山羊高繁殖力候选基因骨形态发生蛋白受体I B的多态性分析     

钱丽丽  贾青  李雪梅 《中国草食动物》2010,(Z1)

BMPR-IB基因中的A746G突变与Booroola绵羊高繁殖力完全相关.为了研究该基因与山羊繁殖力的关系,试验采用PCR-SSCP方法对河北中部本地山羊中不同繁殖力群体的BMPR-IB基因进行多态性检测.并通过BLAST、BioEdit、DNasp等生物软件对山羊、绵羊、人等6个物种BMPR-IB基因的CDS序列进行了生物信息分析.结果发现在供试山羊不同繁殖力群体BMPR-IB基因不存在A746G的突变,生物信息学分析发现35条序列闻存在370个多态位点,山羊和绵羊间的核苷酸歧义度和遗传距离是各物种间最小的.  相似文献   

清远麻鸡PGC-1α基因多态性与肉质性状的相关性分析     

刘宏祥束婧婷  李慧芳陈宽维 王金玉 《中国农学通报》2011,27(7):314-321

[目的]PGC-1α基因是影响肉品质的关键基因。本文对清远麻鸡PGC-1α基因的多态性进行了研究,希望找出对肉品质有较大影响的突变位点,为下一步进行蛋白质功能验证打下基础。[方法]利用PCR-SSCP和PCR-LDR方法找出清远麻鸡PGC-1α基因的多态性位点,将所测得的肉品质指标脂肪含量、剪切力和胸肌失水率按照不同基因型进行方差分析与多重比较,分析不同基因型对肉品质的影响。[结果]筛查出了清远麻鸡的两个多态性位点SNP1和SNP2,均为G到A的突变。其中SNP1为内含子的突变,SNP2为外显子8上的有义突变。SNP1对肉品质没有显著影响,SNP2对胸肌系水力有显著影响。母鸡的肉品质要高于公鸡的,其中剪切力指标性别之间差异极显著。至于SNP2,AG型的肉品质要好于AA型和GG型的。  相似文献   

促性腺激素释放激素受体(GnRHR)基因多态性及其与济宁青山羊高繁殖力关系   总被引：1，自引：0，他引：1  

储明星  肖杰文  狄冉  李学伟  方丽  马月辉  李奎 《农业生物技术学报》2009,17(2):218-223

设计8对引物, 应用聚合酶链式反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）技术检测促性腺激素释放激素受体（gonadotropin releasing hormone receptor, GnRHR）基因外显子1、外显子2和外显子3在高繁殖力山羊(Caprar hircus)品种（济宁青山羊）和低繁殖力山羊品种（安哥拉、波尔和内蒙古绒山羊）中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果发现引物P4扩增片段具有多态性,其余7对引物的扩增片段都不存在多态性。对于引物P4扩增片段,在济宁青山羊、波尔山羊和内蒙古绒山羊中均检测到AA、AB和BB基因型,而在安哥拉山羊中只检测到AA和AB基因型,未检测到BB基因型;测序分析发现BB型与AA型相比在外显子1有1个突变（757G→A）,但未引起氨基酸改变;济宁青山羊AA、AB和BB基因型频率分别为0.623、0.300和0.077,BB型济宁青山羊平均产羔数比AB型和AA型分别多0.69只（P　<　0.05）和0.82只（P　<　0.05）,AA型和AB型济宁青山羊产羔数的最小二乘均值差异不显著（P　>　0.05）。  相似文献   

尼罗罗非鱼2个Dmrt基因的序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

杨东  刘红艳  张繁荣  余来宁 《湖北农业科学》2009,48(2)

参照不同物种DM结构域设计了一对兼并引物,扩增出一条带,长约150bp.对扩增产物进行克隆,阳性克隆采用SSCP分析筛选不同基因片段,进一步对筛选的不同基因进行了DNA测序.结果获得2个不同的Dmrt基因,采用BLAST方法与人类相应Dmrt基因进行序列比对,发现与人类相应Dmrt基因的氨基酸序列一致性分别为89.1%和100%.根据尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的拉丁文名,接习惯将其命名为onDmrt1,onDmrt2.与其他动物相关的Dmrt基因进行聚类分析,结果表明,不同进化地位动物的Dmrt基因DM域编码序列存在高度的同源性,显示Dmrt基因在系统进化上高度保守.序列上的相似性可能暗示着它们在功能上的保守性.  相似文献   

Diversity of pathogenic Fusarium populations associated with asparagus roots in decline soils in Spain and the UK     

J. Y. Wong  P. Jeffries 《Plant pathology》2006,55(3):331-342

Asparagus decline is a disease associated with several species of Fusarium . In order to assess the relative significance of causative species, single-stranded conformational polymorphism (SSCP) analysis of the ITS2 (internal transcribed sequence) region of the ribosomal DNA was used to rapidly and objectively identify the fusarial populations associated with the roots of two intensively sampled asparagus crops, one in the UK and the other in Spain. Over 360 fusarial isolates were obtained from fields showing symptoms of asparagus decline, and most were easily differentiated by SSCP into four principal species, F. oxysporum f. sp. asparagi , F. proliferatum , F. redolens and F. solani . Fusarium oxysporum f. sp. asparagi (Foa) was most frequently isolated from the UK site (69%), whilst Foa and F. proliferatum were found in similar proportions overall (40 and 39%, respectively) from the Spanish site, although individual fields showed considerable intraregional variation. Other minor populations, such as F. culmorum , were also found. Most isolates were highly pathogenic to asparagus in vitro , although F. solani isolates comprised both pathogenic and nonpathogenic populations. Two populations of Foa were distinguished by a single ITS2 base transition, and the dominance of these two populations differed between Europe and the USA. Fusarium proliferatum was more abundant in Spain than in the UK. Phylogenetic analysis using EF1α sequences indicated that isolates of F. oxysporum pathogenic to asparagus are spread across a number of clades within the species complex, supporting the hypothesis that pathogenicity to asparagus in this species is a relatively unspecialized trait.  相似文献   

绵羊朊蛋白等位基因多态性的研究     

张建辉  赵兴绪  吴润  柳纪省 《动物医学进展》2006,27(8):88-91

绵羊痒病的发生和易感性可受绵羊朊蛋白等位基因密码子136,154和171多态性的影响。利用SSCP电泳和非变性聚丙烯酰胺凝胶结合的方法对10只健康绵羊的朊蛋白等位基因154,171两个多态性位点进行检测,发现8只纯合子羊基因型为154RR171QQ,2只杂合子羊基因型为154RR171HR。表明该方法可以应用于此等位基因多态性的研究中。  相似文献   

罗氐沼虾3个Dmrt基因的序列分析   总被引：5，自引：0，他引：5       下载免费PDF全文

彭巧玲  蒲友光  程子华  聂刘旺 《中国水产科学》2005,12(1):5-9

Dmrt基因家族是一个与性别决定相关的基因家族。迄今，已在鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类等高等动物中检测到了Dmrt基因的存在。为了进一步探讨该家族在系统进化中的保守性，本研究采用简并PCR技术，扩增了罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)Dmrt基因的DM结构域。经序列分析，获得了Dmrt基因家族的3个成员，其编码序列分别与人DMRT2、DMRT3、DMRT14基因DM结构域编码序列的相似性分别为93％、80％和95％，根据罗氏沼虾的拉丁名分别命名为MrDmrt2、MrDmrt3、MrDmrt4。与其他动物相关的Dmrt基因进行聚类分析，结果表明，不同进化地位动物的Dmrt基因DM域编码序列存在高度的同源性，显示Dmrt基因在系统进化上高度保守，序列上的相似性可能暗示着它们在功能上的保守性。  相似文献   

蒙古马生长激素基因的克隆及部分序列的PCR-SSCP分析     

乌尼尔夫  张焱如  芒来 《黑龙江畜牧兽医》2008,(1):8-10

通过PCR-SSCP方法对7个品种285匹马的生长激素基因做了多态性分析,在所检测的5′端侧翼区、第一内含子、第二外显子和第五外显子4个位点中,仅第五外显子检测到多态,该多态位点由A和B两种等位基因控制.GH基因第1 719处1个T→C的突变和1 743处G→A的突变,导致等位基因B变为等位基因A.除纯血马外,A基因在各品种中均为优势等位基因,B基因为纯血马的优势基因.在此多态位点,乌珠穆沁马、乌审马和巴尔虎马处于Hardy-Weinberg平衡状态,纯血马、三河马和锡尼河马则未达到Hardy-Weinberg平衡状态.  相似文献   

大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子Ⅰ遗传多态性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

薛良义  李婷  孙升  肖章奎  沈秋静  童丽娟 《水产科学》2008,27(10)

肌肉生长抑制素是控制骨骼肌生长发育的重要细胞因子,采用PCR-SSCP和测序方法分析了大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子I的单核苷酸多态性,结果发现,外显子I有7个多态性位点,分别是270(G→A)、196(C→T)、349(A→T)、51(T→C)、352(G→A)、348(C→T)和264(G→T),但只有349位点和352位点的碱基突变造成错义突变,氨基酸变化分别为T→S和E→K,其他位点均属同义突变。存在7种基因型,它们的频率分别为0.2708、0.0833、0.3333、0.0208、0.1667、0.1047和0.0208,该基因位点的杂合度为0.709。统计分析表明,外显子I无论是基因型水平上的多态性还是氨基酸水平上的突变均与体长和体质量呈显著性相关(P<0.05),但与肌肉脂肪含量无显著相关(P>0.05)。  相似文献   

利用SSCP技术分析棉花纤维差异表达的基因   总被引：1，自引：1，他引：1  

谢晓兵  于霁雯  吴嫚  翟红红  范术丽  宋美珍  庞朝友  李兴丽  张金发  喻树迅 《棉花学报》2011,23(4):306-310

 单链构象多态性(Single strand conformation polymorphism,SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,可以检测出在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中因构象差异而导致的单链DNA片段迁移率的不同。本研究根据棉花基因芯片筛选的纤维发育中差异表达基因设计了162对引物,利用SSCP技术在4个陆地棉品种、4个海岛棉品种中进行多态性检测。结果表明,在162对引物中,146对引物经PCR扩增后在1.5%的琼脂糖凝胶电泳中检测出现清晰、明亮的带。经过SSCP分析,54对引物在陆地棉之间产生多态性,共出现116个多态性位点;45 对引物在海岛棉之间产生多态性,共出现111个多态性位点;79对引物在陆地棉和海岛棉之间产生多态性,共出现260个多态性位点;36对引物在陆地棉之间、海岛棉之间同时出现多态性。进一步聚类分析后表明,海岛棉和陆地棉分别聚在了一起。  相似文献