增加39.85%和295.33%;在升高温度对照CO₂浓度条件下,缓释肥处理比普通肥处理使子囊菌门和毛壳菌属分别增加33.16%和154.49%。CO₂对变形菌门、鞘氨醇单胞菌属和毛壳菌属的影响达显著水平。在各气候变化环境下,各土壤理化性质均有所改善;与普通氮肥相比,缓释氮肥处理在各气候环境下土壤有机质、碱解氮和全氮含量降低,土壤有效磷和总磷含量升高。冗余分析表明,土壤细菌群落结构主要受土壤全氮和盐分含量的影响,而真菌群落结构主要受土壤pH和有效磷含量的影响。研究结果表明,未来气候环境变化对土壤微生物群落的影响大于缓释肥处理。该结果加深了缓释肥对土壤微生物群落结构和多样性影响的认识,为未来气候环境变化下缓释肥推广使用提供理论依据。  相似文献   

In vitro Selection of DNAAptamers and Fluorescence-Based Recognition for Rapid Detection Listeria monocytogenes     

LIU Guo-qing  ;LIAN Ying-qi  ;GAO Chao  ;YU Xiao-feng  ;ZHU Ming  ;ZONG Kai  ;CHEN Xue-jiao  ;YAN Yi 《中国农业科学(英文版)》2014,(5):1121-1129

Aptamers are specific nucleic acid sequences that can bind to a wide range of nucleic acid and non-nucleic acid targets with high affinity and specificity. Nucleic acid aptamers are selected in vitro from single stranded DNA or RNA ligands containing random sequences of up to a few hundred nucleotides. Systematic evolution of ligands by exponential enrichment （SELEX） was used to select and PCR amplify DNA sequences （aptamers） capable of binding to and detecting Listeria monocytogenes, one of the major food-borne pathogens. A simplified affinity separation approach was employed, in which L. monocytogenes in exponential （log） phase of growth was used as the separation target. A fluorescently-labeled aptamer assay scheme was devised for detecting L. monoeytogenes. This report described a novel approach to the detection of L. monocytogenes using DNA aptamers. Aptamers were developed by nine rounds of SELEX. A high affinity aptamer was successfully selected from the initial random DNA pool, and its secondary structure was also investigated. One of aptamers named e01 with the highest affinity was further tested in aptamer-peroxidase and aptamer-fluorescence staining protocols. This study has proved the principle that the whole-cell SELEX could be a promising technique to design aptamer-based molecular probes for dectection of pathogenic microorganisms without tedious isolation and purification of complex markers or targets.  相似文献   

Nitrogen Deficiency Limited the Improvement of Photosynthesis in Maize by Elevated CO₂ Under Drought     

ZONG Yu-zheng  SHANGGUAN Zhou-ping 《中国农业科学(英文版)》2014,(1):73-81

Global environmental change affects plant physiological and ecosystem processes. The interaction of elevated CO2, drought and nitrogen （N） deficiency result in complex responses of C4 species photosynthetic process that challenge our current understanding. An experiment of maize （Zea mays L.） involving CO2 concentrations （380 or 750 μmol mol1, climate chamber）, osmotic stresses （10% PEG-6000, -0.32 MPa） and nitrogen constraints （N deficiency treated since the 144th drought hour） was carried out to investigate its photosynthesis capacity and leaf nitrogen use efficiency. Elevated CO2 could alleviate drought-induced photosynthetic limitation through increasing capacity of PEPC carboxylation （Vp~,x） and decreasing stomatal limitations （SL）. The N deficiency exacerbated drought-induced photosynthesis limitations in ambient CO2. Elevated CO2 partially alleviated the limitation induced by drought and N deficiency through improving the capacity of Rubisco carboxylation （Vmax） and decreasing SL. Plants with N deficiency transported more N to their leaves at elevated CO2, leading to a high photosynthetic nitrogen-use efficiency but low whole-plant nitrogen-use efficiency. The stress mitigation by elevated CO2 under N deficiency conditions was not enough to improving plant N use efficiency and biomass accumulation. The study demonstrated that elevated CO2 could alleviate drought-induced photosynthesis limitation, but the alleviation varied with N supplies.  相似文献   

山东省城市开发建设项目雨水综合利用研究     

宗萍萍  周士勇 《安徽农业科学》2014,(28):9877-9878

山东省雨水资源匮乏,对城市开发建设项目采取雨水综合利用,不仅可以缓解水资源危机,有效减少地表径流,减轻城市排水和河道行洪压力,而且能够从源头上控制城市水体污染.对山东省开发建设项目雨水综合利用现状及存在的问题进行分析,结合不同类型城市开发建设项目的特点,总结出了山东省城市建筑小区建设、交通道路建设、公共设施建设、公园与景观绿地建设雨水综合利用形式.  相似文献   

一个籼稻叶夹角新基因的激素敏感性分析和基因定位     

廖慧敏  张启军  秦海龙  夏士健  宗寿余  高艳红  吕川根 《江苏农业学报》2014,(6)

本研究对一个叶夹角变小、叶片短而直立的突变体ser(Short and erect)进行了植物激素敏感性试验和基因定位。激素试验结果表明,ser对赤霉素(Gibberellic acid,GA)敏感而对油菜素内酯(Brassinolide,BR)敏感性降低。遗传分析结果表明,ser的直立叶性状受1对隐性单基因ser控制。在ser×08CR578 F2群体中,利用分子标记将ser基因定位在水稻第5染色体长臂上的标记RM3437与RM5454之间,ser基因距离2个标记的遗传距离分别为5.3c M和1.5 c M;在ser×L604 F2群体中,ser基因定位于第5染色体上标记RM18504与RM1237之间,距离2个标记的遗传距离分别为1.5 c M和2.1 c M。在2个群体中,ser基因均与标记RM18532共分离。本研究为进一步精细定位与克隆ser基因奠定了基础,也为解析水稻叶夹角变化机制及选育高产理想株型水稻提供了理论支撑和基因资源。  相似文献