一品红转化酶基因片段的克隆和序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

苏家乐  俞菊  梁国华 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》2006,27(3):87-89

根据植物酸性转化酶基因的保守区序列,设计1对PCR引物,以一品红基因组DNA为模板,采用PCR方法扩增出长约500 bp的DNA片段,克隆入pM D-18T载体,测序结果表明:获得1个一品红酸性转化酶基因家族的成员,该基因片段长523 bp,编码173个氨基酸,属于开放阅读框的一部分,不含内含子。在G enB ank中进行同源性检索的结果表明,该成员编码的氨基酸与其他植物细胞壁酸性转化酶编码的氨基酸同源性较高。  相似文献   

根癌农杆菌胁迫下多花蔷薇（Rosa multiflora'Inermis 4'）的基因表达分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

赵小兰  苏晓华  田传卫  赵梁军 《中国农业科学》2005,38(7):1425-1430

  多花蔷薇无刺4号（Rosa multiflora'Inermis 4'）对根癌病有较强抗性。以根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)接种多花蔷薇无刺4号为目的材料,刺伤处理为对照,采用抑制差减杂交（suppression subtractive hybridization,SSH）方法,构建了富集多花蔷薇根癌病抗性相关基因的差减cDNA文库。差异筛选差减cDNA文库后,随机选取增强表达的92个克隆进行测序,去除冗余的cDNA和病菌的基因片段,共得到53个单一序列。利用GenBank数据库进行核酸和蛋白质同源性比较,获得的cDNA片段功能涉及：细胞分裂、生长（22个克隆）,逆境防御、信号转导及激素调节（11个克隆）以及初生与次生代谢（10个克隆）。另有10个基因片段功能未知,可能为新的EST。根据测序及比对分析结果,对多花蔷薇无刺4号抗根癌病的分子机理进行了探讨。  相似文献   

Cloning,Expression and Bioinformatics Analysis of Enterococcus faecalis from Northeast Black Bear     

QIN Xiao-dong  CHU Xi-tong  LU Cheng  SUN Fu-liang  SUN Xing-zhong 《中国畜牧兽医》2017,44(8):2248-2254

In order to detect Enterococcus faecalis endocarditis antigen (EfaA) of bear that was used to disclose the infected Northeast Black bear immediately, a pair of PCR primers was synthesized by EfaA gene of Enterococcus faecalis that was recorded in GenBank (accession number:U03756.1) and the target fragment was 689 bp. The PCR product was cloned by pMD19-T vector, then was transferred to Escherichia coli DH5α competent cells and the positive clones were filtered. Recombinant plasmid (pMD19-T-EfaA) was extracted. Identification of PCR and digestion, sequencing, the structure prediction of proteins were operated. The results showed that EfaA gene was cloned successfully, and the gene homology with ATCC 29212 was 100.0%. pMD19-T-EfaA was constructed successfully, structure of proteins was predicted. This study provided theoretical basis for diagnostic methods of Enterococcus faecalis and laid basis for prevention and control of Northeast Black bear disease.  相似文献   

猪乙脑病毒HW株的全基因组克隆及分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

付文鹏  陈建军  岳桂平  熊东海  徐涤平  杨在清 《华中农业大学学报》2006,25(2):117-119

流行性乙型脑炎(Japanese encephalitis virus,JEV)是一种中枢系统人畜共患急性传染病,由蚊为媒介传播,以高热和狂暴或沉郁等神经症状为特征[1],猪患乙型脑炎的主要症状表现为怀孕母猪流产,产死胎或弱仔,公猪则患睾丸炎,仔猪呈神经症状,使养猪业遭受巨大损失。1988年我国学者方  相似文献   

犬瘟热病毒疫苗株附着蛋白基因的克隆及同源性比较     

王卓聪  苏凤艳  宗春苗  王全凯 《经济动物学报》2006,10(4):219-222

根据发表的犬瘟热病毒(CDV)参考株Ondetstepoort的序列设计1对引物,以犬瘟热病毒疫苗株感染Vero细胞总RNA为模板,利用RT-PCR扩增出附着蛋白基因843 bp片段,将这个片段连接到pMD18-T载体上,经过PCR鉴定、酶切鉴定得到1个阳性克隆,将阳性质粒进行序列测定,结果表明,该片段与Onderstepoort株核苷酸同源性为95.9%。从基因角度为犬瘟热的预防、诊断和治疗提供理论依据。  相似文献   

水貂12S rRNA基因的克隆     

王红梅  白秀娟 《经济动物学报》2006,10(4):193-195

为探讨水貂的系统发育关系,对金州水貂的12S rRNA基因进行了克隆测序,序列长度为450 bp。结果表明,金洲水貂的12S rRNA基因与伶釉的同源性为92.48%,与林釉的同源性为91.83%,与北美水貂的同源性为90.99%,与獾的同源性为90.99%。  相似文献   

大豆铁蛋白cDNA的克隆及植物表达载体的构建   总被引：1，自引：0，他引：1  

王永斌  郭长虹  郭东林  蔡秋艺  张爽  李集临  林红 《大豆科学》2006,25(4):454-457

以大豆为材料,利用RT-PCR法扩增得到大小约750bp的片段,将这个片段连接到克隆载体pBlueskript SK＋上进行测序,结果证明,此片段就是大豆的铁蛋白基因。将此片段再正向插入到植物表达载体pBI121的CaMV35s启动子和NOS终止子之间,构建了植物表达载体pBIFe,并成功地将该载体导入根癌农杆菌EHA105。此项工作为获得表达铁蛋白的转基因植物奠定了基础。  相似文献   

鹅细小病毒四平分离株VP3基因的克隆与序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

张鑫  李柏岁  徐佳  李长瑜  王淳玉  胡桂学 《吉林农业大学学报》2006,28(4):436-439

根据已发表的鹅细小病毒(GPV)核苷酸序列,设计并合成了1对引物,对吉林农业大学预防兽医学研究室分离鉴定的GPV四平株(SP)主要保护性抗原蛋白VP3基因进行扩增。所得到的PCR产物片段大小约1.6 kb,与预期片段大小相符。将该片段纯化后与T载体连接,转化到感受态大肠杆菌JM-109中进行克隆。对所提质粒进行快速鉴定、PCR鉴定以及限制性内切酶NheⅠ和BamHⅠ双酶切鉴定,筛选阳性重组质粒,对重组质粒测序并进行核苷酸序列分析。结果表明:GPV四平株VP3基因长1 605 nt,包含了完整编码GPV VP3蛋白阅读框,且与国内GPV分离株B,GD,HG5/82相应核苷酸序列和氨基酸序列的同源性较高,分别为96.2%,96.3%,96.4%和97.4%,98.7%,98.9%。据此认为,GPV四平株VP3基因可以作为构建具有普遍应用价值的基因工程疫苗的候选基因。  相似文献   

卵形鲳鲹TLR13基因的克隆、表达分析和亚细胞定位研究          下载免费PDF全文

毛美琴  蓝桢宇  黄凤萍  郭锡燚  乐蒙  胥鹏  吴颖瑞  彭银辉  蔡小辉 《渔业科学进展》2023,44(3):85-96

Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)是一种古老的先天性免疫受体,参与病原体相关分子模式识别,对维持免疫稳态和预防感染至关重要。本研究克隆和鉴定了卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)TLR13基因(命名为ToTLR13),其开放阅读框(ORF)为1 269 bp,编码422个氨基酸,等电点为8.13。保守结构域分析显示,ToTLR13含有跨膜结构域(TM)、LRR结构域和TIR结构域,符合TLR家族的典型特征。通过建立TLR13保守域三级结构发现,ToTLR13与小鼠(Mus musculus)和大黄鱼(Larimichthys crocea) TLR13功能结构域的蛋白三级结构具有较高重叠性。多序列比对显示,ToTLR13与其他硬骨鱼TLR13具有较高的相似性,与其他纲物种的序列相似性较低。系统进化树结果显示,To TLR13与硬骨鱼TLR13聚在一起,其中与鞍带石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)最为接近,与哺乳动物、两栖类和贝类相分离。实时荧光定量PCR (Real-time fluorescence quantitativ...  相似文献   

玉米轴色突变体698-3R的遗传鉴定     

余学杰  李开兵  张玉  柯永培  蔡林  石海春 《西北农业学报》2020,30(6):860-869

以辐射诱变获得的玉米红轴突变体698-3R为材料,通过遗传交配设计分析轴色的遗传规律,利用SSR-BSA法初步定位轴色基因,并对候选基因进行克隆和表达分析。结果表明:(1)突变体698-3R的红轴对白轴性状表现为显性遗传,受一对核基因控制,初步定位在第一染色体上的SSR标记phi095与umc1452之间,与phi095相距3.9cM,与umc1452相距7.1cM,将该基因暂定名为C(t);(2)以轴色基因 P1的cDNA为模板克隆C(t),发现698-3R有3个C(t)转录本,而野生型698-3中至少有2个;预测氨基酸序列比对发现,698-3R中3个C(t)蛋白的氨基酸序列与已知P_1-wr蛋白一致,突变使其获得完整的MYB结构域和酸性激活域,而野生型698-3中698-3-P-1蛋白由于编码序列缺失导致移码突变,不具有该功能结构域;(3)对C(t)基因qRT-PCR分析发现,除25DAP外,其余4个时期在698-3R中表达水平均显著或极显著高于698-3;以 A1和 C2基因表达验证分析发现,C(t)与验证基因表达模式一致,说明C(t)可能具有 P1激活调控 A1和 C2基因表达的功能。推测该红轴基因C(t)可能为一个 P_1-wr基因。  相似文献