卢氏绿壳蛋鸡壳色性状的AY493302标记     

王丹华  雷雪芹  徐廷生  高灵照  张小辉  肖赞奇 《兽医大学学报》2012,(9):1374-1377

卢氏鸡是我国唯一片羽型的可产绿壳蛋的地方鸡种,壳色有绿壳和褐壳2种颜色。本研究采集131只卢氏绿壳蛋鸡,45只卢氏褐壳蛋鸡及18只地方白壳蛋鸡的血液,提取基因组DNA,用微卫星AY493302标记探讨了这3种壳色的基因型差异。结果表明,微卫星AY493302在卢氏绿壳蛋鸡、卢氏褐壳蛋鸡以及地方白壳蛋鸡之间基因型分布差异极显著,基因型AA（225bp/225bp）在卢氏鸡中的频率为0.396 9,且只在卢氏绿壳蛋鸡中出现。其A基因频率在卢氏绿壳蛋鸡、卢氏褐壳蛋鸡和地方白壳蛋鸡中分别为0.698 5,0.500 0,0.500 0。进一步进行测序发现,卢氏绿壳蛋鸡AA基因型在19bp处碱基和217bp处碱基均为G,但卢氏绿壳蛋鸡AB基因型在19bp处碱基却为C,在217bp处碱基与绿壳蛋鸡AA基因型同为G。卢氏褐壳蛋鸡AB基因型和地方白壳蛋鸡的AB基因型则表现在19bp处碱基为C,217bp处碱基为T。AA基因型的序列与NCBI数据库中红色原鸡比较,达99%同源的序列有V00425.1、J02015.1和NW_003763484.1,均位于鸡的1号染色体上。该微卫星标记的群体杂合度、群体多态信息含量在卢氏绿壳蛋鸡中都低于卢氏褐壳蛋鸡和地方白壳蛋鸡。尽管在所研究的卢氏绿壳群体中只有39.7%的个体表现为纯合AA基因型,但卢氏褐壳蛋鸡和地方白壳蛋鸡中没有该基因型,故而认为微卫星AY493302的纯合AA基因型可以作为对卢氏绿壳蛋鸡进行分子标记辅助选择的基因型。  相似文献   

利用微卫星标记分析青紫蓝獭兔的保种效果     

申金钰  陈实  赵斌  李佳丽  卢婷婷  翁巧琴  鲍国连  陈阳  吴信生 《中国畜牧杂志》2021,(3):110-114

本研究通过分析青紫蓝獭兔的遗传变异情况,从而掌握青紫蓝獭兔的保种现状,以便对兔群的保种模式和方案提供进一步指导。基于目前已有的青紫蓝獭兔资源群体,筛选出23个微卫星位点,分别统计青紫蓝獭兔1、4、5世代的遗传多样性参数,利用荧光标记的微卫星引物进行扩增,经毛细管电泳后判型,分析等位基因数(A)、有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Obs He)和多态信息含量(PIC)。结果显示:原始世代的A、Ae、He、Obs He和PIC分别为3.1739、2.1043、0.4524、0.5174和0.3878,第4世代为3.0870、1.9847、0.4481、0.5420和0.3807,第5世代为3.1739、1.8771、0.4245、0.4935、0.3574。经卡方检验3个世代各遗传多样性参数差异不显著,提示该保种场较好地保存了青紫蓝獭兔原有的遗传多样性。  相似文献   

绵羊(ATAG)n四碱基微卫星位点的筛选及其在亲子鉴定中的应用     

胡明月  刘正喜  赵中利  曹阳  马惠海  闫守庆 《中国畜牧兽医》2021,48(7):2484-2494

本试验旨在筛选绵羊高度多态性四碱基微卫星遗传标记,建立适用于绵羊亲子关系鉴定的实验体系。试验以小尾寒羊为主要研究对象,从已有的绵羊参考基因组序列出发,基于全基因组序列筛选法共筛选出53个（ATAG）_n四碱基重复微卫星位点,然后通过基因分型数据共筛选出30个扩增效果好、多态信息含量（PIC）丰富的四碱基重复微卫星位点;30个位点的基因分型结果表明,共扩增出253个等位基因,平均等位基因数为8.433,等位基因数均>5,多态信息含量在0.566~0.898,观测杂合度（Ho）范围在0.548~0.903,期望杂合度（He）范围在0.631~0.921,平均期望杂合度为0.776;哈代-温伯格平衡检验30个位点均处于遗传平衡状态。随后根据PCR的扩增效率从获得的30个多态性位点中筛选出22个微卫星位点用于亲权排除概率的计算,根据多态信息含量的大小由高到低依次增加位点数进行组合。结果表明,在两个亲本的基因型均未知的情况下,标记位点数为15个时,累积排除概率可达到99.99%,其中单个位点的第一非亲排除率（non-exclusion probability of the first parent,NE-1P）介于0.321~0.663之间。利用建立的亲子鉴定体系对16只具有系谱记录的小尾寒羊样本进行检测,结果共鉴定出4个具有高置信度的绵羊家系,鉴定结果与系谱记录完全一致。本试验为绵羊分子系谱的构建、亲子鉴定以及保障绵羊育种工作的正常开展奠定重要基础。  相似文献   

一个水稻三倍体×二倍体杂交F2群体的微卫星杂合性丧失     

谢兆辉 《安徽农业科学》2007,35(11):3163-3164,3166

DB102为一田间发现的三倍体水稻,利用它做母本与二倍体水稻中作59杂交,得到一个早世代(F2)稳定群体,通过微卫星分析发现,该群体中有一些微卫星位点发生了杂合性丧失,且至少6条染色体上发生微卫星位点杂合性丧失(loss of heterzygoisity LOH)可能有DNA序列变化。而微卫星位点的杂合性丧失又可能与该杂交组合早世代稳定有关。  相似文献   

牦牛Y染色体基因组单纯型微卫星丰度分析     

颜芳楠  马志杰  徐宇辉  李瑞哲  谢秀梅 《中国畜牧杂志》2023,(6):172-178

微卫星或简单序列重复（SSRs）广泛分布于真核生物基因组中,其在物种基因组结构组成和功能中发挥着重要作用。本研究以2021年报道的牦牛（Bos grunniens）Y染色体基因组序列为研究对象,利用生物信息学方法系统分析了其单纯型微卫星的丰度状况。结果表明,在牦牛Y染色体基因组（26.36 Mb）中共发现12 699个1～6个碱基重复的单纯型SSRs,总长为0.33 Mb,平均长度为25.68 bp,相对频率和相对密度分别为481.77 loci/Mb和12 371.73 bp/Mb,提示牦牛Y染色体基因组包含约1.25%的单纯型SSRs。6类单纯型SSRs在牦牛Y染色体上分布不均匀,其中二碱基重复的SSRs最为丰富,总数为5 835个（45.95%）,平均长度为27.82 bp,而单碱基和三、四、五、六碱基重复的SSRs所占比例分别为29.79%、9.66%、8.81%、5.57%和0.22%。不同类别的单纯型SSRs其不同重复单元的重复次数存在差异,其中以A、AC、AAC等为重复单元的单纯型SSRs在牦牛Y染色体上所含比例相对较高;各重复单元重复次数的范围分别集中在12～20次（单...  相似文献   

安徽省3个地方鸡品种的遗传多样性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

李俊营  詹凯  刘伟  颜小露  许月英  孙建武  钟国发 《家畜生态学报》2011,32(1):20-23

运用微卫星标记对淮南麻黄鸡、皖南三黄鸡和五华鸡3个地方品种遗传多样性进行了分析.在5个座位中,共检测到23个等位基因数,平均有效等位基因数为1.5396,杂合度为0.2920,多态信息含量为0.4156.3个地方品种中,淮南麻黄鸡遗传多样性最低,五华鸡遗传多样性最高.根据5个微卫星座位等位基因频率计算群体遗传一致度和标...  相似文献   

长江中下游和鄱阳湖黄颡鱼亲源关系分析     

王红莹  赵庆文 《湖南农业科学》2010,(12):44-45

采用8对微卫星引物对长江中下游流域武汉江段和鄱阳湖黄颡鱼群体的基因流进行了初步分析，用以初步评估长江中下游和鄱阳湖黄颡鱼之间的亲缘关系。结果表明：黄颡鱼鄱阳湖群体和长江中下游群体共享等位基因占总检测等位基因数的46.2％，长江群体特有等位基因占19．2％，鄱阳湖群体特有等位基因占34．6％。这说明，鄱阳湖黄颡鱼群体大部分与长江中下游群体类似，另外少部分可能与赣江或其他支流群体类似。  相似文献   

利用玉米骨干系进行产量及相关性状的QTL分析     

《科技视界》2013,(29)

玉米重要性状QTL定位是分子标记辅助选择的前提条件,对于提高育种效率有重要意义。本研究以当前大面积推广的一个优良玉米杂交种郑单958的两个亲本(郑58x昌7.2)构建含有225个家系的F2:3群体为基础材料,构建了SSR分子标记遗传连锁图谱,并对产量和相关性状进行了QTL作图。  相似文献   

SLC11A1基因在山羊中的染色体定位和遗传变异研究     

G.M. Vacca  刘丹 《中国畜牧兽医》2012,(1):77

溶质载体家族11成员A1(SLC11A1)基因与抗传染病有关。试验对6个品种427只山羊进行染色体定位、相应的功能结构域和3′非翻译区(3′-UTR)微卫星的遗传变异研究。通过双色荧光原位杂交,将SLC11A1定位于山羊2号染色体上;同时运用单链构型多态性筛查了SLC11A1外显子2、10和15的多态性。结果发现,在各山羊品种中,SH3结合基序、蛋白激酶C磷酸化位点或2个N-连接糖基化位点没有变异。外显子15的变异是由于存在两个微卫星多态性。山羊3′-UTR的上游GT重复(GTn)的基因分型结果显示有8个等位基因(GT11、GT12、GT14-GT19),但缺失GT13(牛中存在)。大多数山羊都有等位基因GT16,但没有等位基因是一个品种独有的。遗传分化系数为0.084。微卫星在山羊的遗传连锁分析中是DNA的信息标记。  相似文献   

浙江中华蜜蜂微卫星遗传多样性分析     

曹联飞  苏晓玲  赵东绪  华启云  胡福良 《中国蜂业》2013,(Z2):10-11

浙江是中华蜜蜂的传统饲养区,本研究对浙江中华蜜蜂的微卫星遗传多样性进行了初步分析。结果发现浙江中华蜜蜂的遗传多样性较低,因此有必要对其采取更加有效的保护措施。  相似文献