绿头野鸭与我国主要地方鸭品种遗传多样性研究   总被引：5，自引：0，他引：5  

苏瑛  陈国宏  龙瑞军  万江虹  马龙 《畜牧兽医学报》2007,38(9):899-906

利用17个微卫星标记,采用PCR扩增,8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染,对绿头野鸭种群和我国9个主要地方鸭品种的遗传多样性进行了检测,统计了各群体的平均有效等位基因(Ne)、平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、群体间的遗传距离(Ds)和相似系数(I)。采用UPGMA和NJ法构建系统发生树。结果表明:17个微卫星座位在绿头野鸭种群和我国9个主要地方鸭品种中的多态信息含量均为高度多态,所有鸭种的平均PIC、H、Ne分别为0.6506、0.6896、4.1±1.5,基因多态性和遗传多样性相对较高;家鸭各品种间的遗传距离在0.1631~0.6844范围内,绿头野鸭与家鸭品种间的遗传距离分别在0.3096~0.8219之间。根据系统发育树推断中国主要地方鸭品种不是单一起源于绿头野鸭。中国主要地方鸭品种大致可以分为5支。一支为北京鸭、荆江鸭,一支为中山鸭、建昌鸭及高邮鸭,一支为靖西大麻鸭和金定鸭,连城鸭为一支,绍兴鸭为另一支。  相似文献   

黄羽肉鸡微卫星多态性与料肉比的相关分析     

王曦  李红霞  朱庆 《中国家禽》2007,29(11):22-24

从鸡的遗传图谱中选取13个微卫星基因座,对黄羽肉鸡A系和B系(粤黄鸡102系)回交F1代群体100个个体进行标记与料肉比的最小二乘分析,结果表明:ADL0252、LEI0071、MCW0004、MCW0245、MCW0341这5个基因座与料肉比之间存在着极显著的关系(P<0.01),而基因座MCW0223、MCW0264与料肉比之间存在着显著的关系(P<0.05)。基因座MCW0004的DD型、ADL0252的CC型和MCW0223的AA型所对应的最小二乘均值最大,其有望作为对料肉比性状进行选择的辅助标记。  相似文献   

朝鲜鹌鹑遗传多样性微卫星标记分析     

孟庆美  孙永强  李大全  乔爱君 《福建畜牧兽医》2007,29(1):1-2

选用鹌鹑上的12个微卫星位点,对随机选取朝鲜鹌鹑的40个个体进行多态性检测,共检测到55个等位基因,每个座位平均等位基因数为4.583个。该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.6945和0.7111,表明朝鲜鹌鹑属多态性较丰富的群体。  相似文献   

微卫星DNA标记及其在检疫性实蝇种群遗传学中的研究应用          下载免费PDF全文

伍祎  李志红  康芬芬  杨定  吴佳教 《植物保护》2007,33(4):1-6

微卫星DNA是一种广泛用于种群遗传学研究的分子标记技术,具有共显性标记、反应速度快、重复性好和结果可靠等特点。本文在概述微卫星标记的原理、特点、位点筛选和引物设计的基础上,系统分析了该技术在检疫性实蝇(小条实蝇属、果实蝇属等)种群遗传关系中的研究与应用。  相似文献   

核桃品种微卫星标记的筛选与鉴别   总被引：1，自引：0，他引：1  

《果树学报》2016,(7)

【目的】筛选合适的微卫星标记,以便精确、快速、高效、可靠地鉴定核桃品种。【方法】从已报道的核桃微卫星引物遴选出22对引物,对5个川早系列核桃品种和2个四川乡土核桃进行鉴别。【结果】经过筛选和比对重复,有15个位点获得了清晰、准确、一致的等位基因信息。15个位点共获得了64个等位基因,平均等位基因数为4.2个,平均表观杂合度为0.648;平均无偏期望杂合度为0.704,表现出了很高的多态性。少数几个位点(wga001、wga032、wga148、wga004与wga079组合、wga349与zmz39组合,wga349与zmz22组合,wga202与zmz05组合,zmz35与zmz44组合等)就可以有效地对供试核桃品种进行鉴定。【结论】15个筛选出的微卫星位点表现出很好的品种鉴别能力,为川早系列核桃品种的鉴定提供了技术支持,也为建立应用更为广泛的核桃品种微卫星鉴别体系提供了一定的借鉴。  相似文献   

贵州地方黄牛品种遗传分化的分子评估     

杨红文  韩勇  刘镜  肖礼华  粟朝芝 《贵州畜牧兽医》2016,(6):5-7

选用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的23对微卫星引物,采用荧光标记-多重PCR技术检测了4个贵州地方黄牛品种的遗传分化。结果显示,思南牛、关岭牛、威宁牛、黎平牛平均杂合度分别为0.71、0.69、0.69、0.65,23个位点多态信息含量在0.38~0.84之间,高度多态位点21个,中度多态位点2个。检测结果为贵州省本地黄牛品种分类提供了分子水平的科学依据。  相似文献   

山西瘦肉型猪SD-Ⅲ系微卫星标记SW489和SW2049的遗传多态性分析     

范晓辉  王钦德  程小强  刘彦清 《上海畜牧兽医通讯》2007,(6):24-25

微卫星标记(microsatellite)又称为短串联重复序列(si m-ple tandemrepeats,STRs),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,因此微卫星标记的应用非常广泛〔1〕。微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。本试验研究的目的就是分析山西瘦肉型猪SD-Ⅲ系卫星标记SW489和SW2049的遗传多态性,从分子水平上了解山西瘦肉型猪SD-Ⅲ系,为猪的动物育种提供科学依据。1材料和方法1.1试验材料1.1.1试验猪…  相似文献   

长江流域铜鱼和圆口铜鱼的遗传多样性   总被引：2，自引：2，他引：0  

袁希平  严莉  徐树英  汪登强  张燕  陈大庆 《中国水产科学》2008,15(3):377-385

利用线粒体DNA控制区序列多态性分析了长江流域铜鱼（Coreius heterodon）和圆口铜鱼（Coreius guichenoti）各4个群体的遗传结构；同时利用9对自行开发的多态性微卫星标记分析圆口铜鱼4个群体的遗传结构。结果显示，铜鱼线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列共检出22个多态位点，28种单倍型，平均单倍型多样性指数（h）和核苷酸多样性指数（7r）分别为0．849和0．00257。圆口铜鱼线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列共检出18个多态位点，28种单倍型，平均单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0．902和0．00424。分子变异分析（AMOVA）结果提示，铜鱼和圆口铜鱼分别有98．80％和99．17％的遗传变异发生于群体内部，表明铜鱼和圆口铜鱼未出现种群分化。选用的9个微卫星标记在圆口铜鱼群体中共检测到48个等位基因；群体平均观测杂合度在0．631～0．753之间；平均期望杂合度为0．598-0．728：平均多态信息含量为0．548～0．670。结果表明，长江流域铜鱼遗传多样性较低，长江上游圆口铜鱼遗传多样性较高，且均未出现种群遗传分化。圆口铜鱼SSR固定指数为0．12l58，高于D．1oop固定指数，显示SSR标记对圆口铜鱼群体间遗传差异的检测更为灵敏。[中国水产科学，2008，15（3）：377-385]  相似文献   

三疣梭子蟹基因组微卫星特征分析   总被引：5，自引：1，他引：4       下载免费PDF全文

宋来鹏  刘萍  李健  刘振辉 《中国水产科学》2008,15(5)

对三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)部分基因组DNA文库测序,获得了总长度为622409个碱基的基因组DNA序列,从中找到微卫星重复序列(1～6bp重复)697个.统计微卫星重复类型,以两碱基重复数目最多,为445个,占微卫星序列总数目的63.84%;其次是三碱基重复152个,占21.81%;再次分别是单碱基重复45个,占6.46%;四碱基重复31个,占4.45%;五碱基重复14个,占2.01%;六碱基重复1个,占1.43%.在单碱基重复类型中,重复拷贝类别全部为A:两碱基重复类型中,AG重复数目最多,其次是AC和AT;三碱基重复类型中以ACT最多,其次是AGG和AAT;四碱基重复类型中,AGAC重复数目最多;五碱基重复类型中,以AACCT重复拷贝类别最多;六碱基重复中以AGGGGA重复数目最多.GC重复拷贝类别的重复数目很少,只发现1个(GenBank注册号为EU113241).  相似文献   

海南中蜂微卫星DNA遗传多样性研究     

《中国蜂业》2015,(8):21-23

本研究利用微卫星DNA方法对海南中蜂蜜蜂群体多态性进行研究,评估品种内的遗传变异。结果共检测到55个等位基因,平均每个位点的等位基因数为11,单个位点的等位基因数从8到13不等。所有位点的平均PIC值与平均期望杂合度分别为0.7569(0.0330)与0.8577(0.0267)。表明海南中蜂群体具有较高的多态性,显示出丰富的遗传多样性和较高的选择潜力,可为分析遗传多样性提供充分的信息。  相似文献