红螯螯虾转录组中的SSR位点信息分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

李喜莲  郭建林  李倩  施伟达  黄振远  顾志敏 《湖北农业科学》2020,59(7):207-211

对红螯螯虾转录组测序数据进行分析,并开发引物通过PCR扩增和毛细管电泳检测,进行了引物多态性和通用性分析。从67 369条Unigenes中共检测到22 727个简单重复序列(SSR)位点,并对包含SSR序列的Unigenes进行功能注释。结果表明,红螯螯虾转录组中微卫星序列的类型较为丰富,其中二核苷酸和三核苷酸重复类型出现频率较多,分别占总SSR出现频率的52.67%和44.25%;四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复类型出现频率较少,分别占总SSR出现频率的2.62%、0.23%和0.24%。SSR重复类型共有68种,其重复次数的范围为5～84次。筛选出SSR引物5对,对浙江本地及台湾2个群体的60个样品进行遗传多样性分析,每对引物平均产生5.6个多态性片段。本研究结果为深入开发红螯螯虾功能性SSR标记奠定了基础,也为开展红螯螯虾分子标记辅助选育提供支持。  相似文献   

亚硝酸盐对越冬红螯螯虾生理指标及肠道菌群的影响   总被引：1，自引：1，他引：0  

韦永春  程顺  贾永义  迟美丽  刘士力  郑建波  李飞  刘一诺  顾志敏 《上海海洋大学学报》2022,31(1):278-287

以越冬红螯螯虾为对象,探讨其在不同亚硝酸盐浓度下的生理指标及肠道菌群变化情况。采用常规生物急性毒性试验法,得到亚硝酸盐胁迫下红螯螯虾的96 h半致死浓度为22.0 mg/L,安全浓度为2.2 mg/L。设置4个实验组,分别为A组(0 mg/L)、B组(0.5 mg/L)、C组(2.3 mg/L)和D组(5.0 mg/L),胁迫6周后取样检测。结果表明:各组成活率、肥满度、肝体指数无显著性差异(P>0.05),但D组成活率、体质量增加率、体长增加率最低。随亚硝酸盐浓度的增加,肝小管排列趋于混乱且大小出现差异,肝小管间结缔组织随之减少,产生空泡化,在D组中变化尤为明显。SOD活性随亚硝酸盐浓度升高而降低,在肝胰腺中,A组显著高于其他3组(P<0.05),D组显著低于其他3组(P<0.05);在肌肉中,A组显著高于C、D组(P<0.05),D组显著低于A、B组(P<0.05)。MDA活性随亚硝酸盐浓度升高而升高,在肝胰腺中,4组均无显著差异(P>0.05);在肌肉中,A组显著低于C、D组(P<0.05)。免疫相关指标均随亚硝酸盐浓度升高而降低,在肝胰腺中,4组ACP、AKP活性均存在显著性差异(P<0.05),A组最高,D组最低;在肌肉中,A组ACP活性显著高于其他3组(P<0.05);4组AKP活性均存在显著性差异(P<0.05),A组最高,D组最低;各组UL活性无显著性差异(P>0.05)。能量代谢指标TG活性随亚硝酸盐浓度升高而降低,A组显著高于D组(P<0.05)。亚硝酸盐胁迫在一定程度上提高了肠杆菌科(Enterobacteriaceae)的比例,且菌群多样性D组最低,A组最高,亚硝酸盐导致了肠道菌群多样性的下降。  相似文献   

红螯光壳螯虾响应长期水体盐度胁迫的基因和代谢通路     

刘树彬  徐畅  贾永义  顾志敏  李二超 《水产学报》2022,46(6):917-930

为探究长期盐度胁迫条件下红螯光壳螯虾肠道基因表达和代谢通路的变化。实验采用Illumina Hiseq 2 500平台对0、5、10和15这4个盐度下养殖5周的红螯光壳螯虾的肠道组织进行了高通量测序。研究共获76 534个unigenes,通过与NR、NT、KO、Swissprot、PFAM、GO和KOG数据库进行比对,成功注释37 378个unigenes。通过引入FPKM(Fragments Per Kilo bases per Million fragments)来估算基因表达水平,基于NR和Pfam两个数据库的蛋白注释结果,448 362个unigenes在GO数据库得到注释。根据KO功能注释与Pathway的联系,9 483个unigenes在KEGG数据库被注释分类到34条通路途径。通过DEGseq进行基因表达差异分析,以盐度0为对照组,显著差异基因筛选条件设置为Q value<0.05且差异倍数|Fold Change|>2,盐度5、10和15组分别获得差异基因2 733、91和236个,其中盐度5组共有2 068个基因显著上调,665个基因显著下调。将所有差...  相似文献   

红螯螯虾弗氏柠檬酸杆菌病病原的分离与鉴定   总被引：11，自引：0，他引：11       下载免费PDF全文

沈锦玉  顾志敏  潘晓艺  周保中  尹文林  曹铮 《中国水产科学》2005,12(2):197-200

从濒死的红螯螯虾(Cheraxquadricarinatus)的肝胰脏中分离得到可疑病菌L1和L2,经细菌学鉴定2株细菌均为弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacterfreundii);经人工感染试验证实L1和L2均导致健康虾发病死亡,其LD50分别为2 2×105CFU/ind、7×105CFU/ind;2株细菌对14种药物的敏感性相似,对9种抗生素敏感,对5种抗生素有抗性。从中筛选出有效药物,应用于生产中取得了较好效果。  相似文献   

六个群体翘嘴红鲌肌肉生化组成的比较   总被引：5，自引：0，他引：5  

王伟  陈立侨  顾志敏  张伟  李二超  李睿  李自荣 《水产学报》2007,31(Z1):92-99

比较分析了中国六群体翘嘴红鲌(Culter alburnus)的肌肉生化组成.试验材料分别取自太湖、兴凯湖、梁子湖、浮桥河水库和南湾水库五个野生群体,以及由太湖野生群体经人工驯养、繁殖数代获得的养殖群体.分析结果表明,各群体之间翘嘴红鲌肌肉的水分、灰分和粗蛋白含量差异不显著(P＞0.05).而养殖群体的粗脂肪含量显著高于其它五个野生群体(P＜0.05).南湾水库群体的多不饱和脂肪酸和必需脂肪酸含量均最高,必需脂肪酸含量由高到低依次为南湾水库群体＞浮桥河水库群体＞兴凯湖群体＞梁子湖群体＞养殖群体＞太湖群体.氨基酸总含量由高到低依次为:太湖群体＞兴凯湖群体＞南湾水库群体＞梁子湖群体＞浮桥河水库群体＞养殖群体,而必需氨基酸含量的高低顺序为:太湖群体＞兴凯湖群体＞梁子湖群体＞南湾水库群体＞浮桥河水库群体＞养殖群体.相比之下,太湖群体的必需氨基酸指数(EAAI)最高,其次依次为:南湾水库群体＞梁子湖群体＞兴凯湖群体＞浮桥河水库群体＞养殖群体.各群体的大多数必需氨基酸氨基酸分(AAS)和化学分(CS)均大于1,仅兴凯湖群体的赖氨酸、苯丙氨酸+酪氨酸的AAS低于1,养殖群体的赖氨酸和缬氨酸的AAS和赖氨酸、蛋氨酸+半胱氨酸、苯丙氨酸+酪氨酸和缬氨酸的CS小于1,而成为各自的限制性氨基酸.综合所得的结果,野生群体的肌肉营养品质明显优于养殖群体,而野生群体中太湖、兴凯湖和南湾水库群体的肌肉品质相对较优.  相似文献   

红螯螯虾的室内人工育苗   总被引：7，自引：1，他引：7  

顾志敏 《水产学报》2003,27(1):32-37

于1996-1998年,在浙北地区,对澳大利亚引进的红螯螯是进行亲虾培育、人工越冬,怀卵孵化,室内人工育苗技术的研究。研究表明,在浙北地区,2.8-4.9g的幼虾经5个月左右的饲养可以达到性成熟并部分怀卵,利用电厂余热水水泥池人工越冬的成活率可达70%以上。越冬后亲是在水温20℃以上即开始交配怀卵,怀卵盛期4-6月。红螯螯虾一年可产卵4次,但只有第一、二次怀卵可用于育苗生产,个体一次怀卵量较少,一般为400-500粒,但群体怀卵比率较高。试验还表明,红螯螯虾出膜幼体即呈幼虾状,需依附母体7-10d后才营独立生活并开口摄食外源性饵料,所研制的幼虾Ⅰ号饲料为红螯螯虾室内人工育苗较好的开口饲料。室内人工育苗成活率可达60%以上。  相似文献   

日本沼虾4种群肌肉营养品质的比较   总被引：21，自引：2，他引：21       下载免费PDF全文

倪娟  赵晓勤  陈立侨  马强  顾志敏  周志明  姚明星 《中国水产科学》2003,10(3):212-215

4个种群日本沼虾(Macrobrachium nipponensis)于2001年8月分别取自太湖、洪泽湖、广西南宁3地天然水域及浙江德清养殖种群。肌肉营养成分测定结果表明,养殖种群的粗蛋白含量为(15.83±0.32)％(质量分数),显著低于3个野生种群(P<0.05),而粗脂肪质量分数为(1.37±0.02)％显著高于野生种群(P<0.05)。3个野生种群中洪泽湖种群鲜味氨基酸含量最高;但太湖种群粗蛋白含量(17.71±0.38)％最高,必需氨基酸组成最为均衡,且单不饱和脂肪酸总量和多不饱和脂肪酸总量均为最高,分别达25.904％和35.953％。比较得出太湖种群日本沼虾肌肉的营养品质最高,养殖种群最低。  相似文献   

六个群体翘嘴红鲐肌肉生化组成的比较     

王伟陈立侨  顾志敏张伟  李二超李睿 李自荣 《水产学报》2007,31(B09):92-99

比较分析了中国六群体翘嘴红鲐（Culter alburnus）的肌肉生化组成。试验材料分别取自太湖、兴凯湖、梁子湖、浮桥河水库和南湾水库五个野生群体，以及由太湖野生群体经人工驯养、繁殖数代获得的养殖群体。分析结果表明，各群体之间翘嘴红鲐肌肉的水分、灰分和粗蛋白含量差异不显著（P〉0．05）。而养殖群体的粗脂肪含量显著高于其它五个野生群体（P〈0．05）。南湾水库群体的多不饱和脂肪酸和必需脂肪酸含量均最高，必需脂肪酸含量由高到低依次为南湾水库群体〉浮桥河水库群体〉兴凯湖群体〉梁子湖群体〉养殖群体〉太湖群体。氨基酸总含量由高到低依次为：太湖群体〉兴凯湖群体〉南湾水库群体〉梁子湖群体〉浮桥河水库群体〉养殖群体，而必需氨基酸含量的高低顺序为：太湖群体〉兴凯湖群体〉梁子湖群体〉南湾水库群体〉浮桥河水库群体〉养殖群体。相比之下，太湖群体的必需氨基酸指数（EAAI）最高，其次依次为：南湾水库群体〉梁子湖群体〉兴凯湖群体〉浮桥河水库群体〉养殖群体。各群体的大多数必需氨基酸氨基酸分（AAS）和化学分（CS）均大于1，仅兴凯湖群体的赖氨酸、苯丙氨酸＋酪氨酸的AAS低于1，养殖群体的赖氨酸和缬氨酸的AAS和赖氨酸、蛋氨酸＋半胱氨酸、苯丙氨酸＋酪氨酸和缬氨酸的CS小于1，而成为各自的限制性氨基酸。综合所得的结果，野生群体的肌肉营养品质明显优于养殖群体，而野生群体中太湖、兴凯湖和南湾水库群体的肌肉品质相对较优。  相似文献   

翘嘴鲌生长激素基因侧翼2个微卫星位点与生长性状的关联分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘士力  蒋文枰  程顺  迟美丽  郑建波  贾永义  赵金良  顾志敏 《浙江农业学报》2019,31(1):62

通过120尾同塘养殖翘嘴鲌体长和体质量的测定,以及生长激素基因(GH)侧翼的2个微卫星位点Cal-GH01和Cal-GH02基因型检测,分析了翘嘴鲌GH基因侧翼的2个微卫星多态性与生长性能的相关性。结果表明:Cal-GH01共检测到3个等位基因(404、407和410 bp)和6种基因型,等位基因407 bp是优势等位基因,407/407 bp是优势基因型;该微卫星位点多态信息含量为0.420,观测杂合度为0.207 2,属中度多态性位点。Cal-GH02共检测到6个等位基因(366、375、378、381、384和387 bp)和11种基因型,等位基因381 bp是优势等位基因,381/381 bp是优势基因型;该微卫星座位多态信息含量为0.450,观测杂合度为0.466 1,属中度多态座位。微卫星位点Cal-GH01的分析结果表明,404/407型个体占样本数的13.3%,其体长最长。407/410型个体占样本数的5%,其体质量最大。Cal-GH01不同基因型个体体长和体质量均有差异,但差异均不显著(P>0.05)。在微卫星位点Cal-GH02中,366/381型个体占样本数的3.3%,其体长和体质量均最大,其体质量显著大于其他基因型个体(P<0.05)。384/387型个体占样本数的2.5%,其体长和体质量均最小,其体长显著小于其他基因型个体(P<0.05)。翘嘴鲌GH基因多态性与生长性状存在关联,推测相关变异位点可作为翘嘴鲌生长的候选辅助标记。  相似文献   

富春江轮虫群落的时空格局及其与环境因子的关系     

郭爱环  原居林  张爱菊  郝雅宾  刘金殿  顾志敏 《江苏农业科学》2019,(7)

2016年对钱塘江流域富春江江段的轮虫群落进行逐季度调查,分析富春江轮虫的种类组成和时空分布,并探讨轮虫群落结构与环境因子的关系。调查共观察到轮虫14属27种,轮虫群落结构的季节差异明显,春季轮虫的密度和生物量最高,秋季次之,冬季最低;春季优势类群为多肢轮虫,秋季优势类群为臂尾轮虫,冬季优势类群为龟甲轮虫。轮虫群落密度在空间上表现为轮虫密度在三江口段最高,5#采样点最低。典型相关分析结果表明,水温、pH值、总磷(TP)含量和高锰酸盐指数(COD_(Mn))等环境因子是影响富春江轮虫群落时空格局的主要因素。  相似文献