微卫星标记在RR-B系剑尾鱼遗传监测中的应用   总被引：2，自引：0，他引：2  

刘宇飞  白俊杰  李凯彬 《水产学报》2007,31(3):280-286

采用49对微卫星引物对RR-B系剑尾鱼和红眼红体的非选育系剑尾鱼进行PCR扩增，有46个微卫星座位能获得稳定的扩增产物，7个微卫星座位能区分RR-B系与非选育群体剑尾鱼。7个微卫星座位在选育系剑尾鱼为单态纯合，而在非选育群体具有多态性，座位Msa014鉴定RRB系剑尾鱼排除概率最高，为98.75%，座位Msd003排除概率最低达到了87.50%，其余5个座位排除概率介于两者之间。为方便今后的遗传监测，对RR-B系剑尾鱼样品的7个微卫星座位进行了测序，确定了其大小和具体的微卫星结构。本实验建立了RR-B系剑尾鱼分子检测方法，为实验动物剑尾鱼的遗传监测奠定了基础。图4表3参23  相似文献   

鸡4号染色体微卫星标记的研究进展     

靳明明 《河南畜牧兽医(综合版)》2009,30(11)

鸡4号染色体上主要存在着影响体重、冠型、蛋清重、蛋重和一些屠体分割性状的QTL.本文重点介绍在鸡4号染色体上进行遗传图谱的构建和重要性状的定位情况.  相似文献   

微卫星DNA标记在家兔遗传育种中的应用     

荣敏  杨福合  章秀婷  邢秀梅  王雷  鲍加荣 《特产研究》2008,30(1):67-70

微卫星DNA是一类由1～6个核苷酸为重复单元而形成的串联重复序列,由于它具有含量丰富、多态性高、共显性等优点.而广泛应用于鉴定亲缘关系、构建遗传图谱、数量性状位点(QTL)定位、遗传多样性估计、标记辅助选择等方面.本文就微卫星标记在家兔遗传育种中的应用进行概述.  相似文献   

雷州山羊和隆林山羊遗传多样性的微卫星分析     

王东劲  侯冠彧  王文强  管松  荣光  马月辉 《勤云标准版测试》2007,(12)

为了调查中国热带、亚热带主要山羊品种的遗传资源现状,应用14对微卫星引物,检测了隆林山羊和雷州山羊不同分布地区的群体遗传多样性水平。隆林山羊(柳州)、隆林山羊(百棚)、雷州山羊(徐闻)、雷州山羊(海南)各群体平均多态信息含量(PIC)分别为0.645、0.600、0.483、0.518;平均杂合度(H)分别为0.281、0.421、0.121、0.157;平均等位基因数(k)分别为5.17、4.93、4.64、4.5,3组数据综合说明两个山羊品种遗传多样性相对匮乏,群体遗传变异较低;NJ法聚类显示,隆林山羊两个群体聚为一类,再与雷州山羊(徐闻)聚在一起,最后为雷州山羊(海南),这与两个品种的来源及地理分布基本一致。研究结果为中国热带、亚热带山羊品种资源开发利用提供了基础资料和科学数据。  相似文献   

猪微卫星DNA座位的突变率     

YueGH  储明星  邓学梅 《中国畜牧兽医》2004,31(2):47

为在 3个 F2代猪群体中进行数量性状基因座(QTL)定位 ,本研究检测了 38个微卫星的基因型 ,在总数为6 6 4 36个亲本—后裔传递的微卫星等位基因中检测到 5个突变等位基因 ,这表明每世代每个座位的总突变率为 7.5 2× 10 - 5。突变率与其它因素 (如侧翼区的 GC含量、杂合度、重复数 )之间没有显著关联 (P>0 .0 5 )。详细的测序结果表明 ,5个突变等位基因中的 4个是分别由 1～ 5个重复插入引起的。剩下的一个突变等位基因要么是由 3个重复插入引起的 ,要么是由 30个碱基对的变化引起的 (16个 CT重复的缺失和 1个 CA重复插入 )。在一个微卫星的侧翼区还检测到 1个碱基对的插入。总之 ,这些数据表明在微卫星之间伸展比收缩更普遍 ,突变过程是非常复杂的 ,并不符合严格的逐步突变模型 ,而且在不同座位之间也有差异。  相似文献   

牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析   总被引：7，自引：2，他引：5  

刘海金  朱晓琛  孙效文  杨立更  薛玲玲  毛连菊 《中国水产科学》2008,15(1):30-37

利用16对微卫星分子标记对牙鲆（Paralichthys olivaceus）的5个养殖群体进行遗传多样性分析。结果表明，等位基因数为2-9个，平均等位基因数为6．0625；有效等位基因数1．2596-5．5161，平均有效等位基因数3．692；各位点的杂合度观测值（Ho）0．2200-0．8000；杂合度期望值（He）0．2061-0．8187。各群体之间无偏倚杂合度期望值从小到大依次为丹东、北戴河、威海、青岛、荣成。Kruskal-Wallis检验结果（H=0．672，df=4，P=0．955）则说明，5个群体遗传多样性差异不显著。群体间基因分化系数（Gs，）为0．0991，各群体之间存在中度遗传分化。采用UPGMA法对5个群体进行聚类，可分3类：丹东和北戴河各为一类，威海、荣成、青岛为一类，其中威海与荣成群体的分化最小。结合Hardy-Weinberg平衡，拟合度检验和遗传偏离指数（动的分析结果表明，各群体的遗传平衡状况存在很大差别。遗传变异的分析结果说明5群体遗传多样性比较丰富。  相似文献   

结构基因座和微卫星标记应用于绵(山)羊群体遗传分化的比较研究   总被引：10，自引：4，他引：6  

杨章平  常洪  孙伟  耿荣庆  毛永江 《畜牧兽医学报》2003,34(5):427-433

对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的随机样本分别进行14个结构基因座和7个微卫星标记的遗传检测,比较由两种遗传标记获得的群体基因平均杂合度(H)、多态信息含量(PIC)及群体有效等位基因数(Ne);分别根据两种类型的基因频率资料,计算3个群体间的标准遗传距离并加以比较。结果表明:由微卫星等位基因频率获得的群体基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数显著大于结构基因座获得的,但在三群体中变化趋势是一致的;由结构基因座资料计算的3个群体间标准遗传距离为0 0268～0 2487,微卫星标记资料计算的3个群体间标准遗传距离为:0 2321～1 2313,绵山羊间显著大于绵羊群体之间。提示:结构基因座和微卫星标记一致揭示3群体内的遗传变异;同羊>湖羊>长江三角洲白山羊;微卫星标记较结构基因座标记更能表达近缘种间进化趋异水平,可将FCB11、MAF33、AE101、FCB128及FCB304位点作为研究绵山羊近缘种间遗传分化的标志性位点。  相似文献   

广灵驴分子系谱的建立及群体遗传结构分析     

牛晓艳  曹亮  明世清  李燕平  詹海杰  姜志广  卫顺生  张元庆 《畜牧兽医学报》2022,53(2):391-401

旨在对广灵县优种驴场保种群体进行调查的基础上构建分子系谱,并对其种群的遗传结构进行分析。本研究采集保种群成年、体况良好的广灵驴（体重350~400 kg）颈静脉血10 mL（n=107）,其中公驴13份,母驴94份,抗凝处理后提取全血DNA。采用12个微卫星标记进行荧光PCR扩增后,用ABI3730测序仪进行分型。分型结果采用Cervus 2.0和Pedigraph 2.4软件构建分子系谱,同时采用STRUCTURE2.3和Fstat软件计算群体遗传参数,采用R语言的hclust函数绘制7头公驴及其后代的系统发生NJ树（邻接树）。结果,对107头种驴进行了分子系谱构建,找到了30头子代的父亲和7头子代的母亲,系谱可靠性>90%;微卫星标记的平均观测杂合度（H_Obs）和多态信息含量（PIC）分别为0.676 5和0.593 9,标记遗传多样性较高;NJ树对7个公驴家系进行了聚类;群体分化系数（F_ST）为0.184,群体平均近交系数（F_IT）为0.033,群体内近交系数（F_IS）为-0.238,且群体处于哈代-温伯格平衡状态,存在很弱的近交。本研究建立了广灵驴保种群可靠性较高的分子系谱并对其遗传结构进行了分析,证明该群体遗传多态性较高,群体近交系数较低,处于较好的保种状态,具有较大的品种资源开发潜力。  相似文献   

利用微卫星标记分析长白山中华蜜蜂遗传多样性     

《中国蜂业》2015,(7)

利用21对微卫星标记对吉林长白山中华蜜蜂群体遗传多样性进行分析,共检测到39个等位基因,等位基因数目从1~5不等。平均等位基因数为1.8571;所有位点的平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)值分别为0.2068和0.1679。表明长白山中华蜜蜂群体遗传多样性较低。  相似文献   

用水稻微卫星引物进行竹子分子系统学研究初探   总被引：27，自引：0，他引：27  

李淑娴  尹佟明  邹惠渝  丁雨龙  黄敏仁 《林业科学》2002,38(3):42-48

竹子和水稻在进化上有较近的亲缘关系 ,本文利用水稻的微卫星引物对竹子的分子系统学进行了初步研究。与传统的分类结果不同 ,研究发现巴山木竹属是与青篱竹属相关属分化较大的 1个竹种 ,同时也证实了巴山木竹属作为 1个单独的属是成立的。研究也明确了茶秆竹的分类学位置。本研究从 1个不同的层面对青篱竹属相关属及属下一些竹种的关系提供了 1个新的研究结果 ,为利用现代分子生物学技术对广义青篱竹属的系统学研究提供了 1个借鉴。同时本研究对开展竹子的分子生物学研究提供了 1个崭新的思路和方法  相似文献